BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283J02
Chromosome13 (Build37)
Map Location 17,266,617 - 17,267,690
singlet/doubletsinglet
Overlap gene5033411D12Rik
Upstream geneLOC665191
Downstream gene2810021B07Rik, Cdc2l5, Rala, LOC434585, LOC382732, 1600012F09Rik, Vdac3-ps1, LOC625310, 4930448F12Rik, Pou6f2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283J02.bB6Ng01-283J02.g
ACCGA082497GA082498
length1051,069
definitionB6Ng01-283J02.b B6Ng01-283J02.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
caaacgcaagtcctgtgtgggttacaaactgagctcaaggccaacctgga
cagattagtaagaccccgtctaaaaattgaaatgtggaggggggggggtt
accgc

gaattcacatggataccagagatatgccacaaatagagaaagacagtctt
actaggctaactcttggaaagttaaatgaatgaacagaacttggctggag
aggtggctccatgggtaaaatatttgtggcataagtttgcagagccaaat
tcaacccatgtgaaaaccagggatggtagtatgttcttagaatctcagtg
tccatgtagcaaatttggaggctgagacacaaaagtcccaaagtcttgtg
ggccagcaaccctggcgttcagagtggcgaacagagaaggtctgtctcaa
tcaagttgaaaggcagggaccagcactcaggattgtcatctgaccatctc
acatgcactggtacatgcataggttcatacacatgcatgttagcaagcac
atattgtacacacaacgaataaaaaatcagaacttactgttgtcatcgta
cctttgtagtagccctcattctgacttttcttataaccatgcagtaatat
ccccaggctttccttctttgagacccaactttactatgtagtccaacctg
ggcttcaacttgtagcaatctttctgcttaggcatcttgagtgctgagat
tatagacaagtaccgctagaccaaaccttggaacataattttgactaggg
aaataaaaatctaataattttgataacgtttttgtggacaggaacagaca
ttcaccatcaatctattagtcatccattcttgttatacttatcacgtcct
tattgactaggtattatatgctgagtattgttttaagttttgtgctaagg
attcatggttgtactttatgtaaaaatcctatgcatttgattttaagcac
ctctcatgcttaaattatctggaatcctgtgctaatctggccttagttat
cgttcttacctattcccaactctttctcacactgcttcatgtccctttga
cccttctaagtacactagcagatcatgctttggtgttatgttccctgtgc
tgctgcatgatagtctttctacagaacatcatggccttatacattttatt
atgagtctgcctcagatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_17266617_17267690
seq2: B6Ng01-283J02.g_62_1130 (reverse)

seq1  ACATCTGA-GCAGACTCATTAATAAAATGTATAAGGCCCATGAATGTCTG  49
      |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||
seq2  ACATCTGAGGCAGACTCA-TAATAAAATGTATAAGG-CCATGATGTTCTG  48

seq1  TAGAAAGACTATCCATGCAAGCAGCACAGGGAACATAACACCAAAGCATG  99
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGACTAT-CATGC-AGCAGCACAGGGAACATAACACCAAAGCATG  96

seq1  ATCTTGCTTAGTGTACTTAGAAGGGTCAAAGGGACATGAAGCAGTGTGAG  149
      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATC-TGC-TAGTGTACTTAGAAGGGTCAAAGGGACATGAAGCAGTGTGAG  144

seq1  AAAGAGTTGGGAATAGGTAAGAACGATAACTAAGGCCAGATTAGCACAGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTTGGGAATAGGTAAGAACGATAACTAAGGCCAGATTAGCACAGG  194

seq1  ATTCCAGATAATTTAAGCATGAGAGGTGCTTAAAATCAAATGCATAGGAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAGATAATTTAAGCATGAGAGGTGCTTAAAATCAAATGCATAGGAT  244

seq1  TTTTACATAAAGTACAACCATGAATCCTTAGCACAAAACTTAAAACAATA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACATAAAGTACAACCATGAATCCTTAGCACAAAACTTAAAACAATA  294

seq1  CTCAGCATATAATACCTAGTCAATAAGGACGTGATAAGTATAACAAGAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCATATAATACCTAGTCAATAAGGACGTGATAAGTATAACAAGAAT  344

seq1  GGATGACTAATAGATTGATGGTGAATGTCTGTTCCTGTCCACAAAAACGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGACTAATAGATTGATGGTGAATGTCTGTTCCTGTCCACAAAAACGT  394

seq1  TATCAAAATTATTAGATTTTTATTTCCCTAGTCAAAATTATGTTCCAAGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAAATTATTAGATTTTTATTTCCCTAGTCAAAATTATGTTCCAAGG  444

seq1  TTTGGTCTAGCGGTACTTGTCTATAATCTCAGCACTCAAGATGCCTAAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCTAGCGGTACTTGTCTATAATCTCAGCACTCAAGATGCCTAAGC  494

seq1  AGAAAGATTGCTACAAGTTGAAGCCCAGGTTGGACTACATAGTAAAGTTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGATTGCTACAAGTTGAAGCCCAGGTTGGACTACATAGTAAAGTTG  544

seq1  GGTCTCAAAGAAGGAAAGCCTGGGGATATTACTGCATGGTTATAAGAAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCAAAGAAGGAAAGCCTGGGGATATTACTGCATGGTTATAAGAAAA  594

seq1  GTCAGAATGAGGGCTACTACAAAGGTACGATGACAACAGTAAGTTCTGAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGAATGAGGGCTACTACAAAGGTACGATGACAACAGTAAGTTCTGAT  644

seq1  TTTTTATTCGTTGTGTGTACAATATGTGCTTGCTAACATGCATGTGTATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATTCGTTGTGTGTACAATATGTGCTTGCTAACATGCATGTGTATG  694

seq1  AACCTATGCATGTACCAGTGCATGTGAGATGGTCAGATGACAATCCTGAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTATGCATGTACCAGTGCATGTGAGATGGTCAGATGACAATCCTGAG  744

seq1  TGCTGGTCCCTGCCTTTCAACTTGATTGAGACAGACCTTCTCTGTTCGCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGTCCCTGCCTTTCAACTTGATTGAGACAGACCTTCTCTGTTCGCC  794

seq1  ACTCTGAACGCCAGGGTTGCTGGCCCACAAGACTTTGGGACTTTTGTGTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAACGCCAGGGTTGCTGGCCCACAAGACTTTGGGACTTTTGTGTC  844

seq1  TCAGCCTCCAAATTTGCTACATGGACACTGAGATTCTAAGAACATACTAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCTCCAAATTTGCTACATGGACACTGAGATTCTAAGAACATACTAC  894

seq1  CATCCCTGGTTTTCACATGGGTTGAATTTGGCTCTGCAAACTTATGCCAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTGGTTTTCACATGGGTTGAATTTGGCTCTGCAAACTTATGCCAC  944

seq1  AAATATTTTACCCATGGAGCCACCTCTCCAGCCAAGTTCTGTTCATTCAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATTTTACCCATGGAGCCACCTCTCCAGCCAAGTTCTGTTCATTCAT  994

seq1  TTAACTTTCCAAGAGTTAGCCTAGTAAGACTGTCTTTCTCTATTTGTGGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTTTCCAAGAGTTAGCCTAGTAAGACTGTCTTTCTCTATTTGTGGC  1044

seq1  ATATCTCTGGTATCCATGTGAATTC  1074
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCTGGTATCCATGTGAATTC  1069


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |