BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-287G14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 49,374,341 - 49,533,662
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgd3, Bicd2, Ippk
Upstream geneLOC667351, Zfp169, A830005F24Rik, AW456874, Barx1, Phf2, EG667415, BC010304, C030044B11Rik, Wnk2, Ninj1, 1110007C09Rik, Susd3
Downstream geneCenpp, Tes3-ps, Ecm2, Aspn, Omd, Ogn, Nol8, Iars, LOC667488, LOC670357, EG638833, Gm272, EG667503, EG667507, LOC100040099, LOC625110, LOC676907, LOC667546, LOC667552, LOC100040085, LOC100040159, LOC100040176, LOC100040118, Gm906, 2310081J21Rik, LOC676954, LOC667625, LOC667632, EG667637, Fbxw17
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-287G14.bB6Ng01-287G14.g
ACCGA085345GA085346
length1,14690
definitionB6Ng01-287G14.b B6Ng01-287G14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,374,341 - 49,375,496)(49,533,573 - 49,533,662)
sequence
gaattcaagtcagaactgacccaaaagcttcaaccccactggatagcttc
tatagtgttgaaagatgctatacatttaaccagaggagagacataagcat
acatcatacccagatgtgaaccctgtaagttacaataacaactggcccag
caagacacacccgattatacaatagaggcatgaatgtcatgggagtgacc
aatcactttctgattggatttaagctccattccacaagatgaaccccata
tgtagtgctattattcagacaagaaactgtggctaggtatgtcatagaaa
cttgcagagctggagagatggctcagtggtttagaactctgactgctctt
ccacaggtcctgagttcaattcccagcaaccacatggcatctcacaacta
tctgaaatgggatctgatgcccccttatgatgtgtctgaagacagctaca
ttgtacttatatacataaaaaataaaaaataataaacatatcctgagtgt
gtgaatgtgaaaaaaaaaggaaacttgcaaagatatagctacttattcaa
gaatagaggctggcctatgagtgtaattcagtgatcaggtatttgcctag
caaatgtaaggccttgggaagaaccaagaagaggaagaagaggaggaagg
agaagaaaaggaggaggtagggggaaaagtagctatagaaagagaaactg
tgtctcttcctgtatgtaaggtacttgaatggatctcccactataactcc
ttcctttcttttctctccctctaaaccagagcatggttctggggacagtt
gagatcttgatgtttggctacaattctctatattttggttgctggatact
ccctagttgcaaccgaggtagataaaaaagaatagaaatgctggatatat
ggaacataaatattagatgcttgcagaaaccagtgcagtgtcattagcag
gagatagcccaaaaaacctatctggaaggctacagaagaacctcctcttg
tgcttctgaatctttcagttctaatcagggtcttgagaagcagatgagaa
gttctgtgccatggctggcctgctcaacaggaagagttcgtcctgattgg
tgcaatctgctgataccttctggatgctgcctcctggatcagctca
aaagccaacataggctacattagaccctgtctttaaaaagcaatagacgg
gaagggataaagggagagggagagggagggagggaagagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_49374341_49375496
seq2: B6Ng01-287G14.b_44_1189

seq1  GAATTCAAGTCAGAACTGACCCAAAAGCTTCAACCCCACTGGATAGCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGTCAGAACTGACCCAAAAGCTTCAACCCCACTGGATAGCTTC  50

seq1  TATAGTGTTGAAAGATGCTATACATTTAACCAGAGGAGAGACATAAGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTGTTGAAAGATGCTATACATTTAACCAGAGGAGAGACATAAGCAT  100

seq1  ACATCATACCCAGATGTGAACCCTGTAAGTTACAATAACAACTGGCCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATACCCAGATGTGAACCCTGTAAGTTACAATAACAACTGGCCCAG  150

seq1  CAAGACACACCCGATTATACAATAGAGGCATGAATGTCATGGGAGTGACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACACACCCGATTATACAATAGAGGCATGAATGTCATGGGAGTGACC  200

seq1  AATCACTTTCTGATTGGATTTAAGCTCCATTCCACAAGATGAACCCCATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTTTCTGATTGGATTTAAGCTCCATTCCACAAGATGAACCCCATA  250

seq1  TGTAGTGCTATTATTCAGACAAGAAACTGTGGCTAGGTATGTCATAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTGCTATTATTCAGACAAGAAACTGTGGCTAGGTATGTCATAGAAA  300

seq1  CTTGCAGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAACTCTGACTGCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAACTCTGACTGCTCTT  350

seq1  CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGCATCTCACAACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGCATCTCACAACTA  400

seq1  TCTGAAATGGGATCTGATGCCCCCTTATGATGTGTCTGAAGACAGCTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAATGGGATCTGATGCCCCCTTATGATGTGTCTGAAGACAGCTACA  450

seq1  TTGTACTTATATACATAAAAAATAAAAAATAATAAACATATCCTGAGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACTTATATACATAAAAAATAAAAAATAATAAACATATCCTGAGTGT  500

seq1  GTGAATGTGAAAAAAAAAGGAAACTTGCAAAGATATAGCTACTTATTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATGTGAAAAAAAAAGGAAACTTGCAAAGATATAGCTACTTATTCAA  550

seq1  GAATAGAGGCTGGCCTATGAGTGTAATTCAGTGATCAGGTATTTGCCTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGAGGCTGGCCTATGAGTGTAATTCAGTGATCAGGTATTTGCCTAG  600

seq1  CAAATGTAAGGCCTTGGGAAGAACCAAGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTAAGGCCTTGGGAAGAACCAAGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGG  650

seq1  AGAAGAAAAGGAGGAGGTAGGGGGAAAAGTAGCTATAGAAAGAGAAACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAAAAGGAGGAGGTAGGGGGAAAAGTAGCTATAGAAAGAGAAACTG  700

seq1  TGTCTCTTCCTGTATGTAAGGTACTTGAATGGATCTCCCACTATAACTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTTCCTGTATGTAAGGTACTTGAATGGATCTCCCACTATAACTCC  750

seq1  TTCCTTTCTTTTCTCTCCCTCTAAACCAGAGCATGGTTCTGGGGACAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTCTTTTCTCTCCCTCTAAACCAGAGCATGGTTCTGGGGACAGTT  800

seq1  GAGATCTTGATGTTTGGCTACAATTCTCTATATTTTGGTTGCTGGATACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTTGATGTTTGGCTACAATTCTCTATATTTTGGTTGCTGGATACT  850

seq1  CCCTAGTTGCAACCGAGGTAGATAAAAAAGAATAGAAATGCTGGATATAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGTTGCAACCGAGGTAGATAAAAAAGAATAGAAATGCTGGATATAT  900

seq1  GGAACATAAATATTAGATGCTTGCAGAAACCAGTGCAGTGTCATTAGCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GGAACATAAATATTAGATGCTTGCAGAAACCAGTGCAGTGTCATTAGCAG  950

seq1  GAGATAGCCCAAAAAACCTATCTGGAAGGCTACAGAAGAACCTCCTCCTT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAGATAGCCCAAAAAACCTATCTGGAAGGCTACAGAAGAACCTCCT-CTT  999

seq1  GTGCTTCTGAATCTTTCCAGTTCTATCCAGGGTC-TGAGAAGGCAGATGA  1049
      |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||
seq2  GTGCTTCTGAATCTTT-CAGTTCTAATCAGGGTCTTGAGAA-GCAGATGA  1047

seq1  GGAAGTTCTGTGCCATGGCTGGCTGGCTCACCAGGAAGAGGTGTCGGTCC  1099
       ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||  ||||
seq2  -GAAGTTCTGTGCCATGGCTGGCCTGCTCAACAGGAAGA---GTTCGTCC  1093

seq1  TGAGTGGTGCCATTCTTGGCTGATAACTTCTGGATGCTGCCCTCCTTGAT  1149
      ||| ||||| || |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||
seq2  TGATTGGTG-CAATCT--GCTGATACCTTCTGGATGCTG-CCTCCTGGAT  1139

seq1  CAGCTCA  1156
      |||||||
seq2  CAGCTCA  1146

seq1: chr13_49533573_49533662
seq2: B6Ng01-287G14.g_73_162 (reverse)

seq1  CCTCTTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTTTATCCCTTCCCGTCTATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTTTATCCCTTCCCGTCTATTG  50

seq1  CTTTTTAAAGACAGGGTCTAATGTAGCCTATGTTGGCTTT  90
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAAGACAGGGTCTAATGTAGCCTATGTTGGCTTT  90