seq1: chr13_49374341_49375496
seq2: B6Ng01-287G14.b_44_1189
seq1 GAATTCAAGTCAGAACTGACCCAAAAGCTTCAACCCCACTGGATAGCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAAGTCAGAACTGACCCAAAAGCTTCAACCCCACTGGATAGCTTC 50
seq1 TATAGTGTTGAAAGATGCTATACATTTAACCAGAGGAGAGACATAAGCAT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATAGTGTTGAAAGATGCTATACATTTAACCAGAGGAGAGACATAAGCAT 100
seq1 ACATCATACCCAGATGTGAACCCTGTAAGTTACAATAACAACTGGCCCAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACATCATACCCAGATGTGAACCCTGTAAGTTACAATAACAACTGGCCCAG 150
seq1 CAAGACACACCCGATTATACAATAGAGGCATGAATGTCATGGGAGTGACC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGACACACCCGATTATACAATAGAGGCATGAATGTCATGGGAGTGACC 200
seq1 AATCACTTTCTGATTGGATTTAAGCTCCATTCCACAAGATGAACCCCATA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATCACTTTCTGATTGGATTTAAGCTCCATTCCACAAGATGAACCCCATA 250
seq1 TGTAGTGCTATTATTCAGACAAGAAACTGTGGCTAGGTATGTCATAGAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTAGTGCTATTATTCAGACAAGAAACTGTGGCTAGGTATGTCATAGAAA 300
seq1 CTTGCAGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAACTCTGACTGCTCTT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGCAGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAACTCTGACTGCTCTT 350
seq1 CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGCATCTCACAACTA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGCATCTCACAACTA 400
seq1 TCTGAAATGGGATCTGATGCCCCCTTATGATGTGTCTGAAGACAGCTACA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTGAAATGGGATCTGATGCCCCCTTATGATGTGTCTGAAGACAGCTACA 450
seq1 TTGTACTTATATACATAAAAAATAAAAAATAATAAACATATCCTGAGTGT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTACTTATATACATAAAAAATAAAAAATAATAAACATATCCTGAGTGT 500
seq1 GTGAATGTGAAAAAAAAAGGAAACTTGCAAAGATATAGCTACTTATTCAA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAATGTGAAAAAAAAAGGAAACTTGCAAAGATATAGCTACTTATTCAA 550
seq1 GAATAGAGGCTGGCCTATGAGTGTAATTCAGTGATCAGGTATTTGCCTAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATAGAGGCTGGCCTATGAGTGTAATTCAGTGATCAGGTATTTGCCTAG 600
seq1 CAAATGTAAGGCCTTGGGAAGAACCAAGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAATGTAAGGCCTTGGGAAGAACCAAGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGG 650
seq1 AGAAGAAAAGGAGGAGGTAGGGGGAAAAGTAGCTATAGAAAGAGAAACTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAAGAAAAGGAGGAGGTAGGGGGAAAAGTAGCTATAGAAAGAGAAACTG 700
seq1 TGTCTCTTCCTGTATGTAAGGTACTTGAATGGATCTCCCACTATAACTCC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCTCTTCCTGTATGTAAGGTACTTGAATGGATCTCCCACTATAACTCC 750
seq1 TTCCTTTCTTTTCTCTCCCTCTAAACCAGAGCATGGTTCTGGGGACAGTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCTTTCTTTTCTCTCCCTCTAAACCAGAGCATGGTTCTGGGGACAGTT 800
seq1 GAGATCTTGATGTTTGGCTACAATTCTCTATATTTTGGTTGCTGGATACT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGATCTTGATGTTTGGCTACAATTCTCTATATTTTGGTTGCTGGATACT 850
seq1 CCCTAGTTGCAACCGAGGTAGATAAAAAAGAATAGAAATGCTGGATATAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCTAGTTGCAACCGAGGTAGATAAAAAAGAATAGAAATGCTGGATATAT 900
seq1 GGAACATAAATATTAGATGCTTGCAGAAACCAGTGCAGTGTCATTAGCAA 950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAACATAAATATTAGATGCTTGCAGAAACCAGTGCAGTGTCATTAGCAG 950
seq1 GAGATAGCCCAAAAAACCTATCTGGAAGGCTACAGAAGAACCTCCTCCTT 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2 GAGATAGCCCAAAAAACCTATCTGGAAGGCTACAGAAGAACCTCCT-CTT 999
seq1 GTGCTTCTGAATCTTTCCAGTTCTATCCAGGGTC-TGAGAAGGCAGATGA 1049
|||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||
seq2 GTGCTTCTGAATCTTT-CAGTTCTAATCAGGGTCTTGAGAA-GCAGATGA 1047
seq1 GGAAGTTCTGTGCCATGGCTGGCTGGCTCACCAGGAAGAGGTGTCGGTCC 1099
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||
seq2 -GAAGTTCTGTGCCATGGCTGGCCTGCTCAACAGGAAGA---GTTCGTCC 1093
seq1 TGAGTGGTGCCATTCTTGGCTGATAACTTCTGGATGCTGCCCTCCTTGAT 1149
||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||
seq2 TGATTGGTG-CAATCT--GCTGATACCTTCTGGATGCTG-CCTCCTGGAT 1139
seq1 CAGCTCA 1156
|||||||
seq2 CAGCTCA 1146
| seq1: chr13_49533573_49533662
seq2: B6Ng01-287G14.g_73_162 (reverse)
seq1 CCTCTTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTTTATCCCTTCCCGTCTATTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCTTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTTTATCCCTTCCCGTCTATTG 50
seq1 CTTTTTAAAGACAGGGTCTAATGTAGCCTATGTTGGCTTT 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTTTAAAGACAGGGTCTAATGTAGCCTATGTTGGCTTT 90
|