BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-287H14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 8,277,243 - 8,395,034
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdarb2
Upstream geneLOC667611, EG623516, LOC791083, LOC382722
Downstream geneEG666941, Wdr37, LOC100039632, Idi1, EG382723, LOC100039655, Idi2, Gtpbp4, LOC667721, Larp5, EG667727, LOC100039719, Dip2c
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-287H14.bB6Ng01-287H14.g
ACCGA085388GA085389
length1,154739
definitionB6Ng01-287H14.b B6Ng01-287H14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,277,243 - 8,278,410)(8,394,297 - 8,395,034)
sequence
gaattcacttgaacagaaccacagtgtctggttaaaaaaaaaatctgagt
ctcagaaggacctttctcctcacttggctaacatcacatcctggcgcttt
tgacagagaagcagaaattctgtgagatctcccaggatgacaacactgac
agccagatctgaaacaatagaatcttacacaaagggaatagcacaaaatc
cataacacgaaagccagccccatccattgcattggagatgcaaagtcaaa
gtcctacccacctcaggcaggttagtggctgtactcaggaccaaagattt
tacgataagcaaagatggtccttagacctcatggccaagggctcctccga
tttgatccacccacgtattgtgtgacattctgttgagagatgtaaacaaa
tgtcattttgtccccagatcaggatccagtaaaaccaaagtaaaaattct
atcaatgtacaacatgaagaaccaatgagcttacaagaggaatttttaca
gaatgggtgactcaaatgcatgtgtaccaccaaaaacccaccctggcaca
agtttcagacagatcaacaggtcagagagagaatctcttctcagaagcag
gccttgcggttatacaccttagagtgacgaactggtggagtttacaaatc
ttgaaaatttcaagaactccttgagacttgggagttgacttcctcctgaa
agaaatgtttcatttcaggtagaactgcttttcaacaactccgagcaaga
gtcgccaggactctcttgctctttagctatgtccttcagtcctggtattt
cctgtgttggatctgatagagtgagaaagaaacatagagatgcagaccca
gctagagcttagattgggatagagcttacctgccttctcaacactccagc
attgctttttctatcaaagcagattttgccttggctctcagcttctgaaa
ctgtacacgacactgtccatggttcatagtggtatatgtcacctcccttg
cagtcatctaggtagttttcagaaacatttcccagtggagaagatgctcc
actctatggagccatgctggagatttttcttaaagcgggctcagcattgt
atgtcaagaatgactgaagtgggacttgttatcttccggatctgtcaagc
tgaa

gaattcaccctgcactccttccctttgtcaataacaatgtttacagtttc
actgtaatcaactgtgtctgtaaacatgtcaccttaccaaagtctgttaa
tacttcaggtatctctgggcttagggtggtcaaggtgactccggcataac
caaagacctcttccctgaggtgaggactacggaacaggcttagaaactgt
gatttaaaattaaaactgttttgcagacattgtgttcatcaaggccaagg
aaagatccaaaaacacatggcatcagtggttgcaagaggaatgaaggaag
aagacttaccagagggagtagacagagaacacattaacatatgggttaca
attgaattcatagatgtcaatttaaatgtatgggagaaatagtctaagat
aagtagaggaagataagctttcgcagcagacagaagaaagagcagaggca
ggtgaaattcttatcacagaagccacagtattcaaaagaagattgaccag
ttgtcaatcaccggatacttcagtcacactatgtcaacaaggtcaagtaa
attagggacctggaaaattgccattggttagtgacagaattattttgtga
catgggctaacagttttgttaaaagaggagctaagcaccaggttgcaacg
aattgaagcatgtctggtagaaatatgaataaattgctaaagaagcctga
atctgagataatagagggaggagggaaaggggaggtatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_8277243_8278410
seq2: B6Ng01-287H14.b_46_1199

seq1  GAATTCACTTGAACAGAACCACAGTGTCTGGTTAAAAAAAAAATCTGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTGAACAGAACCACAGTGTCTGGTTAAAAAAAAAATCTGAGT  50

seq1  CTCAGAAGGACCTTTCTCCTCACTTGGCTAACATCACATCCTGGCGCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAAGGACCTTTCTCCTCACTTGGCTAACATCACATCCTGGCGCTTT  100

seq1  TGACAGAGAAGCAGAAATTCTGTGAGATCTCCCAGGATGACAACACTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGAGAAGCAGAAATTCTGTGAGATCTCCCAGGATGACAACACTGAC  150

seq1  AGCCAGATCTGAAACAATAGAATCTTACACAAAGGGAATAGCACAAAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGATCTGAAACAATAGAATCTTACACAAAGGGAATAGCACAAAATC  200

seq1  CATAACACGAAAGCCAGCCCCATCCATTGCATTGGAGATGCAAAGTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACACGAAAGCCAGCCCCATCCATTGCATTGGAGATGCAAAGTCAAA  250

seq1  GTCCTACCCACCTCAGGCAGGTTAGTGGCTGTACTCAGGACCAAAGATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTACCCACCTCAGGCAGGTTAGTGGCTGTACTCAGGACCAAAGATTT  300

seq1  TACGATAAGCAAAGATGGTCCTTAGACCTCATGGCCAAGGGCTCCTCCGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGATAAGCAAAGATGGTCCTTAGACCTCATGGCCAAGGGCTCCTCCGA  350

seq1  TTTGATCCACCCACGTATTGTGTGACATTCTGTTGAGAGATGTAAACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATCCACCCACGTATTGTGTGACATTCTGTTGAGAGATGTAAACAAA  400

seq1  TGTCATTTTGTCCCCAGATCAGGATCCAGTAAAACCAAAGTAAAAATTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTTTGTCCCCAGATCAGGATCCAGTAAAACCAAAGTAAAAATTCT  450

seq1  ATCAATGTACAACATGAAGAACCAATGAGCTTACAAGAGGAATTTTTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATGTACAACATGAAGAACCAATGAGCTTACAAGAGGAATTTTTACA  500

seq1  GAATGGGTGACTCAAATGCATGTGTACCACCAAAAACCCACCCTGGCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGGTGACTCAAATGCATGTGTACCACCAAAAACCCACCCTGGCACA  550

seq1  AGTTTCAGACAGATCAACAGGTCAGAGAGAGAATCTCTTCTCAGAAGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCAGACAGATCAACAGGTCAGAGAGAGAATCTCTTCTCAGAAGCAG  600

seq1  GCCTTGCGGTTATACACCTTAGAGTGACGAACTGGTGGAGTTTACAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCGGTTATACACCTTAGAGTGACGAACTGGTGGAGTTTACAAATC  650

seq1  TTGAAAATTTCAAGAACTCCTTGAGACTTGGGAGTTGACTTCCTCCTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATTTCAAGAACTCCTTGAGACTTGGGAGTTGACTTCCTCCTGAA  700

seq1  AGAAATGTTTCATTTCAGGTAGAACTGCTTTTCAACAACTCCGAGCAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGTTTCATTTCAGGTAGAACTGCTTTTCAACAACTCCGAGCAAGA  750

seq1  GTCGCCAGGACTCTCTTGCTCTTTAGCTATGTCCTTCAGTCCTGGTATTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCGCCAGGACTCTCTTGCTCTTTAGCTATGTCCTTCAGTCCTGGTATTT  800

seq1  CCTGTGTTGGATCTGATAGAGTGAGAAAGAAACATAGAGATGCAGACCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTTGGATCTGATAGAGTGAGAAAGAAACATAGAGATGCAGACCCA  850

seq1  GCTAGAGCTTAGATTGGGATAGAGCTTACCTGCCTTCTCAACACTCCAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGCTTAGATTGGGATAGAGCTTACCTGCCTTCTCAACACTCCAGC  900

seq1  ATTGCTTTTTCTATCAAAGCAGATTTTGCCTTGGCTCTCAGCTTCTGAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTTTTTCTATCAAAGCAGATTTTGCCTTGGCTCTCAGCTTCTGAAA  950

seq1  CTGTACAACGACACTGTCCATGGTTCATAGTGGTATATGTTCACCTCCCT  1000
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTGTAC-ACGACACTGTCCATGGTTCATAGTGGTATATG-TCACCTCCCT  998

seq1  TGCAGTCATCTAGGTAGTTTTCAGAAACATTTCCCAGTGGAGAAGATGCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTCATCTAGGTAGTTTTCAGAAACATTTCCCAGTGGAGAAGATGCT  1048

seq1  CCACTCTATTGAG-CATGCTGGAGATTTTTCTTTAAAGGAAGGGGCTCAG  1099
      ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||
seq2  CCACTCTATGGAGCCATGCTGGAGATTTTTC-TTAAAG---CGGGCTCAG  1094

seq1  CAATTTGTAATGTCAAAGATGAGCTGGACAGTGGGACTTGTTTATCTCCA  1149
      ||  |||| |||||||  |||| |||   ||||||||||| |||||| | 
seq2  CA--TTGT-ATGTCAAGAATGA-CTG--AAGTGGGACTTG-TTATCTTCC  1137

seq1  CGATCTGTACAAGGCTGAA  1168
       ||||||| ||| ||||||
seq2  GGATCTGT-CAA-GCTGAA  1154


seq1: chr13_8394297_8395034
seq2: B6Ng01-287H14.g_64_802 (reverse)

seq1  CATACCT-CCCTTTCCCTCCTCCCTCTATTATCTCAGATTCAGGCTTCTT  49
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCTCCCCTTTCCCTCCTCCCTCTATTATCTCAGATTCAGGCTTCTT  50

seq1  TAGCAATTTATTCATATTTCTACCAGACATGCTTCAATTCGTTGCAACCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAATTTATTCATATTTCTACCAGACATGCTTCAATTCGTTGCAACCT  100

seq1  GGTGCTTAGCTCCTCTTTTAACAAAACTGTTAGCCCATGTCACAAAATAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTTAGCTCCTCTTTTAACAAAACTGTTAGCCCATGTCACAAAATAA  150

seq1  TTCTGTCACTAACCAATGGCAATTTTCCAGGTCCCTAATTTACTTGACCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCACTAACCAATGGCAATTTTCCAGGTCCCTAATTTACTTGACCT  200

seq1  TGTTGACATAGTGTGACTGAAGTATCCGGTGATTGACAACTGGTCAATCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGACATAGTGTGACTGAAGTATCCGGTGATTGACAACTGGTCAATCT  250

seq1  TCTTTTGAATACTGTGGCTTCTGTGATAAGAATTTCACCTGCCTCTGCTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTGAATACTGTGGCTTCTGTGATAAGAATTTCACCTGCCTCTGCTC  300

seq1  TTTCTTCTGTCTGCTGCGAAAGCTTATCTTCCTCTACTTATCTTAGACTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTGTCTGCTGCGAAAGCTTATCTTCCTCTACTTATCTTAGACTA  350

seq1  TTTCTCCCATACATTTAAATTGACATCTATGAATTCAATTGTAACCCATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCCATACATTTAAATTGACATCTATGAATTCAATTGTAACCCATA  400

seq1  TGTTAATGTGTTCTCTGTCTACTCCCTCTGGTAAGTCTTCTTCCTTCATT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATGTGTTCTCTGTCTACTCCCTCTGGTAAGTCTTCTTCCTTCATT  450

seq1  CCTCTTGCAACCACTGATGCCATGTGTTTTTGGATCTTTCCTTGGCCTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTGCAACCACTGATGCCATGTGTTTTTGGATCTTTCCTTGGCCTTG  500

seq1  ATGAACACAATGTCTGCAAAACAGTTTTAATTTTAAATCACAGTTTCTAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACACAATGTCTGCAAAACAGTTTTAATTTTAAATCACAGTTTCTAA  550

seq1  GCCTGTTCCGTAGTCCTCACCTCAGGGAAGAGGTCTTTGGTTATGCCGGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTTCCGTAGTCCTCACCTCAGGGAAGAGGTCTTTGGTTATGCCGGA  600

seq1  GTCACCTTGACCACCCTAAGCCCAGAGATACCTGAAGTATTAACAGACTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTTGACCACCCTAAGCCCAGAGATACCTGAAGTATTAACAGACTT  650

seq1  TGGTAAGGTGACATGTTTACAGACACAGTTGATTACAGTGAAACTGTAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAGGTGACATGTTTACAGACACAGTTGATTACAGTGAAACTGTAAA  700

seq1  CATTGTTATTGACAAAGGGAAGGAGTGCAGGGTGAATTC  738
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTATTGACAAAGGGAAGGAGTGCAGGGTGAATTC  739


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |