BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-300O10
Chromosome13 (Build37)
Map Location 95,634,173 - 95,635,075
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneArsb, Cycs-ps3, Lhfpl2, Scamp1, LOC435378, ENSMUSG00000042857, Ap3b1, Tbca
Downstream geneOtp, Wdr41, Pde8b, Zbed3, Aggf1, Crhbp, S100z, F2rl1, F2r, Iqgap2, F2rl2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-300O10.bB6Ng01-300O10.g
ACCGA095355GA095356
length899829
definitionB6Ng01-300O10.b B6Ng01-300O10.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccacaggcttgcttcccatctcagaaggactgccctttctttgtt
ggtctttagtgaagattcaaagctgtctcctaatccttatttaatctctt
ggcacgttatatagattttacttgttttactcagcccagctctctctctg
atgaagtcctctgcatactagctcaatctctcagagaatgcatttgctaa
aattcaacagctttgctgttattactggaattttgttatatagtatcatg
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tccctcctctccctcctctccctcctcctcttcttcctcttctcttgctc
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ttccattagacctcctgccctgatgaagacagtcaggaaaccgtgtcctt
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tctctaaaatatttcatccagtatactttactcatattctttcctcttcc
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tctctctctctctctctcacagacaaaacaacaacagaacatggagtcca
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ctgatattctcattcccagtgcactggggggaactaatttttcctttcct
ggcagctatcagttgtgaataccttcctaggaaaggtatttttgtgtcca
caccccgccccccgccctgtgctgacattttgtctggattgagcttgtgt
gggtgttgtacaagatgtcccaggctctgagttcctatgtccatcttcca
gttatgtctggaaggcattctttccttaaagttatctacacctctgactc
ttcagatctctctgcctccttttcagtagagacttgagtcatgagtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_95634173_95635075
seq2: B6Ng01-300O10.b_49_947

seq1  GAATTCCACAGGCTTGCTTCCCATCTCAGAAGGACTGCCCTTTCTTTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTTAGTGAAGATTCAAAGCTGTCTCCTAATCCTTATTTAATCTCTT  100

seq1  GGCACGTTATATAGATTTTACTTGTTTTACTCAGCCCAGCTCTCTCTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACGTTATATAGATTTTACTTGTTTTACTCAGCCCAGCTCTCTCTCTG  150

seq1  ATGAAGTCCTCTGCATACTAGCTCAATCTCTCAGAGAATGCATTTGCTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGTCCTCTGCATACTAGCTCAATCTCTCAGAGAATGCATTTGCTAA  200

seq1  AATTCAACAGCTTTGCTGTTATTACTGGAATTTTGTTATATAGTATCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GGATTTTTTTTCCTTTGGTTTGGGAATGTGGCCCTTAAGCTACAACTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTTTTTCCTTTGGTTTGGGAATGTGGCCCTTAAGCTACAACTGTT  300

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCTCTCCCTCCTCTCCCTCCTCCTCTTCTTCCTCTTCTCTTGCTC  400

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CCTCTTATATATCATTCTTGTCTCTGTTATGATATCACTTCCAGGATCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGACTACGCTTTCTCTGAGCTACTGTCTTAGGCACATCATAGTCACATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTACGCTTTCTCTGAGCTACTGTCTTAGGCACATCATAGTCACATTT  750

seq1  ACCTCTCCATTGTCTGGTTTTGTCAGCTATGTGAGCATGATCATAAGATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCCATTGTCTGGTTTTGTCAGCTATGTGAGCATGATCATAAGATC  800

seq1  ATATCTACAGGCTCAAGTCCCATGCTTGGCTCATAGCCAGTGCACAATAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTACAGGCTCAAGTCCCATGCTTGGCTCATAGCCAGTGCACAATAC  850

seq1  AAATTTAATAAGTGGATACATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATG  900
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  -AATTTAATAAGTGGATACATGGATGGATGGATGGATGGATG---GGATG  896

seq1  GAT  903
      |||
seq2  GAT  899