BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-311N18
Chromosome13 (Build37)
Map Location 95,405,410 - 95,537,454
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBhmt, Bhmt2, Dmgdh, Arsb, Cycs-ps3, Lhfpl2, Scamp1, LOC435378, ENSMUSG00000042857, Ap3b1
Downstream geneTbca, Otp, Wdr41, Pde8b, Zbed3, Aggf1, Crhbp, S100z, F2rl1, F2r, Iqgap2, F2rl2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-311N18.bB6Ng01-311N18.g
ACCGA103473GA103474
length1,118899
definitionB6Ng01-311N18.b B6Ng01-311N18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,405,410 - 95,406,524)(95,536,556 - 95,537,454)
sequence
gaattctcttattgagaaataaatcattaaccaagctatttctaagttcg
atttgaaaggcttgaatatgtcattaatatatttccccctgtactttctc
ttgattaaggtgcccgtgtctcagggctgctttccctctgactctgactc
ttggctattctagctctcagttcttttcccctggctccctgctgtagtgt
cataacaggaccctccctcagaagaaggagggagatttagagtgtcagtc
ctatccctttgcgtggtattgctaaacattggagacttgcaggagaagtc
cgtgaaagctgcattccccctctcagtgacatgaccaaggaaatgaacat
aggcaaggaattcatttccacagtcttccacaaacatctcatgattcgaa
ataccttgacatttctctcaccaacagtaatcccattcccttcctctcac
ataggggctgaccttagagactcactcacataagcaggatgcaatagaaa
caccctgcatggcttctgagttaggctcaaaaacatagcacaggctgcta
gagaaacctaagcaccaatgctgcgaggaagcccagccacgcagagaggc
agtgtggagatattttagctgccgctctagcagaggtaagggccagcagc
caacgctgatataccatacctagggaatcaagtcagtgaaccctagacat
gggccatttcgtcactctctgtctgcaatcaggccaagcaaggatgaccc
ccaacgacacaataacaaaatgattgtgtctggtttgagacaccaagatt
tgaagaggagctgagattactcaaagagcagcagagtgtctgtgtttggt
tcttcgctatataaaagggttccttggtactgctccctctgttagctgtc
ctcgctcctcatctcagatacaaggtaaagacttggctgcaggtcctaga
gtgaaaagtgatcacaggaagcaggggagaataaagtgaaattgtgaagg
aaaagaagccaatatctgctgcaaataaattgcttactagaattggccag
ctgctgcctctgagcaactggtgggacctctgaagaatatttagggtgtg
cctagaacaagggcatca
gaattcacactgcaagtcgtcaccaacagtcacaagttgctggatactca
cagagctcattacctactccttagccctaactttgtttttgaggtctaag
gacacgaaagagtgaacatcaatcaatgggtttgatgtcatgctgggagt
tcatgaaggaaagagaaggagtaggttgcggaaggaaatgaaaggtagaa
atgagccaaaggagccaaaggatcttcaggcaggaagagccgggtgaatt
aggcgtgatcaatggcttttcaggtttggggagcgaggagtggagagtta
gcatgtataaataaatacaggactggtttgctctgctccacaagcttcca
gaagcatttctgttcacatctcataagcacaacttggttccatcattgca
ccaagctacaaagagggaatatggagcctctagccgggctacagggagcc
ccattaacagtccagagcatccctttgccagctatctatccttcctatca
cctagtattacactctcttggtcacctttctagattttgagactgccgat
gtaaagggaataatagataactatctattattctggagccattttgaatg
accctggccccggagaacatagatttagcttaccccaaattccttgttcc
agcgaggaggtggttgtgtgaagtttttatagttttacaaaagagagaaa
gtcataatcaaggcaaagtttaaagtacatcagtgggtacctcagagagg
caggtagaccaagatgggggctatcctataggcttaaggcacccatctga
tgccattccctgcttttggattggtagatgctagttacctgctaagtcag
tagggttttttgttctgttttgttttgtattttggtttttcgagacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_95405410_95406524
seq2: B6Ng01-311N18.b_46_1163

seq1  GAATTCTCTTATTGAGAAATAAATCATTAACCAAGCTATTTCTAAGTTCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTATTGAGAAATAAATCATTAACCAAGCTATTTCTAAGTTCG  50

seq1  ATTTGAAAGGCTTGAATATGTCATTAATATATTTCCCCCTGTACTTTCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAAAGGCTTGAATATGTCATTAATATATTTCCCCCTGTACTTTCTC  100

seq1  TTGATTAAGGTGCCCGTGTCTCAGGGCTGCTTTCCCTCTGACTCTGACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTAAGGTGCCCGTGTCTCAGGGCTGCTTTCCCTCTGACTCTGACTC  150

seq1  TTGGCTATTCTAGCTCTCAGTTCTTTTCCCCTGGCTCCCTGCTGTAGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTATTCTAGCTCTCAGTTCTTTTCCCCTGGCTCCCTGCTGTAGTGT  200

seq1  CATAACAGGACCCTCCCTCAGAAGAAGGAGGGAGATTTAGAGTGTCAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACAGGACCCTCCCTCAGAAGAAGGAGGGAGATTTAGAGTGTCAGTC  250

seq1  CTATCCCTTTGCGTGGTATTGCTAAACATTGGAGACTTGCAGGAGAAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCCTTTGCGTGGTATTGCTAAACATTGGAGACTTGCAGGAGAAGTC  300

seq1  CGTGAAAGCTGCATTCCCCCTCTCAGTGACATGACCAAGGAAATGAACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAAAGCTGCATTCCCCCTCTCAGTGACATGACCAAGGAAATGAACAT  350

seq1  AGGCAAGGAATTCATTTCCACAGTCTTCCACAAACATCTCATGATTCGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGGAATTCATTTCCACAGTCTTCCACAAACATCTCATGATTCGAA  400

seq1  ATACCTTGACATTTCTCTCACCAACAGTAATCCCATTCCCTTCCTCTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTTGACATTTCTCTCACCAACAGTAATCCCATTCCCTTCCTCTCAC  450

seq1  ATAGGGGCTGACCTTAGAGACTCACTCACATAAGCAGGATGCAATAGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGGCTGACCTTAGAGACTCACTCACATAAGCAGGATGCAATAGAAA  500

seq1  CACCCTGCATGGCTTCTGAGTTAGGCTCAAAAACATAGCACAGGCTGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGCATGGCTTCTGAGTTAGGCTCAAAAACATAGCACAGGCTGCTA  550

seq1  GAGAAACCTAAGCACCAATGCTGCGAGGAAGCCCAGCCACGCAGAGAGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACCTAAGCACCAATGCTGCGAGGAAGCCCAGCCACGCAGAGAGGC  600

seq1  AGTGTGGAGATATTTTAGCTGCCGCTCTAGCAGAGGTAAGGGCCAGCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGGAGATATTTTAGCTGCCGCTCTAGCAGAGGTAAGGGCCAGCAGC  650

seq1  CAACGCTGATATACCATACCTAGGGAATCAAGTCAGTGAACCCTAGACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGCTGATATACCATACCTAGGGAATCAAGTCAGTGAACCCTAGACAT  700

seq1  GGGCCATTTCGTCACTCTCTGTCTGCAATCAGGCCAAGCAAGGATGACCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATTTCGTCACTCTCTGTCTGCAATCAGGCCAAGCAAGGATGACCC  750

seq1  CCAACGACACAATAACAAAATGATTGTGTCTGGTTTGAGACACCAAGATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACGACACAATAACAAAATGATTGTGTCTGGTTTGAGACACCAAGATT  800

seq1  TGAAGAGGAGCTGAGATTACTCAAAGAGCAGGCAGAGTGTCTGTGTTTGG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGGAGCTGAGATTACTCAAAGAGCA-GCAGAGTGTCTGTGTTTGG  849

seq1  TTCTTCGCTATATAAAAGGGTTCCTTGGTACTGCTCCCTCTGTTAGCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCGCTATATAAAAGGGTTCCTTGGTACTGCTCCCTCTGTTAGCTGT  899

seq1  CCTCGCTCCTCATCTCAGATACAAGGTAAAGACTTGGCTGCAGGTCCTAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGCTCCTCATCTCAGATACAAGGTAAAGACTTGGCTGCAGGTCCTAG  949

seq1  AGTGGAAAAGTGATCACAGGAAGCAGGGGAG-ATAAAGTGAAATTGTGAA  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGT-GAAAAGTGATCACAGGAAGCAGGGGAGAATAAAGTGAAATTGTGAA  998

seq1  GG-AAAGAAGCCAATATCTGCTTGCAAATAAATTGCTTACTAGAA-TGGG  1047
      || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| 
seq2  GGAAAAGAAGCCAATATCTGC-TGCAAATAAATTGCTTACTAGAATTGGC  1047

seq1  CAGCTGCTG-CTCTGAGCCACT-GTGGG-CCTCTGAGGGATA-TTAGGGT  1093
      ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | ||| |||||||
seq2  CAGCTGCTGCCTCTGAGCAACTGGTGGGACCTCTGAAGAATATTTAGGGT  1097

seq1  GTGCCTTAGAACAAGGGCATCA  1115
      ||||| ||||||||||||||||
seq2  GTGCC-TAGAACAAGGGCATCA  1118

seq1: chr13_95536556_95537454
seq2: B6Ng01-311N18.g_68_966 (reverse)

seq1  CCTGTCTCGAAAAACCAAAATACAAAACAAAACAGAACAAAAAACCCTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCTCGAAAAACCAAAATACAAAACAAAACAGAACAAAAAACCCTAC  50

seq1  TGACTTAGCAGGTAACTAGCATCTACCAATCCAAAAGCAGGGAATGGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTAGCAGGTAACTAGCATCTACCAATCCAAAAGCAGGGAATGGCAT  100

seq1  CAGATGGGTGCCTTAAGCCTATAGGATAGCCCCCATCTTGGTCTACCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGGTGCCTTAAGCCTATAGGATAGCCCCCATCTTGGTCTACCTGC  150

seq1  CTCTCTGAGGTACCCACTGATGTACTTTAAACTTTGCCTTGATTATGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGAGGTACCCACTGATGTACTTTAAACTTTGCCTTGATTATGACT  200

seq1  TTCTCTCTTTTGTAAAACTATAAAAACTTCACACAACCACCTCCTCGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTTTTGTAAAACTATAAAAACTTCACACAACCACCTCCTCGCTG  250

seq1  GAACAAGGAATTTGGGGTAAGCTAAATCTATGTTCTCCGGGGCCAGGGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGGAATTTGGGGTAAGCTAAATCTATGTTCTCCGGGGCCAGGGTC  300

seq1  ATTCAAAATGGCTCCAGAATAATAGATAGTTATCTATTATTCCCTTTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAAATGGCTCCAGAATAATAGATAGTTATCTATTATTCCCTTTACA  350

seq1  TCGGCAGTCTCAAAATCTAGAAAGGTGACCAAGAGAGTGTAATACTAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCAGTCTCAAAATCTAGAAAGGTGACCAAGAGAGTGTAATACTAGGT  400

seq1  GATAGGAAGGATAGATAGCTGGCAAAGGGATGCTCTGGACTGTTAATGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGAAGGATAGATAGCTGGCAAAGGGATGCTCTGGACTGTTAATGGG  450

seq1  GCTCCCTGTAGCCCGGCTAGAGGCTCCATATTCCCTCTTTGTAGCTTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTGTAGCCCGGCTAGAGGCTCCATATTCCCTCTTTGTAGCTTGGT  500

seq1  GCAATGATGGAACCAAGTTGTGCTTATGAGATGTGAACAGAAATGCTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGATGGAACCAAGTTGTGCTTATGAGATGTGAACAGAAATGCTTCT  550

seq1  GGAAGCTTGTGGAGCAGAGCAAACCAGTCCTGTATTTATTTATACATGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTTGTGGAGCAGAGCAAACCAGTCCTGTATTTATTTATACATGCT  600

seq1  AACTCTCCACTCCTCGCTCCCCAAACCTGAAAAGCCATTGATCACGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCCACTCCTCGCTCCCCAAACCTGAAAAGCCATTGATCACGCCTA  650

seq1  ATTCACCCGGCTCTTCCTGCCTGAAGATCCTTTGGCTCCTTTGGCTCATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACCCGGCTCTTCCTGCCTGAAGATCCTTTGGCTCCTTTGGCTCATT  700

seq1  TCTACCTTTCATTTCCTTCCGCAACCTACTCCTTCTCTTTCCTTCATGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCTTTCATTTCCTTCCGCAACCTACTCCTTCTCTTTCCTTCATGAA  750

seq1  CTCCCAGCATGACATCAAACCCATTGATTGATGTTCACTCTTTCGTGTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGCATGACATCAAACCCATTGATTGATGTTCACTCTTTCGTGTCC  800

seq1  TTAGACCTCAAAAACAAAGTTAGGGCTAAGGAGTAGGTAATGAGCTCTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACCTCAAAAACAAAGTTAGGGCTAAGGAGTAGGTAATGAGCTCTGT  850

seq1  GAGTATCCAGCAACTTGTGACTGTTGGTGACGACTTGCAGTGTGAATTC  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATCCAGCAACTTGTGACTGTTGGTGACGACTTGCAGTGTGAATTC  899