BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050H20.T7 (MSMg01no050_h20.b1) | MSMg01-050H20.TJ (MSMg01no050_h20.g1) |
ACC | AG279555 | AG279556 |
length | 1,150 | 1,233 |
length of high quality (start - end) | 542 (130 - 671) | 650 (76 - 725) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_h20.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_h20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_h20.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_h20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:53 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTCTTNNGNNNCCACTGGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTTTGTTTAGCTTTGAGCCATTTATACCCCCGGGGNNANNNGA
NNNNCNGGAGGGNACCTTTTTAAGTTCTTTATATATATATTGGATATTAG
TCCCCTATCTGATTTGGGATAGGTAAAGATCCTTTCCGAATCTGCTGGTG
GCCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAG
TTTCATGAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTG
CTGTTCTATTCAGGAATTTTTCCCATGTGCCCATATGTTTGAGGCTTTTC
CCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCATTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTC
CTTTTTTTTTTTAGATNTGACCTTAGCACAAGGAGATAGGAATGGATCAC
TTCCAATTCTTCTACATGATAACCGCCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTG
AAAATGCTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTTGAAGAT
CAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTTTTCC
ATTGGTTTACTTGTCTGTCCCTATACCAGTACCATGCAATTTTTATCACA
ATTGCTCTGTAGTAAAGCTTTAGATCCGGCCTGGCGATTCCACCAGATGT
TCTTTTATCCCTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCC
CGATGAATCCGCAGATTGCTCTTCCTAATTCTTTGATTAATTGAGTTGGA
ATTTTTGATGGAGATTGCCTTGAATCTGTAGATTGCCTTTTGGCAAGAAC
CCCATTTTTACAATCTTGATCCTGCCCATCCATGAACTTGGCAGAACTTT
CCCTCCTCTGAAATCCTCTTTAATTTCCTCCTCCAAAAATTTGAGTTCCT
TACATACCGATCTTTTCCCTCCCTTATTAAAGTATCCCCCACAATTTTCC
ATTATTTGGGACATATTGAAAGGGCGTTGTTTCCCTATTTTCTTTTCCAC
CCTGTTATTCCTTTGGTATAAAAACGCCTTTGACTTGTTTGGACTTATAT
TTTATTCCGGTTAACTTCCCCAAATCGTGTTTTCAGGTCTTAGAATTCTC
| TTCNNTNNAAGATTGGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAAGGTTTTGAATTAAGGATGAAGA
ATATGATGTGTTGACTCCTAGCTCTTGAATGTAGACACTATCCTCATATT
ATTCACGTTGCTTCTCTGGTGGTAGAGTCTGCAGGCTTTATTCCATTGTA
ATCTTGTCCCTGGATTTCCTTGTTATTAGAGTGCTTTAAACTTGGTACGC
TGAAATTAGTGCTTAAGATGTGGCTAAAGTGAAGTTAATACATGTACTAG
AGAGTTACCCTTGACCAGGTGGACAGATCTTTACTCCTTACCTCAAAACA
TTCCCAGATCTCCCCATTATCTCTTGGCCAAAGTTTAAACTTGACAGTGT
AGAGGAAAAAAAAAAAAACTCAGACAAACATGCCCTCAGTCATGAACCCT
CAGGGTTTGTTTTGTTACCCATCTCCCTCCTATTTTGTGTCATTTTCATC
CCTTTTTCTCTCTCTTTTTTTCTTCTTCAAGTTTTGTTCACTTACAAAGA
ATTAAGTTTCATTATGGCATTTCTCACACAGAATTTGTCTTGCCCGGTGT
ACTGTCTTCTCACATCTGACTCTTTGAACCTCTCAGTATCTTTTGGTCCA
CTCTCCTTGCTTTCTACCTGGACTTGCAGTGCATACCTTTCCAAATCTGA
GGGAGCAATTGTCTCTTCCTTTGCTTTAGGCTTGGGCTTCTTCTCACTCC
CATGCCTCCTCACGCTTCTCTGTCCAGTGTGTATCACCACATATTTTAGA
CCCCCCCTTTCCTATCATGCAGTTGTTGTTAACCATGTCTAGAGCACAGA
ACTGAACACTTTGAGAAAGGTTTTATTATGACTTCCGGGTTCCTATGAAA
AAGAACAAGAATTGCCCTATGTTAAGTTTTTCAGGAAACCACAGGACCCA
ACTTTTAAATTATACCAATTCCCTGGCAAGGGTTTTTTGAAAAGCTCTAA
TTTTAATTCCCTTTTGTTTTGGAATTATTTTCTGGCCCAAACACATACTT
TGATTCCTGAAAAACCTTAGGGGGGAAAACCTAATCCTACCCCCCCCTTT
TTTTTAATTAAAAAGATTTGAATTCCGTTTTGGATTCAAATTTATAACCC
GGGTGTGAACTCCATTCTGACATTTATATGGGCCATTGGGCCTCGTGCCC
TCTATATATTTTATCTATAATCAAGCTCTTTAT
|
quality values | Open.Hide.12 15 10 10 13 3 0 0 3 0 0 0 3 6 6 6 9 10 10 14 13 13 10 8 8 8 8 8 15 10 10 9 9 10 10 9 15 17 30 33 33 36 36 36 36 50 39 39 43 37
37 40 40 47 47 44 57 48 47 36 36 36 35 31 31 28 30 28 37 23 23 16 9 9 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 10 8 9 9 9 10 17 3 0 0 3 0 0 0 3 3
0 0 0 0 3 0 3 17 14 7 7 3 0 3 7 7 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 13 13 10 16 21 32 36 53 53 53 53 53 53 53 53 57 53 50 50 50 53 47 47 47
43 48 48 40 42 47 47 47 47 68 68 68 68 59 59 54 54 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 44 34 22 17 17 17 22 26 32 40 47 47 47 57 57 48
48 48 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 43 43 35 35 43 59
59 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 57 57 48 40 35 20 20 13 18 18 28 28 42 36 33 26 26 44 44 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 48 54 54 59 59 59 48 48 48 59 59 48 48 37 43 37 37 37 41 37 59 59 59 48 47 47 59 59
27 27 11 12 13 24 31 41 36 27 19 12 11 9 23 3 0 3 27 27 59 59 59 33 27 27 27 30 28 30 48 32 32 28 30 30 37 43 43 43 28 23 23 34 34 43 32 23 15 12
12 12 12 21 24 31 37 39 43 43 43 39 36 44 41 43 57 57 68 68 57 57 47 57 57 57 48 48 48 57 57 68 59 59 57 54 54 54 54 37 37 28 28 28 41 27 20 20 34 34
59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 44 44 52 52 52 43 43 29 35 43 43 31 31 35 43 43 43 35 35 43 44 50 57 52 52 27 27 11 12 12 27 27 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 57 41 38 20 23 23 38 38 12 12 11 26 26 59 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 38 38 19 32 32 50 50 68 59 59 59
59 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 42 30 32 32 36 43 43 43 50 57 48 47 47 47 47 48 57 48 44 42 35 27 24 24 32 35 48 38 57 39 36 30 25
28 30 44 42 48 48 57 57 46 27 24 10 10 10 27 27 57 32 34 18 17 11 23 21 17 14 11 11 19 23 29 32 11 11 11 12 12 22 25 28 25 30 28 33 28 27 25 21 19 25
34 34 37 37 37 37 27 23 9 9 10 15 21 15 37 37 36 36 36 43 43 57 57 57 57 50 50 43 43 42 42 39 39 43 43 46 57 48 48 48 33 30 31 25 22 20 24 15 10 9
9 10 17 19 19 17 15 15 24 22 28 23 19 10 13 8 8 8 8 9 9 18 10 10 10 10 10 9 9 10 11 11 17 11 11 10 12 16 14 19 23 27 30 37 37 37 39 29 17 17
13 15 12 14 16 18 23 19 19 10 10 10 9 10 16 13 10 9 9 9 10 11 26 26 22 15 18 12 23 11 11 11 17 15 13 9 9 9 14 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8
8 13 9 9 10 17 17 19 10 10 9 10 10 9 11 13 15 12 12 22 18 19 19 11 8 10 9 12 11 13 8 8 8 11 8 9 12 10 12 8 10 13 8 8 8 8 10 10 11 9
10 11 9 10 10 16 9 10 19 13 12 12 13 17 11 9 9 10 10 12 19 14 13 11 9 8 8 8 8 8 9 12 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 10 8
9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 19 14 8 9 9 10 12 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 14 10 15 15 8 8 8 8 8 14 15 23 30 18 12 11
10 10 10 13 19 19 11 11 10 9 10 8 6 6 6 7 7 10 10 10 10 10 9 9 9 16 13 16 15 15 15 12 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 11 13 10 8
8 8 8 8 8 8 11 16 11 12 12 8 15 8 9 13 12 8 8 8 10 10 10 10 10 10 12 12 12 10 10 9 10 10 10 10 11 11 18 12 13 10 12 12 10 11 7 7 6 10
15 12 8 8 8 8 11 8 7 7 9 10 10 9 9 12 12 12 15 16 14 15 9 10 8 8 8 8 8 11 8 10 10 11 11 6 6 6 6 6 8 8 8 6 9 8 10 10 10 10
| Open.Hide. 7 8 3 0 0 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 13 7 8 8 6 8 10 9 17 17 15 8 9 10 22 21 30 24 24 35 35 35 35
35 37 36 37 37 37 42 43 53 53 53 53 53 48 48 48 42 42 34 23 12 16 16 15 17 16 16 11 22 24 43 43 48 48 54 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 48 48 37 37 42 37 41 41 28 29 24 50 28 30 36 36 46 57 57 57 68 57 57 57 43 43 37 36 41 50 50 50 50 57 57 50 50 50 51 51 51
51 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 57 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 47 47 59
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 14 14 23 39 44
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 59 59 43 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 45 45 43 43 35 35 35 43 47 59 59 43 45 45 43 43 52 62 43 43 43 62 62 52 62 62 62 62 52 52 52 43 43
62 39 39 31 44 44 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 43 43 62 44 44 39 39 31 44 44 59
59 59 68 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 43 44 23 23 23 44 43 57 57 59 59 57 52 52 57 43 43 33 43 44 57 57 57
57 57 57 52 52 52 52 38 38 33 33 33 44 44 57 52 57 52 38 38 38 43 43 38 36 28 28 28 43 41 43 43 57 57 57 57 48 48 47 57 57 42 42 32 32 27 32 32 43 43
43 44 44 44 44 39 42 47 46 46 37 36 23 25 25 36 36 42 39 43 43 47 40 44 30 28 28 40 40 42 39 32 27 23 15 14 26 26 43 59 59 57 47 47 39 43 43 43 43 43
48 48 47 34 37 28 28 30 37 34 41 59 59 34 34 23 20 17 30 30 26 16 24 21 21 15 15 15 16 13 13 18 27 34 43 40 46 46 41 37 37 22 22 20 28 28 30 34 34 28
34 22 22 10 11 11 19 19 32 37 32 35 30 37 37 48 43 29 28 19 15 13 19 16 10 8 8 9 12 10 15 14 17 16 28 19 16 22 16 18 12 17 7 7 7 10 17 28 33 33
37 21 28 22 20 15 16 13 11 15 12 11 10 11 11 19 26 21 28 24 27 28 30 31 24 25 15 10 10 10 13 18 24 37 37 28 28 28 34 27 20 16 16 10 10 11 11 7 7 9
13 10 18 18 24 12 12 11 11 11 10 15 21 21 13 9 9 9 9 14 12 22 23 13 10 8 8 8 13 12 9 8 8 8 8 8 11 10 10 16 10 12 13 10 10 10 10 8 8 8
8 8 9 10 10 10 8 8 8 15 11 9 12 8 8 10 13 13 15 18 18 18 18 17 21 15 15 12 18 21 17 15 13 10 10 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
9 12 10 8 8 8 10 8 8 8 8 13 14 14 18 9 12 12 10 10 8 10 10 13 9 9 7 7 8 8 14 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 6 8 7 7 8 8 10
12 10 11 15 17 21 15 15 10 11 9 10 10 9 9 10 17 11 8 8 8 12 10 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 15 28 15 20 17 13 9 8 10 8 8 10 13 13 19
21 30 29 21 15 9 9 9 11 11 12 11 11 10 9 7 8 8 11 10 14 18 18 8 10 8 8 8 8 14 7 7 7 8 8 9 11 11 10 8 7 7 6 6 6 6 6 8 8 8
8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 15 11 16 10 13 10 8 8 8 14 23 27 14 12 11 15 12 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 19 15 16 25 18 25 11
11 15 15 16 13 12 9 9 9 9 9 9 9 8 6 6 7 6 8 8 9 8 8 10 10 10 10 11 14 13 11 14 14 15 15 15 19 10 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 6 6
6 6 7 6 6 6 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 9 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 6 6 8 9 9 10 8 6 6 8 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 7 7
9 9 7 10 8 8 10 8 8 8 8 7 7 9 9 7 7 7 8 8 8 6 6 6 6 9 11 12 11 8 8 8 8 |