BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-056F19.T7 (MSMg01no056_f19.b1) | MSMg01-056F19.TJ (MSMg01no056_f19.g1) |
ACC | AG283790 | AG283791 |
length | 717 | 744 |
length of high quality (start - end) | 286 (73 - 358) | 214 (69 - 282) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_f19.b1 PHD_FILE: MSMg01no056_f19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_f19.g1 PHD_FILE: MSMg01no056_f19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCACTAGATGTCCCGGAACAAGAAACATCTCTACAGCATTTATATTAATT
TCTACTCTAGATGTATGTGATACCATTTTCTACATATTCAAATTGATACA
GGAATTTAAAGACTCTTCATTTCATATTTCCTATGCCATAGGTTTGTGAT
GCCTTGCGGTTAAACATAGAAACTCTGCTGCGCACTCTTGTATGTTGAGC
ACAGATCTTTGGAGTCACAGGAATACTTCAGGAAATTCTATTATTCATAC
TTTTTAAGGTAATAGCAAATTGCTGTCAGGTGCCTTAGGTGAGAGTCACT
CAGAGGGATATTTCTCAGGCACACACCCCTACAGCCTGACGCTTCTCAGT
CTCCAGGGTCATGTCCACAGGGATGGGTTGATTCCCAGGAATCCTGGAGA
CACTATAATTCAGCATGCTCAAATCCTTTATGCATAGACCATGCAGGAGC
TGCATGCGAGGTACACATGTTCTCCCTTGACATTAGTTCACGTCCAGGGT
ACTGCAACGTTCAACCGTACACAATGCCATGTGAAGTGTCTCTAGGCTGT
ACTGTTCGGCGAGTGTCGATAAGAGGAGCAGCCCGCATCTGTTCAGTAAA
GATACCATTTTCTCCACATACTCTGAAAGCACAGTGTATGATCTCTCATA
CGCACATTCCTATTCTG
| TAATGTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTCCAGAAATTCAAGGCCTGAGGCTGGAGAGATGACTCAGCTA
GTTAAGAGCACTGGATATTCTTCTAGAGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCA
ACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGTATCTGATGCCCTCTCCC
TGCATGCACACAGAACACTGTGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATA
TATATATATATATATATATATATATATGAGTATATACATATACATATATA
CACACATAATGTGTATCTTTTTTTCTTCACATACATACATACATACTCTC
ATAAATTTTTTTTTTTCCCCCCCCACCCCCCCATTTATCGAGCTATAATA
TTCTATTATATTACCCCTCCCCCCATAAAAAAAAATAATAAGGGCGGGGG
AGAGACCATTGGCCCACCTCCAATATCCATACTTAACACCTATCTTTTAT
CTCCCATTACTCCACAGTTCCCCCTCTACCTTTTATTATTCCCTCATCAA
CTCTACATATACTCACATACTTTACTACTACCTCTATCTCTTTTCTATCA
ACACTTTACTTTTTACCTTCCATCTATCTTCCCTATTCTCCCTTCCCTCT
CTCTTTATTCCCCTCTATTATTTCCTTATTTTCCATTATCCTCTATTCTC
TTTTCCCCACCTTTTCTACCCTTTCCCCCCCTCCTACCCCCGCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 10 14 20 28 28 23 19 15 12 12 17 10 11 11 21 21 33 33 48 26 22 11 11 10 22 8 11 11 13 11 11 11 13 13 15 21 21 24 26 37 37 39 38 38 36 36
31 31 31 28 28 30 21 21 11 11 12 11 11 9 9 9 16 21 15 10 10 10 20 20 37 33 33 31 31 44 53 36 36 36 36 36 36 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 44 42 32 42 32 42 31 42 37 24 23 11 11 13 15 32 32 47 50 57 68 68 50 50 47 47 47 50 50 50 48 47 47 42 42 47 47 47 48 48 47 47
47 41 50 50 50 50 50 57 57 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 68 68 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 47 57 57 57
57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 54 57 54 57 57
57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 44 57 57 57 50 48 48 50 50 50 50 50 50 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59
59 59 57 57 57 57 41 43 43 48 48 48 48 43 43 31 31 20 19 24 24 17 17 18 24 21 30 25 37 37 35 35 39 42 40 40 30 33 33 37 37 39 47 43 57 57 57 50 48 44
43 41 28 28 21 18 15 10 10 10 12 14 20 24 18 23 18 12 8 8 8 8 8 8 10 12 18 25 13 12 12 12 20 19 37 32 37 39 43 43 48 48 59 48 48 43 43 43 48 48
43 43 42 43 43 24 20 10 10 10 21 23 35 35 39 36 44 37 43 36 31 23 25 36 29 23 23 20 20 28 37 39 44 43 39 39 39 37 37 42 42 42 41 37 43 37 37 37 36 36
39 42 46 54 59 57 57 54 54 42 37 28 23 23 34 37 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 47 47 39 37 37 30 30 33 33 37 37 34 31 24 35 37 28 28 14 14 14 21 21 30
39 37 39 37 31 24 20 20 15 21 12 11 11 16 16 28 28 35 35 37 42 47 43 39 39 28 28 21 31 23 35 28 30 30 17 17 26 30 24 22 21 26 17 17 16 21 11 8 8 8
10 16 23 30 30 33 30 28 28 25 18 13 9 9 9 9 22 31 37 37 34 32 23 15 11 10 9 8 10 10 10 15 19 21 19 16 22 16 22 18 23 19 23 23 23 31 31 43 37 33
30 31 31 30 26 15 10 8 10 8 10 10 10 16 16 12 11 11 13 19 19 11 11 11 10 10 10 10 8 6 6 8 11 22 15 15 11 11 11 18 11 17 15 11 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 13 15 28 26 18 16 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 17 24 21 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 18 19 22 20 30 28 24 18 14 11 11 11
11 11 11 8 8 7 7 7 9 8 8 8 9 9 13 10 10 | Open.Hide. 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 11 28 30 30 41 41 33 33 33 28 33 33 39 37 27 19 8 8 8 8 8 7 9 9 16 17 15 20 16 19 16 19 9 9 10 23 25 44 33
33 33 19 21 9 9 11 11 8 8 6 6 6 10 15 15 15 16 21 26 26 33 59 47 57 57 57 57 39 43 39 39 37 37 30 40 42 42 37 42 42 42 51 48 51 50 50 50 50 68
68 68 53 53 57 57 50 53 53 68 68 48 47 41 25 21 14 18 22 25 28 24 28 32 40 57 50 51 68 68 50 50 68 57 57 47 47 47 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 50 50 44 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 54 50 46 36 36 32 36 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 59 59 68 68 59 59 59
57 57 57 57 54 54 54 57 59 57 46 43 39 39 57 57 57 57 57 48 48 47 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 48 48 48 47 47 47 48 48 57 42 42 35 35 35 47 47
57 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 48 48 46 46 46 30 30 12 12 11 11 11 12 16 16 25 19 12 12 22 18 22 11 12 11 20 10 14 10 15 11
25 12 13 8 8 8 8 6 6 8 10 10 16 20 13 10 8 8 9 10 11 8 14 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 16 15 12 11 11 11 11 13 19 19 16 16 10 10 10 10 10
10 9 11 10 8 10 10 13 11 12 24 31 37 29 25 22 22 22 19 20 24 13 13 11 11 11 21 17 24 19 14 13 13 13 8 8 8 8 8 8 9 10 11 15 12 8 8 7 7 10
10 14 19 19 16 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 14 15 21 24 23 14 14 11 11 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 10 10
9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 6 10 8 9 9 9 9 9 8 9 10 8 8 8 10 11 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 16 13 18 15 15 10 10 11 11 11 17 9 8 8 8 8 8 8 8
9 10 9 10 10 13 13 25 19 25 16 12 10 10 10 10 10 10 10 8 8 9 10 11 11 10 13 10 10 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 13 10 12 10 8 8 8 8 8 9 10
9 8 8 10 8 9 9 16 15 11 11 10 10 10 12 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 11 8 9 9 9 8 8 9 10 10 9 10 10 10 10 10 13 10 8 8 6
6 6 8 8 9 9 10 14 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 15 15 15 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 15 12 8 8 8
11 12 16 16 10 10 6 6 6 6 8 8 17 13 13 11 10 11 10 13 11 15 13 8 8 8 9 9 15 11 12 8 8 8 8 8 9 10 8 13 8 8 8 8 |