BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-111F23.T7 (MSMg01no111_f23.b1) | MSMg01-111F23.TJ (MSMg01no111_f23.g1) |
ACC | AG324058 | AG324059 |
length | 1,101 | 1,100 |
length of high quality (start - end) | 574 (106 - 679) | 576 (117 - 692) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_f23.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_f23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_f23.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_f23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:36 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TATTGGGGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTTCCAAG
AGGAAGCCCTTAAAGTCCATTACAAATACTGCCAGGATCAGTCTACTACC
TCCCTTTCCATTACTGACCCAGTCCCTCATTCTCCAGGCAAACAGGTTGA
TTTTAGCAATGAGGAGGAGGGCATCTCTGCTCCAGCTCTCCAGCTGTTAG
GCCTCCAGCTATCCTCTAGTGCCACTATCTAAGGCCCCTCACTCTCTAGC
CCTTCTGCTCCTGCCCGATCAGAAGTACTCCCAGCTTCCCCCTGGCATGA
TTTAGGGAGACTTTGCCTTCCAGAAAGTTACTCCTGTTGTGGTCACTCCT
GCAATGCCTGCCCTCCTGCTAGACTGCCTCTTCCCCAGAAGCCTCTTTCT
CCTCAAGTAGATTGTGAGGCTTTCCTTGTCAATCTTATCCCTGATGTGGT
GACTAGGCTCTGGATTCCCACTCCTTTGCCAGACTTGGCACTAATCAGAA
AAGCTGCCAATGGTTCCAGCCCAGAATTCCCCTTATTTTGAACAAGTACT
GAAGCAAGGGACCATGCACCTCCAGACCTATTATGATTGGTCTAATCTCA
GTGCGGCCTGAACCCCACCCCCACGGTTTCTTAATTGGAGGTCTGCATAT
CATGACTTGGCTGAAAATCAGGCTAGGATTAATCTAGAATATAACCTTAA
CATTATTTTTGACATGCTTACCAGCCACCGATCAGGGGGGCGATGAAGGA
GTCAGATGAAAACATGGACATATAATGTAAATATTGCGTTTATTAGTTTT
TCTTTAGCCTGGGAAGACCGATGAGTTCTGGGCCTTGGTGCCCCTGCCCC
CACCCCCACCCCCATTCTTTTGCCTGGGGCAGTTTACTTCCCTTAACCTA
TCCTGATCCTTTTCCCTTTTCGTGGGACGGTTTAAGTTCTGCCCCTTCCT
GGGACCTTAATCCCCTACCTACATGCCCAGGCAAACAAGGCGCCCCGGGC
CCATGGCAGGAAAAAATCCCCCGGCTTTTAACCCCAAATTTGTTCCCCCT
TCCGGGACACCCCCCTTGTAATCCCCACTCCACCCCTATATTTGACCCCC
C
| NAATCGTATGGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXCCCTTTCACCTGGAGAGAAACCATACAAATGCAAAGAA
TGTGCCTTGGACTTTACATGTTCATCATATTTTAAGTATCATCAGAGACT
TCATACTGGAGAGAAACCCTACACATGCAAAGAATGTGGGAAAGCTTTTG
CTAAATCTTCATGTCTTATTTTACACCAAAGAATTCATACTGGGGAAAAA
CCCTACAAATGTGAAGAGTGTGGCCAGGCATTTATCTGTTCTTCATACCT
GAGGAAGCATCAGAGGATCCATACTGGTGAGAAACCATACACATGTGAAG
AATGTGGCAAAGCTTTTAGCATTTATTCAACCTATGCTCAACACCAGAGA
ATTCATACGGGAGAAAAACCTTATAAATGCAAGGAATGTGATAAAGCATT
TAATAATCACTCAGCCCTAATTAAACATCAAAGAATTCATACTGGAGAGA
AACCCTATGCATGCAAAGAATGTAGTAAAGCTTTTAATAATAGCTCAAGC
CTTATTCGACATCAGCGAATTCACATTGGAATTGAAACCCTAGAAATTCA
AGGAATTTGGCAGGGCCTTTAGTAATAGTTCAGTGCTTAGCTCCAAAATT
TCATGATAATGAAAAGCTGTAGAAATGAGAAAGGTGACTAATTAATAAGT
ATTCTATACATATACCGTGTAAAACATCATGCATGAAAGAAAGCCTACCA
GTTCCAATAGTGTTGCAACTTTCTCAACTCTTCCTCCTGTCCTACTGATA
CCAGAAAATATATACTGAGGAAGCCTACATGTGTCACTGATGCGTCAAGG
CTTTTACTGACTGTTTACTCCCTCTCAGTGAACTCATGCCTTCCTAGAAA
TCCTCCCCTGTTGATTGGATTTGGAAGGGACTCCTGCCCCGTAGGTGTGG
CCCAAAGCAATTATTTTGGAAAGACCTGTTCCCCTTAGGCCGGTAATAAA
AGCGCATACCTTCAAAATCTTTAACAAAATCTTGAGTTTCCCAATAGGGC
GAACCAAATCCCTCCTTAATATACTCTGAAAATTGCTTGCCTAAAAACCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 13 9 9 9 9 15 12 8 8 8 15 9 10 9 19 8 8 8 22 23 50 39 39 39 36 33 33 33 33 30 28 30 28 21 20 20 28 31 28 25 19 15 11 11 22 22
43 43 47 27 19 10 9 10 9 10 9 8 8 9 9 9 10 13 19 19 26 27 37 37 39 47 48 48 48 50 43 43 36 39 39 47 47 53 53 44 44 39 37 23 25 10 10 10 10 8
10 9 9 13 14 28 24 32 22 22 22 29 31 36 36 48 57 48 53 50 50 43 34 42 42 42 42 48 48 48 48 42 42 42 47 42 46 54 46 46 40 40 37 37 37 39 37 37 39 42
47 43 39 39 39 39 40 57 43 43 43 43 43 43 46 46 54 59 57 43 43 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 50 54 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52
52 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 43 43 43 43 39 43 43 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 44 43 35 35 43 62 62 52
52 43 44 44 31 31 43 43 43 43 62 62 62 62 43 43 39 43 43 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 43 43 39 62 39 43 43 62 62 62 62
52 45 45 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 41 27 23 13 13 39 39 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62
62 62 59 47 39 39 33 43 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 43 43 62 62 62 62 44 39 39 13 13 14 29 32 44 43 39 39 43 30 29 14 14
14 38 38 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 52 52 62 62 62 62 57 57 57 57 57 59 59 59 32 32 17 38 38 52
43 52 57 57 57 43 39 29 29 29 35 36 39 57 57 57 57 57 52 52 43 57 39 39 39 43 57 57 57 57 57 37 37 37 44 43 43 43 52 57 57 47 44 35 33 31 33 33 43 43
50 43 39 39 38 43 23 27 23 38 16 26 12 12 12 27 24 35 35 47 44 57 57 57 57 43 43 37 43 43 59 59 59 57 57 48 57 42 42 35 35 35 32 32 14 14 14 23 27 29
28 28 28 32 27 30 30 28 32 37 32 32 12 15 18 24 24 35 39 39 48 43 43 42 46 42 43 43 43 48 43 47 37 37 23 28 20 32 18 19 12 23 15 29 28 28 28 28 29 39
43 41 41 59 39 39 27 23 15 15 13 20 22 20 20 32 32 30 30 17 17 17 30 41 43 43 25 25 13 12 12 22 23 23 27 13 12 13 24 24 37 28 39 37 37 32 30 30 15 15
17 18 20 19 24 11 11 11 19 21 34 28 25 23 20 17 13 24 16 18 19 24 21 28 21 20 12 9 9 9 15 18 28 20 26 20 18 22 17 17 17 22 24 28 24 19 15 19 15 16
13 11 11 11 15 12 12 11 9 9 10 10 9 9 9 11 11 14 13 12 14 12 18 10 9 9 8 13 17 18 19 30 37 28 18 11 11 11 13 15 24 25 30 30 14 14 13 13 19 19
19 18 12 11 10 8 8 8 12 8 9 8 11 8 8 8 13 17 15 15 10 11 9 10 8 8 8 10 14 18 11 8 8 8 8 8 6 8 9 9 18 12 20 17 20 13 13 10 10 8
10 10 12 15 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 14 21 33 27 33 22 21 12 12 10 8 8 8 10 10 10 10 10 15 9 8 8 10 15 19 13 10 8 8 8 8 8 9 10
10 10 13 12 8 8 8 8 8 8 25 13 10 9 10 9 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 17 19 26 23 10 7 6 6 8 8 10 9
9 8 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 8 10 12 10 7 6 8 8 11 11 11 11 11 11 9 8 8 10 8 9 9 8 12 8 10 8 8 8 13 8 8 10 9 9 9 9
12 9 11 11 11 10 10 9 8 8 9 10 10 9 10 11 11 17 16 11 11 10 10 10 8 10 10 15 8 8 8 8 10 10 11 11 11 18 13 13 9 6 8 6 6 10 15 19 17 11
8 8 8 8 8 6 9 9 11 9 9 11 21 17 14 10 10 8 8 8 8 9 10 12 10 9 9 9 7 7 8 7 8 10 8 8 6 6 8 6 6 10 6 6 8 8 18 18 14 13
11 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 7 6 7 7 6 6 6 6 15 13 9 8 8 15 22 14 16 12 12 9 9 7 7 11 12 15 9 10 10 19 21 28 22 22 28 33 34 36 33 37 28 34 32 32 29
39 39 48 50 50 50 28 30 15 13 10 10 10 11 10 10 8 8 8 6 8 8 8 6 6 9 11 12 19 30 34 39 30 30 32 26 35 19 23 23 34 34 48 48 48 48 48 59 43 37
25 21 11 11 12 12 14 10 13 11 11 11 19 17 19 10 10 10 27 35 43 43 43 39 39 39 39 42 47 47 47 42 39 34 42 33 36 36 40 36 48 42 39 28 31 20 23 22 41 36
36 28 28 36 44 44 48 30 30 17 17 17 30 30 42 47 47 41 41 36 36 30 30 26 30 30 33 33 36 37 46 44 48 42 47 35 33 33 29 29 33 44 44 50 41 41 50 50 57 50
50 50 47 50 43 44 32 32 32 32 32 35 43 43 52 52 52 52 52 57 43 42 42 43 43 43 44 28 28 28 44 44 57 57 57 52 52 43 57 43 43 43 47 43 45 45 57 57 52 57
52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 43 43 39 35 35 38 34 17 17 20 38 43 43 23 35 20 24 43 43 62 62 62 62 62 43 43 35 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 45 45 45 62 62 52 52 52 43 43 20 20 20 43 43 43 43 43 35 35 43 44 35 29 26 38 32 52 52 43 52 62 62 52 52 52 52 62 52 52 62 62 62 62 52 52 62 62 43
43 43 43 35 43 43 43 39 43 43 31 35 35 44 44 44 44 31 31 31 44 44 62 62 62 44 44 29 29 29 44 44 62 62 52 52 43 43 29 23 14 14 14 13 12 11 21 24 39 39
62 62 62 62 62 41 43 27 27 14 20 39 43 43 62 44 44 39 31 31 39 43 43 52 52 52 62 43 52 45 52 52 62 44 44 39 39 35 35 43 43 39 39 43 43 39 39 39 62 62
62 52 43 43 39 39 39 39 39 62 44 43 39 39 39 28 39 43 35 43 43 44 43 35 35 33 43 43 19 19 19 24 35 35 43 43 43 35 35 43 62 62 62 43 39 35 35 43 43 43
52 62 43 43 39 39 43 43 43 35 35 24 38 24 24 24 23 34 39 44 43 18 18 11 18 18 38 28 35 35 39 39 43 35 35 26 43 43 52 38 38 14 14 11 26 27 38 30 39 38
38 42 42 42 36 34 27 27 32 43 43 32 32 23 32 17 24 24 43 38 47 35 35 35 38 36 32 17 17 32 24 24 35 44 43 33 33 41 44 27 24 12 12 12 19 17 24 36 30 24
19 27 43 43 43 44 36 43 28 35 33 35 35 35 30 22 22 30 24 32 24 28 30 37 40 42 35 32 19 24 19 18 15 21 20 36 24 26 12 12 11 23 24 18 15 20 24 32 42 37
37 28 28 28 37 37 39 35 35 35 28 28 28 28 30 33 25 32 15 15 11 15 11 16 16 18 25 12 17 19 26 32 37 37 26 28 28 28 24 12 16 12 12 14 16 21 14 11 11 11
18 22 33 35 28 28 12 10 8 13 13 16 12 14 19 19 16 24 15 15 12 12 10 10 10 10 13 11 11 11 21 11 11 11 19 12 14 15 18 15 17 10 10 10 11 14 15 11 13 13
13 9 10 8 8 8 10 14 15 10 9 9 9 10 9 9 9 14 15 30 19 16 10 10 10 10 12 19 13 10 10 10 9 10 9 10 10 10 13 15 8 8 10 13 12 17 16 16 23 23
19 15 9 8 8 9 11 16 13 15 8 9 12 15 12 12 19 21 17 14 9 9 9 10 12 13 13 11 9 9 13 13 12 10 10 8 8 10 15 13 10 9 9 9 10 10 10 10 11 10
10 9 9 9 8 8 8 8 11 10 12 10 9 9 9 10 15 12 12 12 14 9 12 9 10 9 8 8 6 6 7 8 12 13 10 11 11 19 17 18 15 14 11 10 10 10 10 10 8 8
6 6 6 8 8 8 9 8 10 8 12 10 10 13 10 10 8 8 10 10 10 13 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8
8 8 8 9 10 10 10 10 13 13 12 12 11 13 18 22 17 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 15 15 15 10 9 9 9 9 10 10 9 9 10 10 12 10 6
6 6 8 8 10 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 11 11 12 13 12 12 9 9 9 8 8 8 9 9 9 13 11 11 11 11 11 8 8 8 8 6 8 6
6 6 6 8 9 10 12 12 11 11 8 8 8 8 8 8 11 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 8 8 8 9 8 10 7 7 8 7 8 8 8 8 8 8
|