BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-142K02.T7 (MSMg01no142_k02.b1) | MSMg01-142K02.TJ (MSMg01no142_k02.g1) |
ACC | AG347192 | AG347193 |
length | 1,193 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 579 (90 - 668) | 698 (92 - 789) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_k02.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_k02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_k02.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_k02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGATTCTNNNNNNCTACAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCACTTATGCTAATGAGCCCTTATAACTTTAATCTAAAGTT
CCTGAAAAAGTTTAACAATCCTACTCTATGTTTTATACCCCACTAATGGT
TACTCACATCTCTCTTTAAATGCTTCTAGATAATGTTCAGTAGTAAGTGC
CAGGCATCCTGGTATGAGGTCATCACATTTGTGGCAACAAAAATATGAAT
AGCCTTCATCTTTGATGGAAATGCCTTCTGAACTGGCTGGTGGCCTTCCT
TCCTTTCTTAGTTTCTTTTCATCCCAGATTGGCTGCTTCCTTGTTTAATT
ATTTCTGATCCTTAAAAACCTGCTGTACAGAAATACAAGAAGTGGAGGAT
GAAGAGTGATAATGCTCTTCAGAATGAAATATATGGTTTTCTTCATAGTA
GAATCATATCCTATAGTTATGATTGGCAGCCAAGAACAATGGTAATAACA
TGCATTTTCTTTGGTTCCTCTGGGACCCATACGATCATACAGATACAGCC
TGTCTGGCACTGGGCTAATTATTTAATATCCTCTCTTCTAGGAACACCAT
TGTTTACTAGGGTTGTATGGGTCTGTTCACACACCGTTTAAAAATTTTAT
ATTGATCTTCCTTCTGGTCAGTGCCTATTACAGCAACAGTCATAGGTCAG
TGAACAATGCTTCACCCACAGCTCTGCCTTGTCTGACTTGTCTGCTTTCT
TATTAGTCTGTCTATATTCTATAAATCTTTTTTTATCTTTTTCTATATAC
TTATTCATAGCATAACGCTTGTTTATTAATCTTGTTCCTTATTTATTTTT
TTAATATTGTTCTATTATTATTTTTTTTTTCTTATATCTTAATGTCCCTT
ATAATCTTTGTTTTTTTTTTTGTATTCTATTATTATTTTATTTTTTCTCT
CATTTCTTTTCTTATTTTCTTTTTTATTTCATTATTTCTTTATTTTGTCT
TATTTTCTTTAAACTTTTCTATATTATTTTCTTCTTTATTTTTTATTCTT
ATTTTTTTTTTATTCTTTTTTCTTCTTTTTCTTTTCTCTTTTTATTCTTA
TTCCTGCTTTCTTCTTCTTTCCTTGTTCTTCATTTATATTTTACTCTTAT
CTTCTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTATATTTCTTTTTTCTTT
| NCCAATCTTNNNNNNTAACATGGTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTACATCCACCAGAGACT
CTGAAACATATAGAGGAGAACGTGGGGGAAAGCCTCGACCACATGGGCAC
AGGGGGCAAATTCCTGAACAGAACACCAATGGCTTGTGCTGTAAGATTGA
GAATTGACAAATGGGACCTCATAAAACTGCAAAGCTTCTGTAAGGCAAAA
CATACTGTCAATAACACAAAAAGGCCACCAACAGAGTGGGAAAGGATTTT
CACCAATCCTAAATCCGATAAGGGACTAATTTCCAATATATACAAAGAAC
TCAAGAAGCTGGACTCCAGAAAGTCAAATAACCCCATTAAAAAATGGGGC
ACAGAGCTAAACATTGAATTCTCAACTAAGGAATACCAAATGGCTGATAG
CCAGAAACTGGAAAGAACCCAGATGTCCCTCAACAGAGGAATGGATACAG
AAAATGTATCCATTTACATAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAACAAT
GAATTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGGATCTGGAGGATATCATCCT
GAGTAAGGTAACCCCATCACAAAAGAACACACATGATATGCACTCACTGA
TAAGTGGATATTAACCCAGAAACTTAGAATATCCAAGATACAATTTGCAA
TACACATGAAACCCAAGAAGAAGGAAGACCAAAGTGTGGATACTTCGTCC
CTCCTTAGAATGGGGAACAAAATACCCATGGAAAGAGTTACCTAGACAAA
GTTTGGAGCTGAGAGGAAAGGATGCACCATCCAGAGACTGCCCCACCTGG
GGATCCCTCCCATAAACCACCCACCAACCCAGACCCTATTGCATATTCCA
ACAAGATTTTTCTGACCGCACCCTGATATAGCTTGTTCCCGGGGAAGCTC
CTGCCCGTGCTCTGTCAAATTCATATATGGACTGCCTCCCAGTCTTCCTC
TTAAATGGGAACCCCGGCCCCCCCCCTGGGTTGCTCTTACATACATTTCC
CTCTTCTTCTTTTAACACTTTCCCTCTCCCCTCTTTTTCCTTATAGCTCT
ATTTTTACTCTTCTTCCTGCTCCTCCCTTCTATTTGTTTCCTCCTTCTCC
TCTTATCTCTTCCTTCAATATCTTTCTCCTTCTCCTCCATCTTTTCTCTT
TTCTCTTCTTCATCTTTCNTCTTTCTTCTCCCCTTT
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 8 8 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 7 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 15 15 8 8 8 8 12 12 17 18 35 28 23 28 28 33 34 42 47
53 50 50 50 50 50 50 37 37 57 38 38 38 36 36 36 36 31 31 31 31 31 30 39 28 23 12 12 9 8 8 8 8 8 8 13 16 17 18 20 19 23 32 33 36 36 38 53 53 53
53 53 53 53 53 53 57 57 53 53 31 31 31 33 33 22 23 15 11 10 10 10 10 10 13 23 29 31 31 31 33 28 28 30 24 19 14 10 9 9 9 10 9 14 18 27 32 59 50 50
53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50 50 53 50 50 50 53
48 50 59 59 34 29 21 12 15 11 11 11 11 11 11 12 29 31 59 59 59 50 53 53 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68
54 54 44 35 43 43 43 46 43 48 59 59 59 59 57 57 57 43 42 42 43 43 36 36 23 28 41 44 59 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59
59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 54 48 48 59 59 59 57 50 50 48 48 43 59 40 47 59 48 43 43 43 37 37 31 28 28 30 33 31 43 36 32 29 29 32 32 37 39 41 47 47 48 48
48 48 47 38 36 36 31 31 31 31 30 37 37 25 25 17 17 22 23 21 25 25 22 16 18 9 12 9 9 8 8 8 11 12 10 10 10 10 12 10 13 13 17 22 20 21 11 11 11 11
11 12 12 15 15 15 21 13 13 10 10 10 10 11 23 12 10 9 10 10 10 10 10 12 16 15 15 32 30 19 20 18 14 16 10 8 8 8 8 12 12 15 11 11 11 18 8 8 8 8
8 8 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 11 11 11 13 13 17 10 10 8 8 8 8 13 10 8 8 6
6 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 13 12 9 9 8 10 10 8 8 8 10 8 8 9 11 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 7 8 12 10 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 14 11 14 17 18 16 10 8 6 6 8 8 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 11 9
12 12 11 11 11 10 11 11 11 10 9 12 9 8 8 8 10 10 12 16 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 10 11 11 12 12 11 11 11 11 10 13 11
10 10 9 15 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 13 13 14 11 10 10 13 10 8 8 8 8 10 10 10 10 13 11 9 10 8 6 6 8 11 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 9 8 8 12 9 9 8 8 6 6 10 12 13 12 9 9 9 10 13 15 13 13 15 13 13 10 10 10 10 10 10 8 6 6 8 10 9 10 10 10 10 10 15 12 12
12 15 22 19 10 10 11 12 10 10 9 9 9 11 13 10 10 16 20 16 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 13 11 15 10 10 11 13 9 14 14 13 10 10 10 10 19 16
15 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 12 8 14 15 15 8 11 11 10 10 12 16 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 11 11 15 12 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 12
12 11 12 15 21 24 15 12 9 8 10 8 8 8 13 15 12 10 7 7 9 9 11 11 16 10 8 8 8 8 13 12 12 18 16 17 19 20 10 10 15 9 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 8 8 8 6 6 6 3 0 3 7 7 9 6 8 7 8 6 6 6 6 8 7 8 12 11 13 8 8 8 22 17
19 12 12 19 19 28 32 35 37 33 37 30 28 35 36 50 36 36 44 44 50 50 47 47 30 23 12 9 9 10 10 8 8 8 8 13 8 9 9 9 10 13 24 24 39 44 44 47 39 34
36 34 34 42 42 53 43 40 42 47 47 47 50 53 57 57 34 34 11 11 11 11 17 18 16 33 34 43 37 37 37 35 33 28 23 15 10 9 10 9 9 9 10 14 19 27 41 46 46 48
48 50 53 59 59 59 59 57 57 57 57 47 50 43 43 48 48 48 42 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 46 46 68 68 68 68 68 50 50 48 48 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 44 44 42 47 47 44 44 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 44 44 33 35 35 44 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
54 54 52 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 59 59 59 68 68 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 54 54 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 50 50 50 53 50 50 41 41 28 15 12 11 11 11 11 12 24 28 39 41 59 47 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59
54 54 54 57 57 57 57 48 48 48 48 48 50 57 57 57 57 54 48 48 47 57 43 46 44 48 48 59 59 59 46 57 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 59 59 68 59 59 57 59 59 57 59 59 59 59 44 44 29 33 38 43 44 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 37 37 43 50 50 57 59 59 57
57 54 54 57 57 68 68 68 68 59 59 50 57 59 54 50 59 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 54 54 54 57 57 68
68 68 68 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 48 39 37 29 28 28 43 43 47 48 37 37 41 34 43 43 43 43 43 42 42 42 36 47 48 48 48 37 37 30 37 37 43 43 41 37 37
43 59 36 36 36 37 37 39 27 28 32 28 32 32 41 41 43 36 37 44 37 41 41 43 44 39 39 32 28 28 30 32 41 59 43 41 41 37 37 39 41 41 47 46 43 23 23 10 10 11
16 16 19 24 18 27 23 37 36 31 28 24 24 28 30 31 34 30 32 26 21 27 21 28 23 28 21 34 25 21 21 24 24 28 37 25 25 12 9 11 13 13 13 11 10 12 19 16 18 24
17 19 19 24 12 12 12 9 9 9 15 9 11 12 15 15 13 13 19 17 29 21 19 9 9 9 9 17 18 10 11 9 9 9 10 10 13 19 19 19 17 16 16 10 10 13 19 15 10 10
10 10 8 10 8 10 10 14 17 17 9 9 8 8 8 13 8 9 11 11 8 8 8 8 8 11 9 9 8 10 8 10 10 10 9 9 8 11 8 8 8 8 10 8 13 8 8 8 6 10
8 9 12 11 12 12 11 11 18 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 13 16 15 15 11 9 9 8 8 8 10 8 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 12
9 11 11 18 16 11 8 8 10 7 7 7 13 10 10 11 11 11 13 11 11 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8
8 8 8 13 11 15 18 12 10 10 10 10 10 8 11 11 10 10 10 11 12 16 17 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 12 11 11 12 12 11 11 9 10 11 12 12
6 6 6 8 10 9 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 19 15 10 10 12 10 10 9 10 9 17 12 9 9 9 8 10 8 8 8 8 6 6 10 8 8
8 8 8 8 15 9 9 10 21 13 8 10 8 10 10 8 8 7 8 8 9 12 11 11 10 12 12 12 8 8 12 12 12 8 10 7 6 8 8 10 11 8 8 8 8 10 8 9 9 9
15 8 6 8 8 8 12 10 10 8 10 8 8 8 9 11 11 11 11 8 8 6 6 13 12 8 6 8 6 7 8 8 8 10 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 12 8 8 6 7 6
8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 15 13 11 8 8 3 0 3 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 13 13 10 |