BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-237K21.T7 (MSMg01no237_k21.b1) | MSMg01-237K21.TJ (MSMg01no237_k21.g1) |
ACC | AG402559 | AG402560 |
length | 822 | 747 |
length of high quality (start - end) | 283 (133 - 415) | 237 (111 - 347) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no237_k21.b1 PHD_FILE: MSMg01no237_k21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:55:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no237_k21.g1 PHD_FILE: MSMg01no237_k21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:55:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTACAACTTAAAACCCCAAATACAACCCACCATAACCNCCCCAANNNCNN
NNCGCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAATC
CGCGGAATTCAAAGTCATTTGCCTTGAAAAGAAATGAAATATTTTCTCTA
TTGTCCCAAAGCCCATTTTAGACTTTTAAACGCTCTATCTGAGACAAAAT
TCCTGTTATTGCTGCTTTTTTGGGTAGAGCAGAACTCATGTTGGATGCCT
GTGCTAGGAAGCTGTTTGCCTTACAGGCAGCAAAGCCAGTGAGGTTCTTT
CTGAAGTCCTCAATGGGACATCAGAAATTAAATGCACTCTGCTCTTCCCT
GGGCTCTGATGTCACACAGTGTCCCTTTGTATTTTACCATGTACCACCCT
GGCTTTATGAGGCAAGTAGGTTTTGTCACACCCCACTAATGATCTTCTAA
GGGGAGGAATTGTGACTCATTCTTTGTATCACCCACAACATTTAGCAGCT
TATTCTACAAAGGTTGGGGCCCACTGGATAGAAAGCTTGGGCTAAGCTCA
TTCTAATGATGGCAGTGTGCTTCTTCGTTTCATTTGATGGCGCTTCTGTG
CTCCTGTTTCTCCATGGGTTACTTCCATGTGTCCTGTGGATAACAGGATT
GTATAGGTTACCACTTAGAGTACAAAGCAATGTGTTATACTCATGGACGA
ATTAAAGTTTTATCATTTTTAAAGAAGTGAAGAGGTTAAACACCATAAAT
GGCAATTTTCTTAGTGTACATTCCCGAAATTGCGAGGAATTGCTTTGGTC
CTCTAAATGATGGTATAATAAG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXAGAACTTTTCAGCTGGGAAACAAAAGTACCAGTGAGTACAGCTT
TATTACGCAAGTCTGGTCTTGAACTTTCTAAGGAAATTCAAGACAGTCTA
TCAGAAGTAAAGTGGAAAATAGCTTTACAAGGTATGTTTGGCCTTGAACT
TTATCTAGTGTTAGAAGCCCTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGG
TTAAGGCAGGGCAGATTCTGGACGAAATTCAGGACAATCTATCAGAAGTA
AAGCGGTGTTAGAGAGTAGGAGCAAAGAAAAAATATGGTGCACAGAATTA
TTATACCCCCCCCTCCCAGGGTCTTGAACCCAAGGAAAAGTTAAGGTCAG
GTACGAATACCTGGAAGAGAAATTAAAAGAGGGGAGAAGAAAAAAAGAAA
AAAAAAAAGATCAATTAGAGAAGCCAGTTCTTAGTAGTTCTAAATCAGAT
AAAAAGGCTATTAGGGCCTAAAAGGCGCTCTCCCGAACAGGTGAAGCCAC
TGGACAATTAACAAAGATCGTCCAGGGACCTCAGGAGTCCTTCTCAGATT
TTGTGGCCAGTATGACAGAGGCAGGCTCTTGCAGCCTACAAGGTCTTATT
GTCCACCCTAAAGTTGTAGATCAAGATTGCAAAGGGGAACTTCAGGTTCT
CTGTTCTTGTCCTCAAGTTGTCTTTTCTATATCACAAGGGGACAGAA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 7 8 10 8 6 9 9 10 8 12 7 6 8 8 9 9 13 17 19 10 8 8 8 8 6 6 8 7 7 8 8 10 8 8 3 0 3 8 10 10 10 3 0 0 0 3 0 0
0 0 3 10 9 9 10 11 9 15 9 11 16 23 23 37 37 37 28 17 15 19 17 22 10 10 10 19 21 33 24 24 33 30 30 28 34 19 22 11 15 10 9 9 9 8 8 8 10 12
16 30 30 33 30 30 28 28 28 30 33 33 33 33 21 12 10 10 12 9 10 10 11 6 8 6 6 7 7 10 11 14 14 27 27 39 31 31 35 36 36 36 53 53 59 57 57 53 53 53
53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 59 59 33 21 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 17 32 41 41 46 46 46 48 39 47 39 39 47 47 47 50 50 53
53 53 59 59 59 57 57 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 42 39 37 37 42 44 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 47 54 54 57
57 57 57 57 57 43 43 37 43 39 57 57 47 43 43 47 59 57 57 57 57 57 57 50 46 46 44 52 43 47 35 35 43 43 43 57 57 57 48 48 48 50 50 47 57 54 59 59 59 59
68 68 59 59 47 47 43 47 44 44 43 42 42 28 28 20 32 32 46 42 44 42 30 30 37 42 57 57 57 41 43 43 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 48 48
43 43 43 47 47 59 57 57 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 48 59 59 48 47 47 47 30 30 18 12 11 11 12 12 27 22 14 14 24 31 39 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57
48 48 47 43 47 47 48 47 47 30 30 28 24 19 15 9 9 9 9 10 12 21 25 23 18 18 26 22 11 11 11 13 18 17 18 20 20 17 20 20 32 34 47 48 57 59 57 59 47 43
43 33 31 24 22 24 28 30 42 42 43 39 37 30 28 28 28 33 32 35 35 43 43 39 37 33 33 32 32 24 28 23 23 28 17 15 13 13 13 15 28 23 25 12 14 15 23 24 32 31
28 28 37 37 32 16 15 11 15 12 23 26 15 18 11 12 12 12 16 16 18 29 17 18 17 31 23 30 17 17 18 19 16 19 11 17 23 13 16 10 23 26 12 12 16 11 12 11 13 17
17 17 11 10 10 10 13 19 18 18 20 11 11 9 10 17 19 36 23 28 21 31 29 28 19 20 9 9 11 11 11 10 10 10 26 23 28 23 23 13 18 15 17 18 8 8 8 8 8 8
10 11 11 12 12 9 9 13 16 16 19 15 11 15 11 21 15 15 15 11 12 11 16 20 13 13 10 10 13 11 8 8 8 10 9 12 12 9 11 12 20 19 12 12 10 10 13 13 13 10
9 8 10 7 8 8 9 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 11 12 10 10 11 11 11 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 11 10 10 10 10 10 8 7 7 8 8
9 11 11 13 9 9 9 9 9 10 11 12 12 12 9 9 9 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 10
9 10 10 10 10 9 10 8 10 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 9 13 16 13 7 7 7 8 8 8 9 9 9 9
12 12 22 19 9 9 13 11 12 7 7 6 8 8 11 11 10 10 8 8 6 6 | Open.Hide.37 41 41 41 41 40 40 40 41 41 33 26 10 8 8 8 8 8 6 9 9 10 10 16 13 28 21 28 32 19 23 11 10 10 26 23 39 37 37 35 27 18 9 12 11 15 15 16 12 12
13 15 15 15 10 13 12 16 24 33 41 48 50 36 36 36 36 36 36 57 59 48 48 48 47 47 57 57 50 50 50 53 50 50 42 53 50 50 53 50 53 50 41 37 37 37 37 37 25 17
8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 22 25 34 59 46 46 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 48 48 48 42 42 48 48 43 46 41 37 37 46 46 50
54 54 54 57 57 57 57 68 68 68 57 57 47 47 47 48 47 47 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 59 59 48 48 48 57 47 47 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 57 57 57 48 53 48 48 42 48 48 48 48 59 59 59 59 59 47 35 35 37 43 47 48 47
41 41 41 30 20 13 10 10 10 10 11 12 13 15 25 23 34 39 40 47 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 39 40 59 39 25 28 15 12 11 12 8 6 6
6 6 6 9 12 11 14 12 16 17 20 16 11 11 11 17 12 12 12 11 12 25 31 59 59 48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 46 59 43 43 43 47 46 48 48 47 59 28 28
8 8 8 8 10 15 22 26 32 25 26 11 10 8 8 8 8 8 15 25 41 41 39 37 37 35 30 24 26 13 13 13 19 28 32 23 21 12 12 12 24 28 37 43 43 43 37 37 30 30
30 32 32 36 43 43 36 40 29 33 27 32 23 28 23 34 20 23 23 41 38 43 43 43 47 47 48 48 59 59 41 41 20 20 32 29 32 32 37 43 57 57 54 54 57 57 39 39 44 57
57 43 43 34 43 43 50 50 47 50 43 44 43 43 35 43 43 57 57 43 43 43 44 57 44 48 48 48 48 59 59 57 48 48 48 57 57 57 48 57 48 48 44 44 33 33 25 25 25 30
44 36 41 37 41 41 36 43 36 28 23 28 44 44 57 57 54 48 46 40 40 43 40 37 36 32 32 36 34 31 30 22 17 17 24 25 28 30 32 39 39 43 48 37 34 28 23 23 31 34
41 47 41 34 34 28 24 20 22 22 17 17 23 22 15 16 16 24 28 28 36 36 30 29 17 17 15 30 30 37 24 24 17 15 20 14 22 22 15 20 23 25 28 17 14 16 14 28 21 24
15 17 19 26 22 28 22 23 21 21 15 19 24 26 28 19 19 15 18 14 26 24 30 35 35 32 20 20 14 14 14 28 30 37 37 37 31 32 30 30 30 28 30 28 34 33 28 24 28 21
18 11 12 9 12 19 27 32 20 20 17 20 16 16 10 10 11 11 15 9 9 10 15 18 26 25 20 16 16 14 12 12 10 10 15 13 13 10 16 16 19 19 20 28 28 22 22 |