BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-363C24.T7 (MSMg01no363_c24.b1) | MSMg01-363C24.TJ (MSMg01no363_c24.g1) |
ACC | AG471686 | AG471687 |
length | 1,503 | 762 |
length of high quality (start - end) | --- | 524 (77 - 600) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no363_c24.b1 PHD_FILE: MSMg01no363_c24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:58:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no363_c24.g1 PHD_FILE: MSMg01no363_c24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:58:49 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TGCCATATCCCGTCCGCTCTAATATACGCGCCGTTTATCTTCGCTTTTAT
CGCTAGAGCGAATAGTGCATGGCCATACCATATCTTCCTAGCGCGACTGT
CACTGCCGTTGCACGTGTGAGNCATGTGAAATAGTATAACGGAGGGGGGC
ATATCGATGGTGGATAGCGATATGAGCTGAGTGCGGATCTTGACGATGAA
GTCATATTATAAACTTACACACACACATGTCTCGCCTATTCGCCGTAGCT
AGTTCCGACGCTGTGCCGCATGTAGCCTAAGCGACTGCGGGATAGAGGAC
TGAAACATTTTACAGTGCATTCGATCTCGTCTCGTGCGAATATTTGTAAA
ATAGAGGGTCGTCTGTCGCGACTTTTATATATGCTGTAGCGCATTATGCA
CACCACTTCNAGCTACTTGGCGCTCTTGTAGCTGTTGTCCAGTTCATCGC
TTGTACTGCGATCTAATCGTAGTGGAGCGCACAGCTCGTGTGCCGCTTGT
TGTCGTTTGACCAATGAGCACGACCTGTTGTTATAGCCTAGGCTAGGAGC
GCTGATCTTATCTCATGCTCTGACCACGTGTTATAACGAGATATCCCATC
TATGATCGCGATATTGGCGCGCTCACAAGCGCTCCACGATTTGAGTTATG
CGAATCTGTTCTTGTGTATAATACACCGAGTTCACGTCTCATGTATCCAG
CTCCGTACTATGCATCACGTGCTGCAGACTGGGCGTGCGGTGCCCAGTGC
CATATATTGTGTATAGTGAAGCAAACAGCGTGCTCGTTCATATGTGACTT
TACGAGTGACCTCCGCGCGTCGTATATGTGCTCCAACGAGATGTTGTGTC
GTACTCCTTGACTCGATCGACACTTGTCATCTCTGTGGTATACTGACACC
TCTCCTATACTACATCGCTCTCGCTCTCTCTCACGGTCATCGTCGGCCAC
GCTTCTACTCGTGTCTATGCTTCTTCGTCTCTCTACTACCGACTAAATTG
CGCATGCGTACTATTTCATAGACCCCCACAGATTATTATACGCACTTGCG
GACAGATCTCCGGCCGCTGAGAGGTCTACGCGGATTTGTTATATATCCTC
GCGTCCGTACAGCCACATCTAGTATTCGTCTCTTCACCATGCCGTCGCTG
TCCCGCCTCCGAATATATTTCTTTAACGTGTGTGTACCGTCGCTGTATCG
ACGCACGTATGGCGATCGCCACANATGCAGNAGTCATGACCGCCTCTATA
CCGCTTCTGCGCTAGACACGTGATTGTATTACTCACTCGGATTGTACGGC
TCTCGCACTCACTAGATCGCTCATATGTGATCACCACGTCGAGATTATTA
GCGNAGTAGTCCTGTATGGGCGGGTAATATATATCATGCGCGATCTATAT
CACACGCGACTAACGTAGTACATTAGTGCTCGCGATCATATATCAATCGT
AACGATATTGACACGTGTACGTACAATATGTGTGCTGTAGCTGGATAGCG
TCN
| NCCGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXTCCCAAAATACACTGTTGTCATACCCAGAGAATGTG
CATCAGAAAGGTGAGAGATCCACATGCTCTCAATAGATCCTCATGCCTAT
CTTCCTTTGTAAGACACAGGCAATACTCAATGGGCATTCATCGATCTCAC
GCCGGTCTGTCAAATTACAATGACTGCCCCATACACTAATCAAGGAGGCC
ATCAAGAGTGGCTCTGCACACAGACTCACTCTTTCAGACTTAAAAATATG
TCACCTTCCAAGGAAGCAAGCGCCAGGAGGTACATAGTAGGGTCCCAGAA
CTAAAGGAAGCAGACTGGATGGGCAAGTGAAGACTACGAGCTAGCTCAGT
GTAACAACACACAGGCAGCAGACTCCATTCGCTGGCCCCATCTTCCAATA
ACAAGATCCCATGTCCCTCTGCACTGATCCATGCCCTCTGGAACAGCGTG
TCCAGTCACTAACATCATATGTGAAGTGTCACACAAGGTTACATGTTTAA
ACAGCGACAGGAAGCACAAAGGTGGCAGTTTCTCCACTCCCCTCCAGTGC
CAAGCTCCTTTATTCCCCCTGGCCCTGGTTCCACACGCTGTTCTGAGTGT
CATAAGAGAGTGAGGGTGACAAAACCTTTCTTCCTTTTTGTATAGAGGGC
AATTGATCATTGCTTATTGATCGGGCCCGTTATTATAGCCTAATTTCACT
ATTCCGCTTTCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 9 9 9 10 10 11 11 6 6 6 6 8 10 11 9 9 9 7 10 6 6 8 8 9 12 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 11 15 14 12 10 10
9 10 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 10 9 9 12 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 7 6 8 8 8 8 8 8 11
9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 7 8 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 8 8 17 8 8 8 8 10 8 10 8 9 9 9 9 12 10 8 6 6 6
6 8 8 11 8 8 6 6 10 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 6 6 8
6 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 7 8 8 6 6 8 8 6
6 7 8 8 9 8 8 8 9 8 8 11 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 12 9 9 8 11 10 7 6 7 6 8 8 6 8 6 7 8 8 9
9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 11 11 11 11 11 14 8 10 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 7 8 8 6 6 6 10 10
8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 7 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 9 9 10
10 8 8 8 6 8 9 10 3 0 3 9 9 9 10 12 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 8 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 6 8 9 9 10 10 10 8
10 10 11 10 8 8 9 10 10 10 10 10 10 9 6 8 8 10 11 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 8 8 10 8 10 8 8 8
8 8 8 8 9 9 13 10 8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 9 6 8 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 10 10 10 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 11 11 6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 9 10 10 6
6 6 6 8 10 9 9 9 9 9 9 10 6 6 6 6 8 10 6 9 8 8 8 8 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 7 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8 8 9 15 13 10 7 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 11 9 9 7 7 7 7 7 8 8 8 10 8 6 6 6 6 10 10 9 9 9 9 10 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 10 9 9 9 10 10 12 13 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10
10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 11 10 10 11 11 12 12 10 9 9 9 9 9 10 11 10 10 10 11 15 10 10 10 10 9 9 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
13 10 10 10 8 10 10 10 8 8 6 6 6 8 6 9 9 9 10 9 9 9 9 9 8 8 10 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 12 19 12 6 6 8 8 9 10 13
10 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 12 10 6 6 6 6 6 6 10 10 8 10 17 13 8 8 9 8 8 10 8 10 10 9 7 7 6 8 8
8 8 10 10 10 10 10 8 9 9 10 10 23 21 9 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 13 15 9 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 13 10
8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 11 11 11 8 6 7 7 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8
6 6 6 6 6 6 6 6 9 12 14 13 8 8 9 9 9 7 10 8 9 10 9 9 10 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 9 9 9 11 13 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 8 3 0 3 8 7 8 6 6 8 8 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 15 13 10 9 9 10 12 11 11 11 9 10 10 10 10 10 11 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8
8 8 11 10 10 9 11 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 10 10 12 10 10 10 8 8 6 6 6 8 9 6 6 8 8 8 8 11 13 8 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 9 3 0 3 11 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 10 11 9 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 10 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 10
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 10 8 10 6 6 6 7 6 6 11 10 6 6 6 6 8 10 10 12 10 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 10 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 11 11 11 9 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 7 7 6 6 6 6 6 8 8 9 10 13 10 10 8 8 6 6
6 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 11 10 10 9 9 9 10 9 9 10 21 21 35 35 37 39 39 30 30 28 24 26 32 37 37 34 23 13 9 9 9 10 9 9 9 16 17 19 26 21 30 37 33 33 33
33 33 33 33 37 37 37 30 25 18 6 6 6 6 7 7 9 11 24 9 13 14 8 8 8 11 14 23 37 36 41 33 33 33 33 36 53 57 53 53 50 50 53 37 37 37 37 36 37 57
57 50 48 48 42 42 42 48 48 68 68 54 54 54 54 54 42 43 39 39 37 46 46 48 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 57 57 52 52 57 59 57 54 54 52 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 62 62
62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 43 39 35 35 31 35 35 39 43 43 47 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 45 45 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 57 59 59 59 59 59 43 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68 59 59 52 52 52 50 59 59 59 52 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57
50 57 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 57 57 57 46 46 46 43 43 43 43 43 43 44 44 54 57 54
57 43 42 39 35 32 39 39 43 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 57 48 48 59 47 47 35 35 32 37 37 41 41 32 32 41 43 43 41 47 46 46 43 43 43 43 39
39 33 33 32 33 39 37 37 39 35 34 34 28 28 22 21 21 18 18 22 28 37 26 34 37 37 37 43 43 48 39 37 37 29 22 22 21 21 18 16 19 25 24 27 27 22 19 19 15 15
15 19 18 11 13 13 26 26 27 27 15 15 15 21 24 29 16 17 16 10 8 8 8 8 8 10 8 9 10 12 12 10 12 12 21 24 21 23 11 12 12 24 22 26 22 12 8 8 8 8
8 8 11 13 12 11 11 11 12 12 12 12 11 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 15 19 22 12 11 11 14 13 11 9 9 8 10 8 10 10 10 13 14 15 14 19 10 10 10
10 10 8 8 6 6 8 8 9 11 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 8
8 10 10 8 8 11 11 10 15 12 12 12 |