BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-428J02.T7 (MSMg01no428_j02.b1) | MSMg01-428J02.TJ (MSMg01no428_j02.g1) |
ACC | AG521503 | AG521504 |
length | 960 | 746 |
length of high quality (start - end) | --- | 518 (81 - 598) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no428_j02.b1 PHD_FILE: MSMg01no428_j02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:50:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no428_j02.g1 PHD_FILE: MSMg01no428_j02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:50:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | GGGCATTCGGTTGTCGTGTCTTTCCCTCCGGGGCGCCACCTCCAAAAACC
ATTGAACACACCTCGACAAGGCCCCCCGGGCTCGTATACGAGTCTCTTCC
CTTGTCACAAACTTTTTTTGTCAGCTTCTACCCGCGATCCCACGTCATTA
CACCACCTCCCTCTCCCCCCGTTCTTATCTTGATTACCATCCTTCCCGTG
GCCTCGCCTCTTAGTAGACAACCATATATATAACGATCGCTCCCCTATCT
CACTTCAGCCCTCCCGTTCTTTCGCCACAAATTTCTACTCAGTAGGCTGA
TATACCATGCCAACCATAAGATGCTACTATACGTCCTATTTACCTTCATT
AGGGATCTGTTGGTTATGCCACCCGTNCTTCAATATTTTATTTTCAAAAC
ATTTCAAGTTTTCCGAGTGGCATATCAGCCTACTCATAGAGCGCCCATAC
CCCTTATTCGCCACCCGACGGGCTATTGCTACCTTTCCAAAAATGATTAG
TTAGTAAATAAAGATAAGCAACCATTTTTGCACCACCCACACACACTTAT
CTAACCTCACACCCCACTATTCATGACCTCCAAAAACCTAGTATCCAACG
ACCAAACGCGAATTCGCAGATGAACATCCCATTGGCCAACTTACCCACCC
TATGCCATAGCCGACGAAATTATAAACCGTGTTAACGACAATCACCGTAA
TTAAAGAGACAATAAACAATACCCAATAGAAAACGCCGCATCCCACGACG
ACAGAGCCCCACCATAAAGAGTAATATCCAAAATCTACGCCCCCCGCAAT
ACGTACGACTCGCGTCACGTTTCAACCGGTGTTGTTCAATACACACCTGC
GTCCGGAGGCCGCCCCTGTAACCCCTGACCGCGCCCCCATGCTTTCTAAC
CCTTCTTCCCCCCGCCCCCCCTTTATCTTTTCTCCCACCCCCCCTATTTT
TATAATTCGC
| NGGGCGAATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTCATTCTCCTACCTCTT
AACTTATAGATTTGCTCGTTCGTATGTCCCAGGGACTCAGATGTTGCATC
CCTGTGCTTCTTAAGATTTACTATGCTTTGACTGAGTGATCCGACTTCTC
TAGCTTGTCTCCAATCACTGGTATCCTAATGTGCCCATGATTATTCTACT
GATGAGACTTTCCACTTAGTTTTTTATTTGATTTATGAAGTTTTTACTTC
AAGCATCATTTTAGCGTGACTTTCTCCCATATCTCTATATTTGGTTCAAT
TCTATTTTCATATTCTCAATTGTCTTTGATATTTCATTTGCTTCTTCTCT
CTGAGCATTCATCCAGGCATTTTATTCTTATCCTCTTTGCATCCATCTGG
AAGTGAGTTCATGTTCTCTTTGAAATATTTGTATTTTCATGGAAAATATC
TATAATTTTAAAAGTATTTTTTCTGAAGATTTGTTTAAATTACTCTCACT
GGGGATTACATGTTTAGTAATTTAGGAGGAAACATAGTCTGTGATTGTGA
TAGAGCTCATGTTTTAAGATTGGTCTTGCCACGTGGAGGCAATTTGCTGG
TTTGGTCTTTGGTGTGAGTTTCTCACCTACTTTTTCTGACCGAGTGGCTT
GAAATCTCCCTGTTGTTCTCTGGCTTTAACAATTGCCTTCCCCAAG
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 11 15 11 12 11 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 13 13 17 10 10 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 11 11
10 10 10 10 8 10 10 12 10 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 11 11 11 10 17 10 8 8 8 8 8 10 10 9 11 10 9 6 6 6 6 8 6 10 11 11 10 10 10 10 9
9 13 10 11 11 10 8 8 8 8 10 10 8 8 10 10 11 11 10 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 13 15 17 11 11 11 10 9 8 8 8 10 10 11 21 13 12 8 6 6 10 10 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8
6 6 8 8 6 7 12 10 12 10 11 8 8 8 11 10 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 10
8 9 8 8 8 8 11 11 14 13 16 12 11 11 8 8 8 8 8 8 9 12 11 11 6 10 7 6 8 8 8 8 9 9 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 15 19 19 15 13 10 10 10 9 9 9 9 9 8
8 8 8 8 11 11 11 11 11 9 9 9 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 8 8 8 3 0 3 8 8 9 9 9 9 11 11 9 9 9 12 15 12 13 15 15 16 15 8 8 6
7 8 8 6 6 8 8 8 13 8 8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 13 18 13 13 12 8 8 7 6 8 8 8 8 10 10 9 9 10 13
15 15 13 8 8 10 10 10 8 15 10 10 8 8 8 8 11 10 13 8 11 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 7 10 6 6 8 8 11 10 10 12
8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 11 10 10 8 8 6 6 7 8 12 8 12 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 6 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 13 13 13 11 18 10 10 8 12 6 6 8 10 10 10 8 10 11 16
10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 10 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 10 11 10 10 11 11 10 9 12 12 13 18 15 12 10 12 11 11 11 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 12 9 10 9 10 9 10 11 13 15 12 10 9 9 9 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 9 9 9
9 10 11 10 8 8 6 6 6 8 6 10 13 11 11 13 15 10 10 10 10 10 12 16 11 9 9 9 9 9 10 8 9 7 6 8 8 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
7 7 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 12 13 11 8 10 10 8 7 7 11 8 11 11 11 10 8 9 9 11 9 13 11 11 11 11 12 12 12 12 12 10 15 15 10 10 10 13 10
10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 12 11 10 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 9 8 8 6
6 8 8 9 10 11 11 11 11 11 11 11 12 11 8 8 8 8 8 8 11 11 9 10 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 10 10 7 7 8 8 10 9 9 9 9 8 8 6 6
8 8 8 11 11 16 13 17 11 11 8 10 8 8 8 13 22 15 12 12 14 12 10 8 6 6 8 8 8 11 9 9 9 9 18 11 11 11 10 10 11 10 14 10 10 10 10 12 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 7 7 8 8 8 8 7 9 15 3 0 3 23 23 31 36 41 39 39 41 37 37 37 32 28 26 34 30 30 25 16 6 6 6 6 6 6 8 8 11 12 21 21 39 37
37 44 44 38 36 33 33 33 33 37 37 37 42 27 19 10 9 9 9 10 11 11 11 22 17 28 33 33 33 33 48 48 47 47 47 47 53 50 59 59 57 59 59 59 57 50 50 50 48 48
57 57 68 68 68 68 68 54 54 54 50 48 53 54 54 43 46 43 48 43 43 37 44 48 57 57 47 47 42 37 30 32 32 50 42 47 42 37 30 43 43 68 68 57 57 57 48 47 47 57
57 57 57 59 59 54 57 57 57 54 50 44 44 51 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52
43 59 57 57 57 59 59 59 59 57 43 39 39 57 57 57 52 52 57 57 57 57 44 43 43 43 57 59 59 59 59 59 43 42 42 41 39 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 62 44 62 43 43 31 31 31 43 43 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 38 38 20
20 38 32 43 43 39 39 39 43 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 44 44 28 24 18 13 13 15 38 38 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 38 32 38 38 52 57
59 59 57 54 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 57 50 48 48 57 57 47 48 48 48 57 57 54 57 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68
68 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 46 59 59 59 48 48 48 59 41 59 59 59 46 47 46 43 59 59 44 41 41
44 44 44 47 47 50 59 48 48 48 48 48 43 47 40 43 43 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 46 47 48 57 43 40 34 33 43 43
40 44 44 57 59 57 47 47 47 47 50 50 57 57 48 43 43 43 47 47 47 41 41 37 32 24 24 34 28 34 34 40 39 37 37 39 36 36 35 31 31 34 43 36 26 26 26 26 36 39
32 31 36 43 37 34 34 33 28 28 25 31 21 21 16 17 24 30 34 28 18 14 15 21 18 31 41 31 36 37 32 34 23 19 19 12 11 14 18 29 21 28 28 33 24 21 11 11 11 19
19 15 27 26 23 23 12 9 9 9 9 11 14 30 28 21 12 12 12 19 19 17 13 11 12 15 22 13 12 10 11 11 10 12 12 18 15 15 13 15 10 10 10 21 13 15 15 15 12 12
16 12 17 14 24 25 22 25 17 12 8 8 11 10 10 15 19 19 20 20 16 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11
8 8 10 10 10 13 15 12 11 10 10 10 9 9 8 8 8 10 8 8 10 12 11 17 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 |