BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-438H08.T7 (MSMg01no438_h08.b1) | MSMg01-438H08.TJ (MSMg01no438_h08.g1) |
ACC | AG529048 | AG529049 |
length | 828 | 783 |
length of high quality (start - end) | 353 (41 - 393) | 379 (76 - 454) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no438_h08.b1 PHD_FILE: MSMg01no438_h08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:04:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no438_h08.g1 PHD_FILE: MSMg01no438_h08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:04:15 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
ATATTTCTCTGCGAGCATGAACCCGGAAATTGTAGGCATCTACATTTCAC
CCTTAACGAGGCATCTGTGTATCTGCAATGGCATCCTCTTACTTTCTCAA
AAAGCTGTGTCAGAGAAGGCAGGATGAAATTTGAACCCATACTCATTCAG
GGCAAGGCAGACGTTCCCTGTGCTCTGGGAAGATAAAGGACCCGGACAGT
GGAGTTTATATCATCAGCCCTAAGTGCTTTATGATTCCCTGAACAGCAGC
TCATTTCTGTGACCCTCGGTAGCACAATAGACCTGCTGAGCCAGCTCAGC
TCTGTGCAGTGGTACACCCTTTACCACTCCGGGAGGGGGGGGGNAAAGCA
NGAAATACATGCTCCCCAAGGACCAAGGTTGAATAACAAACAAACCCTTT
CTACAATTCTAAGAACAACATAATACTTCCGGTGCTTTACTATTTTATAA
GGTGACAGTTTGGTCACCCTACTCCCTTACTTAACTTTCTGCTTCATATT
CCCTCATCTACCTATTTTCTCTCCTTTTCTTCCTTCACTCATTTTCTATC
CTTCTACGCCCTTCTTTTTTCCTTCTTTTTTTAATTTCAAATCATTTCCT
TTCTCTCCTCTTTTTTCTTTCTTTTTTCTTTTCCTCCCCATTTCTTCCTC
TCCTTTCTCCTCGCCTCTTTTCATCTACCTCTCTCTCCTCTTTTATCGAC
TAACTCTCCCTCCCCCTTCTCTTCTTCTCTTTCTATTCTATTCTTTATCT
CCACATGTTATATCTTATATATCTTTTN
| CGATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATAATGGTCTTTGTCTGCTGTAAG
GAAACGTTACCTTGATGAGGGACGAGGACTACACTTCCCTCTGGGTATAA
GGACTAATATTTAGGCTGTCAGATATTATGCTGGCTTAGTACAGTGGTAG
TTGTGGATTCTCCTCCAAGATCCATGACTTCACTAGCTTTGTGTAGTTGG
CTAGGTTTCCAGCACCAGGCATGGGCTCCCTCTTACTGAGTGTGTTTTAA
CTGCATTTGGACAGTTGCTGGTTATTGTCAAGGTATTCATGTCACCACTG
TGTTCTTAACTTGCCATGACAAACTTTTCTATAGGACTCATAGGTTTTAA
AGAGCAGATAGGGGCTCAATCCTTCATATTGTTTGTAGTTTTGCAATGAG
ATCCAGCCATGTAAATTTCTTTGGTTAATTCTGGGCCTGATGTGTACAGA
GAAGCTTTGGACCCCAATTGATAATATGCTAACCACTCTTTTCTAAGGGC
CCTCTTGCCAGATAATTTTGCATATTTGATATTTATCCTTCCTTTCTCTT
TTTCTCGTTGCTTTTTCTGGTTGGTAAATGGCCTTTTGCCTGTCTCAATC
TTGCTCAACATTCCTTTGCTACTGCCCTTTTCTGTGTTAAATCTTTGTCC
TCTTCTTCTTCTTCTTTTTGTTCCCTCATCCTCCTTCTTCTTATTCTCCG
CTCAATCTTACTTCGCTCTCCTCTTTTTTTATC
|
quality values | Open.Hide.27 27 27 28 13 13 12 11 14 17 14 14 14 16 15 25 37 37 37 47 31 31 31 30 27 21 19 7 7 7 8 7 9 9 12 9 9 9 9 10 17 23 37 59 33 33 33 33 41 37
37 33 33 43 43 23 23 11 10 8 11 10 10 8 19 19 33 33 33 43 43 57 57 50 57 57 43 43 43 47 47 47 47 47 53 57 57 59 59 59 68 68 68 68 43 42 42 41 43 43
50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 43 28 28 37 43 43 47 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50
57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 57 57 57 57 57 68 68 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 38 38 17 17
19 38 44 57 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 44 43 43 47 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 48 57 57 57 48
59 40 40 30 43 43 37 41 30 41 40 43 43 43 43 42 48 48 48 59 48 48 48 48 48 48 48 48 43 41 37 36 36 33 33 33 50 59 59 39 23 23 3 0 3 23 23 23 16 3
0 3 22 22 15 11 11 12 12 11 13 12 12 14 26 25 26 15 15 13 15 16 28 24 24 15 15 13 18 24 34 18 16 16 12 15 10 10 9 9 14 14 26 23 21 12 18 15 16 13
13 13 11 11 11 12 15 18 16 16 16 10 10 9 10 11 16 16 15 15 13 18 13 13 15 21 15 19 10 10 10 10 12 16 16 15 14 13 8 8 8 17 19 15 13 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 10 15 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 10 10 9 8 8 10 10 8 8 8 10 10 12 8 11 11 11 8 9 8 8 8 8 6 6 8
6 9 9 10 10 11 11 11 11 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 21 10 12 10 15 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 17 19 11 11 11 9
11 9 9 10 9 9 9 9 9 12 15 12 11 11 11 13 13 12 10 13 13 11 10 12 10 12 12 15 21 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 11 11 11 8 10 10 10 10 10 12
18 13 19 19 19 13 9 8 8 8 10 10 8 13 15 15 15 12 8 8 11 11 12 9 14 21 15 15 13 15 16 13 11 11 11 11 12 15 11 11 11 11 11 15 9 8 8 8 8 8
8 8 10 8 10 8 10 8 8 8 8 9 11 11 9 8 8 8 12 12 13 19 21 17 11 9 9 9 9 13 12 16 13 10 10 10 10 10 9 12 12 11 12 10 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 10 12 11 11 10 10 12 13 18 23 10 10 10 8 8 8 11 8 10 8 8 8 8 18 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 9 8 8 8 8 8
9 9 7 6 8 11 12 8 9 9 10 10 13 13 11 11 10 9 10 10 10 10 13 11 17 18 3 0 | Open.Hide. 6 6 8 19 10 10 9 8 8 8 9 9 14 19 37 37 31 37 39 44 44 39 39 37 31 31 37 37 27 21 13 6 6 6 6 6 3 0 3 12 12 22 22 37 37 39 44 33 36 36
36 36 33 41 37 37 41 25 17 9 9 9 9 9 18 19 34 34 37 29 31 31 31 36 36 38 38 42 36 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 57 57 47 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59
59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 44 44 29 43 43 44 38 57 57 57 57 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 38 38 15 16 11
15 15 27 41 44 57 68 57 57 57 59 57 39 39 36 36 36 38 40 37 39 42 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 23 23 24 34 34 68 68 68 68 59
59 54 59 54 59 59 59 34 34 11 16 16 11 26 15 12 15 12 24 24 40 59 59 57 48 48 57 57 57 50 50 39 41 37 30 28 34 34 43 36 25 17 12 11 11 23 22 32 32 20
20 24 31 19 12 12 9 9 9 17 18 21 24 20 20 28 32 28 24 20 20 19 15 6 6 8 10 11 14 20 20 18 22 19 11 11 11 17 18 26 27 13 13 11 13 13 15 15 11 11
12 11 12 11 11 12 24 22 12 12 19 13 10 8 9 9 9 11 23 10 8 8 8 10 13 21 12 12 11 12 12 10 8 8 8 10 10 11 11 9 10 10 8 8 8 8 10 16 11 11
10 9 9 9 11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 12 9 8 10 10 8 8 8 8 8 11 11 8 10 10 9 10 14 10 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 10 10 10
12 12 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 10 13 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 6
6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 9 10 10 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 15 17 15 6 6 8 8 11 10 10 10 8 6 6 8 8 8 10 10 15 15 17 10 10 10 9 10 8 8 11 11 12 10 11 9
8 8 8 8 8 11 10 9 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 10 11 10 17 12 24 24 18 14 8 8 6 6 6 6 |