BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-469N15.T7 (MSMg01no469_n15.b1) | MSMg01-469N15.TJ (MSMg01no469_n15.g1) |
ACC | AG552990 | AG552991 |
length | 777 | 756 |
length of high quality (start - end) | 189 (125 - 313) | 239 (72 - 310) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_n15.b1 PHD_FILE: MSMg01no469_n15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:46:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_n15.g1 PHD_FILE: MSMg01no469_n15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:46:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATCATTCGCGTCGTTAAACGAATCACTTTCAAAACAGGATCCGCGGAA
ATCTTCTATCCCGAGAGAAGCACAGGATCAGCTGCTTCTGCTGGAACAAA
ACAGACTGGAAAGGGACACACGGGGACTGGATGGCAAAAGTGTCCTGTGG
GTAGAGTAATCTGGCCCAGTGAATGCATAATATTTGTCCAAACTTATTGA
ACGGGATACTTTCGATTGGGACACTTCTGCATGTGAAATTTTCCTCCAAC
AAAAGCTAAAAGTAAATATGAAATTGTAATAAACAAATGGGACGGTGCAG
TTCTTGAGAAAGCTTTTCTTCAGTGTCTACAATGTGCTTTAAATAGAAAG
AAACAGAAGAGGGGTCAATGGTGAGCAGTGGATGTGTGGGTGGATGAAGC
AAGAATCATAAAAATTTAATGGCGGGATAGAGCTCATGCGATTGTTTTCT
TTAAAACTTTCATAGTTTCTTTAGCTTAACATTTAAAAAAAATATATGGA
CTGTTGAACGGAACAGAATACATGTGGTAAGCTTTAAATACCTCCTGCTC
TATGTTTCTTGTTACTGGTTCCAATTTCCCCTACACTCTCCCCTCACTGT
GCTTCTCGCCACCCCTTAGATTACGATTTTCTCTACTGCTTTCCCCTTTT
TTTACCCTTCTTTCCTAACGCCCCCGCTACCATGATTTACCCTTCCCCCT
TCTCTCCCCTTATCCATTCTTTTTCCCTTTCCCCCTTTTCTCTCTTCTTT
CTTTTACATTCCCCCGCCCTCTCTCGT
| CATTGCTGTGGGAGGCCTGGGGGNCGCCGGTTCAACATCATGAGGTGAAC
TATAGAATATCAGAACAATTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCT
TAACCTCTGAGCTATCTCTCTAGCCTCATGTGCCAATTTTTTTTTTATTT
TATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCGAATGCTATACCAAA
AGTCCCCCATATCTACCCACCCCTCATGTGCCAATTTTTAATGTTCATTT
ATTTACATGCATGTGTCTATGTGAGTGTGTGTACGTGTATGTGTGGGTAC
CTGGGGAAGCTTGAGTGGNATCAGATCCCTTGGCACTAGAGTGGCAGTGA
GCCACTTGATGTAGGTGCTAGAAACAGAACTCTGGTCTCTGCAGGAGTCA
CAAAGTGTTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTAGCCATACCACATATTAGTT
TAGTACCAGCATCTTCTCTGGAGATTACTAATTAGCTTCCTTTTATCTAT
GAGCACAGCTTGCCTACTGAGATCAGCCATCACACCGCTGTTCACAATGA
CACAGTTGAGGCTGCTCACACTGGTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCCCTCCT
TCTTTCCTTCTTTCATTTTTTCTTCCTTTATTTCCCCTTTCCCTTTTTCT
TTTTGTTCCTCTGGCCTCGATGCGCCTTTCTTCCCCTTTTTTTATTTCCC
CCTTCTTCCTTCTTTTTTATCCGATAACCCCCCCCCCCCTTTTTTTTCCT
TCCTTG
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 10 11 10 12 10 8 8 7 9 9 9 9 10 10 10 9 11 6 7 7 9 7 8 8 7 17 17 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 18 21 36 59 24 17 12 12
12 24 22 25 12 12 9 9 9 12 14 9 9 9 11 11 14 14 14 15 16 19 22 29 29 31 31 36 21 21 11 11 13 30 31 50 48 46 46 47 47 59 59 41 28 27 30 32 33 33
33 33 33 33 33 43 43 41 43 37 36 24 24 14 14 14 28 28 23 19 16 23 18 16 11 16 26 32 42 42 42 43 37 30 30 30 39 37 32 32 30 30 30 39 40 46 37 32 32 39
39 32 33 33 37 37 28 28 28 28 20 20 28 33 25 24 34 32 30 30 37 37 37 37 37 39 41 39 39 39 42 42 47 47 47 39 35 35 35 42 42 57 59 59 59 57 54 48 48 48
43 42 42 32 32 32 42 42 50 54 46 46 39 39 39 48 43 57 44 37 37 40 42 48 57 57 48 46 44 43 42 42 37 39 44 42 50 50 50 38 48 44 42 42 24 20 12 12 12 15
17 24 32 42 44 47 40 37 30 30 30 44 44 39 35 35 37 44 44 47 39 39 39 59 59 47 43 36 35 42 37 43 43 43 39 43 32 30 24 29 24 18 30 24 33 33 43 43 39 39
39 39 47 47 34 41 34 30 21 23 18 12 12 11 12 9 7 7 7 8 8 11 11 27 29 34 39 37 37 37 48 48 57 48 48 59 57 48 43 43 43 43 48 57 46 39 39 39 37 37
32 23 18 18 17 19 19 14 23 18 31 23 21 21 14 21 24 32 32 35 35 41 41 36 40 25 28 28 32 23 25 25 36 33 37 42 32 28 27 32 28 27 27 33 36 36 32 24 20 20
24 41 41 41 41 41 35 32 30 27 30 28 32 28 28 29 29 18 15 22 15 12 10 10 10 13 15 26 22 14 14 18 21 31 43 28 32 17 15 15 15 12 17 19 30 41 59 59 48 47
37 34 28 25 25 25 26 24 14 14 12 12 13 13 26 22 25 12 10 10 10 10 12 9 9 9 15 14 24 28 28 24 24 21 12 12 13 15 21 20 30 30 37 37 39 32 28 23 23 15
26 21 24 28 18 18 14 15 12 12 12 15 15 15 13 13 13 16 16 11 11 11 11 16 15 12 11 11 11 10 12 8 8 12 19 24 32 25 20 18 18 18 22 19 10 13 8 8 6 8
15 20 28 34 25 22 19 11 12 11 16 15 15 14 11 8 8 9 10 9 9 10 11 11 23 25 19 10 9 10 10 16 15 12 10 10 19 16 20 27 16 15 11 9 12 12 14 12 12 8
7 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 16 13 11 11 10 10 11 13 10 11 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 9 9 9 12 10 11 8 8 10 14 12 11 11 11 11 11 16
16 21 28 17 11 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 10 11 11 11 12 8 8 6 6 6 6 8 10 10 13 11 10 8 8 8 8 8 9 10 11 13 13 10 14 11 11 10 12
12 10 10 10 10 10 11 8 8 8 10 8 9 10 10 8 8 8 8 8 10 13 10 10 9 9 9 13 21 25 28 30 28 24 22 22 12 9 8 7 6 11 15 20 14 11 12 10 9 10
10 13 12 12 11 13 11 10 10 15 15 17 13 8 7 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 | Open.Hide.11 14 11 11 8 8 7 8 10 10 10 12 9 10 10 15 20 19 19 9 7 7 3 0 3 8 7 6 6 6 6 7 8 10 8 8 9 9 8 8 8 9 9 10 19 19 22 18 18 21
27 28 21 21 9 9 7 7 7 7 7 9 9 9 10 10 10 10 13 18 11 15 14 26 35 39 39 41 42 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 50 50 59 47 47
44 44 44 32 32 37 37 37 25 20 12 9 9 9 15 22 31 36 36 28 30 41 59 59 57 57 57 57 50 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59
68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 32 32 15 12 12 17 35 32
39 39 44 35 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48
48 48 59 59 59 47 30 25 16 9 9 9 9 6 6 6 6 3 0 3 9 22 15 32 32 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 48 59 59 43 43 48 59 59 59 57 57 34 30
19 15 14 14 14 18 30 34 42 39 24 24 14 15 19 44 44 59 57 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 48 54 57 59 59 59 47 47 42 42 43 40 36 43 44 44 42 48 43 43 43
44 59 59 59 59 43 35 35 35 42 42 48 59 47 47 37 35 35 40 44 44 44 43 43 43 43 46 46 57 57 57 48 59 48 48 48 59 59 54 54 54 59 59 68 57 57 57 57 48 48
48 48 48 48 48 48 43 43 43 39 39 32 39 39 59 48 48 43 43 37 43 39 36 32 34 33 38 37 37 36 33 30 28 16 16 13 18 21 24 25 39 37 37 37 37 37 37 43 43 32
32 41 41 28 30 12 10 10 10 10 23 22 28 28 19 13 14 23 23 37 31 28 28 28 28 28 28 30 30 35 37 35 36 33 37 28 28 28 31 33 26 28 14 14 14 21 17 22 11 14
10 10 10 14 21 28 15 22 12 13 12 30 30 32 32 30 15 12 9 9 10 15 10 16 16 17 13 14 16 21 33 33 31 31 18 18 8 8 8 12 11 16 28 14 14 12 13 9 9 14
14 24 21 19 14 10 10 10 10 10 11 10 12 9 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 15 11 10 10 10 10 10 11 12 10 10 15 13 12 10 13 10 10 9 9 11 11 18 11 11 10
14 7 9 6 6 6 10 10 15 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 10 14 10 9 8 8 8 8 8 10 12 17 17 15 14 14 12 11 11 18 12 12 11
10 10 10 12 16 22 26 22 10 10 10 10 10 15 10 11 11 9 9 11 10 9 9 9 9 9 12 11 19 19 13 10 10 10 10 21 25 19 15 15 14 21 24 24 24 16 15 11 11 10
10 10 12 10 10 10 |