| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | B6Ng01-001M11.b | B6Ng01-001M11.g |
| ACC | DH840004 | DH840005 |
| length | 1,038 | 898 |
| definition | DH840004|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001M11, 5' end. | DH840005|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001M11, 3' end. |
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (55,288,817 - 55,289,856) | (55,179,226 - 55,180,123) |
|---|
| sequence | gaattctttttttttttttttttttttttttggtttttcgagtcagggtt
tctctgtgtagttcctggctgtcctggaactcactttgtagaccaggctg
gcctcgaactcagatatccgcctgcctctgccatcacgcccacccctccg
atcccccggctgaattctttatcctatttttcacagactgggctaataag
cctgtgctaccatacctggctttggttttgcgtgtttgtttgtttgtttg
ctagctatgaggcagggtctctttattaagtgactctggctgtcctggaa
ctcattacatagactggcctcaaattcacagaaatgtgcctgtcactgcc
ttgttgctgggattgaaggcatggctgtcacacccagccagtgctctgct
tttgtatttatggagaatagcatctctgcatttagctttaagctttattt
acttcgtaatttaacctaattcaggtcagtgaattatgacattgatgaga
ttgtgtcatttagcccatagtattgtttagggctgggggcacggcggggg
tgggggcagtgtttttgttttttaagatagggtttcctggatcctagaac
tcaattagtagtccatgctggcctcgaactcacatcctcctgcctctgcc
ttctgagtgctggattaaaggtgtgtgccactgccatccatccagctagt
agtgtcttaggatgcctcctatgttggtgaaagtgtggattgtcactgta
tatcacatagatcctgtataaacaatcttaatgcaagtgatataaatatt
tatttactcagatatgaaattatatcatttaagagatttcgttaaccaag
tggtcatggaattaaacatttataaaacatttgtaatcttgctagttggt
ttattagttttagtttggtgtgtctgttacaaaagcaaagcctagttcac
tttaaattgctggtaattggaaaacaacagcagattctgggtcagcttta
acaaccaggattgttcacactggcctaaatactgttca
| gaattccaggccaacatggacgggcgaaactctgtctcaagaaaacaaaa
caaacaaacaaaaaaaaaatcaaagaacaaacaaaacaaaacaacaacaa
caacaataacaacaaaacccagatgttctacagcacccacgaagaccggc
cagacttagtgactcccaataaactaaatcgccaacaaagcagattacaa
taacaactgataacaagaacaagctgccttcaggatggcttattaaatca
attgttcagagaccgttcaaagcatgagtcgttccacgctaagagtacct
gcattcgtgatggacagaggaacaagtttccaggatgacaacattacagc
gtggtcggctttgggactggcttcaaggcattcactggaaatgagagtat
tcagagtgacaaagattcatgattaagctggaaaatgtcatggtcctttg
taagtacatgatttgagaagaaaacaagaagataaaagaaaatatgtaat
caacctatgacatcgaatggaaatttcaagacaaatgtttataatgtacc
atttttgtaagaacttagcgtgcttctaaggggattgtaagccatggccc
ttaaaacctctcaggcaggctggctcttcatggaaacttgttacacagat
tgcaatgagccagggttttactctgagacacgactgagagctggaatata
aactagccctgatagaaatttcagatctcaaagaaaagcaaagaaatttg
gctccaaaataggacagattggaacattttttgccaaaggactatgaggc
cgtgaagggaaatgattcgggagaggagaactgggaaccttttgaaagcc
aggcatgaagtagagggcaccccattcctgttgttatctgtgtgtgtg
|
| quality values | Open.Hide.42 16 35 30 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 28 28 28 27 21 19 14 21 25 25 35 43 41 20 41 36 43 36 32 36 59 52 39 45
41 43 36 36 35 35 29 39 34 27 24 37 45 41 49 39 52 43 39 45 52 35 36 49 35 49 36 43 45 38 41 37 35 37 44 52 49 44 30 37 18 52 37 36 35 23 44 36 52 45
49 34 43 34 36 13 26 36 36 29 37 18 12 30 26 27 31 39 44 18 37 39 36 45 35 41 31 39 29 35 41 37 29 36 44 22 35 18 37 52 49 27 44 35 30 35 30 39 36 13
35 44 36 43 49 52 52 27 37 27 35 36 49 36 39 45 36 35 37 36 30 39 45 52 39 39 43 52 59 35 35 36 25 37 26 18 41 37 35 52 44 52 36 36 39 37 29 36 38 23
41 44 24 36 27 36 33 35 36 45 45 32 41 41 43 52 36 52 49 33 49 52 59 36 44 49 59 59 52 39 49 34 39 52 41 41 44 41 43 49 44 39 43 45 49 45 45 49 52 49
45 43 43 23 44 43 43 49 26 43 24 45 27 27 22 50 52 28 39 36 39 39 41 45 39 39 39 43 49 29 36 36 37 36 35 37 37 43 52 32 37 41 36 36 35 37 49 37 49 49
43 43 37 29 36 45 43 41 30 36 37 13 35 37 37 52 52 24 35 36 36 28 36 49 43 45 37 27 39 31 18 44 44 36 36 43 30 35 37 49 37 49 33 36 28 37 49 49 36 49
43 45 49 39 36 41 41 49 52 59 37 49 38 37 31 37 43 23 45 23 23 33 41 52 25 35 45 43 43 28 45 36 49 41 45 33 23 35 52 38 38 27 43 35 39 41 36 41 49 52
59 52 49 41 36 43 43 52 52 41 49 41 36 36 23 43 49 30 37 23 33 26 34 37 26 36 31 37 43 28 41 49 34 24 31 49 52 52 34 37 49 28 43 43 49 41 39 49 50 49
37 49 43 49 37 19 25 43 49 41 50 43 43 49 43 50 34 37 43 43 49 37 26 14 49 21 24 22 14 43 49 49 49 49 50 43 43 49 50 50 33 50 43 35 36 30 25 43 14 33
32 31 43 29 32 24 32 31 43 50 52 39 25 50 50 39 36 32 32 16 26 36 34 38 43 32 50 43 40 28 50 47 38 50 50 53 47 42 34 25 27 38 18 21 22 24 47 53 42 34
38 47 42 42 61 39 27 28 24 23 39 28 50 50 43 42 36 34 38 42 32 53 28 23 29 21 43 24 24 20 38 37 34 38 38 34 38 26 34 23 24 34 28 34 28 45 30 43 38 26
34 35 26 28 24 47 43 34 38 47 27 37 50 52 34 42 50 42 38 39 43 30 53 50 32 19 39 47 20 38 38 32 45 30 37 29 34 30 38 50 43 47 28 52 42 45 37 50 28 53
30 44 28 50 34 45 22 36 45 27 38 45 45 47 19 31 24 39 46 22 34 18 34 31 52 38 39 37 52 21 38 37 53 30 52 27 36 37 47 24 40 22 53 28 42 52 34 31 41 36
52 36 41 33 15 33 29 32 37 14 52 40 26 36 34 53 36 30 52 31 32 24 40 31 41 37 38 20 41 37 53 53 31 33 32 22 53 37 39 28 41 30 22 41 15 29 30 40 25 27
28 32 33 33 30 29 28 34 30 20 29 34 18 45 25 48 25 32 32 33 51 32 32 15 47 27 39 20 39 30 38 24 30 25 16 33 35 25 29 29 22 24 29 13 51 39 25 30 23 51
29 28 29 51 44 21 39 31 39 18 14 39 17 24 20 24 33 46 46 23 35 28 28 23 29 35 20 18 51 43 22 33 13 36 19 26 10 51 30 28 21 22 28 28 34 22 14 19 33 25
24 29 33 12 29 25 26 28 33 15 33 22 30 20 51 29 15 10 22 51 39 25 15 8 46 51 27 18 16 22 51 26 7 5 27 31 11 35 9 33 17 20 23 34 28 25 14 33 31 20
51 28 16 19 20 41 12 21 51 51 28 41 19 20 51 12 32 23 28 21 8 34 17 27 14 36 8 27 27 27 17 38 38 29 13 24 15 38 25 13 25 14 31 22 7 23 19 9 12 14
22 35 18 12 39 19 24 26 29 19 17 24 30 17 9 4 5 7 10 12 23 37 42 28 15 16 16 8 6 11 10 7 8 7 4 4 11 9 28 38 33 13 22 29 9 26 8 32 5 6
5 13 8 28 16 24 7 20 9 29 12 12 21 22 6 5 6 13 6 29 9 26 22 6 9 9 10 36 18 5 6 15 11 19 5 17 17 9 | Open.Hide.61 47 61 49 61 55 49 12 15 13 22 10 11 13 12 10 13 31 41 59 59 59 61 61 61 61 59 59 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61
59 59 49 52 52 35 30 30 35 45 59 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 59 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61
59 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 59 59 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 59 59 61 61 61 61 59 44 61 59 59 61 61 61 61
61 61 59 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 55 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 55 55 61 61 55 55 61 61 55 55 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61
61 61 55 50 61 61 55 61 61 61 50 55 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 55 61 50 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 43 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 43 61 61 61 61 61
61 50 53 53 61 53 53 61 61 61 61 61 61 61 45 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 52 53 53 57 57 57 53 57 57 57 53 52 57 53 53 53 57 57 53
53 57 57 57 57 57 53 52 53 57 42 57 57 52 57 57 52 53 57 52 50 57 53 53 53 53 52 50 53 47 57 53 57 39 19 57 53 34 53 53 53 47 47 50 53 57 53 50 53 53
53 47 53 43 52 53 47 47 43 47 57 53 50 33 57 52 33 34 57 42 53 53 46 45 53 53 57 53 53 42 50 57 53 57 57 53 45 52 53 57 32 47 47 53 34 53 42 40 52 37
47 57 50 39 34 37 57 53 36 34 31 31 53 57 57 35 57 53 50 38 34 40 50 53 53 52 27 32 28 40 40 37 53 41 53 52 43 21 52 36 44 37 40 40 40 42 42 40 35 29
53 37 37 37 31 36 38 46 53 40 53 40 34 40 36 53 57 33 29 57 53 40 41 29 47 34 40 48 41 40 57 40 40 53 57 57 41 22 30 26 45 46 29 44 26 25 31 46 44 44
47 30 39 31 44 29 47 48 39 29 30 27 32 31 29 33 26 38 20 29 30 18 24 26 18 29 48 51 51 51 51 41 29 24 27 24 47 36 28 36 29 24 29 29 29 29 48 24 39 16
37 30 32 29 29 30 17 46 27 34 51 34 25 28 33 24 46 29 33 46 34 31 20 36 14 36 34 12 41 29 27 29 30 39 25 13 41 17 17 20 30 46 30 28 39 36 30 22 30 26
22 24 32 26 16 28 36 29 32 23 31 38 23 30 10 44 20 10 10 18 41 46 40 14 21 36 21 30 21 20 5 16 7 4 7 7 21 28 28 21 10 17 10 6 7 30 9 7 |