BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-003J19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 72,375,480 - 72,500,051
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGfra2, LOC100043132, LOC100043136, LOC668477
Downstream geneLOC668482, LOC675957, Fndc3a, LOC100043721, LOC100043723, LOC668487, LOC668489, Cysltr2, LOC100043149
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-003J19.bB6Ng01-003J19.g
ACCDH841270DH841271
length1,0741,098
definitionDH841270|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-003J19, 5' end.DH841271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-003J19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,375,480 - 72,376,552)(72,498,958 - 72,500,051)
sequence
gaattcaacctgagacctagagagaaaagtatgcagcatagagggaaaag
ttgacaaaatggataaaatggtcaataatatggaccattttataagtttc
tgtgacttcctttaacaacaatacaatgggctcacacccagacctacatt
gtagaatctaaaaccaaataacttccagaagaaaatgtaagagaaaaatc
tttgtggtttcagtttgttttgttcctttattttactgcgacatgaagag
aattatctctaaaaaaatgaacaatcatgcaaacaaaattaaaacaagaa
ataaaaatttgactttagttgtgaaaaagtaggaactgtagggagctgcg
atgatatgaatgtatctcataatcatggtgaaaggaagaagccagaaaac
atgcaagtgacacttgagagacataaaactgagcagcagttgcaaggggc
aaagaaggaggtgggagctctgtgagaaaagaggttgtagtagaagggat
tgtgggggtcttcatcaccctaatggtggggacaatgctcatagaaatac
attagagcatgccagcttgacactttaacaatatgagatttattgactac
cagttacacattgggaagctattttacaatctttaaggtaattttttttc
ttcagtaaatccatttaacagatgcagaactggagctggagagaaggaaa
tgctatcctcccttcaatggtcaagacaccaggtctacttatattagccc
aaccacaaacacagatactggactgtggtattatttcatgacatctctag
ctttattaagtaaatgaaattcttcagtcccaatataatatttggagcaa
ctgtaatacatatggctgatcatggactcagatgtcagtaaaaggcacat
ggcagagtttgggactcaattcattcctactacagtggacgtctctaaac
tagctgtccttctcctgcatgttttatcattgaggggatccacagtgcat
gacgaacaagcttttctcaaatatatttacattattttcagatctatact
cggaataggctgctagagctacaa
gaattctttcttctctactagaaggtagaacttctccaaatgttatccac
acactgcgtgtgtctctagcagggagggagtgttaaggcctctgcactct
catggaacaggaggttaaacaatgtatatgttcagccttgggagtggtac
tattagatgtggccctgttggagtaggtgtagtcttgtttgagtaggtat
gtcacagtgggtgtagactttaagaccaccatcctagctgcctggaagct
agtattgtgctagcagcctttagataaagataaagaactttcagttcctc
ctgcaccaagggtgccatgttccagccttgatgatactggactgaaccta
tgaacctgtaagccagccccaattaaatgttgtccttataagagttacca
tggtcatggtgtttgttcacagcagtaaaaccctaagacactagctaagg
ctaaacatatgttaaaggggacacactcttggcaagcattctcccgatcc
acagcttgtccctcaagctctctgtacaagcaggtactgccccttcccct
ctcttaatgctcatgcttaaatcagtgctccccataaatgccaacttcca
tttaaaagtgtgtaaagccaccacatcgaaggtggcggggttgacatttc
tttttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttccttt
ccttttcttttctcttctttcttttctttttttattagatattttcaata
attacatttcaaatgttatctccttcccttgtttcccctctgaaatccct
ctatcccctccccctccctctgctcaccaacccacccactcctgcttcct
ggtcctggcattcccctgtattggggcaccaagccttcacagaaccaagg
gcctctcctcccattgatgtctgtactggctagttttgtgtcaactgaca
cagctggcgttatcacagagaaaggagcttcagttgaggaaatgcctcca
tgagctcaactgtaggcattttctcaattagtgatcaggggaaaggcccc
ttgtgggtggtgcatcctggctggtagtctggggttctataaagagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_72375480_72376552
seq2: B6Ng01-003J19.b_47_1120

seq1  GAATTCAACCTGAGACCTAGAGAGAAAAGTATGCAGCATAGAGGGAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCTGAGACCTAGAGAGAAAAGTATGCAGCATAGAGGGAAAAG  50

seq1  TTGACAAAATGGATAAAATGGTCAATAATATGGACCATTTTATAAGTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAAAATGGATAAAATGGTCAATAATATGGACCATTTTATAAGTTTC  100

seq1  TGTGACTTCCTTTAACAACAATACAATGGGCTCACACCCAGACCTACATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACTTCCTTTAACAACAATACAATGGGCTCACACCCAGACCTACATT  150

seq1  GTAGAATCTAAAACCAAATAACTTCCAGAAGAAAATGTAAGAGAAAAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAATCTAAAACCAAATAACTTCCAGAAGAAAATGTAAGAGAAAAATC  200

seq1  TTTGTGGTTTCAGTTTGTTTTGTTCCTTTATTTTACTGCGACATGAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGGTTTCAGTTTGTTTTGTTCCTTTATTTTACTGCGACATGAAGAG  250

seq1  AATTATCTCTAAAAAAATGAACAATCATGCAAACAAAATTAAAACAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATCTCTAAAAAAATGAACAATCATGCAAACAAAATTAAAACAAGAA  300

seq1  ATAAAAATTTGACTTTAGTTGTGAAAAAGTAGGAACTGTAGGGAGCTGCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAATTTGACTTTAGTTGTGAAAAAGTAGGAACTGTAGGGAGCTGCG  350

seq1  ATGATATGAATGTATCTCATAATCATGGTGAAAGGAAGAAGCCAGAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATGAATGTATCTCATAATCATGGTGAAAGGAAGAAGCCAGAAAAC  400

seq1  ATGCAAGTGACACTTGAGAGACATAAAACTGAGCAGCAGTTGCAAGGGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGTGACACTTGAGAGACATAAAACTGAGCAGCAGTTGCAAGGGGC  450

seq1  AAAGAAGGAGGTGGGAGCTCTGTGAGAAAAGAGGTTGTAGTAGAAGGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGGAGGTGGGAGCTCTGTGAGAAAAGAGGTTGTAGTAGAAGGGAT  500

seq1  TGTGGGGGTCTTCATCACCCTAATGGTGGGGACAATGCTCATAGAAATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGGTCTTCATCACCCTAATGGTGGGGACAATGCTCATAGAAATAC  550

seq1  ATTAGAGCATGCCAGCTTGACACTTTAACAATATGAGATTTATTGACTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAGCATGCCAGCTTGACACTTTAACAATATGAGATTTATTGACTAC  600

seq1  CAGTTACACATTGGGAAGCTATTTTACAATCTTTAAGGTAATTTTTTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTACACATTGGGAAGCTATTTTACAATCTTTAAGGTAATTTTTTTTC  650

seq1  TTCAGTAAATCCATTTAACAGATGCAGAACTGGAGCTGGAGAGAAGGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTAAATCCATTTAACAGATGCAGAACTGGAGCTGGAGAGAAGGAAA  700

seq1  TGCTATCCTCCCTTCAATGGTCAAGACACCAGGTCTACTTATATTAGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCCTCCCTTCAATGGTCAAGACACCAGGTCTACTTATATTAGCCC  750

seq1  AACCACAAACACAGATACTGGACTGTGGTATTATTTCATGACATCTCTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACAAACACAGATACTGGACTGTGGTATTATTTCATGACATCTCTAG  800

seq1  CTTTATTAAGTAAATGAAATTCTTCAGTCCCAATATAATATTTGGAGCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTAAGTAAATGAAATTCTTCAGTCCCAATATAATATTTGGAGCAA  850

seq1  CTGTAATACATATGGCTGATCATGGACTCAGATGTCAGTAAAAGGCACAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAATACATATGGCTGATCATGGACTCAGATGTCAGTAAAAGGCACAT  900

seq1  GGCAGAGTTT-GGACTCAATTCATTCCTACTACAGTGGACGTCTCTAAAC  949
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGTTTGGGACTCAATTCATTCCTACTACAGTGGACGTCTCTAAAC  950

seq1  TAGCTGTCCTTCTCCTGCATGTTTTATCATTGAGGGGATCCACAGTGCAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGTCCTTCTCCTGCATGTTTTATCATTGAGGGGATCCACAGTGCAT  1000

seq1  GACGAACAAGGCTTTTCTCAAATATA-TTACATTATTTTCAGATCTATAC  1048
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GACGAACAA-GCTTTTCTCAAATATATTTACATTATTTTCAGATCTATAC  1049

seq1  TTCGTATAGGCTGCTAGAGCTACAA  1073
      |  | ||||||||||||||||||||
seq2  TCGGAATAGGCTGCTAGAGCTACAA  1074

seq1: chr14_72498958_72500051
seq2: B6Ng01-003J19.g_81_1165 (reverse)

seq1  TGCTCTCTTATAGAACCCAAGACTACCAGCCCAGGGATGGCACCACCCAC  50
      |||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||
seq2  TGCTCT-TTATAGAACCCCAGACTACCAGCC--AGGAT-GCACCACCCAC  46

seq1  AAGGGGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTTGG  100
      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  AAGGGGCCTTTCCCC--TGATCACTAATTGAGAAAATGCC-TACAGTT-G  92

seq1  AGCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCTTTCTCTGTGATAACGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCTTTCTCTGTGATAACGC  142

seq1  CAGCTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGTACAGACATCAATGGGAG  200
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTGTC-AGTTGACACAAAACTAGCCAGTACAGACATCAATGGGAG  191

seq1  GAGAGGCCCTTGGTTCTGTGAAGGCTTGGTGCCCCAATACAGGGGAATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGCCCTTGGTTCTGTGAAGGCTTGGTGCCCCAATACAGGGGAATGC  241

seq1  CAGGACCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGTGAGCAGAGGGAGGGGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGTGAGCAGAGGGAGGGGGAG  291

seq1  GGGATAGAGGGATTTCAGAGGGGAAACAAGGGAAGGAGATAACATTTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAGAGGGATTTCAGAGGGGAAACAAGGGAAGGAGATAACATTTGAA  341

seq1  ATGTAATTATTGAAAATATCTAATAAAAAAAGAAAAGAAAGAAGAGAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATTATTGAAAATATCTAATAAAAAAAGAAAAGAAAGAAGAGAAAA  391

seq1  GAAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAA  441

seq1  GGAAAAAGAAATGTCAACCCCGCCACCTTCGATGTGGTGGCTTTACACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAGAAATGTCAACCCCGCCACCTTCGATGTGGTGGCTTTACACAC  491

seq1  TTTTAAATGGAAGTTGGCATTTATGGGGAGCACTGATTTAAGCATGAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATGGAAGTTGGCATTTATGGGGAGCACTGATTTAAGCATGAGCA  541

seq1  TTAAGAGAGGGGAAGGGGCAGTACCTGCTTGTACAGAGAGCTTGAGGGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGAGGGGAAGGGGCAGTACCTGCTTGTACAGAGAGCTTGAGGGAC  591

seq1  AAGCTGTGGATCGGGAGAATGCTTGCCAAGAGTGTGTCCCCTTTAACATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTGGATCGGGAGAATGCTTGCCAAGAGTGTGTCCCCTTTAACATA  641

seq1  TGTTTAGCCTTAGCTAGTGTCTTAGGGTTTTACTGCTGTGAACAAACACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGCCTTAGCTAGTGTCTTAGGGTTTTACTGCTGTGAACAAACACC  691

seq1  ATGACCATGGTAACTCTTATAAGGACAACATTTAATTGGGGCTGGCTTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCATGGTAACTCTTATAAGGACAACATTTAATTGGGGCTGGCTTAC  741

seq1  AGGTTCATAGGTTCAGTCCAGTATCATCAAGGCTGGAACATGGCACCCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCATAGGTTCAGTCCAGTATCATCAAGGCTGGAACATGGCACCCTT  791

seq1  GGTGCAGGAGGAACTGAAAGTTCTTTATCTTTATCTAAAGGCTGCTAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCAGGAGGAACTGAAAGTTCTTTATCTTTATCTAAAGGCTGCTAGCA  841

seq1  CAATACTAGCTTCCAGGCAGCTAGGATGGTGGTCTTAAAGTCTACACCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACTAGCTTCCAGGCAGCTAGGATGGTGGTCTTAAAGTCTACACCCA  891

seq1  CTGTGACATACCTACTCAAACAAGACTACACCTACTCCAACAGGGCCACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACATACCTACTCAAACAAGACTACACCTACTCCAACAGGGCCACA  941

seq1  TCTAATAGTACCACTCCCAAGGCTGAACATATACATTGTTTAACCTCCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATAGTACCACTCCCAAGGCTGAACATATACATTGTTTAACCTCCTG  991

seq1  TTCCATGAGAGTGCAGAGGCCTTAACACTCCCTCCCTGCTAGAGACACAC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATGAGAGTGCAGAGGCCTTAACACTCCCTCCCTGCTAGAGACACAC  1041

seq1  GCAGTGTGTGGATAACATTTGGAGAAGTTCTACCTTCTAGTAGA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTGTGGATAACATTTGGAGAAGTTCTACCTTCTAGTAGA  1085