BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009J19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 97,291,131 - 97,394,866
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668654
Upstream geneKlhl1, LOC100043366
Downstream geneEG668659, Dach1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009J19.bB6Ng01-009J19.g
ACCDH845507DH845508
length1,1481,091
definitionDH845507|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009J19, 5' end.DH845508|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009J19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,393,712 - 97,394,866)(97,291,131 - 97,292,225)
sequence
gaattcactaatgggtgggataataatactgtttgctatttgcttttgtt
taacttgtcaatgcaacatctattgtgagtgaatgcttagaagtaatttt
gccttttaagtatcataaacattaacaaatgctatttgattcacttacca
atgataggagtagagccatgaaattttcttaaccttttctctagctcaat
aaatcaccagcagacaagaactttaagcccgacttcagtaggaaatcagc
agacagatgtagtgcacattcccaacaaaataattcagaacctgtttcaa
tttatcaaatgcctgctttatctgtcaaagccatgtcccttcttaaataa
agggcattgtttctgcagcgagggaaagggtctgatgcattgttatctgc
aaatggatggcggaataatggaacaacaagcagggtttcaaactaagaga
tcaaaggccagaatgcattacaaatcttgttaaaataaatgagactaaga
gcacaattccaatgaagaccttcatagtctgaaacagtctccccctgttt
tcagaagagatctttaaaatgaatcttaatcccaccataaacaccaaatg
gctttagagcttctgtccaaaaagtgcaatatgcaaagggggtagatttg
aagaattctcatgcaacttggatataaggacctgcgtgtgctcacatggt
agcatttttctgacattgttgatcttcctatatgctgcattttttcatat
aagaaaaactttgttcatattacatctgaatggaattcatatatatttga
ttaggaacatacaactgaaatgaatatgcttattttggttatgttagtca
ttcgtaagtaatcccttttgatttcagtgatttccttatcttattatggc
aaatgggacacattgtgttaaccctctcaagtataagaaaagaatgaaaa
tatatgaattctaaacatttaattattttactcatacacagtaatctttc
atccaggcactctcagctcaaatgcgtgtttaaactatcattgcagtgat
gatgatgagatgatgactgctggcaccatcttaccctggaatctgacctg
tgacagtacagctgatgtattcgtcctctgcatattgaacctttgtct
gaattcctcttctacttggatttgcattcaaagagtgatgcctgcgtttt
ttaaaaccctgaactgtgtgtgtatggtgtctgtatctgccagttattac
tgctttagactctgtttgcagacaaaggtaaaatgttgcatacattttct
ccacacatgcacttatgaaccctagtgaattactccaaagagaattgcat
gcacctattgaggcagagtgtataagaggaggtttatttctgtcactaat
cactcttgaaaactatggcattaaatagacatatctaacagcagagtgtg
ttaactcagagagaagtctatatcaaggaaaaacagtggctatattttta
agcaacattaagtataaaaataactgaataattatactaatttgtcagta
ttaatcagaagcgagaaaactttagttaatatgcagtataatgacctgtt
tttaaatataattttaattttcttagttatgtattaattttcttagttat
ttattgtatgctaagtacatgttgaccgccccgaaacattttcctctact
ctatattttcctacttctccttcacatttgtcccctttgtttctctagtc
aattttattatcctttcatttattaagtgcattgttttttttttatgatg
caaaatctagaagccacaaattagagaaaacatatggtagggctttatga
gggggactggcttaattcacttaatacaattttgtcatttatttatattt
tctctgaaacaacatgacataaatctttgtagcagaagagattccattgt
ttatgcatgacccatttttgttaacaatttttatgttcttagactaccca
tgtagcttcgtaacttatcttttaaacattggataataattaagattcct
gtacaagtatctctgtaataagtaaagttggagtcctttagatagtacat
agggcctttaacctaagccagttactaggttatgaaactatccatattat
gtccacagaggttagaatcactttacattctacatgtacagagttgcttc
caaccccatctggcaggagcatgtgctattggtttgtattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_97393712_97394866
seq2: B6Ng01-009J19.b_48_1195 (reverse)

seq1  AGAC-AAGGTTCAATCATGCAGAGGACGAATACATCAGGCTGTACTGTCA  49
      |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGACAAAGGTTCAAT-ATGCAGAGGACGAATACATCA-GCTGTACTGTCA  48

seq1  CAGGTCAGA-TCCAGAGTAAGATGTGTG-CAGCAGTCATCATCTCATCAT  97
      ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCAGATTCCAGGGTAAGATG-GTGCCAGCAGTCATCATCTCATCAT  97

seq1  CATCACCTGCAATGATTAGGTTTAAACACGCATTTGAGCCTGAGAGTGCC  147
      ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CATCA-CTGCAATGAT--AGTTTAAACACGCATTTGAG-CTGAGAGTGCC  143

seq1  TGGGATTGAAAGATTACTGTGTATGAGTAAAATAATTAAATGTTTAGAAT  197
      |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGG--ATGAAAGATTACTGTGTATGAGTAAAATAATTAAATGTTTAGAAT  191

seq1  TCATATATTTTTCATTCTTTTCTTATACTTGAGAGGGTTAACACAATGTG  247
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATA-TTTTCATTCTTTTCTTATACTTGAGAGGGTTAACACAATGTG  240

seq1  TCCCATTTGCCATAATAAGATAAGGAAATCACTGAAATCAAAAGGGATTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTTGCCATAATAAGATAAGGAAATCACTGAAATCAAAAGGGATTA  290

seq1  CTTACGAATGACTAACATAACCAAAATAAGCATATTCATTTCAGTTGTAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACGAATGACTAACATAACCAAAATAAGCATATTCATTTCAGTTGTAT  340

seq1  GTTCCTAATCAAATATATATGAATTCCATTCAGATGTAATATGAACAAAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTAATCAAATATATATGAATTCCATTCAGATGTAATATGAACAAAG  390

seq1  TTTTTCTTATATGAAAAAATGCAGCATATAGGAAGATCAACAATGTCAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTATATGAAAAAATGCAGCATATAGGAAGATCAACAATGTCAGA  440

seq1  AAAATGCTACCATGTGAGCACACGCAGGTCCTTATATCCAAGTTGCATGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGCTACCATGTGAGCACACGCAGGTCCTTATATCCAAGTTGCATGA  490

seq1  GAATTCTTCAAATCTACCCCCTTTGCATATTGCACTTTTTGGACAGAAGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCAAATCTACCCCCTTTGCATATTGCACTTTTTGGACAGAAGC  540

seq1  TCTAAAGCCATTTGGTGTTTATGGTGGGATTAAGATTCATTTTAAAGATC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGCCATTTGGTGTTTATGGTGGGATTAAGATTCATTTTAAAGATC  590

seq1  TCTTCTGAAAACAGGGGGAGACTGTTTCAGACTATGAAGGTCTTCATTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGAAAACAGGGGGAGACTGTTTCAGACTATGAAGGTCTTCATTGG  640

seq1  AATTGTGCTCTTAGTCTCATTTATTTTAACAAGATTTGTAATGCATTCTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGCTCTTAGTCTCATTTATTTTAACAAGATTTGTAATGCATTCTG  690

seq1  GCCTTTGATCTCTTAGTTTGAAACCCTGCTTGTTGTTCCATTATTCCGCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGATCTCTTAGTTTGAAACCCTGCTTGTTGTTCCATTATTCCGCC  740

seq1  ATCCATTTGCAGATAACAATGCATCAGACCCTTTCCCTCGCTGCAGAAAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATTTGCAGATAACAATGCATCAGACCCTTTCCCTCGCTGCAGAAAC  790

seq1  AATGCCCTTTATTTAAGAAGGGACATGGCTTTGACAGATAAAGCAGGCAT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCCTTTATTTAAGAAGGGACATGGCTTTGACAGATAAAGCAGGCAT  840

seq1  TTGATAAATTGAAACAGGTTCTGAATTATTTTGTTGGGAATGTGCACTAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAATTGAAACAGGTTCTGAATTATTTTGTTGGGAATGTGCACTAC  890

seq1  ATCTGTCTGCTGATTTCCTACTGAAGTCGGGCTTAAAGTTCTTGTCTGCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTCTGCTGATTTCCTACTGAAGTCGGGCTTAAAGTTCTTGTCTGCT  940

seq1  GGTGATTTATTGAGCTAGAGAAAAGGTTAAGAAAATTTCATGGCTCTACT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTTATTGAGCTAGAGAAAAGGTTAAGAAAATTTCATGGCTCTACT  990

seq1  CCTATCATTGGTAAGTGAATCAAATAGCATTTGTTAATGTTTATGATACT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCATTGGTAAGTGAATCAAATAGCATTTGTTAATGTTTATGATACT  1040

seq1  TAAAAGGCAAAATTACTTCTAAGCATTCACTCACAATAGATGTTGCATTG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGCAAAATTACTTCTAAGCATTCACTCACAATAGATGTTGCATTG  1090

seq1  ACAAGTTAAACAAAAGCAAATAGCAAACAGTATTATTATCCCACCCATTA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTTAAACAAAAGCAAATAGCAAACAGTATTATTATCCCACCCATTA  1140

seq1  GTGAATTC  1155
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1148

seq1: chr14_97291131_97292225
seq2: B6Ng01-009J19.g_68_1158

seq1  GAATTCCTCTTCTACTTGGATTTGCATTCAAAGAGTGATGCCTGCGTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTTCTACTTGGATTTGCATTCAAAGAGTGATGCCTGCGTTTT  50

seq1  TTAAAACCCTGAACTGTGTGTGTATGGTGTCTGTATCTGCCAGTTATTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACCCTGAACTGTGTGTGTATGGTGTCTGTATCTGCCAGTTATTAC  100

seq1  TGCTTTAGACTCTGTTTGCAGACAAAGGTAAAATGTTGCATACATTTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAGACTCTGTTTGCAGACAAAGGTAAAATGTTGCATACATTTTCT  150

seq1  CCACACATGCACTTATGAACCCTAGTGAATTACTCCAAAGAGAATTGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATGCACTTATGAACCCTAGTGAATTACTCCAAAGAGAATTGCAT  200

seq1  GCACCTATTGAGGCAGAGTGTATAAGAGGAGGTTTATTTCTGTCACTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTATTGAGGCAGAGTGTATAAGAGGAGGTTTATTTCTGTCACTAAT  250

seq1  CACTCTTGAAAACTATGGCATTAAATAGACATATCTAACAGCAGAGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTTGAAAACTATGGCATTAAATAGACATATCTAACAGCAGAGTGTG  300

seq1  TTAACTCAGAGAGAAGTCTATATCAAGGAAAAACAGTGGCTATATTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTCAGAGAGAAGTCTATATCAAGGAAAAACAGTGGCTATATTTTTA  350

seq1  AGCAACATTAAGTATAAAAATAACTGAATAATTATACTAATTTGTCAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACATTAAGTATAAAAATAACTGAATAATTATACTAATTTGTCAGTA  400

seq1  TTAATCAGAAGCGAGAAAACTTTAGTTAATATGCAGTATAATGACCTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAGAAGCGAGAAAACTTTAGTTAATATGCAGTATAATGACCTGTT  450

seq1  TTTAAATATAATTTTAATTTTCTTAGTTATGTATTAATTTTCTTAGTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATATAATTTTAATTTTCTTAGTTATGTATTAATTTTCTTAGTTAT  500

seq1  TTATTGTATGCTAAGTACATGTTGACCGCCCCGAAACATTTTCCTCTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTATGCTAAGTACATGTTGACCGCCCCGAAACATTTTCCTCTACT  550

seq1  CTATATTTTCCTACTTCTCCTTCACATTTGTCCCCTTTGTTTCTCTAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATTTTCCTACTTCTCCTTCACATTTGTCCCCTTTGTTTCTCTAGTC  600

seq1  AATTTTATTATCCTTTCATTTATTAAGTGCATTGTTTTTTTTTTATGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTATTATCCTTTCATTTATTAAGTGCATTGTTTTTTTTTTATGATG  650

seq1  CAAAATCTAGAAGCCACAAATTAGAGAAAACATATGGTAGGGCTTTATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATCTAGAAGCCACAAATTAGAGAAAACATATGGTAGGGCTTTATGA  700

seq1  GGGGGACTGGCTTAATTCACTTAATACAATTTTGTCATTTATTTATATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGACTGGCTTAATTCACTTAATACAATTTTGTCATTTATTTATATTT  750

seq1  TCTCTGAAACAACATGACATAAATCTTTGTAGCAGAAGAGAATTCCATTG  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCTCTGAAACAACATGACATAAATCTTTGTAGCAGAAGAG-ATTCCATTG  799

seq1  TTTATGCATGACCCATTTTTGTTAACAATTTTTATGTTCTTAGACTACCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCATGACCCATTTTTGTTAACAATTTTTATGTTCTTAGACTACCC  849

seq1  ATGTAGCTTCGTAACTTATCTTTTAAACATTGGATAATAATTAAGATTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGCTTCGTAACTTATCTTTTAAACATTGGATAATAATTAAGATTCC  899

seq1  TGTACAAGTATCTCTGTAATAAGTAAAGTTGGAGTCCTTTAGATAAGTAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTACAAGTATCTCTGTAATAAGTAAAGTTGGAGTCCTTTAGAT-AGTAC  948

seq1  ATAGGGCCTTTAACCTAAGCCAGTTACTAGGTTTATGAAAACTATCCATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
seq2  ATAGGGCCTTTAACCTAAGCCAGTTACTAGG-TTATG-AAACTATCCATA  996

seq1  TTAATGTCCACAGAGGTTAG-ATCACTTTACATTCTACAATGTACAAGAG  1049
      || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  TT-ATGTCCACAGAGGTTAGAATCACTTTACATTCTAC-ATGTAC-AGAG  1043

seq1  TTTGCTTTCAACCCCATCT-GCAGGAGCATGTGCTATTG--TTGTATTG  1095
       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  -TTGCTTCCAACCCCATCTGGCAGGAGCATGTGCTATTGGTTTGTATTG  1091