BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-013L20
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,920,571 - 23,102,347
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik
Upstream geneAdk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneEG435392, LOC665068
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-013L20.bB6Ng01-013L20.g
ACCDH848481DH848482
length1,163719
definitionDH848481|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013L20, 5' end.DH848482|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013L20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,920,571 - 22,921,747)(23,101,628 - 23,102,347)
sequence
gaattctaggcacgaaccaccatgcctggcaactttcttatgttacgttt
tctgtttgtcctaggctggtcttatggtgatcctcctgcttcagcctcct
aagttctgaggctataggcatgcgtcctcatgatggcggcagcctcctta
ttttaaagagaaagaaacaagagacccaaaggggtgaggcaaattgttcc
ggtcctcaccttgggaatggctgaggtgatagggtgacatgagttccaaa
tcgcaggcccaccttcactgtaaaccagagcttccttagtgctgtggaca
gggccagagtcagatgcaatgtactggagtcagacttaatggatcagagt
cagacctaatggatcagagtcagacctaatgtatcgagcctgaacgaaga
ggaaaccgtctactaaacaggaactgaattgacctaataactattttttt
tgagggacatgtgagaaaggtggggttagagccaaagcattctgggaaat
caggacccagacaagctccttaccacagttctgtcctgagtacctggtac
ctgggacaccagaaggccatgggaagacctggatctagacctggctttgc
ctctgaccagcagtgcagcctttggccgcttttaccccgtttggactaac
tttagtttcctgacttggaacctggagcttgtatgcttggccttccttcc
tcacaagggttctgggaaagaaataggaacgtagagtaacatagctttgc
taactgtggagcgtgcctgtatataagctgttgcttactgtctctgggca
gagatcccatgagagccgggtgcagcagcatgtgtgtacatgtattctct
tgacaaagccggtgtcaccttgaggacatcttgcttcaagtcttccaata
attacacagtagtgtacgtgggggttggtgctctgcgtgttggacactta
ataattacagacgaataagagcctggtatgatgggcacccgagtgtgctg
cccaaggcttcgtgtgatctgctgtcatgtgctttcacttaaatgagcag
aggcctgactaattcaactgagacatgtgtagctcagaagctgtacagct
gaatatgtagagacctgccttcaagtctgtctgtgccagaattacagagt
gaccgtaatttgt
gaattccacctcagcagagggatttgggagtgtgtttctatcgccaggat
ggctccagacaaaggaacaacatgacacatcatgtcaagcagctaattat
gagcctgaagaacagctcgaagacttaggccagattaaagggaaaggccg
cgggggcggtgcttctccattgcttctttggatccatttgtgcagaaggg
gctgatgaggtttaagtctttgtacctttgagttccaaagcaaaacaaaa
ccaacaggttgaggaaattaaatactgcccagacccctggacaacaaagc
attgtttaactgctgcaaaggaaaaacaacaacaacgacacacagtggtt
cttcaactcgacagggccctcctgaacatcttaggatatccagagccaca
ttcacggggtaacgcaacaatcccacccaacgacactgaggcaaaatcac
aaggcttggggaaagccaggcaaattctcagctcattgctcctcactgcc
aaagacaacagtcagacacacttcttcctccgctgagagttgtgtgaatt
taatggttcaagggtttgaccaagcaaaagtgacaaagaagatctgattc
ctgtgggtctctaggagtttagacttcatgtgacttgtatcagggcttac
agaaggtaatgtagggagctcagctggtaagcctgagcttgcaatcaggt
aggggtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22920571_22921747
seq2: B6Ng01-013L20.b_49_1211

seq1  GAATTCTAGGCACGAACCACCATGCCTGGCAACTTTCTTATGTTACGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGCACGAACCACCATGCCTGGCAACTTTCTTATGTTACGTTT  50

seq1  TCTGTTTGTCCTAGGCTGGTCTTATGGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTGTCCTAGGCTGGTCTTATGGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCT  100

seq1  AAGTTCTGAGGCTATAGGCATGCGTCCTCATGATGGCGGCAGCCTCCTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTGAGGCTATAGGCATGCGTCCTCATGATGGCGGCAGCCTCCTTA  150

seq1  TTTTAAAGAGAAAGAAACAAGAGACCCAAAGGGGTGAGGCAAATTGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAGAGAAAGAAACAAGAGACCCAAAGGGGTGAGGCAAATTGTTCC  200

seq1  GGTCCTCACCTTGGGAATGGCTGAGGTGATAGGGTGACATGAGTTCCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCACCTTGGGAATGGCTGAGGTGATAGGGTGACATGAGTTCCAAA  250

seq1  TCGCAGGCCCACCTTCACTGTAAACCAGAGCTTCCTTAGTGCTGTGGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGGCCCACCTTCACTGTAAACCAGAGCTTCCTTAGTGCTGTGGACA  300

seq1  GGGCCAGAGTCAGATGCAATGTACTGGAGTCAGACTTAATGGATCAGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCAGAGTCAGATGCAATGTACTGGAGTCAGACTTAATGGATCAGAGT  350

seq1  CAGACCTAATGGATCAGAGTCAGACCTAATGTATCGAGCCTGAACGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTAATGGATCAGAGTCAGACCTAATGTATCGAGCCTGAACGAAGA  400

seq1  GGAAACCGTCTACTAAACAGGAACTGAATTGACCTAATAACTATTTTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACCGTCTACTAAACAGGAACTGAATTGACCTAATAACTATTTTTTT  450

seq1  TGAGGGACATGTGAGAAAGGTGGGGTTAGAGCCAAAGCATTCTGGGAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGACATGTGAGAAAGGTGGGGTTAGAGCCAAAGCATTCTGGGAAAT  500

seq1  CAGGACCCAGACAAGCTCCTTACCACAGTTCTGTCCTGAGTACCTGGTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACCCAGACAAGCTCCTTACCACAGTTCTGTCCTGAGTACCTGGTAC  550

seq1  CTGGGACACCAGAAGGCCATGGGAAGACCTGGATCTAGACCTGGCTTTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGACACCAGAAGGCCATGGGAAGACCTGGATCTAGACCTGGCTTTGC  600

seq1  CTCTGACCAGCAGTGCAGCCTTTGGCCGCTTTTACCCCGTTTGGACTAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACCAGCAGTGCAGCCTTTGGCCGCTTTTACCCCGTTTGGACTAAC  650

seq1  TTTAGTTTCCTGACTTGGAACCTGGAGCTTGTATGCTTGGCCTTCCTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTTCCTGACTTGGAACCTGGAGCTTGTATGCTTGGCCTTCCTTCC  700

seq1  TCACAAGGGTTCTGGGAAAGAAATAGGAACGTAGAGTAACATAGCTTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAGGGTTCTGGGAAAGAAATAGGAACGTAGAGTAACATAGCTTTGC  750

seq1  TAACTGTGGAGCGTGCCTGTATATAAGCTGTTGCTTACTGTCTCTGGGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGTGGAGCGTGCCTGTATATAAGCTGTTGCTTACTGTCTCTGGGCA  800

seq1  GAGATCCCATGAGAGCCGGGTGCAGCAGCATGTGTGTACATGTATTCTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCCCATGAGAGCCGGGTGCAGCAGCATGTGTGTACATGTATTCTCT  850

seq1  TGACAAAGCCGGTGTCACCTTGAGGACATCTTGCTTCAAGTCTTCCAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAAGCCGGTGTCACCTTGAGGACATCTTGCTTCAAGTCTTCCAATA  900

seq1  ATTACACAGTAGTGTACGTGGGGGTTGGTGCTCTGCGTGTTGGACACCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATTACACAGTAGTGTACGTGGGGGTTGGTGCTCTGCGTGTTGGACACTTA  950

seq1  ATAATTACAGAAGGAATAAGAGCCCTGGTATGATGGGCACCCGAGTGTGC  1000
      |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTACAG-ACGAATAAGAG-CCTGGTATGATGGGCACCCGAGTGTGC  998

seq1  TGCCCAGGGGCCTCCGTGTGATCTGCTGTCATGTTGCTTTCCACTTAGAT  1050
      |||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||
seq2  TGCCCAAGG--CTTCGTGTGATCTGCTGTCATG-TGCTTT-CACTTAAAT  1044

seq1  GAAGCAGGAGGGCTTGACTATATCAACTGGAAGCATGTGTTAGCTCAG-A  1099
      | |||||   ||| ||||||  |||||| ||  |||||| |||||||| |
seq2  G-AGCAG--AGGCCTGACTAATTCAACT-GAGACATGTG-TAGCTCAGAA  1089

seq1  GCTGTACAAGCTGGATATG-AG-GACCTGCCTTCAAGTCTGCTCGTGGCA  1147
      ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||   ||| | 
seq2  GCTGTAC-AGCTGAATATGTAGAGACCTGCCTTCAAGTCTGTCTGTGCC-  1137

seq1  GAGAATAACAGAAGTGACCGTGTAATTTGT  1177
       ||||| |||| |||||||  |||||||||
seq2  -AGAATTACAG-AGTGACC--GTAATTTGT  1163

seq1: chr14_23101628_23102347
seq2: B6Ng01-013L20.g_69_787 (reverse)

seq1  CACACACACACACACCCCTACCTGATTGCAAGCTCAGGCTTACCAGCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACCCCTACCTGATTGCAAGCTCAGGCTTACCAGCTGA  50

seq1  GCTCCCTACATTACCTTCTGTAAGCCCTGATACAAGTCACATGAAGTCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTACATTACCTTCTGTAAGCCCTGATACAAGTCACATGAAGTCTA  100

seq1  AACTCCTAGAGACCCACAGGAATCAGATCTTCTTTGTCACTTTTGCTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTAGAGACCCACAGGAATCAGATCTTCTTTGTCACTTTTGCTTGG  150

seq1  TCAAACCCTTTGAACCATTAAATTCACACAACTCTCAGCGGAGGAAGAAG  200
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACCC-TTGAACCATTAAATTCACACAACTCTCAGCGGAGGAAGAAG  199

seq1  TGTGTCTGACTGTTGTCTTTGGCAGTGAGGAGCAATGAGCTGAGAATTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTGACTGTTGTCTTTGGCAGTGAGGAGCAATGAGCTGAGAATTTG  249

seq1  CCTGGCTTTCCCCAAGCCTTGTGATTTTGCCTCAGTGTCGTTGGGTGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTTTCCCCAAGCCTTGTGATTTTGCCTCAGTGTCGTTGGGTGGGA  299

seq1  TTGTTGCGTTACCCCGTGAATGTGGCTCTGGATATCCTAAGATGTTCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGCGTTACCCCGTGAATGTGGCTCTGGATATCCTAAGATGTTCAGG  349

seq1  AGGGCCCTGTCGAGTTGAAGAACCACTGTGTGTCGTTGTTGTTGTTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCCTGTCGAGTTGAAGAACCACTGTGTGTCGTTGTTGTTGTTTTTC  399

seq1  CTTTGCAGCAGTTAAACAATGCTTTGTTGTCCAGGGGTCTGGGCAGTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCAGCAGTTAAACAATGCTTTGTTGTCCAGGGGTCTGGGCAGTATT  449

seq1  TAATTTCCTCAACCTGTTGGTTTTGTTTTGCTTTGGAACTCAAAGGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCCTCAACCTGTTGGTTTTGTTTTGCTTTGGAACTCAAAGGTACA  499

seq1  AAGACTTAAACCTCATCAGCCCCTTCTGCACAAATGGATCCAAAGAAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTAAACCTCATCAGCCCCTTCTGCACAAATGGATCCAAAGAAGCA  549

seq1  ATGGAGAAGCACCGCCCCCGCGGCCTTTCCCTTTAATCTGGCCTAAGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGAAGCACCGCCCCCGCGGCCTTTCCCTTTAATCTGGCCTAAGTCT  599

seq1  TCGAGCTGTTCTTCAGGCTCATAATTAGCTGCTTGACATGATGTGTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGCTGTTCTTCAGGCTCATAATTAGCTGCTTGACATGATGTGTCATG  649

seq1  TTGTTCCTTTGTCTGGAGCCATCCTGGCGATAGAAACACACTCCCAAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCCTTTGTCTGGAGCCATCCTGGCGATAGAAACACACTCCCAAATC  699

seq1  CCTCTGCTGAGGTGGAATTC  720
      ||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCTGAGGTGGAATTC  719