BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018J02
Chromosome14 (Build37)
Map Location 104,959,684 - 105,103,687
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD130009I18Rik
Upstream geneScel, LOC100043448, Slain1, Ednrb, Pou4f1, 2610206B13Rik
Downstream geneLOC435420, Rbm26, LOC621103, LOC100043466, Ndfip2, LOC620376
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018J02.bB6Ng01-018J02.g
ACCDH851931DH851932
length720862
definitionDH851931|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018J02, 5' end.DH851932|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018J02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(105,102,968 - 105,103,687)(104,959,684 - 104,960,542)
sequence
gaattctgtctacagtcaaacctatattacttctctcaaataaacagcat
gcatattttaggtccattttgcttttactcttaaaattcattcactaaat
gttcataactcgtcactggcaaaagcctctaaacttcttggcagaggtat
tgggagtatacagcctgagttctatcagcattggcagaggtgtgggagta
tacaacctgagttctatcaccattggcagaggtgtgggagtatacagcct
gagttctatcaccattggcagaggtgtgggagtatacagcctgagttcta
tcaccattggcagaggtgtggaagtatacaggctgagttctatctatcac
cattggcagaggtgtgggagtatacagcctgagttctatcagcattggca
gagatatggggagtatacagcctgagttctatcagcattggcagagatat
ggggagtatacagcctgagttctatcagcattggcagagatatggggagt
atacagcctgagttctatcagcattggcagagatatggggagtatacagc
ctgagttctatcagcattggcagaggtgtgggagtatacagcctgagttc
tatcaccattggcagaggtgtgggagtatacagcctgagttctatcagca
ttggcagaggtgtgggagtatacagcctgagttctatcactcatggtgaa
tgttacacataagtcacttg
gaattcttctttcgtgtcttgtcaggaaattatgggattaaccagagctt
cataatgtccctttgctgccaaattcaaatcatctctcatttagtttgtt
ctttatccaagagacctgataaaacctatttataacatgggctcacttag
ttactgatggaaatgacaagctatgggctgagaataagtgagtaataatt
tctggaacacttgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgttccagaaggtttccac
ttttctctcactttgtttgttatagttgggttaaatctaaatttaaattt
agtctttcaactaaatttaatactatataattccttttaataatgaatct
gggacttttaagaagcgaatttggtattttgttaagaggagttctcacct
tctctttaaggagaaaacaatccatgcccttacattacaaaagccagtga
tccaatgtaacaacagaacaagcaagagggtccttgaaaggaggaagatg
tgatgaactaaaaggaataaagggtgaatttttcggtggaccagaatgaa
catggttgtcagagcacacaaaatgcatgcccatgcactgtgctgggcat
acacactatattatctcatttaatgctggcaatcagggcactggtagcta
ttttccattgcactgtatagttagaaaatggaaacattatatgcaagtcc
ccacagctgcaagtaagtaaattggttttccaatccacatctttctaagt
acaaatctcttttctttcgttagtgctcttcttgattatacatttggcta
gggctttgtaggacatattgggccattcttttcgaagaaatgaaaaaaag
gctctgttttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_105102968_105103687
seq2: B6Ng01-018J02.b_44_763 (reverse)

seq1  CAAGTGACTTATGTGTAACATTCACCATGAGTGATAGAACTCAGGCTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGACTTATGTGTAACATTCACCATGAGTGATAGAACTCAGGCTGTA  50

seq1  TACTCCCACACCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCCACACCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCA  100

seq1  CACCTCTGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCTGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTCTG  150

seq1  CCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGC  200

seq1  TGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGA  250

seq1  ACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGCTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGG  300

seq1  CTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATACTCCCCATATCTCTGCCAATGCTGATAGAACTCAGGCTGTATA  350

seq1  CTCCCACACCTCTGCCAATGGTGATAGATAGAACTCAGCCTGTATACTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACACCTCTGCCAATGGTGATAGATAGAACTCAGCCTGTATACTTC  400

seq1  CACACCTCTGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTCTGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTC  450

seq1  TGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTCTGCCAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAATGGTGATAGAACTCAGGCTGTATACTCCCACACCTCTGCCAATG  500

seq1  GTGATAGAACTCAGGTTGTATACTCCCACACCTCTGCCAATGCTGATAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGAACTCAGGTTGTATACTCCCACACCTCTGCCAATGCTGATAGA  550

seq1  ACTCAGGCTGTATACTCCCAATACCTCTGCCAAGAAGTTTAGAGGCTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGCTGTATACTCCCAATACCTCTGCCAAGAAGTTTAGAGGCTTTT  600

seq1  GCCAGTGACGAGTTATGAACATTTAGTGAATGAATTTTAAGAGTAAAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTGACGAGTTATGAACATTTAGTGAATGAATTTTAAGAGTAAAAGC  650

seq1  AAAATGGACCTAAAATATGCATGCTGTTTATTTGAGAGAAGTAATATAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGACCTAAAATATGCATGCTGTTTATTTGAGAGAAGTAATATAGG  700

seq1  TTTGACTGTAGACAGAATTC  720
      ||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACTGTAGACAGAATTC  720

seq1: chr14_104959684_104960542
seq2: B6Ng01-018J02.g_71_932

seq1  GAATTCTTCTTTCGTGTCTTGTCAGGAAATTATGGGATTAACCAGAGCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTTCGTGTCTTGTCAGGAAATTATGGGATTAACCAGAGCTT  50

seq1  CATAATGTCCCTTTGCTGCCAAATTCAAATCATCTCTCATTTAGTTTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATGTCCCTTTGCTGCCAAATTCAAATCATCTCTCATTTAGTTTGTT  100

seq1  CTTTATCCAAGAGACCTGATAAAACCTATTTATAACATGGGCTCACTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATCCAAGAGACCTGATAAAACCTATTTATAACATGGGCTCACTTAG  150

seq1  TTACTGATGGAAATGACAAGCTATGGGCTGAGAATAAGTGAGTAATAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGATGGAAATGACAAGCTATGGGCTGAGAATAAGTGAGTAATAATT  200

seq1  TCTGGAACACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTCCAGAAGGTTTCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAACACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTCCAGAAGGTTTCCAC  250

seq1  TTTTCTCTCACTTTGTTTGTTATAGTTGGGTTAAATCTAAATTTAAATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTCACTTTGTTTGTTATAGTTGGGTTAAATCTAAATTTAAATTT  300

seq1  AGTCTTTCAACTAAATTTAATACTATATAATTCCTTTTAATAATGAATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTCAACTAAATTTAATACTATATAATTCCTTTTAATAATGAATCT  350

seq1  GGGACTTTTAAGAAGCGAATTTGGTATTTTGTTAAGAGGAGTTCTCACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTTTTAAGAAGCGAATTTGGTATTTTGTTAAGAGGAGTTCTCACCT  400

seq1  TCTCTTTAAGGAGAAAACAATCCATGCCCTTACATTACAAAAGCCAGTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTAAGGAGAAAACAATCCATGCCCTTACATTACAAAAGCCAGTGA  450

seq1  TCCAATGTAACAACAGAACAAGCAAGAGGGTCCTTGAAAGGAGGAAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATGTAACAACAGAACAAGCAAGAGGGTCCTTGAAAGGAGGAAGATG  500

seq1  TGATGAACTAAAAGGAATAAAGGGTGAATTTTTCGGTGGACCAGAATGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACTAAAAGGAATAAAGGGTGAATTTTTCGGTGGACCAGAATGAA  550

seq1  CATGGTTGTCAGAGCACACAAAATGCATGCCCATGCACTGTGCTGGGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTGTCAGAGCACACAAAATGCATGCCCATGCACTGTGCTGGGCAT  600

seq1  ACACACTATATTATCTCATTTAATGCTGGCAATCAGGGCACTGGTAGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTATATTATCTCATTTAATGCTGGCAATCAGGGCACTGGTAGCTA  650

seq1  TTTTCCATTGCACTGTATAGTTAGAAAATGGAAACATTATATGCAAGTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCATTGCACTGTATAGTTAGAAAATGGAAACATTATATGCAAGTCC  700

seq1  CCACAGCTGCAAGT-AGTAAATTGG-TTTCCAATCCACATCTTTCTAAGT  748
      |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCTGCAAGTAAGTAAATTGGTTTTCCAATCCACATCTTTCTAAGT  750

seq1  ACAAATCTCTTTTCTTTCGTTTAGTGCTCTTCTTGATTTATACA-TTGGC  797
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  ACAAATCTCTTTTCTTTCG-TTAGTGCTCTTCTTGA-TTATACATTTGGC  798

seq1  TAGGGCTTTGTAGGACATATT-GGCCATTC-TATCAGAGGAATGAAAAGA  845
      ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||| |
seq2  TAGGGCTTTGTAGGACATATTGGGCCATTCTTTTCGAAGAAATGAAAAAA  848

seq1  AGGCTCTGTTTTCT  859
      ||||||||||||||
seq2  AGGCTCTGTTTTCT  862