BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-021I08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 96,013,228 - 96,101,585
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043783, LOC677613, LOC100043784, LOC382931
Downstream gene4921530L21Rik, Klhl1, LOC100043366
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021I08.bB6Ng01-021I08.g
ACCDH854002DH854003
length1,1901,091
definitionDH854002|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021I08, 5' end.DH854003|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021I08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,100,359 - 96,101,585)(96,013,228 - 96,014,336)
sequence
gaattcataaaagaaggaagagtagtcacaagtagaggaaatacatgcaa
agcacattgtatttacatgtatgtgaatgttcttatgaaactcattacta
tatacaatgaatatatgcaaataacgttattactccaaggaaaacattgt
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agcaaaatcgtatggactgtctgtctgttctccatattcgttacagcatg
gagtcacagaagaataataccactctgctggtacccaattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_96100359_96101585
seq2: B6Ng01-021I08.b_46_1235 (reverse)

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      |||| |||||||  || ||||| |  ||||||| |||||||||| |||||
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      |||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||  ||||| |||||
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      |||||||||   |||||| ||||| ||||    || ||| |||||| |||
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         ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |
seq2  ---TTTATAA-ATTTTGATTAT--ATTATTA-GTAAGTGATAGCACAA-T  170

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      |||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||
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      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ACAAAGTAATTTTTTCAAACTCTTTCTAAATTGAATATATTGTAATTTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTATTTGCATATATTCATTGTATATAGTAATGAGTTTCATAAGAACA  1113

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACTCTTCCTTCTTTTATGAATTC  1190

seq1: chr14_96013228_96014336
seq2: B6Ng01-021I08.g_73_1163

seq1  ACAAACCCATTCTTATCTCAAGAATAAGTCCAAGTCCAAGTGGATCAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCACAAAAAAACAAATACACTGAATCTAATAGAAAAAAAAGTGGGG  100

seq1  AAAAACCTTGAACACATGGGCACAGGGTAAAATTTCCTGAACAGAACGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCTTGAACACATGGGCACAGGGTAAAATTTCCTGAACAGAACGCC  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTTAGGCTCTAAGATCTACAATAGACAAATGAAACCTCATAAAAT  200

seq1  TGCAAAGTTTCAATAAGGCATATCACACTGTCAATAGGACAAAGTAGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGTTTCAATAAGGCATATCACACTGTCAATAGGACAAAGTAGCAT  250

seq1  CCCACAATTTGGAAAAACATCTTTACCAACCCTATAACAAATAGAGGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAATTTGGAAAAACATCTTTACCAACCCTATAACAAATAGAGGGCT  300

seq1  AATATCCAAAATATATAAACAATTCAAGAAATTAGACTCCAGAGAACCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCAAAATATATAAACAATTCAAGAAATTAGACTCCAGAGAACCAA  350

seq1  GTAACGCTATTTTAAAATGTGGCACATAGCTAAACAGAGAATTCTCAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACGCTATTTTAAAATGTGGCACATAGCTAAACAGAGAATTCTCAACT  400

seq1  GAGGAATCTCGCATGGCTGAGAAGCACTTATTTTTTTTTTCTATAATCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAATCTCGCATGGCTGAGAAGCACTTATTTTTTTTTTCTATAATCAG  450

seq1  AATACTACCATCTGTAAAGTCCTCTAAAAAAGAAATTAGAGTTTTCAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTCTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATT  550

seq1  TTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACAGGGTTTCTCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACAGGGTTTCTCTGT  600

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAAATCCACCTGCCTCCGGAGTGCTAGGATTAAAGGCGTGAGCAAC  700

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACTGCCTCAATGTTCTTTCTAATTTTGAAATATTTTTATGATATA  750

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATTTGAAATCTCAAGCATTTATAAACTTATGTGGGTTTTGTATATCATGA  850

seq1  TTGTGTATGTGTGTGCAGGTCCATGGATTTGACTATGGTCCCTTGCTCTA  899
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seq2  TTGTGTATGTGTGTGCAGGTCCATGGATTTGACTATGGTCCCTTGCTCTA  900

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      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  TGGTGCACATATGAGGGCTAGAGGATACTTCTCAGTTGCTACTTC-TACT  949

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      ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTCCTTCTTA-TTAGGAGG--AAAAACTATCTCTTTTTCACTAATGT-T  995

seq1  AACACAGGCCAAAAATCGTATGGAACTGTCCTGTCTGTATCT-CATATTC  1047
      |||||||    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||
seq2  AACACAG---CAAAATCGTATGG-ACTGT-CTGTCTGT-TCTCCATATTC  1039

seq1  TGTTTACAAGCATTGGAGTCACAGATAGATATATTA-CACTCTGCCTGGT  1096
         |||| |||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||    |
seq2  --GTTAC-AGCA-TGGAGTCACAGA-AGA-ATAATACCACTCTGC----T  1079

seq1  GTTACCCATATTC  1109
      | |||||| ||||
seq2  GGTACCCA-ATTC  1091