BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024L08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 69,132,897 - 69,195,898
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdam7, Adamdec1
Upstream geneLOC100043046, LOC100043056, Cdca2, Kctd9, Gnrh1, Dock5, Nefl, Nefm, LOC100043072
Downstream geneAdam28, LOC641033, LOC100043082, Stc1, EG545808, Nkx2-6, Nkx3-1, Slc25a37, D930020E02Rik, Entpd4, Loxl2, R3hcc1, Chmp7, Tnfrsf10b, Rhobtb2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024L08.bB6Ng01-024L08.g
ACCDH856260DH856261
length9741,081
definitionDH856260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024L08, 5' end.DH856261|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,132,897 - 69,133,874)(69,194,810 - 69,195,898)
sequence
gaattcttcgggaaaggggttgttgagtatgcatgctggtttctgatcct
gcagaaattgctggtattgggtttggctgcatttgctgaattttattgca
gggatgctagagatgagatgaggtgagaataaagatttgcttctgtaaac
atttaataaagaattggaaatgaaaaacaattgctaactactggggcaga
gccatggtcgggtgtgtttttatttatttgttgtgttgcagagacaacta
ccaaatttagtttcagtgaaaaattctgattatgtgtcttccaacaaacc
cttcctaagacaacagttggttgtctgtgtttcctgttcctacttagccc
ctaatgtatcccacttatttaaaaaatatttttattttatgttataggtg
ttttgcttgtatgtatatctgtttcttgtgtgtagtgcccacagaggcta
gaagagggatttcccaccaccccaccccctgagctagagttaaagatggt
aaaacttcatgaagatgcaggcagttgaacgtcaatcttttgcaagagca
acaagtgttcttaataactaagccatctatttaatcccctaatgtacccc
tctcaacataaccatgtaataatataaatctgatttaccatctctgaaac
attataaacttctcaaccaagtcaaggatcacattgtgtttagttcctta
ggaataatcatgagttaacacagtgtctggaatagagtagtttgatatta
tgttatatgatattatatgttatacttacatattataaaacattgtatta
ttcatatattaacaatatgtactcattatacatcatagtatattatgtgg
tattgtagaaataaactcagcagaaatataaaaagcatctttaggacttt
taatgctcatttttaactagcaactccactccctttcttcttctttggtt
ggatggtttcaatgactggataca
gaattcatcctgggatctgccatttccctgtaaaataagtaggtctgagg
atggcttttaacatggccagtgagacaacaggtcagaaatcacagcaaac
ttttcaaagataggagtggacaaacaataaaacacacatacacaatgctc
atgtatctacacactcaattagacacacccacatactgatactcacagac
tcagaaaaaccttcattttaacacattcaaacacactcactaacacaatg
cacctttacacacacacacacactagtataataagtaaaatggaaagcta
acctagctagtttaagcctgattctggaaagtctgccaatcatatcataa
atcttgaaaagaatagattcttactaatattaaccttctggattctatct
tcattcaaatacatgttaggcaacagctcagatgtagcagccacagggcc
agctgtagagcagtttaggaatcctctgatatccttttcatttcattcct
ggggattggtagagcctggtcagtctttgagcttagctatatagccaaaa
tggtagttgtcacaattgtgacctatacactctcattaatggcatgcctc
tttgtatacatgcacacacacgcatgcatgcatttataatgtctacattt
caacagtgcgatgtattttctactctagaaaccctgctactatgaaggcc
acatccaaaatgcaaggggctctctggccaggatcagtacctgtgatggg
ttgaggtgagaaatgaagtagtaaatgctaagggacatttgtcacacagc
ctttaatcttcctcatgtttccctttgtcttcttactatttgagttgttt
ctgttcatcattaattgctggattaaagtgaagaataaattatcatggta
ggtcacttcattaactgttgttctagaattcagccccagctctgtcaaag
ctacatcctgactgtggaaagtctgccatcatttcataattgggctaaat
ggcctcatgacatgtgtcattaccaggtttatctacttacccttggatca
ttatgccatttcttcttaatatatatcacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_69132897_69133874
seq2: B6Ng01-024L08.b_45_1018

seq1  GAATTCTTCGGGAAAGGGGTTGTTGAGTATGCATGCTGGTTTCTGATCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCGGGAAAGGGGTTGTTGAGTATGCATGCTGGTTTCTGATCCT  50

seq1  GCAGAAATTGCTGGTATTGGGTTTGGCTGCATTTGCTGAATTTTATTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAATTGCTGGTATTGGGTTTGGCTGCATTTGCTGAATTTTATTGCA  100

seq1  GGGATGCTAGAGATGAGATGAGGTGAGAATAAAGATTTGCTTCTGTAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGCTAGAGATGAGATGAGGTGAGAATAAAGATTTGCTTCTGTAAAC  150

seq1  ATTTAATAAAGAATTGGAAATGAAAAACAATTGCTAACTACTGGGGCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATAAAGAATTGGAAATGAAAAACAATTGCTAACTACTGGGGCAGA  200

seq1  GCCATGGTCGGGTGTGTTTTTATTTATTTGTTGTGTTGCAGAGACAACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGTCGGGTGTGTTTTTATTTATTTGTTGTGTTGCAGAGACAACTA  250

seq1  CCAAATTTAGTTTCAGTGAAAAATTCTGATTATGTGTCTTCCAACAAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATTTAGTTTCAGTGAAAAATTCTGATTATGTGTCTTCCAACAAACC  300

seq1  CTTCCTAAGACAACAGTTGGTTGTCTGTGTTTCCTGTTCCTACTTAGCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTAAGACAACAGTTGGTTGTCTGTGTTTCCTGTTCCTACTTAGCCC  350

seq1  CTAATGTATCCCACTTATTTAAAAAATATTTTTATTTTATGTTATAGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTATCCCACTTATTTAAAAAATATTTTTATTTTATGTTATAGGTG  400

seq1  TTTTGCTTGTATGTATATCTGTTTCTTGTGTGTAGTGCCCACAGAGGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTTGTATGTATATCTGTTTCTTGTGTGTAGTGCCCACAGAGGCTA  450

seq1  GAAGAGGGATTTCCCACCACCCCACCCCCTGAGCTAGAGTTAAAGATGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGGGATTTCCCACCACCCCACCCCCTGAGCTAGAGTTAAAGATGGT  500

seq1  AAAACTTCATGAAGATGCAGGCAGTTGAACGTCAATCTTTTGCAAGAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTCATGAAGATGCAGGCAGTTGAACGTCAATCTTTTGCAAGAGCA  550

seq1  ACAAGTGTTCTTAATAACTAAGCCATCTATTTAATCCCCTAATGTACCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGTTCTTAATAACTAAGCCATCTATTTAATCCCCTAATGTACCCC  600

seq1  TCTCAACATAACCATGTAATAATATAAATCTGATTTACCATCTCTGAAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAACATAACCATGTAATAATATAAATCTGATTTACCATCTCTGAAAC  650

seq1  ATTATAAACTTCTCAACCAAGTCAAGGATCACATTGTGTTTAGTTCCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAAACTTCTCAACCAAGTCAAGGATCACATTGTGTTTAGTTCCTTA  700

seq1  GGAATAATCATGAGTTAACACAGTGTCTGGAATAGAGTAGTTTGATATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAATCATGAGTTAACACAGTGTCTGGAATAGAGTAGTTTGATATTA  750

seq1  TGTTATATGATATTATATGTTATACTTACATATTATAAAACATTGTATTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATATGATATTATATGTTATACTTACATATTATAAAACATTGTATTA  800

seq1  TTCATATAATAAACAATATGTACTCATTATACATCATAGTATATTATGTG  850
      ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAT-ATTAACAATATGTACTCATTATACATCATAGTATATTATGTG  849

seq1  GTATTGTAGAAATAAACTCAGCAGAAATATTAAAAGCATCATTAGGACTT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GTATTGTAGAAATAAACTCAGCAGAAATATAAAAAGCATCTTTAGGACTT  899

seq1  CTAAATGCTCAGTTTTAAACTAGC-ACTCCACT-CCTTTCTCTCTTCCTT  948
       | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||
seq2  -TTAATGCTCA-TTTTTAACTAGCAACTCCACTCCCTTTCT-TCTT-CTT  945

seq1  TGGTTTGATTGCTTTCAATGACTGAATACA  978
      ||||| || || |||||||||||| |||||
seq2  TGGTTGGA-TGGTTTCAATGACTGGATACA  974

seq1: chr14_69194810_69195898
seq2: B6Ng01-024L08.g_67_1147 (reverse)

seq1  CTGTGATATATTATTTAAGAAGATATGGCATAATGGATTCCAGGGGTAAG  50
      |||||||||||   ||||||||| |||||||||||   |||| |||||| 
seq2  CTGTGATATAT--ATTAAGAAGAAATGGCATAATG--ATCCAAGGGTAA-  45

seq1  GTAGATAAACTTGGTAATGGACACATGTCATTGAGGCCATTTAGCCCAAT  100
      |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTAGATAAACCTGGTAAT-GACACATGTCA-TGAGGCCATTTAGCCCAAT  93

seq1  TATGAAATGATTGGCAGACTTTCCACAGTCAGGATGTAGCTTTGACAGAG  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAATGA-TGGCAGACTTTCCACAGTCAGGATGTAGCTTTGACAGAG  142

seq1  CTGGGGCTGAATTCTAGAACAACAGTTAATGAAGTGACCTACCATGATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCTGAATTCTAGAACAACAGTTAATGAAGTGACCTACCATGATAA  192

seq1  TTTATTCTTCACTTTAATCCAGCAATTAATGATGAACAGAAACAACTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCTTCACTTTAATCCAGCAATTAATGATGAACAGAAACAACTCAA  242

seq1  ATAGTAAGAAGACAAAGGGAAACATGAGGAAGATTAAAGGCTGTGTGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAAGAAGACAAAGGGAAACATGAGGAAGATTAAAGGCTGTGTGACA  292

seq1  AATGTCCCTTAGCATTTACTACTTCATTTCTCACCTCAACCCATCACAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCCCTTAGCATTTACTACTTCATTTCTCACCTCAACCCATCACAGG  342

seq1  TACTGATCCTGGCCAGAGAGCCCCTTGCATTTTGGATGTGGCCTTCATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGATCCTGGCCAGAGAGCCCCTTGCATTTTGGATGTGGCCTTCATAG  392

seq1  TAGCAGGGTTTCTAGAGTAGAAAATACATCGCACTGTTGAAATGTAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGGGTTTCTAGAGTAGAAAATACATCGCACTGTTGAAATGTAGACA  442

seq1  TTATAAATGCATGCATGCGTGTGTGTGCATGTATACAAAGAGGCATGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAATGCATGCATGCGTGTGTGTGCATGTATACAAAGAGGCATGCCA  492

seq1  TTAATGAGAGTGTATAGGTCACAATTGTGACAACTACCATTTTGGCTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAGAGTGTATAGGTCACAATTGTGACAACTACCATTTTGGCTATA  542

seq1  TAGCTAAGCTCAAAGACTGACCAGGCTCTACCAATCCCCAGGAATGAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAAGCTCAAAGACTGACCAGGCTCTACCAATCCCCAGGAATGAAAT  592

seq1  GAAAAGGATATCAGAGGATTCCTAAACTGCTCTACAGCTGGCCCTGTGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGATATCAGAGGATTCCTAAACTGCTCTACAGCTGGCCCTGTGGC  642

seq1  TGCTACATCTGAGCTGTTGCCTAACATGTATTTGAATGAAGATAGAATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACATCTGAGCTGTTGCCTAACATGTATTTGAATGAAGATAGAATCC  692

seq1  AGAAGGTTAATATTAGTAAGAATCTATTCTTTTCAAGATTTATGATATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTTAATATTAGTAAGAATCTATTCTTTTCAAGATTTATGATATGA  742

seq1  TTGGCAGACTTTCCAGAATCAGGCTTAAACTAGCTAGGTTAGCTTTCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGACTTTCCAGAATCAGGCTTAAACTAGCTAGGTTAGCTTTCCAT  792

seq1  TTTACTTATTATACTAGTGTGTGTGTGTGTGTAAAGGTGCATTGTGTTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTATTATACTAGTGTGTGTGTGTGTGTAAAGGTGCATTGTGTTAG  842

seq1  TGAGTGTGTTTGAATGTGTTAAAATGAAGGTTTTTCTGAGTCTGTGAGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTGTTTGAATGTGTTAAAATGAAGGTTTTTCTGAGTCTGTGAGTA  892

seq1  TCAGTATGTGGGTGTGTCTAATTGAGTGTGTAGATACATGAGCATTGTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTATGTGGGTGTGTCTAATTGAGTGTGTAGATACATGAGCATTGTGT  942

seq1  ATGTGTGTTTTATTGTTTGTCCACTCCTATCTTTGAAAAGTTTGCTGTGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGTTTTATTGTTTGTCCACTCCTATCTTTGAAAAGTTTGCTGTGA  992

seq1  TTTCTGACCTGTTGTCTCACTGGCCATGTTAAAAGCCATCCTCAGACCTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGACCTGTTGTCTCACTGGCCATGTTAAAAGCCATCCTCAGACCTA  1042

seq1  CTTATTTTACAGGGAAATGGCAGATCCCAGGATGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTTACAGGGAAATGGCAGATCCCAGGATGAATTC  1081