BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-027O10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,184,975 - 22,315,596
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdk
Upstream geneAA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1
Downstream geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-027O10.bB6Ng01-027O10.g
ACCDH858520DH858521
length1,0541,038
definitionDH858520|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027O10, 5' end.DH858521|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027O10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,314,536 - 22,315,596)(22,184,975 - 22,186,017)
sequence
gaattctatgtacctttagttattaggcccttagaaagcattagctcagg
actacagagagtactatctgctctttagaggacccaagttcagtccctag
cacacacatagcagcttacaactatctaacaacagttccaggggagccaa
caccctcacatgagcataagagcatgcaaatgaccaatgcacaagaaaaa
caatcatttaaaaaaaaaaagtattagcctatgcaaaccttcaaactgcc
aaggctaattaggaatgggtagccacagagttctaacatctgatttcaat
agtcatgaacagacaaggttatcggtcaatcgttaaatgatttaataacc
tcaagctctgtaaaggaacaccccaagttaacctcagatggtatcacccc
acacctcatatgtgccttcctgctttgtgattgattggttgcttgcttct
gttttgttgaagcgggctagcatggaactcattgcatctctctctggctg
acctccaattctgaaagcttcctgcctcagcctccagaagctgagctgta
agcttcacctctataacttcaaatcctttaaatgcattctggatcaaatc
tgaaaccagtgagccaatgcaggactacacccaacactattctttctctc
cgacttgtggccagctccctcgttctctctgtgcagtgccctccctccct
actgtatctgacagagaccttgaagggctcttggacttctaggctctgct
gctgcttcctgtcaagttttcctggcctgtgcaggggcccacagcattct
ggtccctactgtagccctggtctgtataaagttagagtttgttgaaggac
caaataaataaaagcatttatcccatcctatgatcacaggctttcctaat
taatcttctattgtacagaccaccagcctgctcattggaataactgccct
tatctatgaagcaattcatatggtgactcttgctttagcatattagaatc
atctgtggttagctaacctttcttggccaaggtctcacatgagactaata
atta
gaattctccttaatagggacggggtttcgttttctctctctcttgcttct
tgcgctcttgcttcttgcactctggctcctgaagatgtaagcaataaagc
tttgccgcagaagattctggtttgttgcgtctttcctggccggtcgtgag
aacgcgtctaataacaaagcacggtgacacagcctaaaatcccagcactt
gagagatggaggcaggaacagagatagttcaaagccagctcagacaacat
accaagattcagatcaacttaggttgtataatgtgagctcttgtctaaaa
gaaaaaatacatatataagtatattcttgccattattctgtaatttacca
agttacagttaatttattagtatatgatcaaaaaagctggcattaaaaat
taaaacaacatagccatgcatggtgacacacttctatgattccccacact
ccaacctgtgttatctaaaaacctttttcatacaaatagtgttccagatg
tgggatttaacttggtaatgtggcacttctagcaccttgagggcctgagt
tcggttcctagtactgctccttgcctcagtttaactactgcatggacttg
cagtctttctgtcatagagcaattttaattcctcagattccttttctttt
attgaccctgaagccccctcacccccaccctgtgtcctacaattcactgt
tgcccaggctgggcatgaaaagtagttcttaggggctggggagatggctt
acttgttaaaagtacttgctgctcttgtaaaggattcaggcttggttccc
agcacctacacagtagctcacaaccattggtaactccagtttccagggga
tctgatgccctctcttgattagtacagctacaactatgcacatggtacac
aaatatatattgcaggccaacactcatacatataacaataaatctaaaat
aatagtaagtgtagtagtagttttcccagaagctattcagtgcattattc
gcttagattcatttacttaatttatgatggtttagaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22314536_22315596
seq2: B6Ng01-027O10.b_46_1099 (reverse)

seq1  TAATTTAATTAGTCTCATGTGAGACCTAGGGCAAAGAAAGGTTAGGCTAA  50
      |||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||
seq2  TAATT--ATTAGTCTCATGTGAGACCT-TGGCCAAGAAAGGTTA-GCTAA  46

seq1  -CACAGATGATTCTAAATATGGCTAAAGCAAGAGTCA-CATATGAATTGC  98
       ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCACAGATGATTCT-AATAT-GCTAAAGCAAGAGTCACCATATGAATTGC  94

seq1  TTCATAGATAAAGGGCAGTTATTCCAATGAGCAGGCTGGTGGTCTGTACA  148
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAGAT-AAGGGCAGTTATTCCAATGAGCAGGCTGGTGGTCTGTACA  143

seq1  ATAGAAAGATTAATTAGGAAAGCCTGTGATCATAGGATTGGATAAATGCT  198
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATAG-AAGATTAATTAGGAAAGCCTGTGATCATAGGATGGGATAAATGCT  192

seq1  TTTATTTATTTGGTCCTTCAACAAACTCTAAACTTTATACAGACCAGGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTATTTGGTCCTTCAACAAACTCT-AACTTTATACAGACCAGGGC  241

seq1  TACAGTAGGGACCAGAATGCTGTGGGCCCCTGCACAGGCCAGGAAAACTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAGGGACCAGAATGCTGTGGGCCCCTGCACAGGCCAGGAAAACTT  291

seq1  GACAGGAAGCAGCAGCAGAGCCTAGAAGTCCAAGAGCCCTTCAAGGTCTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGAAGCAGCAGCAGAGCCTAGAAGTCCAAGAGCCCTTCAAGGTCTC  341

seq1  TGTCAGATACAGTAGGGAGGGAGGGCACTGCACAGAGAGAACGAGGGAGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGATACAGTAGGGAGGGAGGGCACTGCACAGAGAGAACGAGGGAGC  391

seq1  TGGCCACAAGTCGGAGAGAAAGAATAGTGTTGGGTGTAGTCCTGCATTGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACAAGTCGGAGAGAAAGAATAGTGTTGGGTGTAGTCCTGCATTGG  441

seq1  CTCACTGGTTTCAGATTTGATCCAGAATGCATTTAAAGGATTTGAAGTTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGGTTTCAGATTTGATCCAGAATGCATTTAAAGGATTTGAAGTTA  491

seq1  TAGAGGTGAAGCTTACAGCTCAGCTTCTGGAGGCTGAGGCAGGAAGCTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTGAAGCTTACAGCTCAGCTTCTGGAGGCTGAGGCAGGAAGCTTT  541

seq1  CAGAATTGGAGGTCAGCCAGAGAGAGATGCAATGAGTTCCATGCTAGCCC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTGGAGGTCAGCCAGAGAGAGATGCAATGAGTTCCATGCTAGCCC  591

seq1  GCTTCAACAAAACAGAAGCAAGCAACCAATCAATCACAAAGCAGGAAGGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAACAAAACAGAAGCAAGCAACCAATCAATCACAAAGCAGGAAGGC  641

seq1  ACATATGAGGTGTGGGGTGATACCATCTGAGGTTAACTTGGGGTGTTCCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGAGGTGTGGGGTGATACCATCTGAGGTTAACTTGGGGTGTTCCT  691

seq1  TTACAGAGCTTGAGGTTATTAAATCATTTAACGATTGACCGATAACCTTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAGCTTGAGGTTATTAAATCATTTAACGATTGACCGATAACCTTG  741

seq1  TCTGTTCATGACTATTGAAATCAGATGTTAGAACTCTGTGGCTACCCATT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCATGACTATTGAAATCAGATGTTAGAACTCTGTGGCTACCCATT  791

seq1  CCTAATTAGCCTTGGCAGTTTGAAGGTTTGCATAGGCTAATACTTTTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATTAGCCTTGGCAGTTTGAAGGTTTGCATAGGCTAATACTTTTTTT  841

seq1  TTTTAAATGATTGTTTTTCTTGTGCATTGGTCATTTGCATGCTCTTATGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATGATTGTTTTTCTTGTGCATTGGTCATTTGCATGCTCTTATGC  891

seq1  TCATGTGAGGGTGTTGGCTCCCCTGGAACTGTTGTTAGATAGTTGTAAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGAGGGTGTTGGCTCCCCTGGAACTGTTGTTAGATAGTTGTAAGC  941

seq1  TGCTATGTGTGTGCTAGGGACTGAACTTGGGTCCTCTAAAGAGCAGATAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATGTGTGTGCTAGGGACTGAACTTGGGTCCTCTAAAGAGCAGATAG  991

seq1  TACTCTCTGTAGTCCTGAGCTAATGCTTTCTAAGGGCCTAATAACTAAAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTCTGTAGTCCTGAGCTAATGCTTTCTAAGGGCCTAATAACTAAAG  1041

seq1  GTACATAGAATTC  1061
      |||||||||||||
seq2  GTACATAGAATTC  1054

seq1: chr14_22184975_22186017
seq2: B6Ng01-027O10.g_69_1106

seq1  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50

seq1  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100

seq1  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150

seq1  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200

seq1  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250

seq1  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300

seq1  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350

seq1  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400

seq1  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450

seq1  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500

seq1  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550

seq1  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600

seq1  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650

seq1  AATGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTACAATTCACTGT  700
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTACAATTCACTGT  700

seq1  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  750

seq1  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCAGGCTTGGTTCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCAGGCTTGGTTCCC  800

seq1  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAG-TTCCAGGGGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAGTTTCCAGGGGA  850

seq1  TCTGATGCCCTCTCTTGATAAGTACAGCTACCAACTATGCACATGGTACA  899
      ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTGATGCCCTCTCTTGATTAGTACAGCTA-CAACTATGCACATGGTACA  899

seq1  CAAATATATA-TGCAGGCCAAACACTCATACATAAAACAAATAAATCTAA  948
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  CAAATATATATTGCAGGCC-AACACTCATACATATAAC-AATAAATCTAA  947

seq1  AATAATAGTAAGTGTAGTAGTAGTTTTCACCAG-AGCTATTCAGTTGCAT  997
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||
seq2  AATAATAGTAAGTGTAGTAGTAGTTTTC-CCAGAAGCTATTCAG-TGCAT  995

seq1  TATTCGTCTAAGAATTCATTTACTTAAATTTATGATGGCTTAGAAA  1043
      |||||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  TATTCG-CTTAG-ATTCATTTACTT-AATTTATGATGGTTTAGAAA  1038