BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051B05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 113,847,579 - 113,976,816
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043510
Upstream geneEG223186, LOC100043509, Tpm3-rs7
Downstream geneLOC382947, LOC668791, LOC100043821
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051B05.bB6Ng01-051B05.g
ACCDH874828DH874829
length6301,143
definitionDH874828|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051B05, 5' end.DH874829|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,847,579 - 113,848,209)(113,975,648 - 113,976,816)
sequence
gaattctcagaggactaataaaataaaagaaagtagtaaatccgattttc
tccacctcctgctctttggttaatcatttaacttgttaagagtatagtat
aaggtagacgtaatgttctacccacagagatcactatgccttttccattt
ttgttctctttcttgaacatttgtatctccacaggaacagaagtaagaga
tcttcatacaaaacaaagagaaacaaagcaaagacaaaaaaacacttgca
aaagatctctgtggtgtgatttattttgtatccctggcccttcagaaaat
actcagttgctagtcaattgtccctttgagaactgttagctgtaggaaga
acaatgtcagcttgattgacaacccagggcttccaggtactagaccacca
agcaaggaatgtacatggagggatccaaggctccagatagatacatatgt
agcagagccttgtctgacatcagtggtgggaagggccttggtcctatgga
ggcttgatgccccagtgtagagggttgctagagcagtggagtggaagaag
tagggtgggtgggggagcactctcatagaggcaaaggagaggggacagag
ggcataggtgggatggagggttttatggat
gaattctaaataataccactgtactttttggagaaatggagaatcttgtc
cagctcaggcttgacttttactccctatgtagtccagactaacctcaaag
tcttaaagaccttcctgcctcaatgtcttgaaggctgtaataaagggttg
aaactggatttaacaaccaaaaggatgaaggcacacactaatctcatgcc
aaagcagatgtttaaaacgtgttactgtaggatctctagagcctttgaga
ggaagaatttagtcattttaactttctgatgagaattgggttaggaccaa
tatatgactatagcagaatatcattggacatcatttcacttattttgata
agtgaagcaaactctggtgagattcaagcactgacttaaactgctcatct
gataattttttttctatgatttctataagtgctcctgagacccatgagtt
ccaaggtgtggcattttttacaggggcctgaaacgtgaagagatgttttc
ttgactaggctatgtaattggttggtagtgtacttccttagcatccaaga
agccatggatacaatctcagcaccacaaaatgccagttccttagcactac
cctgggattgtaacatggggagttgaagtccagatgaactgaattccaag
attactttttgatcaacatagagttggaggatagatggcaaaaaaaatgc
aactatataaacaaaacaaaagcaacctaagagacagtggttggctgtag
ttagatgccctcttgtcatgcaagggtgtgattcaaaagctcttctggct
tcttttaattctttgtttcctggccactcaagattaaatttgcctgctaa
gtactattaacactatgtgtcaactcatcacaggagcagagcacacatca
atctaagaaccaaagccttccaaactttgaaactgtgatgaaaccacaca
cacaccacacacacacaccacacacactaacacacaccaccacactacta
cacattcactacacatatataaacctactattactttcataaaccaccat
acacatagccacccttccacatacatgccatatgtacactatacatgcca
gaagacaatgcaataaaatgtcattcctttccagttctcagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_113847579_113848209
seq2: B6Ng01-051B05.b_41_670

seq1  GAATTCTCAGAGGACTAATAAAATAAAAGAAAGTAGTAAATCCGATTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGAGGACTAATAAAATAAAAGAAAGTAGTAAATCCGATTTTC  50

seq1  TCCACCTCCTGCTCTTTGGTTAATCATTTAACTTGTTAAGAGTATAGTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTCCTGCTCTTTGGTTAATCATTTAACTTGTTAAGAGTATAGTAT  100

seq1  AAGGTAGACGTAATGTTCTACCCACAGAGATCACTATGCCTTTTCCATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGACGTAATGTTCTACCCACAGAGATCACTATGCCTTTTCCATTT  150

seq1  TTGTTCTCTTTCTTGAACATTTGTATCTCCACAGGAACAGAAGTAAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTCTTTCTTGAACATTTGTATCTCCACAGGAACAGAAGTAAGAGA  200

seq1  TCTTCATACAAAACAAAGAGAAACAAAGCAAAGACAAAAAAACACTTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATACAAAACAAAGAGAAACAAAGCAAAGACAAAAAAACACTTGCA  250

seq1  AAAGATCTCTGTGGTGTGATTTATTTTGTATTCCCTGGCCCTTCAGAAAA  300
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAAGATCTCTGTGGTGTGATTTATTTTGTA-TCCCTGGCCCTTCAGAAAA  299

seq1  TACTCAGTTGCTAGTCAATTGTCCCTTTGAGAACTGTTAGCTGTAGGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAGTTGCTAGTCAATTGTCCCTTTGAGAACTGTTAGCTGTAGGAAG  349

seq1  AACAATGTCAGCTTGATTGACAACCCAGGGCTTCCAGGTACTAGACCACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGTCAGCTTGATTGACAACCCAGGGCTTCCAGGTACTAGACCACC  399

seq1  AAGCAAGGAATGTACATGGAGGGATCCAAGGCTCCAGATAGATACATATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGGAATGTACATGGAGGGATCCAAGGCTCCAGATAGATACATATG  449

seq1  TAGCAGAGCCTTGTCTGACATCAGTGGTGGGAAGGGCCTTGGTCCTATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGAGCCTTGTCTGACATCAGTGGTGGGAAGGGCCTTGGTCCTATGG  499

seq1  AGGCTTGATGCCCCAGTGTAGAGGGTTGCTAGAGCAGTGGAGTGGAAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTGATGCCCCAGTGTAGAGGGTTGCTAGAGCAGTGGAGTGGAAGAA  549

seq1  GTAGGGTGGGTGGGGGAGCACTCTCATAGAGGCAAAGGAGAGGGGACAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGTGGGTGGGGGAGCACTCTCATAGAGGCAAAGGAGAGGGGACAGA  599

seq1  GGGCATAGGTGGGATGGAGGGGTTTATGGAT  631
      ||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGGCATAGGTGGGATGGAGGGTTTTATGGAT  630

seq1: chr14_113975648_113976816
seq2: B6Ng01-051B05.g_66_1208 (reverse)

seq1  ATCTGAGATAACTGGAAAAGGGGAAATGACATTTATTATTTTTGCATGTG  50
      |||||||  |||||||||    | |||||||||     || |||||| ||
seq2  ATCTGAG--AACTGGAAA----GGAATGACATT-----TTATTGCAT-TG  38

seq1  TC-TCTGTGCATGTTATAGTGTACATATGTGCATGTATGTGGAAGGTGTG  99
      || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |
seq2  TCTTCTG-GCATG-TATAGTGTACATATG-GCATGTATGTGGAAGGGTGG  85

seq1  CTATGTGTATGTGTGTTTATGAATGTATATGTATGTGTTTTATATATGTT  149
      |||||||||||   ||||||||| |||   |||   | |||||||||| |
seq2  CTATGTGTATGGTGGTTTATGAAAGTAATAGTA---GGTTTATATATG-T  131

seq1  GTAGGTGAATGTGTATGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTG  199
      ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
seq2  GTA-GTGAATGTGTA-GTAGTGTG-GTG-GTGTGTGTTAGTGTGTGTG-G  176

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTTCATCACAGTTTCAAAGTTTGG  249
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTG-GTGTGTGTG-TGGTTTCATCACAGTTTCAAAGTTTGG  224

seq1  AAGGCTTTGGTTCTTAGATTGATGTGTTGCTCTGCTCCTGTGATGAGTTG  299
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTTGGTTCTTAGATTGATGTG-TGCTCTGCTCCTGTGATGAGTTG  273

seq1  ACACATAGTGTTAATAGTACTTAGCAGGCAAATTTAATCTTGAGTGGCCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATAGTGTTAATAGTACTTAGCAGGCAAATTTAATCTTGAGTGGCCA  323

seq1  GGAAACAAAGAATTAAAAGAAGCCAGAAGAGCTTTTGAATCACACCCTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACAAAGAATTAAAAGAAGCCAGAAGAGCTTTTGAATCACACCCTTG  373

seq1  CATGACAAGAGGGCATCTAACTACAGCCAACCACTGTCTCTTAGGTTGCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACAAGAGGGCATCTAACTACAGCCAACCACTGTCTCTTAGGTTGCT  423

seq1  TTTGTTTTGTTTATATAGTTGCATTTTTTTTGCCATCTATCCTCCAACTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTTGTTTATATAGTTGCATTTTTTTTGCCATCTATCCTCCAACTC  473

seq1  TATGTTGATCAAAAAGTAATCTTGGAATTCAGTTCATCTGGACTTCAACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGATCAAAAAGTAATCTTGGAATTCAGTTCATCTGGACTTCAACT  523

seq1  CCCCATGTTACAATCCCAGGGTAGTGCTAAGGAACTGGCATTTTGTGGTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGTTACAATCCCAGGGTAGTGCTAAGGAACTGGCATTTTGTGGTG  573

seq1  CTGAGATTGTATCCATGGCTTCTTGGATGCTAAGGAAGTACACTACCAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATTGTATCCATGGCTTCTTGGATGCTAAGGAAGTACACTACCAAC  623

seq1  CAATTACATAGCCTAGTCAAGAAAACATCTCTTCACGTTTCAGGCCCCTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTACATAGCCTAGTCAAGAAAACATCTCTTCACGTTTCAGGCCCCTG  673

seq1  TAAAAAATGCCACACCTTGGAACTCATGGGTCTCAGGAGCACTTATAGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAATGCCACACCTTGGAACTCATGGGTCTCAGGAGCACTTATAGAA  723

seq1  ATCATAGAAAAAAAATTATCAGATGAGCAGTTTAAGTCAGTGCTTGAATC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAGAAAAAAAATTATCAGATGAGCAGTTTAAGTCAGTGCTTGAATC  773

seq1  TCACCAGAGTTTGCTTCACTTATCAAAATAAGTGAAATGATGTCCAATGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGAGTTTGCTTCACTTATCAAAATAAGTGAAATGATGTCCAATGA  823

seq1  TATTCTGCTATAGTCATATATTGGTCCTAACCCAATTCTCATCAGAAAGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGCTATAGTCATATATTGGTCCTAACCCAATTCTCATCAGAAAGT  873

seq1  TAAAATGACTAAATTCTTCCTCTCAAAGGCTCTAGAGATCCTACAGTAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGACTAAATTCTTCCTCTCAAAGGCTCTAGAGATCCTACAGTAAC  923

seq1  ACGTTTTAAACATCTGCTTTGGCATGAGATTAGTGTGTGCCTTCATCCTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTTTAAACATCTGCTTTGGCATGAGATTAGTGTGTGCCTTCATCCTT  973

seq1  TTGGTTGTTAAATCCAGTTTCAACCCTTTATTACAGCCTTCAAGACATTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGTTAAATCCAGTTTCAACCCTTTATTACAGCCTTCAAGACATTG  1023

seq1  AGGCAGGAAGGTCTTTAAGACTTTGAGGTTAGTCTGGACTACATAGGGAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGAAGGTCTTTAAGACTTTGAGGTTAGTCTGGACTACATAGGGAG  1073

seq1  TAAAAGTCAAGCCTGAGCTGGACAAGATTCTCCATTTCTCCAAAAAGTAC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTCAAGCCTGAGCTGGACAAGATTCTCCATTTCTCCAAAAAGTAC  1123

seq1  AGTGGTATTATTTAGAATTC  1169
      ||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTATTATTTAGAATTC  1143