BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051E21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 103,151,379 - 103,259,087
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLmo7, LOC100043795, LOC545567, LOC669278
Downstream geneKctd12, LOC668699, Irg1, Cln5, Fbxl3, LOC100043441, Phr1, LOC100043797, Scel, LOC100043448, Slain1, Ednrb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051E21.bB6Ng01-051E21.g
ACCDH874988DH874989
length1,1851,112
definitionDH874988|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E21, 5' end.DH874989|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,151,379 - 103,152,568)(103,257,962 - 103,259,087)
sequence
gaattcttcaccccctcatccctctcctttggctctgagagggtgctccc
cccacccacacactaccacccaccatgcacccactggggcatcaagcctc
tacagaatcagatgcatcttctcccactgaggccaattttcaatgcaaga
gaaaggattcctttcaccaggcacaacattgtccggctgatctctaagtg
caatcaagtgatgtccacggaaaggagtgagctgtgcaagtggacacacg
cttaacatagtgagataactatatagagccagcatcctgtggaagtctaa
acaacaccacagctcactctgggatttaaagatataattacttaagcagc
ctactaactaaatttaaacatatcattgtttaagtctctattgtaagcaa
aattttttttgcaaactcctaaatacattcagaaaaaaaattgttagact
cagctgcaactagaaaaacaatcaaaagatattcaatagcatttctcaag
tgataagaaaatattcaactacaattcagtctaatatagaccgctaacca
attaaattaaaatttcatgccatcctcagagtattaaaacctatttttat
ttttaaaaaaaacttttaaaaaagcattcatttgctttttcttaagtatt
tccagctggatatattatgtgaattgagtttcatactcaatggaataata
acaggtggtcccataggctgaatgaagatttgattataagtccagggaaa
actgcaataacaatattttaattctaaatactatagttctaatatcttta
aatataacaccttttagttacagtatcatcatccctaacagaaacaatgt
tgccattgcattatttaccgagcatgggctacacagtactgtgtcaaatt
cttagctttgtcccactttcccagacctcatcctactcctgtaagcagag
gaattagagggtcatactcactcctaagaaattccaggcatgcttcctta
gggctcccaagtgggttgttatgccatgagtaaagatcctaagataatcc
aaaaggatgcatttgcagctggattgtggggcatctctgatgaagtgatg
gtcactgggatggaagtttctaatcaaactggaaagacatttgactaaat
gggatctaccatatgtttcaattcaaaacaaagga
gaattcagtgatgcaactgattccaagtggaaagaaaaatgtgagtttga
atgtgctgctcatgttggaagggacggctgtgattgtgccagattcacat
ctgcttttattttgcagttactcctcttggcttcactagagcatatgtga
cctacaggacacgatgcttttaaggtgactttgccttgctccccagatac
agatgttcccagagttgtgttcctaattaaatattgactataaaagtaag
gatcgcaggcaagtttgaaaagcataaaagttgttatggagatatggaaa
tccattcactggtaacacttcatttttttggcctttgaaaagcagtgatg
atagaggaccaacatgctttgtaagtcaccacgtctcctttggcaattta
ttttaatgtattttgttcccagaggaaagaaagtgattcacatgactctt
aatgctttccagctgtccagggagaaaatatggtttggattcagttgtaa
aagggagtctccaaaaacctgaagctcttgtgtttctgttctcaggagtg
gattctcgccagcctgctttatagaattctttaaggctaatccttttctc
cttgttattttgtcaacaaccagcaggtatcaggtcctctctaggtgtct
ctgggtctgagaccttccagatctagaatgtggtttgtttccctcaagcg
gtcatgtggaacactgaccttgaagaatggtcagttcaagaacataagca
tgggccatgagagtttggaaaacttttagaattagagttaacttcttaaa
gtgtgttaactgtgttctctcaaatctatatgttgaaactttagttgcca
gggtggtggtcttgaaagtgaccatcaggagacgagcaagatatgagggt
gagggaacttcctgaatgggcttagtgacccaataaagatgcaaagagca
tgcccatccagtcgcctcctttttccttgccacaggagtctcaaggagtc
gtcttttatacatgcacgtgactgtgaacactattgtacataacctgctc
tagaacactggatcacagcaccacatctggggccccaactcaggaatgta
ggaaagagattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_103151379_103152568
seq2: B6Ng01-051E21.b_41_1225

seq1  GAATTCTTCACCCCCTCATCCCTCTCCTTTGGCTCTGAGAGGGTGCTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCACCCCCTCATCCCTCTCCTTTGGCTCTGAGAGGGTGCTCCC  50

seq1  CCCACCCACACACTACCACCCACCATGCACCCACTGGGGCATCAAGCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCACACACTACCACCCACCATGCACCCACTGGGGCATCAAGCCTC  100

seq1  TACAGAATTAGATGCATCTTCTCCCACTGAGGCCAATTTTCAATGCAAGA  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAATCAGATGCATCTTCTCCCACTGAGGCCAATTTTCAATGCAAGA  150

seq1  GAAAGGATTCCTTTCACCAGGCACAACATTGTCCGGCTGATCTCTAAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGATTCCTTTCACCAGGCACAACATTGTCCGGCTGATCTCTAAGTG  200

seq1  CAATCAAGTGATGTCCACGGAAAGGAGTGAGCTGTGCAAGTGGACACACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCAAGTGATGTCCACGGAAAGGAGTGAGCTGTGCAAGTGGACACACG  250

seq1  CTTAACATAGTGAGATAACTATATAGAGCCAGCATCCTGTGGAAGTCTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACATAGTGAGATAACTATATAGAGCCAGCATCCTGTGGAAGTCTAA  300

seq1  ACAACACCACAGCTCACTCTGGGATTTAAAGATATAATTACTTAAGCAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACACCACAGCTCACTCTGGGATTTAAAGATATAATTACTTAAGCAGC  350

seq1  CTACTAACTAAATTTAAACATATCATTGTTTAAGTCTCTATTGTAAGCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTAACTAAATTTAAACATATCATTGTTTAAGTCTCTATTGTAAGCAA  400

seq1  AATTTTTTTTGCAAACTCCTAAATACATTCAGAAAAAAAATTGTTAGACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTTTTGCAAACTCCTAAATACATTCAGAAAAAAAATTGTTAGACT  450

seq1  CAGCTGCAACTAGAAAAACAATCAAAAGATATTCAATAGCATTTCTCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCAACTAGAAAAACAATCAAAAGATATTCAATAGCATTTCTCAAG  500

seq1  TGATAAGAAAATATTCAACTACAATTCAGTCTAATATAGACCGCTAACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAGAAAATATTCAACTACAATTCAGTCTAATATAGACCGCTAACCA  550

seq1  ATTAAATTAAAATTTCATGCCATCCTCAGAGTATTAAAACCTATTTTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATTAAAATTTCATGCCATCCTCAGAGTATTAAAACCTATTTTTAT  600

seq1  TTTTAAAAAAAACTTTTAAAAAAGCATTCATTTGCTTTTTCTTAAGTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAAAAACTTTTAAAAAAGCATTCATTTGCTTTTTCTTAAGTATT  650

seq1  TCCAGCTGGATATATTATGTGAATTGAGTTTCATACTCAATGGAATAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTGGATATATTATGTGAATTGAGTTTCATACTCAATGGAATAATA  700

seq1  ACAGGTGGTCCCATAGGCTGAATGAAGATTTGATTATAAGTCCAGGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTGGTCCCATAGGCTGAATGAAGATTTGATTATAAGTCCAGGGAAA  750

seq1  ACTGCAATAACAATATTTTAATTCTAAATACTATAGTTCTAATATCTTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAATAACAATATTTTAATTCTAAATACTATAGTTCTAATATCTTTA  800

seq1  AATATAACACCTTTTAGTTACAGTATCATCATCCCTAACAGAAACAATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAACACCTTTTAGTTACAGTATCATCATCCCTAACAGAAACAATGT  850

seq1  TGCCATTGCATTATTTACCGAGCATGGGCTACACAGTACTGTGTCAAATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATTGCATTATTTACCGAGCATGGGCTACACAGTACTGTGTCAAATT  900

seq1  CTTAGCTTTGTCCCACTTTCCCAGACCTCATCCTACTCCTGTAAGCAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCTTTGTCCCACTTTCCCAGACCTCATCCTACTCCTGTAAGCAGAG  950

seq1  GAATTAGAGGGTTCATACTCACTCCTAAGAAATTCCAGGCAGGCTTCCTT  1000
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAATTAGAGGG-TCATACTCACTCCTAAGAAATTCCAGGCATGCTTCCTT  999

seq1  AAGTGCTCCCAAGTGGGTTGTTATGCCATGAAGTAAAGATCCTAAGATAA  1050
       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -AGGGCTCCCAAGTGGGTTGTTATGCCATG-AGTAAAGATCCTAAGATAA  1047

seq1  TCCAAAAAGGATGCATTTGCAGCTG--ATGTGGGGCATCTCTGATGAAGT  1098
      ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
seq2  TCC-AAAAGGATGCATTTGCAGCTGGATTGTGGGGCATCTCTGATGAAGT  1096

seq1  GATTGGTCACTGGAATGTAAGTCTCTAAATCAGACTTGAAAAGCATTTGA  1148
      || |||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||  |||||||
seq2  GA-TGGTCACTGGGATGGAAGTTTCT-AATCAAACTGGAAAGACATTTGA  1144

seq1  CTAAATGGTATCACCTAGTTGTTTCAATCTAAAAACAAAGAA  1190
      |||||||| |||  | |  ||||||||| | ||||||||| |
seq2  CTAAATGGGATCTACCATATGTTTCAAT-TCAAAACAAAGGA  1185

seq1: chr14_103257962_103259087
seq2: B6Ng01-051E21.g_68_1179 (reverse)

seq1  AAATCTCTTTCTTACAATCCTTGAGGTTGGGGGCACCAGAATGTGGTGCT  50
      ||||||||||| |||| ||| ||||  | ||||| |||| ||||||||||
seq2  AAATCTCTTTCCTACATTCC-TGAG--TTGGGGCCCCAG-ATGTGGTGCT  46

seq1  GGTGGATCCAGTG-TCTAGAGCAGGGTTATTGTACAGATAGTGTTCACAG  99
      |   ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| 
seq2  G--TGATCCAGTGTTCTAGAGCA-GGTTA-TGTACA-ATAGTGTTCACA-  90

seq1  GTCACGTGCATGTGATAGAAAGGACGACTCC-TGAGACTTCCTGTGGCAA  148
      ||||||||||||   || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  GTCACGTGCATG---TATAAAAGACGACTCCTTGAGAC-TCCTGTGGCAA  136

seq1  GGGAAAAGGGAGGGCGACTGGATGGGCATGCTCTTTGCATCTTTTATTGG  198
      || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGAAAAAGG--AGGCGACTGGATGGGCATGCTCTTTGCATC-TTTATTGG  183

seq1  GTCACTAAGCCCATTCAGGAAGTTCCCTCACCCTCATATCTTGCTCGTCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTAAGCCCATTCAGGAAGTTCCCTCACCCTCATATCTTGCTCGTCT  233

seq1  CCTGATGGTCACTTTCAAGACCACCACCCTGGCAACTAAAGTTTCAACAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATGGTCACTTTCAAGACCACCACCCTGGCAACTAAAGTTTCAACAT  283

seq1  ATAGATTTGAGAGAACACAGTTAACACACTTTAAGAAGTTAACTCTAATT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATTTGAGAGAACACAGTTAACACACTTTAAGAAGTTAACTCTAATT  333

seq1  CT-AAAGTTTTCCAAACTCTCATGGCCCATGCTTATGTTCTTGAACTGAC  397
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGTTTTCCAAACTCTCATGGCCCATGCTTATGTTCTTGAACTGAC  383

seq1  CATTCTTCAAGGTCAGTGTTCCACATGACCGCTTGAGGGAAACAAACCAC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTCAAGGTCAGTGTTCCACATGACCGCTTGAGGGAAACAAACCAC  433

seq1  ATTCTAGATCTGGAAGGTCTCAGACCCAGAGACACCTAGAGAGGACCTGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAGATCTGGAAGGTCTCAGACCCAGAGACACCTAGAGAGGACCTGA  483

seq1  TACCTGCTGGTTGTTGACAAAATAACAAGGAGAAAAGGATTAGCCTTAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGCTGGTTGTTGACAAAATAACAAGGAGAAAAGGATTAGCCTTAAA  533

seq1  GAATTCTATAAAGCAGGCTGGCGAGAATCCACTCCTGAGAACAGAAACAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATAAAGCAGGCTGGCGAGAATCCACTCCTGAGAACAGAAACAC  583

seq1  AAGAGCTTCAGGTTTTTGGAGACTCCCTTTTACAACTGAATCCAAACCAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTTCAGGTTTTTGGAGACTCCCTTTTACAACTGAATCCAAACCAT  633

seq1  ATTTTCTCCCTGGACAGCTGGAAAGCATTAAGAGTCATGTGAATCACTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTCCCTGGACAGCTGGAAAGCATTAAGAGTCATGTGAATCACTTT  683

seq1  CTTTCCTCTGGGAACAAAATACATTAAAATAAATTGCCAAAGGAGACGTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCTGGGAACAAAATACATTAAAATAAATTGCCAAAGGAGACGTG  733

seq1  GTGACTTACAAAGCATGTTGGTCCTCTATCATCACTGCTTTTCAAAGGCC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTACAAAGCATGTTGGTCCTCTATCATCACTGCTTTTCAAAGGCC  783

seq1  AAAAAAATGAAGTGTTACCAGTGAATGGATTTCCATATCTCCATAACAAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATGAAGTGTTACCAGTGAATGGATTTCCATATCTCCATAACAAC  833

seq1  TTTTATGCTTTTCAAACTTGCCTGCGATCCTTACTTTTATAGTCAATATT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGCTTTTCAAACTTGCCTGCGATCCTTACTTTTATAGTCAATATT  883

seq1  TAATTAGGAACACAACTCTGGGAACATCTGTATCTGGGGAGCAAGGCAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAGGAACACAACTCTGGGAACATCTGTATCTGGGGAGCAAGGCAAA  933

seq1  GTCACCTTAAAAGCATCGTGTCCTGTAGGTCACATATGCTCTAGTGAAGC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTTAAAAGCATCGTGTCCTGTAGGTCACATATGCTCTAGTGAAGC  983

seq1  CAAGAGGAGTAACTGCAAAATAAAAGCAGATGTGAATCTGGCACAATCAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGGAGTAACTGCAAAATAAAAGCAGATGTGAATCTGGCACAATCAC  1033

seq1  AGCCGTCCCTTCCAACATGAGCAGCACATTCAAACTCACATTTTTCTTTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGTCCCTTCCAACATGAGCAGCACATTCAAACTCACATTTTTCTTTC  1083

seq1  CACTTGGAATCAGTTGCATCACTGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGAATCAGTTGCATCACTGAATTC  1112