BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-055A12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 71,609,717 - 71,750,963
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043132
Upstream genePpp3cc, LOC100043115, Slc39a14, EG668450, Piwil2, Polr3d, Phyhip, Bmp1, Sftpc, Lgi3, Reep4, Hr, Nudt18, Rai16, Epb4.9, Fgf17, Npm2, Xpo7, LOC668443, Dok2, Gfra2
Downstream geneLOC100043136, LOC668477
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-055A12.bB6Ng01-055A12.g
ACCDH877610DH877611
length9421,058
definitionDH877610|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055A12, 5' end.DH877611|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055A12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,609,717 - 71,610,658)(71,749,892 - 71,750,963)
sequence
gaattcatgctggttttgtcttgttattgtgactctattgcagtgtttgc
ctgtcatgcccagaaggataagggttctgtgtaatgaaggggaaagcatg
gttgaaaagttgtgtaggcagaggagatggaagaagagagaggaggcaga
aggaagagggcatgaagaggagccagtgataggtgttagtctgttgcttc
cttgaggtgaagacgatataatatatcctggtgtagatggcccaagaacc
taaggagtacataaagaataacctatagcagctggatgtgtaagttagtg
gaatggtgcttgcctaacaggtcctggcttctatccccagaacagctccc
ataccatctaatatgtgtgaaaagaatatacaacactcccagactttttg
gtgaattaatatttacattattattcaaaaataattaatgacaaacaaga
cagcaatgctccataacttgtgcaccaggagagctcatctttctaggagt
tgatagaactctgaaattggtctttacatttctagtggctatgcactggg
gtccaagctaatcttaaagtgatgtaggcacttttaatcacatgttcaaa
actgaactaatggcaggtatggtcagatcttaaacaagttacttgtaact
acccttctacttgggaagtgtgggtgtgcattagtaggggcctcacttgt
caggtctggaagatgggtatgaatttgtgggtatgacaggtgagaggcct
catttgtcatgtctggaagatgggtgtgagttttctccataactggtgag
tagagaagggaggtagggtacctaataaggaagatgtgtcagtatccatg
aggccaagtgctccagacagatgagaatattggagtggagtagagtggga
aggtgatgatcatggcatgtaggtcatgccataaccataaga
gaattccagatgctgggctacaagaataactacctaagaccttctggtgg
gggtctccaggttaggtgctctaaggcagacacagaaacagtgaaggagt
tagttaagttcctgatggtctcaagttttgatatttcaaacattgctatg
ccttgccagttccataccagttcttctattggcatggtccacatgcccca
cagctctgcagtaaagtttctagattatatggtaattctatttttaatat
ttaaagggatttcactgattttcaaaatgactctagccacttaccctctg
ttcattttgctgtttttctgtgctatttataatgactttcttttattttt
aattacatcctatttatatgtgtaagggtttgtgaccataagcacagtgc
ctacagaggccagaaaagtgcataggctacccttctgagctgcagacata
agagctgagaattagactccagtcctcttcaaaggcagcaagtgcccttg
atcactaagccatttctccaaccccaggacagtctttataaaatggagtc
tttacagatgttcctaacaagatgataagttatcatgggggaaaaaatat
gtcccctttgaccctttttaccattcagagttgatattctgcctgatatc
tacactgagctacctgagactatatgagttgccagggtgctgatctgctg
ggatggcaagtagacataaaccatatgctacctaagaggctgaggaccag
accaggaggcgacagtgactggtcactgagtaagcataagggcctgagtt
taagccccaggacccttgtgttagacatggctgtgccttcctgcaaatgc
catcttttctgagagacagaaacagaggatttctgagcctttctggcttc
cagcctacctctaggttagtgaaagactctgtctcatggaatgagaggag
aatgatagagcagacactcaacttcttctctctgcttctcatgcgtgaac
aaggatgtgcgcatgcacacacgatagcagacagcagcatgacaggatgc
accaacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_71609717_71610658
seq2: B6Ng01-055A12.b_47_988

seq1  GAATTCATGCTGGTTTTGTCTTGTTATTGTGACTCTATTGCAGTGTTTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGCTGGTTTTGTCTTGTTATTGTGACTCTATTGCAGTGTTTGC  50

seq1  CTGTCATGCCCAGAAGGATAAGGGTTCTGTGTAATGAAGGGGAAAGCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCATGCCCAGAAGGATAAGGGTTCTGTGTAATGAAGGGGAAAGCATG  100

seq1  GTTGAAAAGTTGTGTAGGCAGAGGAGATGGAAGAAGAGAGAGGAGGCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAAAGTTGTGTAGGCAGAGGAGATGGAAGAAGAGAGAGGAGGCAGA  150

seq1  AGGAAGAGGGCATGAAGAGGAGCCAGTGATAGGTGTTAGTCTGTTGCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAGGGCATGAAGAGGAGCCAGTGATAGGTGTTAGTCTGTTGCTTC  200

seq1  CTTGAGGTGAAGACGATATAATATATCCTGGTGTAGATGGCCCAAGAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGGTGAAGACGATATAATATATCCTGGTGTAGATGGCCCAAGAACC  250

seq1  TAAGGAGTACATAAAGAATAACCTATAGCAGCTGGATGTGTAAGTTAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGTACATAAAGAATAACCTATAGCAGCTGGATGTGTAAGTTAGTG  300

seq1  GAATGGTGCTTGCCTAACAGGTCCTGGCTTCTATCCCCAGAACAGCTCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGTGCTTGCCTAACAGGTCCTGGCTTCTATCCCCAGAACAGCTCCC  350

seq1  ATACCATCTAATATGTGTGAAAAGAATATACAACACTCCCAGACTTTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATCTAATATGTGTGAAAAGAATATACAACACTCCCAGACTTTTTG  400

seq1  GTGAATTAATATTTACATTATTATTCAAAAATAATTAATGACAAACAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATTAATATTTACATTATTATTCAAAAATAATTAATGACAAACAAGA  450

seq1  CAGCAATGCTCCATAACTTGTGCACCAGGAGAGCTCATCTTTCTAGGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATGCTCCATAACTTGTGCACCAGGAGAGCTCATCTTTCTAGGAGT  500

seq1  TGATAGAACTCTGAAATTGGTCTTTACATTTCTAGTGGCTATGCACTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAACTCTGAAATTGGTCTTTACATTTCTAGTGGCTATGCACTGGG  550

seq1  GTCCAAGCTAATCTTAAAGTGATGTAGGCACTTTTAATCACATGTTCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAAGCTAATCTTAAAGTGATGTAGGCACTTTTAATCACATGTTCAAA  600

seq1  ACTGAACTAATGGCAGGTATGGTCAGATCTTAAACAAGTTACTTGTAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACTAATGGCAGGTATGGTCAGATCTTAAACAAGTTACTTGTAACT  650

seq1  ACCCTTCTACTTGGGAAGTGTGGGTGTGCATTAGTAGGGGCCTCACTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTCTACTTGGGAAGTGTGGGTGTGCATTAGTAGGGGCCTCACTTGT  700

seq1  CAGGTCTGGAAGATGGGTATGAATTTGTGGGTATGACAGGTGAGAGGCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCTGGAAGATGGGTATGAATTTGTGGGTATGACAGGTGAGAGGCCT  750

seq1  CATTTGTCAGGTCTGGAAGATGGGTGTGAGTTTTCTCCATAACTGGTGAG  800
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTCATGTCTGGAAGATGGGTGTGAGTTTTCTCCATAACTGGTGAG  800

seq1  TAGAGAAGGGAGGTAGGGTACCTAATAAGGAAGATGTGTCAGTATCCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAGGGAGGTAGGGTACCTAATAAGGAAGATGTGTCAGTATCCATG  850

seq1  AGGCCAAGTGCTCCAGACAGATGAGAATATTGGAGTGGAGTAGAGTGG--  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  AGGCCAAGTGCTCCAGACAGATGAGAATATTGGAGTGGAGTAGAGTGGGA  900

seq1  AGGTGATGATCATGGCCATGTAGGTCATGCCATAGTCCATAAGA  942
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  AGGTGATGATCATGG-CATGTAGGTCATGCCATA-ACCATAAGA  942

seq1: chr14_71749892_71750963
seq2: B6Ng01-055A12.g_68_1125 (reverse)

seq1  GTGTGTGGTGCATCCCTGTTCATGCCTGCTGTCTGCTATCTGTGTGTGCA  50
      |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  GTGT-TGGTGCAT-CCTG-TCATG-CTGCTGTCTGCTATC-GTGTGTGCA  45

seq1  TGCGCACATCCCTGTTCACGCATGAGGAGGCCAGAGGAGGAGGAGGTTGA  100
      ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||   || || |||||
seq2  TGCGCACATCCTTGTTCACGCATGAGAAG--CAGAG--AGAAGAAGTTGA  91

seq1  GTGTTCTGCTCTATCATTCTTCCTCTCATTCCCTTGAGACAGAGTCTTTC  150
      ||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||
seq2  GTG-TCTGCTCTATCATTC-TCCTCTCATT-CCATGAGACAGAGTCTTTC  138

seq1  ACTAAACCTAGAGGTAGGCTGGAAGCCAGAAAGGCTCAGAAATCCTCTGT  200
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACT-AACCTAGAGGTAGGCTGGAAGCCAGAAAGGCTCAGAAATCCTCTGT  187

seq1  TTCTGTCTCTCAGAAAAGATGGCATTTGCAGGAAGGCACAGCCATGTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTCTCAGAAAAGATGGCATTTGCAGGAAGGCACAGCCATGTCTA  237

seq1  ACACAAGGGTCCTGGGGCTTAAAACTCAGGCCCTTATGCTTACTCAGTGA  300
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGGGTCCTGGGGCTT-AAACTCAGGCCCTTATGCTTACTCAGTGA  286

seq1  CCAGTCACTGTCGCCTCCTGGTCTGGTCCTCAGCCTCTTAGGTAGCATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCACTGTCGCCTCCTGGTCTGGTCCTCAGCCTCTTAGGTAGCATAT  336

seq1  GGTTTATGTCTACTTGCCATCCCAGCAGATCAGCACCCTGGCAACTCATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTATGTCTACTTGCCATCCCAGCAGATCAGCACCCTGGCAACTCATA  386

seq1  TAGTCTCAGGTAGCTCAGTGTAGATATCAGGCAGAATATCAACTCTGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTCAGGTAGCTCAGTGTAGATATCAGGCAGAATATCAACTCTGAAT  436

seq1  GGTAAAAAGGGTCAAAGGGGACATATTTTTTCCCCCATGATAACTTATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAAAGGGTCAAAGGGGACATATTTTTTCCCCCATGATAACTTATCA  486

seq1  TCTTGTTAGGAACATCTGTAAAGACTCCATTTTATAAAGACTGTCCTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTAGGAACATCTGTAAAGACTCCATTTTATAAAGACTGTCCTGGG  536

seq1  GTTGGAGAAATGGCTTAGTGATCAAGGGCACTTGCTGCCTTTGAAGAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAGAAATGGCTTAGTGATCAAGGGCACTTGCTGCCTTTGAAGAGGA  586

seq1  CTGGAGTCTAATTCTCAGCTCTTATGTCTGCAGCTCAGAAGGGTAGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTCTAATTCTCAGCTCTTATGTCTGCAGCTCAGAAGGGTAGCCTA  636

seq1  TGCACTTTTCTGGCCTCTGTAGGCACTGTGCTTATGGTCACAAACCCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTTTTCTGGCCTCTGTAGGCACTGTGCTTATGGTCACAAACCCTTA  686

seq1  CACATATAAATAGGATGTAATTAAAAATAAAAGAAAGTCATTATAAATAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATAAATAGGATGTAATTAAAAATAAAAGAAAGTCATTATAAATAG  736

seq1  CACAGAAAAACAGCAAAATGAACAGAGGGTAAGTGGCTAGAGTCATTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAAAACAGCAAAATGAACAGAGGGTAAGTGGCTAGAGTCATTTTG  786

seq1  AAAATCAGTGAAATCCCTTTAAATATTAAAAATAGAATTACCATATAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCAGTGAAATCCCTTTAAATATTAAAAATAGAATTACCATATAATC  836

seq1  TAGAAACTTTACTGCAGAGCTGTGGGGCATGTGGACCATGCCAATAGAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAACTTTACTGCAGAGCTGTGGGGCATGTGGACCATGCCAATAGAAG  886

seq1  AACTGGTATGGAACTGGCAAGGCATAGCAATGTTTGAAATATCAAAACTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGTATGGAACTGGCAAGGCATAGCAATGTTTGAAATATCAAAACTT  936

seq1  GAGACCATCAGGAACTTAACTAACTCCTTCACTGTTTCTGTGTCTGCCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCATCAGGAACTTAACTAACTCCTTCACTGTTTCTGTGTCTGCCTT  986

seq1  AGAGCACCTAACCTGGAGACCCCCACCAGAAGGTCTTAGGTAGTTATTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACCTAACCTGGAGACCCCCACCAGAAGGTCTTAGGTAGTTATTCT  1036

seq1  TGTAGCCCAGCATCTGGAATTC  1072
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCCCAGCATCTGGAATTC  1058