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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-056K10
Chromosome	14 (Build37)
Map Location	95,503,485 - 95,504,434
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC100043356, LOC100043783
Downstream gene	LOC677613, LOC100043784, LOC382931, 4921530L21Rik
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-056K10.b	B6Ng01-056K10.g
ACC	DH878744	DH878745
length	1,269	948
definition	DH878744\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056K10, 5' end.	DH878745\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056K10, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattccaaatacactcgaccagaaaagaaattcctccccacacagaata atccgaacaaaaaatgcactaaataaagatagaatattaaaagcagtaag ggaaaaaggtcaagtaacatataaaggcaagcctgtcagaattataccag atttttcaccagagactatgaaagccagaagatcctagacatatgttata cagacactaagagaacacaaatgccaacccaggctactatacccagccaa actttcaattaccttagatggagaaacaaaagtattccatgacagaacca aactcacacattatctttccacgaatcccacccttcaaaggataataata gaaaaaacaaacaaacaaacaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaac aaaaacaaaaacaaaaacaaaaacaaaaaaaccaaaaacaatataaggac agaaaccatgtcctagaaaaagcaagaaggtttttcttcaacaaacctaa aagaagacagccacaagaacagaatgccaactttaacaacaaagataata ggaagcaacaattacttttccttaatatctcttaatatcaatgaactcaa ctccccaataaaaagacatagactaacagactggctacacaatcaggacc aaacattttgacacttacaggaaagtcatctaagggaaaaagatagacac tacctcagaatgaaaggctggaaaacaattttccaagcaagtggtctgaa gaaacaagctggagtagccattctaatatctaataaaatcgacttccaac ccaaagtcgtcaaaaggacaagggaggggcacttcatactcatcaaaggt aaatacttcaagaggaattgtcatttctgaatatctatgcttccaaatgc aagggcagccacattcattaaagaaactttagtaaagcttcaaagcacac attgcacatcatacaattaatagtggggagacttcaacacaagactttca tcaattggacagaatcctggaaaataggaatctaaatagggactgagtgg aaacttaacggaggttatggaacaatggacttaccagatatctagagaac atttaatctaaaacaaatgatttacctcttctcacgacttcatggtatcc tctctcaatggactataattggttacacaaggacttaacgatacaaaatt ggaactgtgtcatgcctcgctaccgattaccattgggcctcagagacgag tactcctcataattacaac	gaattctgtagtccacagctccaaactcctcaaacccacaccaaactcct taacattcaaaaaccagagttacactattattttcacagggacaaatttt aatatgagtaactaagtaaaaaaaaaaaacaaaaaaacaaaaaaacaaga cgtatttgtttatggtgtgtaggactataggaaatcataatgaggaaagt agtttggtagaaatgtgggtcagccagttccattttgtttgcaatcaaga atcaaagagatattaaggctgttattcatacccttccctcaactttactc agtctgttattccatgtaacagaatggcagttacacattcagggtgatta ttcattccttattttagttcacatataaatactctaataaatatacccag aattataaaccctagatttacattttaataaccaagaacacttaagatga gaaaataatttttgtctcatttgttaatgggaagatatagcaataaaggc tataacaaaagttttaagtaaataattatgaaacctggattttaaaatta tcactttgatgttatgagttaacaaatattggcatcttaaatatttgtac cactgtgcaaaatggaaaaagccttagagggaaggaatgaagggctgaag aatagaagagatggaacacagcaagtgattgactgacagaaagaacagat agatgctcattacacttggtatatatatgcataaagttacttgaataaat gccacccttagacatttgggagttaagagcccattcaaaggatctaatga atcccttcctaaatgtatttaaaatgtctaggttgtcacatgacaaatat catgttaatgaaattctcatttaacagctgtgttcagtgtgttatctatt tggatgtgattttcattgcagttaccgatggactgaacctaggaagac
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr14_95503485_95504434 seq2: B6Ng01-056K10.g_71_1018 (reverse) seq1 GTCTTCCTAGCTTCAGTCCATCGGTAACTGCAATGAAAATGCACATCAAA 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| seq2 GTCTTCCTAGGTTCAGTCCATCGGTAACTGCAATGAAAAT-CACATCCAA 49 seq1 ATAAGATAACACACTGAACAACAGGCTGTTAAAATGAGAATATCATTAAC 100 \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AT-AGATAACACACTGAAC-ACA-GCTGTT-AAATGAGAATTTCATTAAC 95 seq1 ATGATATTTGTCATGTGACAACCTAGACATTTTAAATACATTTAGG-ATG 149 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| seq2 ATGATATTTGTCATGTGACAACCTAGACATTTTAAATACATTTAGGAAGG 145 seq1 GATTCATTAGATCCTTTGAATGGGCTCTTAACT-CCAAATGTCTAA-GGT 197 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| seq2 GATTCATTAGATCCTTTGAATGGGCTCTTAACTCCCAAATGTCTAAGGGT 195 seq1 GGCATTTATTCAAGTAACTTTATGCATATATATACCAAGTGTAATGAGCA 247 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCATTTATTCAAGTAACTTTATGCATATATATACCAAGTGTAATGAGCA 245 seq1 TCTATCTGTTCTTTCTGTCAGTCAATCACTTGCTGTGTTCCATCTCTTCT 297 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTATCTGTTCTTTCTGTCAGTCAATCACTTGCTGTGTTCCATCTCTTCT 295 seq1 ATTCTTCAGCCCTTCATTCCTTCCCTCTAAAGCTTTTTCCATTTTGCACA 347 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCTTCAGCCCTTCATTCCTTCCCTCTAAGGCTTTTTCCATTTTGCACA 345 seq1 GTGGTACAAATATTTAAGATGCCAATATTTGTTAACTCATAACATCAAAG 397 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGGTACAAATATTTAAGATGCCAATATTTGTTAACTCATAACATCAAAG 395 seq1 TGATAATTTTAAAATCCAGGTTTCATAATTATTTACTTAAAACTTTTGTT 447 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGATAATTTTAAAATCCAGGTTTCATAATTATTTACTTAAAACTTTTGTT 445 seq1 ATAGCCTTTATTGCTATATCTTCCCATTAACAAATGAGACAAAAATTATT 497 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAGCCTTTATTGCTATATCTTCCCATTAACAAATGAGACAAAAATTATT 495 seq1 TTCTCATCTTAAGTGTTCTTGGTTATTAAAATGTAAATCTAGGGTTTATA 547 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCTCATCTTAAGTGTTCTTGGTTATTAAAATGTAAATCTAGGGTTTATA 545 seq1 ATTCTGGGTATATTTATTAGAGTATTTATATGTGAACTAAAATAAGGAAT 597 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCTGGGTATATTTATTAGAGTATTTATATGTGAACTAAAATAAGGAAT 595 seq1 GAATAATCACCCTGAATGTGTAACTGCCATTCTGTTACATGGAATAACAG 647 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATAATCACCCTGAATGTGTAACTGCCATTCTGTTACATGGAATAACAG 645 seq1 ACTGAGTAAAGTTGAGGGAAGGGTATGAATAACAGCCTTAATATCTCTTT 697 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTGAGTAAAGTTGAGGGAAGGGTATGAATAACAGCCTTAATATCTCTTT 695 seq1 GATTCTTGATTGCAAACAAAATGGAACTGGCTGACCCACATTTCTACCAA 747 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GATTCTTGATTGCAAACAAAATGGAACTGGCTGACCCACATTTCTACCAA 745 seq1 ACTACTTTCCTCATTATGATTTCCTATAGTCCTACACACCATAAACAAAT 797 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTACTTTCCTCATTATGATTTCCTATAGTCCTACACACCATAAACAAAT 795 seq1 ACGTCTTGTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTACTTAGTTACTCAT 847 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACGTCTTGTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTACTTAGTTACTCAT 845 seq1 ATTAAAATTTGTCCCTGTGAAAATAATAGTGTAACTCTGGTTTTTGAATG 897 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTAAAATTTGTCCCTGTGAAAATAATAGTGTAACTCTGGTTTTTGAATG 895 seq1 TTAAGGAGTTTGGTGTGGGTTTGAGGAGTTTGGAGCTGTGGACTACAGAA 947 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTAAGGAGTTTGGTGTGGGTTTGAGGAGTTTGGAGCTGTGGACTACAGAA 945 seq1 TTC 950 \|\|\| seq2 TTC 948

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr14_95503485_95504434
seq2: B6Ng01-056K10.g_71_1018 (reverse)

seq1  GTCTTCCTAGCTTCAGTCCATCGGTAACTGCAATGAAAATGCACATCAAA  50
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  GTCTTCCTAGGTTCAGTCCATCGGTAACTGCAATGAAAAT-CACATCCAA  49

seq1  ATAAGATAACACACTGAACAACAGGCTGTTAAAATGAGAATATCATTAAC  100
      || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||
seq2  AT-AGATAACACACTGAAC-ACA-GCTGTT-AAATGAGAATTTCATTAAC  95

seq1  ATGATATTTGTCATGTGACAACCTAGACATTTTAAATACATTTAGG-ATG  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
seq2  ATGATATTTGTCATGTGACAACCTAGACATTTTAAATACATTTAGGAAGG  145

seq1  GATTCATTAGATCCTTTGAATGGGCTCTTAACT-CCAAATGTCTAA-GGT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  GATTCATTAGATCCTTTGAATGGGCTCTTAACTCCCAAATGTCTAAGGGT  195

seq1  GGCATTTATTCAAGTAACTTTATGCATATATATACCAAGTGTAATGAGCA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTTATTCAAGTAACTTTATGCATATATATACCAAGTGTAATGAGCA  245

seq1  TCTATCTGTTCTTTCTGTCAGTCAATCACTTGCTGTGTTCCATCTCTTCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTGTTCTTTCTGTCAGTCAATCACTTGCTGTGTTCCATCTCTTCT  295

seq1  ATTCTTCAGCCCTTCATTCCTTCCCTCTAAAGCTTTTTCCATTTTGCACA  347
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTCAGCCCTTCATTCCTTCCCTCTAAGGCTTTTTCCATTTTGCACA  345

seq1  GTGGTACAAATATTTAAGATGCCAATATTTGTTAACTCATAACATCAAAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACAAATATTTAAGATGCCAATATTTGTTAACTCATAACATCAAAG  395

seq1  TGATAATTTTAAAATCCAGGTTTCATAATTATTTACTTAAAACTTTTGTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATTTTAAAATCCAGGTTTCATAATTATTTACTTAAAACTTTTGTT  445

seq1  ATAGCCTTTATTGCTATATCTTCCCATTAACAAATGAGACAAAAATTATT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCTTTATTGCTATATCTTCCCATTAACAAATGAGACAAAAATTATT  495

seq1  TTCTCATCTTAAGTGTTCTTGGTTATTAAAATGTAAATCTAGGGTTTATA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCATCTTAAGTGTTCTTGGTTATTAAAATGTAAATCTAGGGTTTATA  545

seq1  ATTCTGGGTATATTTATTAGAGTATTTATATGTGAACTAAAATAAGGAAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGGGTATATTTATTAGAGTATTTATATGTGAACTAAAATAAGGAAT  595

seq1  GAATAATCACCCTGAATGTGTAACTGCCATTCTGTTACATGGAATAACAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATCACCCTGAATGTGTAACTGCCATTCTGTTACATGGAATAACAG  645

seq1  ACTGAGTAAAGTTGAGGGAAGGGTATGAATAACAGCCTTAATATCTCTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGTAAAGTTGAGGGAAGGGTATGAATAACAGCCTTAATATCTCTTT  695

seq1  GATTCTTGATTGCAAACAAAATGGAACTGGCTGACCCACATTTCTACCAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTGATTGCAAACAAAATGGAACTGGCTGACCCACATTTCTACCAA  745

seq1  ACTACTTTCCTCATTATGATTTCCTATAGTCCTACACACCATAAACAAAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTTCCTCATTATGATTTCCTATAGTCCTACACACCATAAACAAAT  795

seq1  ACGTCTTGTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTACTTAGTTACTCAT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCTTGTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTACTTAGTTACTCAT  845

seq1  ATTAAAATTTGTCCCTGTGAAAATAATAGTGTAACTCTGGTTTTTGAATG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATTTGTCCCTGTGAAAATAATAGTGTAACTCTGGTTTTTGAATG  895

seq1  TTAAGGAGTTTGGTGTGGGTTTGAGGAGTTTGGAGCTGTGGACTACAGAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGAGTTTGGTGTGGGTTTGAGGAGTTTGGAGCTGTGGACTACAGAA  945

seq1  TTC  950
      |||
seq2  TTC  948

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