BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063E12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 66,835,110 - 66,961,841
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtk2b, LOC100043676, Trim35
Upstream geneFzd3, Fbxo16, Zfp395, Pnoc, Elp3, Gm600, Scara5, Pbk, Esco2, Ccdc25, Scara3, Clu, Gulo, Adam2, LOC100043675, Ephx2, Chrna2
Downstream geneStmn4, Adra1a, ENSMUSG00000057913, LOC668366, Dpysl2, EG432870, Pnma2, LOC672614, Bnip3l, Ppp2r2a, Ebf2, EG628416
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063E12.bB6Ng01-063E12.g
ACCDH883423DH883424
length961741
definitionDH883423|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063E12, 5' end.DH883424|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063E12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,960,883 - 66,961,841)(66,835,110 - 66,836,042)
sequence
gaattcaacccagactttgagatgaggaatttttttttctttttcattgt
tgtttgagacatggtcttgctatgtagaccaggctggccttgaactcata
gagagctacctgcctctctcctctcttgtgagagctggtgtgaaaggcat
acactaccacacccaggtttgaggagagtttttaacagcaatagcatttg
tgcgtatctgaagtggtggctgccacacgcagccgcagctcactggtcga
ctgtcttggagcctctgatcctgacatttacctttcatctacctgccaca
gccacagtgcatgggttggtttctctctgcccgtcaccctatgttattct
gcaagtgtctcttttggacagacatttccaaacccccaactccacaccag
gaaaagaagctaaccttatgctgcttggcaggggccttgggtttcagaac
acatctggctgttttttcaggcatcaccctcaggagtgcagccagggagg
aatgccattcagactgaaattcaatgagcactgccacatcccaccagccg
aggacccagatcagactcagaggtgtctcttaccataccagactggggtc
caaatttaagcaaattgcaaagtgtagccacattgctgtcaagaggaacc
ctctcccctccccaatctgcccttcccagcctggggagtctggaactcca
aacaccacacagattagctagctctggcaatggagggaggggataaaaga
gagtgggttgccatgacgatggtagccaatcagctatctgctgctaccaa
gagagggaaagggtagtctgagtcgccctgcctgtgaaacagagtggagc
aaaaggtaagatgggaagagacaggtcatcactacccaaggcaaagaaca
ggagtggggaagagaattgagacgagagctgctccttctccagaatcatc
tagctatcaca
gaattcagaagttatttgaggggtgtctgcaggaagcacccccaggagcg
tagaacaatgtggcattgaaggaaagacaggcgaaaaggggactgtgctg
agtactgaatcttggacaagccccctttcaatcctctgggaactggaggg
gactggggagcccaggatggaccgaccacatctcactcagagaaagggag
agctgggagcatgtctactccacttcatatgctcagtgttcttggcagtt
cttgtcagttctgcacaagggagatgccagaaagcctttaggcaaagatg
cagaacaggcagctgggagatgagggagaatactgaagtggcaaggcctg
agggggcccaggagggatgatggcaatggtacattaggattgggaagatg
ggggggtacttagtccctaaatagcatagtcctagtcaggagtacaaaca
agcaactgcatatgctccaggaagtgctggcctgctggcttgaggatctg
ctggtctggtaggcttcaatttgtatgtggtaagttgtacacaaggcttt
cacaaaggtggattgggagacaggcatctgaggggggaagtggagtgacc
tatgacacacaaccccagggacttgaccttatctgcattggactgaatgc
atgagtcccttaatatttatatgctcaaattctaacccccccaagatgct
ggtatgacatagggatacatagagagaggtttacattgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_66960883_66961841
seq2: B6Ng01-063E12.b_48_1008 (reverse)

seq1  TGTGATAGCTAGATGATTCTGGAGAAGGAGCAGCTCTCGTCTCACTTCTC  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTGATAGCTAGATGATTCTGGAGAAGGAGCAGCTCTCGTCTCAATTCTC  50

seq1  TTTCCCACTCCTGTTCTTTGCCTTGGGTAGTGATGACCTGTCTCTTTCCA  100
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCCCCACTCCTGTTCTTTGCCTTGGGTAGTGATGACCTGTCTCTTCCCA  100

seq1  TCTTACC-TTTGCTCCACTCTGTTTCACAGGCAGGGCGACTCAGACTACC  149
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCTTTTGCTCCACTCTGTTTCACAGGCAGGGCGACTCAGACTACC  150

seq1  C-TTCCCTCTCTTGGTAGCAGCAGATAGCTGATTGGCTACCATCGTCATG  198
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCTCTCTTGGTAGCAGCAGATAGCTGATTGGCTACCATCGTCATG  200

seq1  GCAACCCACTCTCTTTTATCCCCTCCCTCCATTGCCAGAGCTAGCTAATC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCCACTCTCTTTTATCCCCTCCCTCCATTGCCAGAGCTAGCTAATC  250

seq1  TGTGTGGTGTTTGGAGTTCCAGACTCCCCAGGCTGGGAAGGGCAGATTGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGTGTTTGGAGTTCCAGACTCCCCAGGCTGGGAAGGGCAGATTGG  300

seq1  GGAGGGGAGAGGGTTCCTCTTGACAGCAATGTGGCTACACTTTGCAATTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGGAGAGGGTTCCTCTTGACAGCAATGTGGCTACACTTTGCAATTT  350

seq1  GCTTAAATTTGGACCCCAGTCTGGTATGGTAAGAGACACCTCTGAGTCTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAATTTGGACCCCAGTCTGGTATGGTAAGAGACACCTCTGAGTCTG  400

seq1  ATCTGGGTCCTCGGCTGGTGGGATGTGGCAGTGCTCATTGAATTTCAGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGTCCTCGGCTGGTGGGATGTGGCAGTGCTCATTGAATTTCAGTC  450

seq1  TGAATGGCATTCCTCCCTGGCTGCACTCCTGAGGGTGATGCCTGAAAAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGGCATTCCTCCCTGGCTGCACTCCTGAGGGTGATGCCTGAAAAAA  500

seq1  CAGCCAGATGTGTTCTGAAACCCAAGGCCCCTGCCAAGCAGCATAAGGTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGATGTGTTCTGAAACCCAAGGCCCCTGCCAAGCAGCATAAGGTT  550

seq1  AGCTTCTTTTCCTGGTGTGGAGTTGGGGGTTTGGAAATGTCTGTCCAAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTTTTCCTGGTGTGGAGTTGGGGGTTTGGAAATGTCTGTCCAAAA  600

seq1  GAGACACTTGCAGAATAACATAGGGTGACGGGCAGAGAGAAACCAACCCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACACTTGCAGAATAACATAGGGTGACGGGCAGAGAGAAACCAACCCA  650

seq1  TGCACTGTGGCTGTGGCAGGTAGATGAAAGGTAAATGTCAGGATCAGAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGTGGCTGTGGCAGGTAGATGAAAGGTAAATGTCAGGATCAGAGG  700

seq1  CTCCAAGACAGTCGACCAGTGAGCTGCGGCTGCGTGTGGCAGCCACCACT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGACAGTCGACCAGTGAGCTGCGGCTGCGTGTGGCAGCCACCACT  750

seq1  TCAGATACGCACAAATGCTATTGCTGTTAAAAACTCTCCTCAAACCTGGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATACGCACAAATGCTATTGCTGTTAAAAACTCTCCTCAAACCTGGG  800

seq1  TGTGGTAGTGTATGCCTTTCACACCAGCTCTCACAAGAGAGGAGAGAGGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTAGTGTATGCCTTTCACACCAGCTCTCACAAGAGAGGAGAGAGGC  850

seq1  AGGTAGCTCTCTATGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACATAGCAAGACCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGCTCTCTATGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACATAGCAAGACCA  900

seq1  TGTCTCAAACAACAATGAAAAAGAAAAAAAAATTCCTCATCTCAAAGTCT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCAAACAACAATGAAAAAGAAAAAAAAATTCCTCATCTCAAAGTCT  950

seq1  GGGTTGAATTC  959
      |||||||||||
seq2  GGGTTGAATTC  961

seq1: chr14_66835110_66836042
seq2: B6Ng01-063E12.g_70_810

seq1  GAATTCAGAAGTTATTTGAGGGGTGTCTGCAGGAAGCACCCCCAGGAGCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAGTTATTTGAGGGGTGTCTGCAGGAAGCACCCCCAGGAGCG  50

seq1  TAGAACAATGTGGCATTGAAGGAAAGACAGGCGAAAAGGGGACTGTGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACAATGTGGCATTGAAGGAAAGACAGGCGAAAAGGGGACTGTGCTG  100

seq1  AGTACTGAATCTTGGACAAGCCCCCTTTCAATCCTCTGGGAACTGGAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTGAATCTTGGACAAGCCCCCTTTCAATCCTCTGGGAACTGGAGGG  150

seq1  GACTGGGGAGCCCAGGATGGACCGACCACATCTCACTCAGAGAAAGGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGGGAGCCCAGGATGGACCGACCACATCTCACTCAGAGAAAGGGAG  200

seq1  AGCTGGGAGCATGTCTACTCCACTTCATATGCTCAGTGTTCTTGGCAGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGAGCATGTCTACTCCACTTCATATGCTCAGTGTTCTTGGCAGTT  250

seq1  CTTGTCAGTTCTGCACAAGGGAGATGCCAGAAAGCCTTTAGGCAAAGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCAGTTCTGCACAAGGGAGATGCCAGAAAGCCTTTAGGCAAAGATG  300

seq1  CAGAACAGGCAGCTGGGAGATGAGGGAGAATACTGAAGTGGCAAGGCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACAGGCAGCTGGGAGATGAGGGAGAATACTGAAGTGGCAAGGCCTG  350

seq1  AGGGGGCCCAGGAGGGATGATGGCAATGGTACATTAGGATTGGGAAGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGCCCAGGAGGGATGATGGCAATGGTACATTAGGATTGGGAAGATG  400

seq1  GGGGGGTACTTAGTCCCTAAATAGCATAGTCCTAGTCAGGAGTACAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGTACTTAGTCCCTAAATAGCATAGTCCTAGTCAGGAGTACAAACA  450

seq1  AGCAACTGCATATGCTCCAGGAAGTGCTGGCCTGCTGGCTTGAGGATCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACTGCATATGCTCCAGGAAGTGCTGGCCTGCTGGCTTGAGGATCTG  500

seq1  CTGGTCTGGTAGGCTTCAATTTGTATGTGGTAAGTTGTACACAAGGCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTGGTAGGCTTCAATTTGTATGTGGTAAGTTGTACACAAGGCTTT  550

seq1  CACAAAGGTGGATTGGGAGACAGGCATCTGAGGGGGGAAGTGGAGTGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGGTGGATTGGGAGACAGGCATCTGAGGGGGGAAGTGGAGTGACC  600

seq1  TATGACACACAACCCCAGGGACTTGACCTTATCTGCAATGGACTGAATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TATGACACACAACCCCAGGGACTTGACCTTATCTGCATTGGACTGAATGC  650

seq1  ATGAGTCCCTTAATATTTATATGCTCAAATTCTAA-CCCCCCAAGATGCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGAGTCCCTTAATATTTATATGCTCAAATTCTAACCCCCCCAAGATGCT  700

seq1  GGTATGACATAGGGATACATAGAGAGAGGTTTACATAGAGAGAAAGAGAG  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         
seq2  GGTATGACATAGGGATACATAGAGAGAGGTTTACATTGAGA---------  741

seq1  AAATGTCTTTAGTGATCCCATCAGGTGCCCCTTCAGTCTAGGTAGCATCT  799
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  741

seq1  TCATTCAGAGGGCTGCAGCATCAGTAGGCACATCCTAGACACCCCCAGAT  849
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  741

seq1  GCCCCCTGAAATGCTGGACAAGTACGAGAGAATACTTAAATAGGCTTAAA  899
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  741

seq1  ATGTATTGGTAAAGTTCAAGATCCAACGGTGAGA  933
                                        
seq2  ----------------------------------  741