BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-064P15
Chromosome14 (Build37)
Map Location 67,893,059 - 68,031,589
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEbf2, EG628416
Upstream genePtk2b, LOC100043676, Trim35, Stmn4, Adra1a, ENSMUSG00000057913, LOC668366, Dpysl2, EG432870, Pnma2, LOC672614, Bnip3l, Ppp2r2a
Downstream geneLOC100043046, LOC100043056, Cdca2, Kctd9, Gnrh1, Dock5, Nefl, Nefm, LOC100043072
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-064P15.bB6Ng01-064P15.g
ACCDH884605DH884606
length1,167665
definitionDH884605|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-064P15, 5' end.DH884606|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-064P15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,030,417 - 68,031,589)(67,893,059 - 67,893,723)
sequence
gaattcaaggccagcctgcactacctagtgagtttaaggccagcctgaga
ctacatagcttgcctgagtctcaaaaaatttaaatcaatcaactaatcag
caaatatagaacatattataagtagtctaaaatatatcatcaaatgaaaa
ataatttaccatatagatcatagtgattgaaaaaaaagaaataaatatgt
taaggacagtattggaaaaattattcttttcaaaggactatatataacaa
atttagatggacctccttataaaaccaacctcattggaacatatggtagg
gttgatatacaaaatccagctcactaaatgccttgccatgcatttccaca
taagatcacgcgtgatggaaataaccaaggaaaacttaagtcaccactct
gggttaccaagagttgcatggagggaacaatatgctgccatctgctctct
ctgtcattcagtcacattacctcatagcatcagtataaaatgaattccac
ggagcctcatttccacatgtctaaactctttgaagtttatgatactcaac
tttacccattaatattcccactatctagttcccagagagctcagaatcta
actgcaaactacctgtaatggtgaaatagcccatctgtaacactggggtt
tatgtgcccctactgggtagtccatgatgcactctttaactctgcacacc
ccagagagctggccttttgatggagaagacccatttggaggctggctttc
aggagggtagtaccttggttatttccttgtgtggactctgaaatgctgac
gccgagctggctgccgtaagagttgatacccatcataccgctgtgagctg
gggagctggaaagagctggaatctggctggggttcctggggacactgtac
agggcttcagcaatgtctgcagcacgctttaaaatgatgtcctacggaaa
ggcacgctggggtaagcatggtatccagaactaagagtcaaactcaacag
agtacagatgcacgcagctacctgattattggtgtggtgttgcgtaagag
ggcttcccacaggtccgcactctttttcacaagcatttcctggaaggaaa
acaagggggattccatccgaaggacggcccctatggccaccaaaactata
tgaaaacaagtccacac
gaattcatttatttgactgtgttgctggatggcatgtcggatgctgggct
gtacgcctcctgaggtcttcggtgacctctgttctatctgacagtggctc
cagcagactggcttgttgctctcgatcagccgtgggacatacatttaatg
gctatggaactcaacctttccagatccttctcaggtgacacattcactgt
ggtaaaggtagagttggctttgcagtattgcctgccgctcagatacagaa
agggaagagggtagacgtggaatctagcaaccagagggagaaagcccacg
catggccacgctagggccctcgtgattttccacaaagttcttgagcttat
aaactaggagaggagagtgtgttgtaaatactacttggtaaaaatagact
cacccccgggtgtcacttcagtccatcttgtatgctattggtgaaagcta
atattgacctcaaagatctcccaggccctgctggtcatgatgattacatt
ggaattggggacagagtgtcccaagtgcattcaaatattagcctctgtga
acagcccaaatgtaggacgtttgaaactgtttcacgtggaaactatgcgg
ccatatctttctttgcagagagaactgctgagatatctggtaagactata
tgtggttgtgtggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_68030417_68031589
seq2: B6Ng01-064P15.b_49_1215 (reverse)

seq1  GTGTGGACTTGTTTTCAATTATAGTTTTTTGTTTGCCATTTGGGGCTGTC  50
      |||||||||||||||||  |||||  ||||| | |||| | ||||| |||
seq2  GTGTGGACTTGTTTTCA--TATAG--TTTTGGTGGCCA-TAGGGGCCGTC  45

seq1  TCTCTGATTGTATCCCCCCTGTGTTTTCTTTCAGGAAATGC-TGTTGAAA  99
        || ||| | ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||  |||
seq2  CTTCGGATGGAATCCCCCTTGT-TTTCCTTCCAGGAAATGCTTGTGAAAA  94

seq1  AGAGCTGCGGACCTGGTGGAAGCCCTC-TACGGCACACCACA-CAATAAT  147
      |||| ||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| |||||||
seq2  AGAG-TGCGGACCTGTGGGAAGCCCTCTTACGCAACACCACACCAATAAT  143

seq1  CAGGTTAGCTGCGTGCATCTTGTACTCTGTTGAGTTTGACTCTTAGTTCT  197
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGG-TAGCTGCGTGCATC-TGTACTCTGTTGAGTTTGACTCTTAGTTCT  191

seq1  GGATACCATGCTTACCCCAGCGTGCCTTTCCGTAGGACATCATTTTAAAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACCATGCTTACCCCAGCGTGCCTTTCCGTAGGACATCATTTTAAAG  241

seq1  CGTGCTGCAGACATTGCTGAAGCCCTGTACAGTGTCCCCAGGAACCCCAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTGCAGACATTGCTGAAGCCCTGTACAGTGTCCCCAGGAACCCCAG  291

seq1  CCAGATTCCAGCTCTTTCCAGCTCCCCAGCTCACAGCGGTATGATGGGTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTCCAGCTCTTTCCAGCTCCCCAGCTCACAGCGGTATGATGGGTA  341

seq1  TCAACTCTTACGGCAGCCAGCTCGGCGTCAGCATTTCAGAGTCCACACAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTCTTACGGCAGCCAGCTCGGCGTCAGCATTTCAGAGTCCACACAA  391

seq1  GGAAATAACCAAGGTACTACCCTCCTGAAAGCCAGCCTCCAAATGGGTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATAACCAAGGTACTACCCTCCTGAAAGCCAGCCTCCAAATGGGTCT  441

seq1  TCTCCATCAAAAGGCCAGCTCTCTGGGGTGTGCAGAGTTAAAGAGTGCAT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATCAAAAGGCCAGCTCTCTGGGGTGTGCAGAGTTAAAGAGTGCAT  491

seq1  CATGGACTACCCAGTAGGGGCACATAAACCCCAGTGTTACAGATGGGCTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACTACCCAGTAGGGGCACATAAACCCCAGTGTTACAGATGGGCTA  541

seq1  TTTCACCATTACAGGTAGTTTGCAGTTAGATTCTGAGCTCTCTGGGAACT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCATTACAGGTAGTTTGCAGTTAGATTCTGAGCTCTCTGGGAACT  591

seq1  AGATAGTGGGAATATTAATGGGTAAAGTTGAGTATCATAAACTTCAAAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGTGGGAATATTAATGGGTAAAGTTGAGTATCATAAACTTCAAAGA  641

seq1  GTTTAGACATGTGGAAATGAGGCTCCGTGGAATTCATTTTATACTGATGC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGACATGTGGAAATGAGGCTCCGTGGAATTCATTTTATACTGATGC  691

seq1  TATGAGGTAATGTGACTGAATGACAGAGAGAGCAGATGGCAGCATATTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGGTAATGTGACTGAATGACAGAGAGAGCAGATGGCAGCATATTGT  741

seq1  TCCCTCCATGCAACTCTTGGTAACCCAGAGTGGTGACTTAAGTTTTCCTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCATGCAACTCTTGGTAACCCAGAGTGGTGACTTAAGTTTTCCTT  791

seq1  GGTTATTTCCATCACGCGTGATCTTATGTGGAAATGCATGGCAAGGCATT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATTTCCATCACGCGTGATCTTATGTGGAAATGCATGGCAAGGCATT  841

seq1  TAGTGAGCTGGATTTTGTATATCAACCCTACCATATGTTCCAATGAGGTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAGCTGGATTTTGTATATCAACCCTACCATATGTTCCAATGAGGTT  891

seq1  GGTTTTATAAGGAGGTCCATCTAAATTTGTTATATATAGTCCTTTGAAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTATAAGGAGGTCCATCTAAATTTGTTATATATAGTCCTTTGAAAA  941

seq1  GAATAATTTTTCCAATACTGTCCTTAACATATTTATTTCTTTTTTTTCAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATTTTTCCAATACTGTCCTTAACATATTTATTTCTTTTTTTTCAA  991

seq1  TCACTATGATCTATATGGTAAATTATTTTTCATTTGATGATATATTTTAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTATGATCTATATGGTAAATTATTTTTCATTTGATGATATATTTTAG  1041

seq1  ACTACTTATAATATGTTCTATATTTGCTGATTAGTTGATTGATTTAAATT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTATAATATGTTCTATATTTGCTGATTAGTTGATTGATTTAAATT  1091

seq1  TTTTGAGACTCAGGCAAGCTATGTAGTCTCAGGCTGGCCTTAAACTCACT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAGACTCAGGCAAGCTATGTAGTCTCAGGCTGGCCTTAAACTCACT  1141

seq1  AGGTAGTGCAGGCTGGCCTTGAATTC  1173
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGTGCAGGCTGGCCTTGAATTC  1167

seq1: chr14_67893059_67893723
seq2: B6Ng01-064P15.g_70_734

seq1  GAATTCATTTATTTGACTGTGTTGCTGGATGGCATGTCGGATGCTGGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTATTTGACTGTGTTGCTGGATGGCATGTCGGATGCTGGGCT  50

seq1  GTACGCCTCCTGAGGTCTTCGGTGACCTCTGTTCTATCTGACAGTGGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACGCCTCCTGAGGTCTTCGGTGACCTCTGTTCTATCTGACAGTGGCTC  100

seq1  CAGCAGACTGGCTTGTTGCTCTCGATCAGCCGTGGGACATACATTTAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGACTGGCTTGTTGCTCTCGATCAGCCGTGGGACATACATTTAATG  150

seq1  GCTATGGAACTCAACCTTTCCAGATCCTTCTCAGGTGACACATTCACTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGGAACTCAACCTTTCCAGATCCTTCTCAGGTGACACATTCACTGT  200

seq1  GGTAAAGGTAGAGTTGGCTTTGCAGTATTGCCTGCCGCTCAGATACAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGGTAGAGTTGGCTTTGCAGTATTGCCTGCCGCTCAGATACAGAA  250

seq1  AGGGAAGAGGGTAGACGTGGAATCTAGCAACCAGAGGGAGAAAGCCCACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGAGGGTAGACGTGGAATCTAGCAACCAGAGGGAGAAAGCCCACG  300

seq1  CATGGCCACGCTAGGGCCCTCGTGATTTTCCACAAAGTTCTTGAGCTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCCACGCTAGGGCCCTCGTGATTTTCCACAAAGTTCTTGAGCTTAT  350

seq1  AAACTAGGAGAGGAGAGTGTGTTGTAAATACTACTTGGTAAAAATAGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAGGAGAGGAGAGTGTGTTGTAAATACTACTTGGTAAAAATAGACT  400

seq1  CACCCCCGGGTGTCACTTCAGTCCATCTTGTATGCTATTGGTGAAAGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCGGGTGTCACTTCAGTCCATCTTGTATGCTATTGGTGAAAGCTA  450

seq1  ATATTGACCTCAAAGATCTCCCAGGCCCTGCTGGTCATGATGATTACATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGACCTCAAAGATCTCCCAGGCCCTGCTGGTCATGATGATTACATT  500

seq1  GGAATTGGGGACAGAGTGTCCCAAGTGCATTCAAATATTAGCCTCTGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGGGGACAGAGTGTCCCAAGTGCATTCAAATATTAGCCTCTGTGA  550

seq1  ACAGCCCAAATGTAGGACGTTTGAAACTGTTTCACGTGGAAACTATGCGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCCAAATGTAGGACGTTTGAAACTGTTTCACGTGGAAACTATGCGG  600

seq1  CCATATCTTTCTTTGCAGAGAGAACTGCTGAGATATCTGGTAAGACTATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCTTTCTTTGCAGAGAGAACTGCTGAGATATCTGGTAAGACTATA  650

seq1  TGTGGTTGTGTGGTT  665
      |||||||||||||||
seq2  TGTGGTTGTGTGGTT  665