BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-065M07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,184,975 - 22,315,596
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdk
Upstream geneAA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1
Downstream geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-065M07.bB6Ng01-065M07.g
ACCDH885149DH885150
length1,0761,160
definitionDH885149|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065M07, 5' end.DH885150|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065M07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,314,510 - 22,315,596)(22,184,975 - 22,186,139)
sequence
gaattctatgtacctttagttattaggcccttagaaagcattagctcagg
actacagagagtactatctgctctttagaggacccaagttcagtccctag
cacacacatagcagcttacaactatctaacaacagttccaggggagccaa
caccctcacatgagcataagagcatgcaaatgaccaatgcacaagaaaaa
caatcatttaaaaaaaaaaagtattagcctatgcaaaccttcaaactgcc
aaggctaattaggaatgggtagccacagagttctaacatctgatttcaat
agtcatgaacagacaaggttatcggtcaatcgttaaatgatttaataacc
tcaagctctgtaaaggaacaccccaagttaacctcagatggtatcacccc
acacctcatatgtgccttcctgctttgtgattgattggttgcttgcttct
gttttgttgaagcgggctagcatggaactcattgcatctctctctggctg
acctccaattctgaaagcttcctgcctcagcctccagaagctgagctgta
agcttcacctctataacttcaaatcctttaaatgcattctggatcaaatc
tgaaaccagtgagccaatgcaggactacacccaacactattctttctctc
cgacttgtggccagctccctcgttctctctgtgcagtgccctccctccct
actgtatctgacagagaccttgaagggctcttggacttctaggctctgct
gctgcttcctgtcaagttttcctggcctgtgcaggggcccacagcattct
ggtccctactgtagccctggtctgtataaagtttagagtttgttgaagac
caaataaataaagcatttatccatcctatgatcacaggctttcctaatta
atctttctattgtacagaccaccagcctgctcattggaataactgccctt
tatctatgaagcaattcatatgtgactctgctttagccatatttagaatc
atctggtgttagcctaactttctttgccctagttcacatgagactattaa
ataaaatattggaggtaggctgctat
gaattctccttaatagggacggggtttcgttttctctctctcttgcttct
tgcgctcttgcttcttgcactctggctcctgaagatgtaagcaataaagc
tttgccgcagaagattctggtttgttgcgtctttcctggccggtcgtgag
aacgcgtctaataacaaagcacggtgacacagcctaaaatcccagcactt
gagagatggaggcaggaacagagatagttcaaagccagctcagacaacat
accaagattcagatcaacttaggttgtataatgtgagctcttgtctaaaa
gaaaaaatacatatataagtatattcttgccattattctgtaatttacca
agttacagttaatttattagtatatgatcaaaaaagctggcattaaaaat
taaaacaacatagccatgcatggtgacacacttctatgattccccacact
ccaacctgtgttatctaaaaacctttttcatacaaatagtgttccagatg
tgggatttaacttggtaatgtggcacttctagcaccttgagggcctgagt
tcggttcctagtactgctccttgcctcagtttaactactgcatggacttg
cagtctttctgtcatagagcaattttaattcctcagattccttttctttt
aatgaccctgaagccccctcacccccaccctgtgtcctacattcactgtt
gcccaggctgggcatgaaaagtagttcttaggggctggggagatggctta
cttgttaaaagtacttgctgctcttgtaaaggattcaggcttggttccca
gcacctacacagtagctcacaaccattggtaactccagttccaggggatc
tgatgccctctcttgataagtacagctaccaactatgcacatggtacaca
atatatatgcaggccaaacactcatacataaaacaaataaatctaaatta
tagtaagtgtagtagtagtttcaccagagctaatcagtggcattatcgtc
ttagaattcatttacttaaatttatgatggctaaaaaaaacaccacattg
ataacttttcaactttcccttgacttgatatctccagccagccaaaatta
ttttgtgaaacaaaaacatgttttgtaaggaaatgtaatggaagtaacct
ggcttacttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22314510_22315596
seq2: B6Ng01-065M07.b_47_1122 (reverse)

seq1  ATAGCAGACCCTACCTCCAAATATTCTAATTTAATTAGTCTCATGTGAGA  50
      |||||||  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||  ||
seq2  ATAGCAG--CCTACCTCC-AATATT-TTATTTAA-TAGTCTCATGT--GA  43

seq1  CCTAGGGCAAAGAAAGGTTAGGCTAACA-CAGATGATTCTAAATATGGCT  99
       |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGGCAAAGAAA-GTTAGGCTAACACCAGATGATTCTAAATATGGCT  92

seq1  AAAGCAAGAGTCACATATGAATTGCTTCATAGATAAAGGGCAGTTATTCC  149
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGC-AGAGTCACATATGAATTGCTTCATAGATAAAGGGCAGTTATTCC  141

seq1  AATGAGCAGGCTGGTGGTCTGTACAATAGAAAGATTAATTAGGAAAGCCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGCAGGCTGGTGGTCTGTACAATAGAAAGATTAATTAGGAAAGCCT  191

seq1  GTGATCATAGGATTGGATAAATGCTTTTATTTATTTGGTCCTTCAACAAA  249
      |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTGATCATAGGA-TGGATAAATGC-TTTATTTATTTGGT-CTTCAACAAA  238

seq1  CTCTAAACTTTATACAGACCAGGGCTACAGTAGGGACCAGAATGCTGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAACTTTATACAGACCAGGGCTACAGTAGGGACCAGAATGCTGTGG  288

seq1  GCCCCTGCACAGGCCAGGAAAACTTGACAGGAAGCAGCAGCAGAGCCTAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTGCACAGGCCAGGAAAACTTGACAGGAAGCAGCAGCAGAGCCTAG  338

seq1  AAGTCCAAGAGCCCTTCAAGGTCTCTGTCAGATACAGTAGGGAGGGAGGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCAAGAGCCCTTCAAGGTCTCTGTCAGATACAGTAGGGAGGGAGGG  388

seq1  CACTGCACAGAGAGAACGAGGGAGCTGGCCACAAGTCGGAGAGAAAGAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCACAGAGAGAACGAGGGAGCTGGCCACAAGTCGGAGAGAAAGAAT  438

seq1  AGTGTTGGGTGTAGTCCTGCATTGGCTCACTGGTTTCAGATTTGATCCAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGGGTGTAGTCCTGCATTGGCTCACTGGTTTCAGATTTGATCCAG  488

seq1  AATGCATTTAAAGGATTTGAAGTTATAGAGGTGAAGCTTACAGCTCAGCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATTTAAAGGATTTGAAGTTATAGAGGTGAAGCTTACAGCTCAGCT  538

seq1  TCTGGAGGCTGAGGCAGGAAGCTTTCAGAATTGGAGGTCAGCCAGAGAGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAGGCTGAGGCAGGAAGCTTTCAGAATTGGAGGTCAGCCAGAGAGA  588

seq1  GATGCAATGAGTTCCATGCTAGCCCGCTTCAACAAAACAGAAGCAAGCAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAATGAGTTCCATGCTAGCCCGCTTCAACAAAACAGAAGCAAGCAA  638

seq1  CCAATCAATCACAAAGCAGGAAGGCACATATGAGGTGTGGGGTGATACCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATCAATCACAAAGCAGGAAGGCACATATGAGGTGTGGGGTGATACCA  688

seq1  TCTGAGGTTAACTTGGGGTGTTCCTTTACAGAGCTTGAGGTTATTAAATC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGTTAACTTGGGGTGTTCCTTTACAGAGCTTGAGGTTATTAAATC  738

seq1  ATTTAACGATTGACCGATAACCTTGTCTGTTCATGACTATTGAAATCAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACGATTGACCGATAACCTTGTCTGTTCATGACTATTGAAATCAGA  788

seq1  TGTTAGAACTCTGTGGCTACCCATTCCTAATTAGCCTTGGCAGTTTGAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGAACTCTGTGGCTACCCATTCCTAATTAGCCTTGGCAGTTTGAAG  838

seq1  GTTTGCATAGGCTAATACTTTTTTTTTTTAAATGATTGTTTTTCTTGTGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCATAGGCTAATACTTTTTTTTTTTAAATGATTGTTTTTCTTGTGC  888

seq1  ATTGGTCATTTGCATGCTCTTATGCTCATGTGAGGGTGTTGGCTCCCCTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTCATTTGCATGCTCTTATGCTCATGTGAGGGTGTTGGCTCCCCTG  938

seq1  GAACTGTTGTTAGATAGTTGTAAGCTGCTATGTGTGTGCTAGGGACTGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGTTGTTAGATAGTTGTAAGCTGCTATGTGTGTGCTAGGGACTGAA  988

seq1  CTTGGGTCCTCTAAAGAGCAGATAGTACTCTCTGTAGTCCTGAGCTAATG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGTCCTCTAAAGAGCAGATAGTACTCTCTGTAGTCCTGAGCTAATG  1038

seq1  CTTTCTAAGGGCCTAATAACTAAAGGTACATAGAATTC  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTAAGGGCCTAATAACTAAAGGTACATAGAATTC  1076

seq1: chr14_22184975_22186139
seq2: B6Ng01-065M07.g_71_1230

seq1  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTAATAGGGACGGGGTTTCGTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCT  50

seq1  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCAATAAAGC  100

seq1  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCGCAGAAGATTCTGGTTTGTTGCGTCTTTCCTGGCCGGTCGTGAG  150

seq1  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCGTCTAATAACAAAGCACGGTGACACAGCCTAAAATCCCAGCACTT  200

seq1  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGAGGCAGGAACAGAGATAGTTCAAAGCCAGCTCAGACAACAT  250

seq1  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGATTCAGATCAACTTAGGTTGTATAATGTGAGCTCTTGTCTAAAA  300

seq1  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAATACATATATAAGTATATTCTTGCCATTATTCTGTAATTTACCA  350

seq1  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGTTAATTTATTAGTATATGATCAAAAAAGCTGGCATTAAAAAT  400

seq1  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAACATAGCCATGCATGGTGACACACTTCTATGATTCCCCACACT  450

seq1  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTGTGTTATCTAAAAACCTTTTTCATACAAATAGTGTTCCAGATG  500

seq1  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTTAACTTGGTAATGTGGCACTTCTAGCACCTTGAGGGCCTGAGT  550

seq1  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTCCTAGTACTGCTCCTTGCCTCAGTTTAACTACTGCATGGACTTG  600

seq1  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTTCTGTCATAGAGCAATTTTAATTCCTCAGATTCCTTTTCTTTT  650

seq1  AATGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTACAATTCACTGT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATGACCCTGAAGCCCCCTCACCCCCACCCTGTGTCCTAC-ATTCACTGT  699

seq1  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGCTGGGCATGAAAAGTAGTTCTTAGGGGCTGGGGAGATGGCTT  749

seq1  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCAGGCTTGGTTCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTTAAAAGTACTTGCTGCTCTTGTAAAGGATTCAGGCTTGGTTCCC  799

seq1  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAGTTCCAGGGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCTACACAGTAGCTCACAACCATTGGTAACTCCAGTTCCAGGGGAT  849

seq1  CTGATGCCCTCTCTTGATAAGTACAGCTACCAACTATGCACATGGTACAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGCCCTCTCTTGATAAGTACAGCTACCAACTATGCACATGGTACAC  899

seq1  AAATATATATGCAGGCCAAACACTCATACATAAAACAAATAAATCTAAAA  950
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  -AATATATATGCAGGCCAAACACTCATACATAAAACAAATAAATCT-AAA  947

seq1  TAATAGTAAGTGTAGTAGTAGTTTTCACCAGAGCTATTCAGTTGCATTAT  1000
      | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| 
seq2  TTATAGTAAGTGTAGTAGTAG-TTTCACCAGAGCTAATCAGTGGCATTA-  995

seq1  TCGTCTAAGAATTCATTTACTTAAATTTATGATGGCT-TAGAAAACAACA  1049
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||
seq2  TCGTCTTAGAATTCATTTACTTAAATTTATGATGGCTAAAAAAAACACCA  1045

seq1  CATTGATATCTTTTCAACCTTTCACTTGACTTGATATCT-CAGCCAGCAA  1098
      |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CATTGATAACTTTTCAA-CTTTCCCTTGACTTGATATCTCCAGCCAGCCA  1094

seq1  ATATTA-TTTGTGAACTATAAACATTGTTTTGTAAGGAAATTGAAATGAG  1147
      | |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || ||||  
seq2  AAATTATTTTGTGAAACAAAAACA-TGTTTTGTAAGGAAA-TGTAATGGA  1142

seq1  AGTAACCTTGCTTACTTG  1165
      |||||||| |||||||||
seq2  AGTAACCTGGCTTACTTG  1160