BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-072A07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 110,595,176 - 110,641,088
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC640892
Downstream geneSlitrk6, EG668772, EG622052, LOC100043491, LOC100043494
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-072A07.bB6Ng01-072A07.g
ACCDH889556DH889557
length1,0531,096
definitionDH889556|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072A07, 5' end.DH889557|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072A07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,640,035 - 110,641,088)(110,595,176 - 110,596,281)
sequence
gaattctctaatttactttttatcttattttgaatgtctagtggtttttg
taatccatgtccctttccacgtaggtactttctgtttctagagctaaatt
tacttcctatattcattattacagcatatgatagctttctatttttaaat
gtatgtgtttttattgcagggttgctggcattaaaaaacatatgtattaa
atatggcaagacataactatatccaagttttcctaataaatcaatgaaag
attcttctttcctttttgaattcacacaattccatgcaattaattgttca
tggaggttgatggtaagaactgaaaagtcttttatttgttttaacttaga
acttgttcatgtaaactaagtaagtgtgtgtgtgtgtgttggtatacaca
cacacagtacaggtactgtactggctggtttcctgtattaacttgacaca
aactggagttatcaaaaagaaaggcacctcccttgaggaaatgcctccat
gagatccagctgtaaggcatttcctcaattagtgatcaagggggcaaggc
ccagactattgtgggtggtgccatccctgggctggtagtcctgggttcta
tcagaaaacaagctgagcaagcaaggggatgcaatccagtaagcagcacc
ttccaatgtctctgcatcatctacttcctccaagttcctgccctgtgtga
gttcctgtactgacttcccttggtgatgacctgcaatgtggaagtgcaag
ctgaataaacccctttctccccaacatgcttcttgatcgtaatattttgt
gcaagaatacaaaccctagttaaggagttactaaattctaaaaaacccat
tttgctttatagacatgtttataacccattttttgtctatttctgtaagg
atgctggagtctagagtgactctatgggaagatctcacatcctccctttt
gtaacactttaagctgaataaactatgcttatgaaaattttactaattta
gggaaaagaatcttatgtcaggttgtgcttactgttgaatgtattgcatc
acg
gaattcactctgtagaccaggctggccttgaactcagaaatccgcctgtc
tctgccttccaagtgctgggattaaaggtgtgtgccaccactgccaagca
ccttatatgtcttttttgtagcataataaataatattttctaaactgaaa
ataagtagaagaccacatatattagagacattctaaatattaaatatttc
ctaacttggaagttttagagatatgccgaatatgggaaaacttatgtttt
aaaattcataataacagtaatgatattaataatctcccagtgaataccta
gtgtaagaagctagaaatagtcatatgctttaattagaaagtgatatacc
atttcttttaaaagaaagactctcttcaccaggagtaatatgctacatct
ccctgtataatgaagactaccaaatgcttaaaaacctatatgtaaaactt
tggatatttatgtttataaccatttaagacaatgattatttattgatact
tttcctgccttgaaatatgttgcatattttctttaatgattttgtggaac
aattgcagtatgtatcaatttaaataataatgttatccagtattttttaa
aactctatttaatcatttttttttacaatctggattttatccccaccccc
cagttcatgatctgactgctccacattccatacctcctcttgccttctcc
atgaatatgttgccacctttccactctttaagccaccagacctctccact
cctgggggcctccagtctcttgagggttaggtgtatcttccccttctgag
tccagacccagcagtcctctgctctatatgcattgggggcctcatatcaa
ctgttatagtatgctgcctggttggtggtccagtgtctcaaagatctctg
ggtccaggttaattgagactggtggtccccctatagctttactctctcct
tagtttcttccagcttttccctaattcagtcacagtggacactctgtcca
ttggtggtgcaaatattctgcatctgactcttcagctgcctttggggctt
tcaagggcagtcatgatagtcctttggggcacctctgtagcctcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_110640035_110641088
seq2: B6Ng01-072A07.b_42_1093 (reverse)

seq1  GTGATGCCATACATTCAACAGTAAGCCACAACCTGACATAAAGATTCTTT  50
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
seq2  GTGATGCAATACATTCAACAGTAAG-CACAACCTGACAT-AAGATTC-TT  47

seq1  TTCCCTAAAATAAGTAAAATTTTCATAAGCATAGTTTATTCAGCTAAAGG  100
      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
seq2  TTCCCT-AAATTAGTAAAATTTTCATAAGCATAGTTTATTCAGCTTAAAG  96

seq1  TGTTACAAA--GGGGGATGTGAGATTCTTCCCATAGAGTCACTCTAGACC  148
      |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTTACAAAAGGGAGGATGTGAGA-TCTTCCCATAGAGTCACTCTAGA-C  144

seq1  TCCAGCATTCTTACAGAAATAGAC-AAAAATGGGTTATAAACATGTCTAT  197
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCATCCTTACAGAAATAGACAAAAAATGGGTTATAAACATGTCTAT  194

seq1  AAAGC-AAATGGGTTTTTTAGAATTTAGTAACTCCTTAACTAGGGTTTGT  246
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAAATGGGTTTTTTAGAATTTAGTAACTCCTTAACTAGGGTTTGT  244

seq1  ATTCTTGCACAAAATATTACGATCAAGAAGCATGTTGGGGAGAAAGGGGT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTGCACAAAATATTACGATCAAGAAGCATGTTGGGGAGAAAGGGGT  294

seq1  TTATTCAGCTTGCACTTCCACATTGCAGGTCATCACCAAGGGAAGTCAGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCAGCTTGCACTTCCACATTGCAGGTCATCACCAAGGGAAGTCAGT  344

seq1  ACAGGAACTCACACAGGGCAGGAACTTGGAGGAAGTAGATGATGCAGAGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAACTCACACAGGGCAGGAACTTGGAGGAAGTAGATGATGCAGAGA  394

seq1  CATTGGAAGGTGCTGCTTACTGGATTGCATCCCCTTGCTTGCTCAGCTTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGAAGGTGCTGCTTACTGGATTGCATCCCCTTGCTTGCTCAGCTTG  444

seq1  TTTTCTGATAGAACCCAGGACTACCAGCCCAGGGATGGCACCACCCACAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGATAGAACCCAGGACTACCAGCCCAGGGATGGCACCACCCACAA  494

seq1  TAGTCTGGGCCTTGCCCCCTTGATCACTAATTGAGGAAATGCCTTACAGC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTGGGCCTTGCCCCCTTGATCACTAATTGAGGAAATGCCTTACAGC  544

seq1  TGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAAGGGAGGTGCCTTTCTTTTTGATAA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAAGGGAGGTGCCTTTCTTTTTGATAA  594

seq1  CTCCAGTTTGTGTCAAGTTAATACAGGAAACCAGCCAGTACAGTACCTGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTTTGTGTCAAGTTAATACAGGAAACCAGCCAGTACAGTACCTGT  644

seq1  ACTGTGTGTGTGTATACCAACACACACACACACACTTACTTAGTTTACAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTGTGTGTATACCAACACACACACACACACTTACTTAGTTTACAT  694

seq1  GAACAAGTTCTAAGTTAAAACAAATAAAAGACTTTTCAGTTCTTACCATC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGTTCTAAGTTAAAACAAATAAAAGACTTTTCAGTTCTTACCATC  744

seq1  AACCTCCATGAACAATTAATTGCATGGAATTGTGTGAATTCAAAAAGGAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCCATGAACAATTAATTGCATGGAATTGTGTGAATTCAAAAAGGAA  794

seq1  AGAAGAATCTTTCATTGATTTATTAGGAAAACTTGGATATAGTTATGTCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATCTTTCATTGATTTATTAGGAAAACTTGGATATAGTTATGTCT  844

seq1  TGCCATATTTAATACATATGTTTTTTAATGCCAGCAACCCTGCAATAAAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATATTTAATACATATGTTTTTTAATGCCAGCAACCCTGCAATAAAA  894

seq1  ACACATACATTTAAAAATAGAAAGCTATCATATGCTGTAATAATGAATAT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACATTTAAAAATAGAAAGCTATCATATGCTGTAATAATGAATAT  944

seq1  AGGAAGTAAATTTAGCTCTAGAAACAGAAAGTACCTACGTGGAAAGGGAC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTAAATTTAGCTCTAGAAACAGAAAGTACCTACGTGGAAAGGGAC  994

seq1  ATGGATTACAAAAACCACTAGACATTCAAAATAAGATAAAAAGTAAATTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTACAAAAACCACTAGACATTCAAAATAAGATAAAAAGTAAATTA  1044

seq1  GAGAATTC  1054
      ||||||||
seq2  GAGAATTC  1052

seq1: chr14_110595176_110596281
seq2: B6Ng01-072A07.g_66_1161

seq1  GAATTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCGCCTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCGCCTGTC  50

seq1  TCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGTGCCACCACTGCCAAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGTGCCACCACTGCCAAGCA  100

seq1  CCTTATATGTCTTTTTTGTAGCATAATAAATAATATTTTCTAAACTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATATGTCTTTTTTGTAGCATAATAAATAATATTTTCTAAACTGAAA  150

seq1  ATAAGTAGAAGACCACATATATTAGAGACATTCTAAATATTAAATATTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTAGAAGACCACATATATTAGAGACATTCTAAATATTAAATATTTC  200

seq1  CTAACTTGGAAGTTTTAGAGATATGCCGAATATGGGAAAACTTATGTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTTGGAAGTTTTAGAGATATGCCGAATATGGGAAAACTTATGTTTT  250

seq1  AAAATTCATAATAACAGTAATGATATTAATAATCTCCCAGTGAATACCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTCATAATAACAGTAATGATATTAATAATCTCCCAGTGAATACCTA  300

seq1  GTGTAAGAAGCTAGAAATAGTCATATGCTTTAATTAGAAAGTGATATACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAAGAAGCTAGAAATAGTCATATGCTTTAATTAGAAAGTGATATACC  350

seq1  ATTTCTTTTAAAAGAAAGACTCTCTTCACCAGGAGTAATATGCTACATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTTTTAAAAGAAAGACTCTCTTCACCAGGAGTAATATGCTACATCT  400

seq1  CCCTGTATAATGAAGACTACCAAATGCTTAAAAACCTATATGTAAAACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTATAATGAAGACTACCAAATGCTTAAAAACCTATATGTAAAACTT  450

seq1  TGGATATTTATGTTTATAACCATTTAAGACAATGATTATTTATTGATACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATATTTATGTTTATAACCATTTAAGACAATGATTATTTATTGATACT  500

seq1  TTTCCTGCCTTGAAATATGTTGCATATTTTCTTTAATGATTTTGTGGAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGCCTTGAAATATGTTGCATATTTTCTTTAATGATTTTGTGGAAC  550

seq1  AATTGCAGTATGTATCAATTTAAATAATAATGTTATCCAGTATTTTTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCAGTATGTATCAATTTAAATAATAATGTTATCCAGTATTTTTTAA  600

seq1  AACTCTATTTAATCATTTTTTTTTACAATCTGGATTTTATCCCCACCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTATTTAATCATTTTTTTTTACAATCTGGATTTTATCCCCACCCCC  650

seq1  CAGTTCATGATCTGACTGCTCCACATTCCATACCTCCTCTTGCCTTCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCATGATCTGACTGCTCCACATTCCATACCTCCTCTTGCCTTCTCC  700

seq1  ATGAATATGTTGCCACCTTTCCACTCTTTAAGCCACCAGACCTCTCCACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATATGTTGCCACCTTTCCACTCTTTAAGCCACCAGACCTCTCCACT  750

seq1  CCTGGGGGCCTCCAGTCTCTTGAGGGTTAGGTGTATCTTCCCCTTCTGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGGCCTCCAGTCTCTTGAGGGTTAGGTGTATCTTCCCCTTCTGAG  800

seq1  TCCAGACCCAGCAGTCCTCTGCTCTATATGCATTGGGGGCCTCATATCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACCCAGCAGTCCTCTGCTCTATATGCATTGGGGGCCTCATATCAA  850

seq1  CTGTTATAGTATGCTGCCTGGTTGGTGGTCCAGTGTCTCAAAGATCTCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATAGTATGCTGCCTGGTTGGTGGTCCAGTGTCTCAAAGATCTCTG  900

seq1  GGTCCAGGTTAATTGAGACTGGTGGTCCCCCTATAGCTTTACTCTCCTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGTCCAGGTTAATTGAGACTGGTGGTCCCCCTATAGCTTTACTCT-CTCC  949

seq1  TTAGTTTCTTCCAGCTTTTCCCTAATTCAGTCACAGTGGACAACTTCTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  TTAGTTTCTTCCAGCTTTTCCCTAATTCAGTCACAGTGGACA--CTCTGT  997

seq1  CCATTGGTTGGTTGCAAATA-TCTGCATCTGACTCTTTCAGCTGCCTTTT  1049
      ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  CCATTGGT--GGTGCAAATATTCTGCATCTGACTC-TTCAGCTGCC-TTT  1043

seq1  GGGGCTTTCAAAGGGCAGTCATGATAGGTCCCTTTTGTGAGCA-CTCTGT  1098
      ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||
seq2  GGGGCTTTC-AAGGGCAGTCATGATA-GTCC--TTTG-GGGCACCTCTGT  1088

seq1  AGCCTCAG  1106
      ||||||||
seq2  AGCCTCAG  1096