BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076I10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,976,114 - 101,104,877
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668672, EG546623, Klf12, LOC100043413, EG668683, EG668684
Downstream gene1700110M21Rik, LOC100043421, LOC382936, Tbc1d4, Commd6, Uchl3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076I10.bB6Ng01-076I10.g
ACCDH892770DH892771
length967786
definitionDH892770|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076I10, 5' end.DH892771|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076I10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,976,114 - 100,977,074)(101,104,103 - 101,104,877)
sequence
gaattctctattaactctaattccttttttgtgccctttcccctactact
tcattaacatgaactcacacagaagatatcccgtagaatacagaggacaa
aatgccaataccttgatttccaagtttctaaatagactcttgagatttgt
atcagagagattctagaaagccagaatggtcatatattctatttctaaaa
gtctcagcatgaaggcaaccagattttgctctcacagatattttggaagt
aagcttaggcctagagaccaagtgggtcatctaagctggtatatgttggg
ggtgatgcatactgcacagggtatggctctgttctaagaacttgtatgga
aaaagtctcctctggagtaaggtgggactgagatcagttgaggagagttc
tagaacctagaactatgatgtgactgaaaggtgctaggacagactgtgtc
ttatgcttcaaagactgattggggaggtaagaagacttgcaaagaagtgc
tatgttggttgtaatctctaagaaactgtggtggtttgactaggaatagc
cccacccccaccccacctcaaatatttgaatgtgcggtcagtagggagca
atactacttgagagatcagaaaagggtggccttgttggactaggcatggc
cttgttagaatgggatgtttgtgaccttcttggaataaagtgtgtcattg
tgggtgggcttttggagttttcaaatgctcacgccaggcccagtgtctct
ctcttcctgctgcctgctacccttgattagaagtctcagctacctctgtg
gcaccacatctgcctggggtgcctccattcttccacctatgtttataatg
ggactaaactgttgaagatgtaagccagaacaattaaacatttcctttat
taagagctgtaatgggtcaagttgtcttttctctccatggagcactagat
aaatgcacagcagccat
gaattcagtatttatatggagagttatagtatattgtaggaaattgataa
ttccctttcctagtgggtatcaattaaaaatagcttcttgatttcaggta
ttactttgtttctgcttctacttatcccttctctatgatgcacttttgtc
tgatttgaacgtgtgcatgcttccacagtctctgtgagtggtttggcttt
ggtgtttgtttgtttgtttgtctgtttgtgataggaagaaaatgaagttg
gatagggaagagctggaaggaggtaagaaaggggaaatgatcaaaatata
ttgtttgaaaaagaagtatgcatctatttattaacataggatgtgtagac
tgtaatttgttgtttgtagagaccattctgcaaaaatatgaccaggaaga
catggcagcacactgtaaatcttcaagtgtcatgtgttccattataatca
caattttgctagtagtatgggaaagaacttaaagttgagaacttatttca
tatctattcaaactgaccataagctataaagaacacagaaacattattta
ttactatcatcttttattactatttatcatgatactggatcgagcaaatt
tgggtatacatcatttaaatgctcaaaataatcatgtaagagggccagga
atgttattgatatcccactagaaaataaacacaagcttcttcccttttag
aatcatttgaccaccaaacaagcctgagtttgcattctctacttctatgt
ctttccattctgtctggagttttgtgcttttctatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100976114_100977074
seq2: B6Ng01-076I10.b_44_1010

seq1  GAATTCTCTATTAACTCTAATTCCTTTTTTGTGCCCTTTCCCCTACTACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATTAACTCTAATTCCTTTTTTGTGCCCTTTCCCCTACTACT  50

seq1  TCATTAACATGAACTCACACAGAAGATATCCCGTAGAATACAGAGGACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAACATGAACTCACACAGAAGATATCCCGTAGAATACAGAGGACAA  100

seq1  AATGCCAATACCTTGATTTCCAAGTTTCTAAATAGACTCTTGAGATTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCAATACCTTGATTTCCAAGTTTCTAAATAGACTCTTGAGATTTGT  150

seq1  ATCAGAGAGATTCTAGAAAGCCAGAATGGTCATATATTCTATTTCTAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAGAGATTCTAGAAAGCCAGAATGGTCATATATTCTATTTCTAAAA  200

seq1  GTCTCAGCATGAAGGCAACCAGATTTTGCTCTCACAGATATTTTGGAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGCATGAAGGCAACCAGATTTTGCTCTCACAGATATTTTGGAAGT  250

seq1  AAGCTTAGGCCTAGAGACCAAGTGGGTCATCTAAGCTGGTATATGTTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTAGGCCTAGAGACCAAGTGGGTCATCTAAGCTGGTATATGTTGGG  300

seq1  GGTGATGCATACTGCACAGGGTATGGCTCTGTTCTAAGAACTTGTATGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATGCATACTGCACAGGGTATGGCTCTGTTCTAAGAACTTGTATGGA  350

seq1  AAAAGTCTCCTCTGGAGTAAGGTGGGACTGAGATCAGTTGAGGAGAGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTCTCCTCTGGAGTAAGGTGGGACTGAGATCAGTTGAGGAGAGTTC  400

seq1  TAGAACCTAGAACTATGATGTGACTGAAAGGTGCTAGGACAGACTGTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACCTAGAACTATGATGTGACTGAAAGGTGCTAGGACAGACTGTGTC  450

seq1  TTATGCTTCAAAGACTGATTGGGGAGGTAAGAAGACTTGCAAAGAAGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCTTCAAAGACTGATTGGGGAGGTAAGAAGACTTGCAAAGAAGTGC  500

seq1  TATGTTGGTTGTAATCTCTAAGAAACTGTGGTGGTTTGACTAGGAATAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGGTTGTAATCTCTAAGAAACTGTGGTGGTTTGACTAGGAATAGC  550

seq1  CCCACCCCCACCCCACCTCAAATATTTGAATGTGCGGTCAGTAGGGAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCCCACCCCACCTCAAATATTTGAATGTGCGGTCAGTAGGGAGCA  600

seq1  ATACTACTTGAGAGATCAG-AAAGGGTGGCCTTGTTGGACTAGGCATGGC  649
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTACTTGAGAGATCAGAAAAGGGTGGCCTTGTTGGACTAGGCATGGC  650

seq1  CTTGTTAGAAT-GGATG-TTGTGACCTTCTTGGAAT-AAGTGTGTCATTG  696
      ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTTGTTAGAATGGGATGTTTGTGACCTTCTTGGAATAAAGTGTGTCATTG  700

seq1  TGGGTGGGC-TTTGGAGTTTTCAAATGCTCACGCCAGGCCCAGTGTCTCT  745
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGGGCTTTTGGAGTTTTCAAATGCTCACGCCAGGCCCAGTGTCTCT  750

seq1  CTCTTCCTGCTGCCTGCTACCCTTGATGTAGAAGTCTCAGCTACCTCTGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCTGCTGCCTGCTACCCTTGAT-TAGAAGTCTCAGCTACCTCTGT  799

seq1  GGCACCACATCTGCCT-GGGTGCCTCCATTCTTCCACCTATGTTTATAAT  844
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCACATCTGCCTGGGGTGCCTCCATTCTTCCACCTATGTTTATAAT  849

seq1  -GGACTAAACTGTTGAAGATGTAAGCCAGAACAATTAAACATTTCCTTTA  893
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTAAACTGTTGAAGATGTAAGCCAGAACAATTAAACATTTCCTTTA  899

seq1  -TAAGAGCTGTAAT-GGTCAAGGTGTCTTTTCACAGCAATGGAGCACTAA  941
       ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  | |||||||||| |
seq2  TTAAGAGCTGTAATGGGTCAAGTTGTCTTTTCTC-TCCATGGAGCACT-A  947

seq1  GATAAATGCACAGCAGCAAT  961
      ||||||||||||||||| ||
seq2  GATAAATGCACAGCAGCCAT  967

seq1: chr14_101104103_101104877
seq2: B6Ng01-076I10.g_68_853 (reverse)

seq1  GATAG-AAAGCAC-AAACTCCAGACAG-ATGG-AAGACATAGAAGTAGAG  46
      ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  GATAGAAAAGCACAAAACTCCAGACAGAATGGAAAGACATAGAAGTAGAG  50

seq1  AATGCAAACTCAGGCTTG-TTGGTGGTCAAATGATTCT-AAAGGGAAGAG  94
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  AATGCAAACTCAGGCTTGTTTGGTGGTCAAATGATTCTAAAAGGGAAGAA  100

seq1  CTTTGTGTTTATTTTCTAGTGGGATATCAAT-ACATTCCTGGCCCTCTTA  143
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTGTTTATTTTCTAGTGGGATATCAATAACATTCCTGGCCCTCTTA  150

seq1  CATGATTA-TTTGAGCATTTAAATGATGTATA-CCAAATTTGCTCGATCC  191
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CATGATTATTTTGAGCATTTAAATGATGTATACCCAAATTTGCTCGATCC  200

seq1  AGTATCATGAT-AATAGTAAT-AAAGATGATAGTAATAAATAATGTTTCT  239
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCATGATAAATAGTAATAAAAGATGATAGTAATAAATAATGTTTCT  250

seq1  GTGTTCTTTATAGCTTATGGTCAGTTTGAATAGATATGAAATAAGTTCTC  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCTTTATAGCTTATGGTCAGTTTGAATAGATATGAAATAAGTTCTC  300

seq1  AACTTTAAGTTCTTTCCCATACTACTAGCAAAATTGTGATTATAATGGAA  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTAAGTTCTTTCCCATACTACTAGCAAAATTGTGATTATAATGGAA  350

seq1  CACATGACACTTGAAGATTTACAGTGTGCTGCCATGTCTTCCTGGTCATA  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGACACTTGAAGATTTACAGTGTGCTGCCATGTCTTCCTGGTCATA  400

seq1  TTTTTGCAGAATGGTCTCTACAAACAACAAATTACAGTCTACACATCCTA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGCAGAATGGTCTCTACAAACAACAAATTACAGTCTACACATCCTA  450

seq1  TGTTAATAAATAGATGCATACTTCTTTTTCAAACAATATATTTTGATCAT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATAAATAGATGCATACTTCTTTTTCAAACAATATATTTTGATCAT  500

seq1  TTCCCCTTTCTTACCTCCTTCCAGCTCTTCCCTATCCAACTTCATTTTCT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTTTCTTACCTCCTTCCAGCTCTTCCCTATCCAACTTCATTTTCT  550

seq1  TCCTATCACAAACAGACAAACAAACAAACAAACACCAAAGCCAAACCACT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCACAAACAGACAAACAAACAAACAAACACCAAAGCCAAACCACT  600

seq1  CACAGAGACTGTGGAAGCATGCACACGTTCAAATCAGACAAAAGTGCATC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGACTGTGGAAGCATGCACACGTTCAAATCAGACAAAAGTGCATC  650

seq1  ATAGAGAAGGGATAAGTAGAAGCAGAAACAAAGTAATACCTGAAATCAAG  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGAAGGGATAAGTAGAAGCAGAAACAAAGTAATACCTGAAATCAAG  700

seq1  AAGCTATTTTTAATTGATACCCACTAGGAAAGGGAATTATCAATTTCCTA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATTTTTAATTGATACCCACTAGGAAAGGGAATTATCAATTTCCTA  750

seq1  CAATATACTATAACTCTCCATATAAATACTGAATTC  775
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATACTATAACTCTCCATATAAATACTGAATTC  786