BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-088G01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,271,848 - 100,469,091
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf12
Upstream geneLOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623
Downstream geneLOC100043413, EG668683, EG668684
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-088G01.bB6Ng01-088G01.g
ACCDH901243DH901244
length1,034904
definitionDH901243|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-088G01, 5' end.DH901244|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-088G01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,468,061 - 100,469,091)(100,271,848 - 100,272,750)
sequence
gaattctgtactggcaacaccctccctgttcttccacttgtgaggaggaa
gctagccttgtggtatatgctatacagaggtgaccctgaatgggtcacta
tcacccccctgtggggctcaaggagcactgtggaagggcacagacagact
gttagagccagaggatggggaaaggaggaagagggggcttttttccttat
atggtatggtcatcatgctttcaacaccagcatgcatggctaggggaagc
tgtccctggggtctttccctgcctggaggactgtgggaggtaacagttgt
tggcagaaagggtgtcattttctcagtggggtagcccctgatatggtgcc
ctctctgcacaaaataacttctcactgaaacaagagattcttgattgagg
gccatacacaaagacatgcaagtaggagagggtcttgctgaggagccttg
cagcaagagagggaggaaatagggaaggagaacaagttttataatcaact
aaaaccccttacataaatgtatgaaacggtaagaaataaagaacgcatga
agtcgctttttggccttttccacttgccagcctggcttccatgcctgttt
tggtactccagatcttaccagcttcattaattttttttttaatgcagtac
ttagcacctatattttagcatggaagtacatagcatattattgtgttttt
ctttatctgaaaaaaatctatacaagacaatagctggcacatagtaaatg
ctcgctcgataccactgattgaatgtcttctaaaaccatgaagctggggg
aaaagaataaagggatcagatgacatgcagttattcagtcaactacagct
aatgagaagatccacacactatacataattaaattagatcccatggattt
tgtttatcttgtcattagagaagagactcagatgtgctcctttgtctgac
cccgtgctaattggagaagcacagaagaggtgtgggtcagcgtgggtaga
aaactgaaagatcttcgggggaagggggggaagg
gaattctccctgtaaaactggcaagatgctttctcagtggagaaaggact
ggctcctacgagagcagacagaactaagccaaccgtgtacttgacttgag
cgacttccttacgacctatcaattaggctctagggccagcgcctggggga
tcctgcttgtttgccactgtcagggttctttgccctggccagttactaat
gctggcgtgcatcaggaaacctggttttattctggatgattacaggcaat
gagaagtaggaagtgcatacagtacagatttaaaaatgttccagttggta
tatatataaaaaaataacaacaaaaagcaataaccaaaaaatcctgctgg
ctggtgggtaccaacctgtgtagctgaagctatttatcaatagaactaca
gcccttggaggagggaaattgcctgatgaagtttttatacctggcagaaa
atgtagagcacagatctctgaagctgggacttgacctgtaaatcatgcta
cttttgcctgaacagttattaaaagtctttttcaaagctacccgacacaa
atggttctccttgtaatgttcatagctcttgctttgtcagaatacaatta
tcctgattagaagctgatactaggaaggataactgtcaccagaaatcatt
ttagaatgtgcagacattcaaaactgagctaggaaccctatgaggttgat
ttgtgcagtttcccaaatcaagtgtgtcattgaaatatattgcaaaaggc
cttcactggagacctttaatatttaagctataaaatgtcttaacaacaaa
aatctcaccaaacccaatttgccacagaaagctgggaaaacagcagcttt
cagtggtgacagactattttggaaagagtgcttgttggggggttgggggg
atat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100468061_100469091
seq2: B6Ng01-088G01.b_46_1079 (reverse)

seq1  CCTTCCCCCCC-TCCCCCGAAGATC-TTCAGTTTTCTACCCACGCTGACC  48
      ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCCCCCTTCCCCCGAAGATCTTTCAGTTTTCTACCCACGCTGACC  50

seq1  CACACCTC-TCTGTGCTTCTCCAATTAGCACGGGGTCAGACAAAGGAGCA  97
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTCTTCTGTGCTTCTCCAATTAGCACGGGGTCAGACAAAGGAGCA  100

seq1  CATCTGAGTCTCTTCTCTAATGACAAGATAAACAAAATCCATGGGATCTA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGAGTCTCTTCTCTAATGACAAGATAAACAAAATCCATGGGATCTA  150

seq1  ATTTAATTATGTATAGTGTGTGGATCTTCTCATTAGCTGTAGTTGACTGA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATTATGTATAGTGTGTGGATCTTCTCATTAGCTGTAGTTGACTGA  200

seq1  ATAACTGCATGTCATCTGATCCCTTTATTCTTTTCCCCCAGCTTCATGGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGCATGTCATCTGATCCCTTTATTCTTTTCCCCCAGCTTCATGGT  250

seq1  TTTAGAAGACATTCAATCAGTGGTATCGAGCGAGCATTTACTATGTGCCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGACATTCAATCAGTGGTATCGAGCGAGCATTTACTATGTGCCA  300

seq1  GCTATTGTCTTGTATAGATTTTTTTCAGATAAAGAAAAACACAATAATAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTGTCTTGTATAGATTTTTTTCAGATAAAGAAAAACACAATAATAT  350

seq1  GCTATGTACTTCCATGCTAAAATATAGGTGCTAAGTACTGCATTAAAAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGTACTTCCATGCTAAAATATAGGTGCTAAGTACTGCATTAAAAAA  400

seq1  AAAATTAATGAAGCTGGTAAGATCTGGAGTACCAAAACAGGCATGGAAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAATGAAGCTGGTAAGATCTGGAGTACCAAAACAGGCATGGAAGC  450

seq1  CAGGCTGGCAAGTGGAAAAGGCCAAAAAGCGACTTCATGCGTTCTTTATT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCAAGTGGAAAAGGCCAAAAAGCGACTTCATGCGTTCTTTATT  500

seq1  TCTTACCGTTTCATACATTTATGTAAGGGGTTTTAGTTGATTATAAAACT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCGTTTCATACATTTATGTAAGGGGTTTTAGTTGATTATAAAACT  550

seq1  TGTTCTCCTTCCCTATTTCCTCCCTCTCTTGCTGCAAGGCTCCTCAGCAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCCTTCCCTATTTCCTCCCTCTCTTGCTGCAAGGCTCCTCAGCAA  600

seq1  GACCCTCTCCTACTTGCATGTCTTTGTGTATGGCCCTCAATCAAGAATCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCTCTCCTACTTGCATGTCTTTGTGTATGGCCCTCAATCAAGAATCT  650

seq1  CTTGTTTCAGTGAGAAGTTATTTTGTGCAGAGAGGGCACCATATCAGGGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTCAGTGAGAAGTTATTTTGTGCAGAGAGGGCACCATATCAGGGG  700

seq1  CTACCCCACTGAGAAAATGACACCCTTTCTGCCAACAACTGTTACCTCCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCCACTGAGAAAATGACACCCTTTCTGCCAACAACTGTTACCTCCC  750

seq1  ACAGTCCTCCAGGCAGGGAAAGACCCCAGGGACAGCTTCCCCTAGCCATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCTCCAGGCAGGGAAAGACCCCAGGGACAGCTTCCCCTAGCCATG  800

seq1  CATGCTGGTGTTGAAAGCATGATGACCATACCATATAAGGAAAAAAGCCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGGTGTTGAAAGCATGATGACCATACCATATAAGGAAAAAAGCCC  850

seq1  CCTCTTCCTCCTTTCCCCATCCTCTGGCTCTAACAGTCTGTCTGTGCCCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCCTCCTTTCCCCATCCTCTGGCTCTAACAGTCTGTCTGTGCCCT  900

seq1  TCCACAGTGCTCCTTGAGCCCCACAGGGGGGTGATAGTGACCCATTCAGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGTGCTCCTTGAGCCCCACAGGGGGGTGATAGTGACCCATTCAGG  950

seq1  GTCACCTCTGTATAGCATATACCACAAGGCTAGCTTCCTCCTCACAAGTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTCTGTATAGCATATACCACAAGGCTAGCTTCCTCCTCACAAGTG  1000

seq1  GAAGAACAGGGAGGGTGTTGCCAGTACAGAATTC  1031
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACAGGGAGGGTGTTGCCAGTACAGAATTC  1034

seq1: chr14_100271848_100272750
seq2: B6Ng01-088G01.g_69_972

seq1  GAATTCTCCCTGTAAAACTGGCAAGATGCTTTCTCAGTGGAGAAAGGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCTGTAAAACTGGCAAGATGCTTTCTCAGTGGAGAAAGGACT  50

seq1  GGCTCCTACGAGAGCAGACAGAACTAAGCCAACCGTGTACTTGACTTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTACGAGAGCAGACAGAACTAAGCCAACCGTGTACTTGACTTGAG  100

seq1  CGACTTCCTTACGACCTATCAATTAGGCTCTAGGGCCAGCGCCTGGGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACTTCCTTACGACCTATCAATTAGGCTCTAGGGCCAGCGCCTGGGGGA  150

seq1  TCCTGCTTGTTTGCCACTGTCAGGGTTCTTTGCCCTGGCCAGTTACTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTTGTTTGCCACTGTCAGGGTTCTTTGCCCTGGCCAGTTACTAAT  200

seq1  GCTGGCGTGCATCAGGAAACCTGGTTTTATTCTGGATGATTACAGGCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGTGCATCAGGAAACCTGGTTTTATTCTGGATGATTACAGGCAAT  250

seq1  GAGAAGTAGGAAGTGCATACAGTACAGATTTAAAAATGTTCCAGTTGGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTAGGAAGTGCATACAGTACAGATTTAAAAATGTTCCAGTTGGTA  300

seq1  TATATATAAAAAAATAACAACAAAAAGCAATAACCAAAAAATCCTGCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATAAAAAAATAACAACAAAAAGCAATAACCAAAAAATCCTGCTGG  350

seq1  CTGGTGGGTACCAACCTGTGTAGCTGAAGCTATTTATCAATAGAACTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGGGTACCAACCTGTGTAGCTGAAGCTATTTATCAATAGAACTACA  400

seq1  GCCCTTGGAGGAGGGAAATTGCCTGATGAAGTTTTTATACCTGGCAGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGGAGGAGGGAAATTGCCTGATGAAGTTTTTATACCTGGCAGAAA  450

seq1  ATGTAGAGCACAGATCTCTGAAGCTGGGACTTGACCTGTAAATCATGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAGCACAGATCTCTGAAGCTGGGACTTGACCTGTAAATCATGCTA  500

seq1  CTTTTGCCTGAACAGTTATTAAAAGTCTTTTTCAAAGCTACCCGACACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGCCTGAACAGTTATTAAAAGTCTTTTTCAAAGCTACCCGACACAA  550

seq1  ATGGTTCTCCTTGTAATGTTCATAGCTCTTGCTTTGTCAGAATACAATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTCTCCTTGTAATGTTCATAGCTCTTGCTTTGTCAGAATACAATTA  600

seq1  TCCTGATTAGAAGCTGATACTAGGAAGGATAACTGTCACCAGAAATCATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATTAGAAGCTGATACTAGGAAGGATAACTGTCACCAGAAATCATT  650

seq1  TTAGAATGTGCAGACATTCAAAACTGAGCTAGGAACCCTATGAGGTTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATGTGCAGACATTCAAAACTGAGCTAGGAACCCTATGAGGTTGAT  700

seq1  TTGTGCAGTTTCCCAAATCAAGTGTGTCATTGAAATATATTGC-AAAGGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTGTGCAGTTTCCCAAATCAAGTGTGTCATTGAAATATATTGCAAAAGGC  750

seq1  CTTCACTGGAGACCTTTAATATTTAAGCTATAAAATGTCTTAACAACAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACTGGAGACCTTTAATATTTAAGCTATAAAATGTCTTAACAACAAA  800

seq1  AATCTCACCAAACCCAATTTGCCACAGAAAGCTGGGAAAACAGCAGCTTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCACCAAACCCAATTTGCCACAGAAAGCTGGGAAAACAGCAGCTTT  850

seq1  CAGTGGTGACAGACTATTTTGGAAAGAGTGCTTGTTGGGGGGTTGGGGGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTGACAGACTATTTTGGAAAGAGTGCTTGTTGGGGGGTTGGGGGG  900

seq1  ATAT  903
      ||||
seq2  ATAT  904