BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-093G10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 21,730,731 - 21,849,198
singlet/doubletdoublet
Overlap geneVcl
Upstream geneGng2, 1810063B07Rik, Kcnk5, LOC100039106, Kcnk16, Nudt13, Ecd, AA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119
Downstream geneAp3m1, Adk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-093G10.bB6Ng01-093G10.g
ACCDH904903DH904904
length1,1481,160
definitionDH904903|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093G10, 5' end.DH904904|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093G10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,848,024 - 21,849,198)(21,730,731 - 21,731,911)
sequence
gaattctcaatttagaggtaagtttgtcctaaagctgaaattaagcagca
aagaagcttgagacagagactccagagcagcagcacatacctgctcagac
tcctcatcactgatgttggtccggcccagcatagtggccttcactgtgga
taggattttgagctgggtgcttatagttgggattcgctcgcatacctaaa
gagaaagtttcatttgacgtttgttggctctcttgcccacaagttcatag
ccaactccatttccagttgataacatgcagaaagtactcaataaaagagc
agcacaaatgcagtagttctaatccctaccatcagtcctgaccatatggt
tgaaattctactgggttaagaaataaaactttgtatccccacactgccct
taatgctgttgctttcccttcttgagtgcctcttcctagtaacccacttc
cctctactgtttccctcacagtcatcatccgagcttcccacgtaggtgct
gtctctcttgttccctccctccccactcgttctctctctcctctcatccc
atcccccaccaccatggacacacacacacagcctatttcccaagtacctg
taagagattggttctaatccgcttatctgtgcactgcttggcaacctcct
tggccaacctcgtcacctcatcagaggccttggcgatatccttggcacac
tgaataagtgcccgcttggtaccactgccccctcttaccagccgagacat
ctctgccatcagcagagccatgcgcttggctgctgcaatgatgtcattgc
cctagagagaagcatagatacagcatgagctctgcctacacaccagccaa
gttaaggaaagtagaaaaccgggaggaagcttgctgctctagcagccctc
tggaaggacaggaaacggggagagtactgtttggggtactagaaagcact
ggagaagcagaagagagagacaggctcttgcccagcactcatgagagata
tctgctgaaacagacccagaaattagtctgaagggcacatgggtgtccag
cacagcactggacaagcactgagcatcttagtatttgggtcataacatag
ggcgagcaggagcgctataggctcttcccttcttaatagggagaaagc
gaattctcccctactatattgctgtataacagtttcctaggagactgaac
cttccatcctacagggaaactccttgagcagtaaacaaatcgagacagct
ttaggaagtcccccaaactaaccagattcaacaggctcttccctgccaga
gtgaacaataaaagctaagttcgtctcagaagttagaaagctgtgtgcca
aaaggacccagacaagttggacgaaaagaaaactctgagagcagaccagc
accctggaagaagcagaaaccagcagagctgcagggaagaagtttatacc
agttagaaggtgcacttagaaaggacactctcgaacctgttgagctgcct
acaggctgtgcagtgtgctccagctttgtgagctgtcactcatgctgagg
tgggccttggtgatgcaactgtttttgcatcatttctgcctgttaagtaa
ccccttatctatatttctgcaagtaaccccattggttcattaagtaggac
tttggtggtatgtgtacttcggtctgttgtgtgttccctatctagggtaa
gaagatgtgtgttgaatctccccacaacagatgttactatctagataact
ctatgaatttaatctgttattctgacctgctttgtcaagattgaaagtaa
aattactattttgtgctgtttacagctaaaagcactgctatttttaaaaa
aaatctatgtgtgtgtatgtgcctatgaatatctctgtgtacatggtaaa
catatggacattctttacaacaagttttacaactctgaggggaacgggtt
ccccaaagcaagtgttatagatctgaagggaaagctatcctgtcagcctg
gagcccaggacaccacaaactcccactgcacaaaatcaaaagcccttcct
ggctaccccaattatcatgcccaatcaaacaacccaagtaaccctaacat
agcgttgtccccttttacttttataaactgccatttgcctttgggccatt
tctctctcctctctattagagcagcccttttccctcttgacaaatatctt
ttccccatctctttgttctttcacttctctcttgtcttctattcccgtct
tggctttatggcctgcctctgttcttctggcaaatatgtcctttggctga
actggtctcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_21848024_21849198
seq2: B6Ng01-093G10.b_43_1190 (reverse)

seq1  GCTTTCTCCCCTATTATAGAAGTGAAGACGCCTGTATGAGCGGCTCCTTG  50
      ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |   ||| ||||||  
seq2  GCTTTCT-CCCTATTA-AGAAGGGAAGA-GCCTAT---AGC-GCTCCT--  41

seq1  GCTCTGGCCCTATGTTATTGACACAATTAACCTGGAGATGCTCAAGTGCT  100
      ||||  ||||||||||| |||| ||| ||  ||  |||||||| ||||||
seq2  GCTC--GCCCTATGTTA-TGACCCAAATA--CT-AAGATGCTC-AGTGCT  84

seq1  TGTCCAGTGCTGTGCCTGGGACACCCATGTTGCCCTTTCAGACTAATATC  150
      |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
seq2  TGTCCAGTGCTGTGC--TGGACACCCATG-TGCCC-TTCAGACTAATTTC  130

seq1  TGGGTCTTGTTTTCAGCCAGGATATTCTCTCATGAGTGCTGGGGCAAGAG  200
      |||||||   |||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGGGTCT--GTTTCAGC--AGATA-TCTCTCATGAGTGCT-GGGCAAGAG  174

seq1  CCCTGTCTCTCTCTTCTGCTTCTCCAGTGCTTTCTAGTACCCCAAACAGT  250
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CCTGTCTCTCTCTTCTGCTTCTCCAGTGCTTTCTAGTACCCCAAACAGT  223

seq1  ACTCTCCCCGTTTCCTGTCCTTCCAGAGGGCTGCTAGAGCAGCAGGCTTC  300
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACTCTCCCCGTTTCCTGTCCTTCCAGAGGGCTGCTAGAGCAGCAAGCTTC  273

seq1  CTCCCGGTTTTCTACTTTCCTTAACTTGGCTGGTGTGTAGGCAGAGCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCGGTTTTCTACTTTCCTTAACTTGGCTGGTGTGTAGGCAGAGCTCA  323

seq1  TGCTGTATCTATGCTTCTCTCTAGGGCAATGACATCATTGCAGCAGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTATCTATGCTTCTCTCTAGGGCAATGACATCATTGCAGCAGCCAA  373

seq1  GCGCATGGCTCTGCTGATGGCAGAGATGTCTCGGCTGGTAAGAGGGGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCATGGCTCTGCTGATGGCAGAGATGTCTCGGCTGGTAAGAGGGGGCA  423

seq1  GTGGTACCAAGCGGGCACTTATTCAGTGTGCCAAGGATATCGCCAAGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACCAAGCGGGCACTTATTCAGTGTGCCAAGGATATCGCCAAGGCC  473

seq1  TCTGATGAGGTGACGAGGTTGGCCAAGGAGGTTGCCAAGCAGTGCACAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATGAGGTGACGAGGTTGGCCAAGGAGGTTGCCAAGCAGTGCACAGA  523

seq1  TAAGCGGATTAGAACCAATCTCTTACAGGTACTTGGGAAATAGGCTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCGGATTAGAACCAATCTCTTACAGGTACTTGGGAAATAGGCTGTGT  573

seq1  GTGTGTGTCCATGGTGGTGGGGGATGGGATGAGAGGAGAGAGAGAACGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTCCATGGTGGTGGGGGATGGGATGAGAGGAGAGAGAGAACGAG  623

seq1  TGGGGAGGGAGGGAACAAGAGAGACAGCACCTACGTGGGAAGCTCGGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGGGAGGGAACAAGAGAGACAGCACCTACGTGGGAAGCTCGGATG  673

seq1  ATGACTGTGAGGGAAACAGTAGAGGGAAGTGGGTTACTAGGAAGAGGCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGTGAGGGAAACAGTAGAGGGAAGTGGGTTACTAGGAAGAGGCAC  723

seq1  TCAAGAAGGGAAAGCAACAGCATTAAGGGCAGTGTGGGGATACAAAGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAAGGGAAAGCAACAGCATTAAGGGCAGTGTGGGGATACAAAGTTT  773

seq1  TATTTCTTAACCCAGTAGAATTTCAACCATATGGTCAGGACTGATGGTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTTAACCCAGTAGAATTTCAACCATATGGTCAGGACTGATGGTAG  823

seq1  GGATTAGAACTACTGCATTTGTGCTGCTCTTTTATTGAGTACTTTCTGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAGAACTACTGCATTTGTGCTGCTCTTTTATTGAGTACTTTCTGCA  873

seq1  TGTTATCAACTGGAAATGGAGTTGGCTATGAACTTGTGGGCAAGAGAGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATCAACTGGAAATGGAGTTGGCTATGAACTTGTGGGCAAGAGAGCC  923

seq1  AACAAACGTCAAATGAAACTTTCTCTTTAGGTATGCGAGCGAATCCCAAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACGTCAAATGAAACTTTCTCTTTAGGTATGCGAGCGAATCCCAAC  973

seq1  TATAAGCACCCAGCTCAAAATCCTATCCACAGTGAAGGCCACTATGCTGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGCACCCAGCTCAAAATCCTATCCACAGTGAAGGCCACTATGCTGG  1023

seq1  GCCGGACCAACATCAGTGATGAGGAGTCTGAGCAGGTATGTGCTGCTGCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGACCAACATCAGTGATGAGGAGTCTGAGCAGGTATGTGCTGCTGCT  1073

seq1  CTGGAGTCTCTGTCTCAAGCTTCTTTGCTGCTTAATTTCAGCTTTAGGAC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTCTCTGTCTCAAGCTTCTTTGCTGCTTAATTTCAGCTTTAGGAC  1123

seq1  AAACTTACCTCTAAATTGAGAATTC  1175
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACCTCTAAATTGAGAATTC  1148

seq1: chr14_21730731_21731911
seq2: B6Ng01-093G10.g_69_1228

seq1  GAATTCTCCCCTACTATATTGCTGTATAACAGTTTCCTAGGAGACTGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCCTACTATATTGCTGTATAACAGTTTCCTAGGAGACTGAAC  50

seq1  CTTCCATCCTACAGGGAAACTCCTTGAGCAGTAAACAAATCGAGACAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATCCTACAGGGAAACTCCTTGAGCAGTAAACAAATCGAGACAGCT  100

seq1  TTAGGAAGTCCCCCAAACTAACCAGATTCAACAGGCTCTTCCCTGCCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAGTCCCCCAAACTAACCAGATTCAACAGGCTCTTCCCTGCCAGA  150

seq1  GTGAACAATAAAAGCTAAGTTCGTCTCAGAAGTTAGAAAGCTGTGTGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACAATAAAAGCTAAGTTCGTCTCAGAAGTTAGAAAGCTGTGTGCCA  200

seq1  AAAGGACCCAGACAAGTTGGACGAAAAGAAAACTCTGAGAGCAGACCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACCCAGACAAGTTGGACGAAAAGAAAACTCTGAGAGCAGACCAGC  250

seq1  ACCCTGGAAGAAGCAGAAACCAGCAGAGCTGCAGGGAAGAAGTTTATACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGAAGAAGCAGAAACCAGCAGAGCTGCAGGGAAGAAGTTTATACC  300

seq1  AGTTAGAAGGTGCACTTAGAAAGGACACTCTCGAACCTGTTGAGCTGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGAAGGTGCACTTAGAAAGGACACTCTCGAACCTGTTGAGCTGCCT  350

seq1  ACAGGCTGTGCAGTGTGCTCCAGCTTTGTGAGCTGTCACTCATGCTGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCTGTGCAGTGTGCTCCAGCTTTGTGAGCTGTCACTCATGCTGAGG  400

seq1  TGGGCCTTGGTGATGCAACTGTTTTTGCATCATTTCTGCCTGTTAAGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCTTGGTGATGCAACTGTTTTTGCATCATTTCTGCCTGTTAAGTAA  450

seq1  CCCCTTATCTATATTTCTGCAAGTAACCCCATTGGTTCATTAAGTAGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTATCTATATTTCTGCAAGTAACCCCATTGGTTCATTAAGTAGGAC  500

seq1  TTTGGTGGTATGTGTACTTCGGTCTGTTGTGTGTTCCCTATCTAGGGTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTGGTATGTGTACTTCGGTCTGTTGTGTGTTCCCTATCTAGGGTAA  550

seq1  GAAGATGTGTGTTGAATCTCCCCACAACAGATGTTACTATCTAGATAACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGTGTGTTGAATCTCCCCACAACAGATGTTACTATCTAGATAACT  600

seq1  CTATGAATTTAATCTGTTATTCTGACCTGCTTTGTCAAGATTGAAAGTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAATTTAATCTGTTATTCTGACCTGCTTTGTCAAGATTGAAAGTAA  650

seq1  AATTACTATTTTGTGCTGTTTACAGCTAAAAGCACTGCTATTTTTAAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACTATTTTGTGCTGTTTACAGCTAAAAGCACTGCTATTTTTAAAAA  700

seq1  AAATCTATGTGTGTGTATGTGCCTATGAATATCTCTGTGTACATGGTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTATGTGTGTGTATGTGCCTATGAATATCTCTGTGTACATGGTAAA  750

seq1  CATATGGACATTCTTTACAACAAGTTTTACAACTCTGAGGGGAACGGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGACATTCTTTACAACAAGTTTTACAACTCTGAGGGGAACGGGTT  800

seq1  CCCCAAAGCAAGTGTTATAGATCTGAAGGGAAAGCTATCCTGTCAGCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAAGCAAGTGTTATAGATCTGAAGGGAAAGCTATCCTGTCAGCCTG  850

seq1  GAGCCAAGGAACACCACAAACTCCCACTGCACAAAATCAAAAGCCCTTCC  900
      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCAGG-ACACCACAAACTCCCACTGCACAAAATCAAAAGCCCTTCC  899

seq1  TGGCTACCCCAATTATCATGCCCAATCAAAACAACCCAAGTAACCCTAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTACCCCAATTATCATGCCCAATC-AAACAACCCAAGTAACCCTAAC  948

seq1  ATAGCGTTGTCCCCTTTTACTTTTATAAACTGCCATTTGCCTATGGGCCA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATAGCGTTGTCCCCTTTTACTTTTATAAACTGCCATTTGCCTTTGGGCCA  998

seq1  TATCTCTCTCCTCTCTATTCAGAGGCAGCCCTTTGTCCCTCCTGGACAAA  1050
      | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||
seq2  TTTCTCTCTCCTCTCTATT-AGA-GCAGCCCTTT-TCCCT-CTTGACAAA  1044

seq1  TATCCTTTTCCCCCATCTCTTGTTCCTTTCCACTTCTCTCTTGTCTTCTA  1100
      ||||  ||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||
seq2  TATC--TTTTCCCCATCTCTTTGTTCTTT-CACTTCTCTCTTGTCTTCTA  1091

seq1  TCTCCCGTCTTTGGCTCTTATGCCCTGCCCTCTGTCTCTCTGGGGCAAAT  1150
      | ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||   |||  |||||||
seq2  T-TCCCGTC-TTGGCT-TTATGGCCTG-CCTCTGTTCTTCT--GGCAAAT  1135

seq1  AAATGTCCTTTGTGCTGAGAACTTGGTCTCG  1181
        |||||||||| |||  |||| ||||||||
seq2  --ATGTCCTTTG-GCT--GAAC-TGGTCTCG  1160