BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094J03
Chromosome14 (Build37)
Map Location 96,415,026 - 96,544,988
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlhl1
Upstream geneLOC677613, LOC100043784, LOC382931, 4921530L21Rik
Downstream geneLOC100043366, LOC668654
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094J03.bB6Ng01-094J03.g
ACCDH905753DH905754
length833370
definitionDH905753|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094J03, 5' end.DH905754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094J03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,544,153 - 96,544,988)(96,415,026 - 96,415,401)
sequence
gaattcatttgctaaatttgacattcaattctactaatgtgtcaaaatgt
ggtgaatatatctcagctattttgtgtatttaaaatatgagattataaaa
agagcacattataataaataaaagttacatgggctctgtcaggctttagt
gtgcatccttgtatttcagtcatgtgtgttaggcacagcaagtctaaggc
tggctttgtatccgttgccaagatttcttggtaggcaggaatgaaaacag
tcatccacctgcctcggagcttagtgaaatccagaaataagcagctcaca
cgaagaggttcactgagcagaaaaagccggagtatcctccattgttatct
gtagattgtcttgggatcagattaaaggatgttgcatgtattaagaaaca
tagggctaaactattaataatctgttttagagtctttattctacaacttg
tcattctaataattattacctacaagacagactacctgaatattttaaat
gatatattaaagaagcaaaacatgatttgtgtatgtgtgtgcacatgtgc
atatatgtctgtgtatgtatatatgtgtatatatatatgtatgtatattc
atatgtatgtatataatatctaattttccaaagtttgaaaattataaata
tattttatagctttgtttttaactataacaaatggaaaagaactgtgtat
acaatacaggttactaagaaatttacgttttcaatgacaaacttgtggag
ttaaggaattcctgaggtagaagcaccttttattgtaaggaaaggtagaa
gtatccctctacatgagtgaaagtgacatatct
aactattcctctatacatcgcatgacctttgaaacatctgctccaccaaa
acatcacaagtctccgttagcaaaacaagctctcacaaggcagctttcag
acaaacatcacatgactcaactgaatttccaacgataccagaatttccac
ttcaattgtcagttttcatgaatcatggattagtaagtttgcatccccca
taactaaacagacatttaacaataagattggataaaagtaagattgaatg
aaagtgcttccaaattatgttctgtaattttattaaaacttcctaaagaa
tagttgtgcaatacttaaaagagactttatggctatttttattttcattc
taggggtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_96544153_96544988
seq2: B6Ng01-094J03.b_42_873 (reverse)

seq1  GATATGTCACCTTTCACCTCATGTAGAGGGATACTTCTACCTTTCCTTAA  50
      ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GATATGTCA-CTTTCA-CTCATGTAGAGGGATACTTCTACCTTTCCTT-A  47

seq1  CAATAAAAAGGTGCTTCTACCTCAGGAATTCCTTAACTCCACATGTTTGT  100
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAAT-AAAAGGTGCTTCTACCTCAGGAATTCCTTAACTCCACAAGTTTGT  96

seq1  CATTGAAATACGTAAATTTCTTAGTAACCTGTATTGTATACACAGTTCTT  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAAA-ACGTAAATTTCTTAGTAACCTGTATTGTATACACAGTTCTT  145

seq1  TTCCATTTGTTATAGTT-AAAACAAAGCTATAAAATATATTTATAATTTT  199
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTTGTTATAGTTAAAAACAAAGCTATAAAATATATTTATAATTTT  195

seq1  CAAACTTTGGAAAATTAGATATTATATACATACATATGAATATACATACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTTGGAAAATTAGATATTATATACATACATATGAATATACATACA  245

seq1  TATATATATACACATATATACATACACAGACATATATGCACATGTGCACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATACACATATATACATACACAGACATATATGCACATGTGCACA  295

seq1  CACATACACAAATCATGTTTTGCTTCTTTAATATATCATTTAAAATATTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACACAAATCATGTTTTGCTTCTTTAATATATCATTTAAAATATTC  345

seq1  AGGTAGTCTGTCTTGTAGGTAATAATTATTAGAATGACAAGTTGTAGAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGTCTGTCTTGTAGGTAATAATTATTAGAATGACAAGTTGTAGAAT  395

seq1  AAAGACTCTAAAACAGATTATTAATAGTTTAGCCCTATGTTTCTTAATAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACTCTAAAACAGATTATTAATAGTTTAGCCCTATGTTTCTTAATAC  445

seq1  ATGCAACATCCTTTAATCTGATCCCAAGACAATCTACAGATAACAATGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAACATCCTTTAATCTGATCCCAAGACAATCTACAGATAACAATGGA  495

seq1  GGATACTCCGGCTTTTTCTGCTCAGTGAACCTCTTCGTGTGAGCTGCTTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACTCCGGCTTTTTCTGCTCAGTGAACCTCTTCGTGTGAGCTGCTTA  545

seq1  TTTCTGGATTTCACTAAGCTCCGAGGCAGGTGGATGACTGTTTTCATTCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGATTTCACTAAGCTCCGAGGCAGGTGGATGACTGTTTTCATTCC  595

seq1  TGCCTACCAAGAAATCTTGGCAACGGATACAAAGCCAGCCTTAGACTTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTACCAAGAAATCTTGGCAACGGATACAAAGCCAGCCTTAGACTTGC  645

seq1  TGTGCCTAACACACATGACTGAAATACAAGGATGCACACTAAAGCCTGAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCTAACACACATGACTGAAATACAAGGATGCACACTAAAGCCTGAC  695

seq1  AGAGCCCATGTAACTTTTATTTATTATAATGTGCTCTTTTTATAATCTCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCCATGTAACTTTTATTTATTATAATGTGCTCTTTTTATAATCTCA  745

seq1  TATTTTAAATACACAAAATAGCTGAGATATATTCACCACATTTTGACACA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAAATACACAAAATAGCTGAGATATATTCACCACATTTTGACACA  795

seq1  TTAGTAGAATTGAATGTCAAATTTAGCAAATGAATTC  836
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGAATTGAATGTCAAATTTAGCAAATGAATTC  832

seq1: chr14_96415026_96415401
seq2: B6Ng01-094J03.g_69_444

seq1  GAATTCAACTATTCCTCTATACATCGCATGACCTTTGAAACATCTGCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTATTCCTCTATACATCGCATGACCTTTGAAACATCTGCTCC  50

seq1  ACCAAAACATCACAAGTCTCCGTTAGCAAAACAAGCTCTCACAAGGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAACATCACAAGTCTCCGTTAGCAAAACAAGCTCTCACAAGGCAGC  100

seq1  TTTCAGACAAACATCACATGACTCAACTGAATTTCCAACGATACCAGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGACAAACATCACATGACTCAACTGAATTTCCAACGATACCAGAAT  150

seq1  TTCCACTTCAATTGTCAGTTTTCATGAATCATGGATTAGTAAGTTTGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACTTCAATTGTCAGTTTTCATGAATCATGGATTAGTAAGTTTGCAT  200

seq1  CCCCCATAACTAAACAGACATTTAACAATAAGATTGGATAAAAGTAAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCATAACTAAACAGACATTTAACAATAAGATTGGATAAAAGTAAGAT  250

seq1  TGAATGAAAGTGCTTCCAAATTATGTTCTGTAATTTTATTAAAACTTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGAAAGTGCTTCCAAATTATGTTCTGTAATTTTATTAAAACTTCCT  300

seq1  AAAGAATAGTTGTGCAATACTTAAAAGAGACTTTATGGCTATTTTTATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATAGTTGTGCAATACTTAAAAGAGACTTTATGGCTATTTTTATTT  350

seq1  TCATTCTAGGGGTGTGTGTGTGTGTG  376
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTAGGGGTGTGTGTGTGTGTG  376