BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112F16
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,920,121 - 23,056,972
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik
Upstream geneAdk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneEG435392, LOC665068
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112F16.bB6Ng01-112F16.g
ACCDH918441DH918442
length7911,175
definitionDH918441|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112F16, 5' end.DH918442|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112F16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,920,121 - 22,920,912)(23,055,801 - 23,056,972)
sequence
aagaacaaagcaatttcaggtacaataactggggtggggagagtgtgggt
tcaaaagcaaaacagcagtacaacacacacacacacacacacacacacac
acacacacaccacgcaccagtaaaaaattccaagtcaaccaactcaatac
atggggcttggaggtgtgtccagtgacacagtccttgcaaaccatgtaag
gccctgggttcagtccccacacaacaaaaacaaaaacaaaaacaaacaaa
caaaaaaaccaaaactggactgaaacacaaaaccaccaaaagacatctgg
ggacattggcatggcccatgaggttttgacctctaatttaactcagcctc
cttatcttatttatttatttatttgagaaggcttttacatcatagcctag
cctgcccttggctgagcaatactcctcctgtttcagccttctgcatactg
gaattctaggcacgaaccaccatgcctggcaactttcttatgttacgttt
tctgtttgtcctaggctggtcttatggtgatcctcctgcttcagcctcct
aagttctgaggctataggcatgcgtcctcatgatggcggcagcctcctta
ttttaaagagaaagaaacaagagacccaaaggggtgaggcaaattgttcc
ggtcctcaccttgggaatggctgaggtgatagggtgacatgagttccaaa
tcgcaggcccaccttcactgtaaaccagagcttccttagtgctgtggaca
gggccagagtcagatgcaatgtactggatcagacttaatgg
gaattcattaaaataacagccctgacccttgagaagtggaagcaggaaag
aacaagaattcatggtcatccttgactacatcgtaagtttgaggctaccc
tgagatacttagaaccttgtctcactgagaacagagctgaccaaagtccg
ctaagtaaacaagcatcatgggggcgggaatgagagtggtaaggggctct
taagttattctggggtctagagtaggggcctctctaagagagtcacattt
aagctgagacctgaagacatgcagaagatatacgaaagaaggtcagaatc
ttaacaagtcaagaagtgcagtcccagtatccttaaaaccagaagtcaca
tctgatctaccttgctaccctagcatctggaactccaactctttcaatgg
acacacagaagaatggagggtgggtaactgtacaaatatctagtgtcatc
tggaaaactccacttggtctgcctttcccaggggagatgatcctcctcct
actggggtgacatctgaacacatgtacacagtaatgaggaaatggaggaa
ggtgcgaaatgtctcctatttggtgggatcagaaacaccgccatgttgag
ctcttcagctccatccatcagcttcgctgagccaggaaacctgaagctac
tgagttcacaccctgatctgaactcccacagtgaagtgtagtggttcatt
atccccaaaacaatttttctgtggttccagctcaacaaagcaacttctaa
aatttaaaaaaaaaaaaaattacatgtctcaaatttaaaggactttgtga
tgtcacaagagagcagcaatcagagatggctgcagcatgcactaaaaaga
ctcaatcagtaacatgctggctgcagcatcatgcgaccttgcaggtaaga
tgttggatctgcatggccacagttagactttaagccccagaaacactgga
ctgttcagctaagaactgttgttgctttccatgtaccatatagaaaggca
agccccactttacaatggtccacagacagaaattcattttttggtgactg
tccaaagggcagatgtagtgataagtaactcgtgtttaggattctagaat
gtgaagctgatcctctgatctggactcaagccaatagattcgagagaccc
catataaatctattgatgtttctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22920121_22920912
seq2: B6Ng01-112F16.b_54_844

seq1  AAGAACAAAGCAATTTCAGGTACAATAACTGGGGTGGGGAGAGTGTGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACAAAGCAATTTCAGGTACAATAACTGGGGTGGGGAGAGTGTGGGT  50

seq1  TCAAAAGCAAAACAGCAGTACAACACACACACACACACACACACACACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGCAAAACAGCAGTACAACACACACACACACACACACACACACAC  100

seq1  ACACACACACCACGCACCAGTAAAAAATTCCAAGTCAACCAACTCAATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACCACGCACCAGTAAAAAATTCCAAGTCAACCAACTCAATAC  150

seq1  ATGGGGCTTGGAGGTGTGTCCAGTGACACAGTCCTTGCAAACCATGTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGCTTGGAGGTGTGTCCAGTGACACAGTCCTTGCAAACCATGTAAG  200

seq1  GCCCTGGGTTCAGTCCCCACACAACAAAAACAAAAACAAAAACAAACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGGGTTCAGTCCCCACACAACAAAAACAAAAACAAAAACAAACAAA  250

seq1  CAAAAAAACCAAAACTGGACTGAAACACAAAACCACCAAAAGACATCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAACCAAAACTGGACTGAAACACAAAACCACCAAAAGACATCTGG  300

seq1  GGACATTGGCATGGCCCATGAGGTTTTGACCTCTAATTTAACTCAGCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATTGGCATGGCCCATGAGGTTTTGACCTCTAATTTAACTCAGCCTC  350

seq1  CTTATCTTATTTATTTATTTATTTGAGAAGGCTTTTACATCATAGCCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCTTATTTATTTATTTATTTGAGAAGGCTTTTACATCATAGCCTAG  400

seq1  CCTGCCCTTGGCTGAGCAATACTCCTCCTGTTTCAGCCTTCTGCATACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCTTGGCTGAGCAATACTCCTCCTGTTTCAGCCTTCTGCATACTG  450

seq1  GAATTCTAGGCACGAACCACCATGCCTGGCAACTTTCTTATGTTACGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGCACGAACCACCATGCCTGGCAACTTTCTTATGTTACGTTT  500

seq1  TCTGTTTGTCCTAGGCTGGTCTTATGGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTGTCCTAGGCTGGTCTTATGGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCT  550

seq1  AAGTTCTGAGGCTATAGGCATGCGTCCTCATGATGGCGGCAGCCTCCTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTGAGGCTATAGGCATGCGTCCTCATGATGGCGGCAGCCTCCTTA  600

seq1  TTTTAAAGAGAAAGAAACAAGAGACCCAAAGGGGTGAGGCAAATTGTTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAGAGAAAGAAACAAGAGACCCAAAGGGGTGAGGCAAATTGTTCC  650

seq1  GGTCCTCACCTTGGGAATGGCTGAGGTGATAGGGTGACATGAGTTCCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCACCTTGGGAATGGCTGAGGTGATAGGGTGACATGAGTTCCAAA  700

seq1  TCGCAGGCCCACCTTCACTGTAAACCAGAGCTTCCTTAGTGCTGTGGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGGCCCACCTTCACTGTAAACCAGAGCTTCCTTAGTGCTGTGGACA  750

seq1  GGGCCAGAGTCAGATGCAATGTACTGGAGTCAGACTTAATGG  792
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGGCCAGAGTCAGATGCAATGTACTGGA-TCAGACTTAATGG  791

seq1: chr14_23055801_23056972
seq2: B6Ng01-112F16.g_68_1242 (reverse)

seq1  AGAGAAACATTCCAAATAGATTTATATGAGGGGCTCTGGAATCTATGGGC  50
      ||||||||||    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||
seq2  AGAGAAACAT---CAATAGATTTATATG-GGGTCTCTCGAATCTATTGGC  46

seq1  -TGAGT-CAGATCAGAAGATC-GC-TCACA-TCTTGGATTCTAAACACGA  95
       ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| | || ||||||||||
seq2  TTGAGTCCAGATCAGAGGATCAGCTTCACATTCTAGAATCCTAAACACGA  96

seq1  GTTACTTTATCACTTACATCTGCCCTTTGTGACAGTCACC--AAAATGAA  143
      ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||
seq2  GTTAC-TTATCAC-TACATCTGCCCTTTG-GACAGTCACCAAAAAATGAA  143

seq1  TTTCTGTCTTGTGG-CCATTGTAAAGTGGGGCCTTTGCCTTTCTATATGG  192
      |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTC-TGTGGACCATTGTAAAGTGGGGC--TTGCCTTTCTATATGG  190

seq1  TACATGAATAGCAACAACAAGTTCTTAGCTGAACAGTCCAGTG-TTCT-G  240
      |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  TACATGGAAAGCAACAAC-AGTTCTTAGCTGAACAGTCCAGTGTTTCTGG  239

seq1  GGCTTAAGGTCT-ACTGTGGCCATGCAGAT-CAACATCTTACCTGCAAGG  288
      ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAAAGTCTAACTGTGGCCATGCAGATCCAACATCTTACCTGCAAGG  289

seq1  TCGCATGATGCTGCAGCCAGCATGTTACTGA-TGAGTCTTTTTAGTGCAT  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCGCATGATGCTGCAGCCAGCATGTTACTGATTGAGTCTTTTTAGTGCAT  339

seq1  GCTGCAGCCATCTCTGATTGCTGCTCTCTTGTGACATCACAAAGTCCTTT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGCCATCTCTGATTGCTGCTCTCTTGTGACATCACAAAGTCCTTT  389

seq1  -AATTTGAGACATGTAATTTTTTTTTTTTTTAAATTTTAGAAGTTGCTTT  436
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGAGACATGTAATTTTTTTTTTTTTTAAATTTTAGAAGTTGCTTT  439

seq1  GTTGAGCTGGAACCACAGAAAAATTGTTTTGGGGATAATGAACCACTACA  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGCTGGAACCACAGAAAAATTGTTTTGGGGATAATGAACCACTACA  489

seq1  CTTCACTGTGGGAGTTCAGATCAGGGTGTGAACTCAGTAGCTTCAGGTTT  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACTGTGGGAGTTCAGATCAGGGTGTGAACTCAGTAGCTTCAGGTTT  539

seq1  CCTGGCTCAGCGAAGCTGATGGATGGAGCTGAAGAGCTCAACATGGCGGT  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCAGCGAAGCTGATGGATGGAGCTGAAGAGCTCAACATGGCGGT  589

seq1  GTTTCTGATCCCACCAAATAGGAGACATTTCGCACCTTCCTCCATTTCCT  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTGATCCCACCAAATAGGAGACATTTCGCACCTTCCTCCATTTCCT  639

seq1  CATTACTGTGTACATGTGTTCAGATGTCACCCCAGTAGGAGGAGGATCAT  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACTGTGTACATGTGTTCAGATGTCACCCCAGTAGGAGGAGGATCAT  689

seq1  CTCCCCTGGGAAAGGCAGACCAAGTGGAGTTTTCCAGATGACACTAGATA  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCTGGGAAAGGCAGACCAAGTGGAGTTTTCCAGATGACACTAGATA  739

seq1  TTTGTACAGTTACCCACCCTCCATTCTTCTGTGTGTCCATTGAAAGAGTT  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTACAGTTACCCACCCTCCATTCTTCTGTGTGTCCATTGAAAGAGTT  789

seq1  GGAGTTCCAGATGCTAGGGTAGCAAGGTAGATCAGATGTGACTTCTGGTT  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTCCAGATGCTAGGGTAGCAAGGTAGATCAGATGTGACTTCTGGTT  839

seq1  TTAAGGATACTGGGACTGCACTTCTTGACTTGTTAAGATTCTGACCTTCT  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGATACTGGGACTGCACTTCTTGACTTGTTAAGATTCTGACCTTCT  889

seq1  TTCGTATATCTTCTGCATGTCTTCAGGTCTCAGCTTAAATGTGACTCTCT  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTATATCTTCTGCATGTCTTCAGGTCTCAGCTTAAATGTGACTCTCT  939

seq1  TAGAGAGGCCCCTACTCTAGACCCCAGAATAACTTAAGAGCCCCTTACCA  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGGCCCCTACTCTAGACCCCAGAATAACTTAAGAGCCCCTTACCA  989

seq1  CTCTCATTCCCGCCCCCATGATGCTTGTTTACTTAGCGGACTTTGGTCAG  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCATTCCCGCCCCCATGATGCTTGTTTACTTAGCGGACTTTGGTCAG  1039

seq1  CTCTGTTCTCAGTGAGACAAGGTTCTAAGTATCTCAGGGTAGCCTCAAAC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTCTCAGTGAGACAAGGTTCTAAGTATCTCAGGGTAGCCTCAAAC  1089

seq1  TTACGATGTAGTCAAGGATGACCATGAATTCTTGTTCTTTCCTGCTTCCA  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGATGTAGTCAAGGATGACCATGAATTCTTGTTCTTTCCTGCTTCCA  1139

seq1  CTTCTCAAGGGTCAGGGCTGTTATTTTAATGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCAAGGGTCAGGGCTGTTATTTTAATGAATTC  1175