BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119D04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 120,735,265 - 120,869,093
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMbnl2
Upstream geneHs6st3, EG621324, LOC100043830, Oxgr1, Gabarapl2-ps, LOC100043831
Downstream geneRap2a, LOC668835, LOC668837, Ranbp5, Farp1, LOC100043837, Stk24, Slc15a1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119D04.bB6Ng01-119D04.g
ACCDH923475DH923476
length1,1251,139
definitionDH923475|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119D04, 5' end.DH923476|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,735,265 - 120,736,409)(120,867,944 - 120,869,093)
sequence
gaattcaaaggcaaagatctgctcttctattcagccagccatgagatgtc
tacaccataagctctcgtcatgtgtcacacatgctggaagtgtcctctta
cttaaaaaaggaaaaaaaaatcactaataaagctcctgttccctgagaga
gagaactttagacatccccgggaagtatcctgtttataaataatgtcagt
tggacccatcaaaccagtcaatttccattttagaatgggaggcgcccctt
cttcccctacttttactacagagaccctgaaacctgggatgtgtttgtcc
ctgcatactggaacaaaggcccaagaaacctaaggcagctgtcagacaat
gccaagtgtatgtataccatgccaagggacacagtcctggagctatagag
accaggctcgctctgcaggggctacgtcaccgatgaacttcacctgttct
gcagtttcctcatgaactgaccctactactgctaactagcatattctttc
cacttggatggattcagtgtcttccggctcagagattacagcatagttgc
attactctctttcagcactgtcgtggccaagaacaacatgatactccgag
gacagctccaccccctgagagctgacctttcagactcccaagcctcccaa
actgggagggaggaggtgtcagcctagctctttgtagtcacacttagggt
ggccatgctgccccacggactagaattttagtgatgtgaccgacaagccc
tttttctcacaacctgaggctgaatatccacactggggattatgccttag
agcggatgaaatagctccagcgggcgaaggataagaaaatgcttccaagg
ccttagcctctttaaagccagaacgtcagctttctgcttgttttcttttc
ccttaagtattatcatcttccagacatttctttaaaaccaggatagtgca
tctggctttgactgagagcgttatagctgcttagtcacatgaataaccca
gcgtgggaagaggcccagtgggtgaagtgcttctgagcagaggaggtctg
agtattcccagcacatgtataaagtcaggtgtgataaacatgtataatct
acacggggggtgggtgaacgggaat
gaattcagttcccaggacctgaagggcagaatagaaaggattcccacagg
ctgtcctttgactctcacacaagcttcatggtattccataccatggacaa
ataaaaatgaacaaattttaaaaagtagtgtatattaaaatttaaaaacc
tggtggtagcttttaactgctgtgtgttgagtcaccccaccttgacattt
gcccccttctagggagtagccgcagaagctgccagactcgcagaagaatc
ctggacaggatgcggtgactcaggatgcgacacagccagacagctgcctg
gtagcacttcttcttaagctcgcaagccccttagaaacaaatctgagtgt
ataggtataagaatatgtgagaagaaagtctgtgggaagatataaaagat
gggactttacacgacctcagcggctaccgcagtttggcttaatgccaaag
aggtgatgtgtcaagttctggccacaccgtgatgagggcacaggacccag
aaacacagtgaccagagtgtgagggaacacgggtcgcatgcttcttggtg
ggggttctgtagctaaggctagggaagggtcccactagagccgactgggc
aagttagagctgactaggcgagctggctgtttcccttagacagttgttca
tgaaattcaggatctgttgttgtctgggtgtaggtcaacgacttgttttc
tgcagttcctgagtagctgacttcctggaacactgagctccatgtagggc
cttggattgtggggcagagttttgaatagatatatagcatgggtctctaa
atcagatatttattgataaattatattaaatattaaattaaattaaatta
aatatgtcaaattatatattaaattatattaaatattaaaattatattgt
ttggtacacacatatttttaccatttagcaaagatgggtacgcatacgta
tatgagataggttgcttgtttatttttacagggaaatgatgctacagaca
cagaccatctttgatgcttttcaaggtactgatatttgattttctactgt
cacctgtgagacatcaaatcaatatgtgtccaaatagttaagcatatgtg
aagaccttcgaactttgtgggaaattcggtctattccta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_120735265_120736409
seq2: B6Ng01-119D04.b_47_1171

seq1  GAATTCAAAGGCAAAGATCTGCTCTTCTATTCAGCCAGCCATGAGATGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGGCAAAGATCTGCTCTTCTATTCAGCCAGCCATGAGATGTC  50

seq1  TACACCATAAGCTCTCGTCATGTGTCACACATGCTGGAAGTGTCCTCTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCATAAGCTCTCGTCATGTGTCACACATGCTGGAAGTGTCCTCTTA  100

seq1  CTTAAAAAAGGAAAAAAAAATCACTAATAAAGCTCCTGTTCCCTGAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAAAAGGAAAAAAAAATCACTAATAAAGCTCCTGTTCCCTGAGAGA  150

seq1  GAGAACTTTAGACATCCCCGGGAAGTATCCTGTTTATAAATAATGTCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTTTAGACATCCCCGGGAAGTATCCTGTTTATAAATAATGTCAGT  200

seq1  TGGACCCATCAAACCAGTCAATTTCCATTTTAGAATGGGAGGCGCCCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCCATCAAACCAGTCAATTTCCATTTTAGAATGGGAGGCGCCCCTT  250

seq1  CTTCCCCTACTTTTACTACAGAGACCCTGAAACCTGGGATGTGTTTGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCCTACTTTTACTACAGAGACCCTGAAACCTGGGATGTGTTTGTCC  300

seq1  CTGCATACTGGAACAAAGGCCCAAGAAACCTAAGGCAGCTGTCAGACAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATACTGGAACAAAGGCCCAAGAAACCTAAGGCAGCTGTCAGACAAT  350

seq1  GCCAAGTGTATGTATACCATGCCAAGGGACACAGTCCTGGAGCTATAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTGTATGTATACCATGCCAAGGGACACAGTCCTGGAGCTATAGAG  400

seq1  ACCAGGCTCGCTCTGCAGGGGCTACGTCACCGATGAACTTCACCTGTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCTCGCTCTGCAGGGGCTACGTCACCGATGAACTTCACCTGTTCT  450

seq1  GCAGTTTCCTCATGAACTGACCCTACTACTGCTAACTAGCATATTCTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTTCCTCATGAACTGACCCTACTACTGCTAACTAGCATATTCTTTC  500

seq1  CACTTGGATGGATTCAGTGTCTTCCGGCTCAGAGATTACAGCATAGTTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGATGGATTCAGTGTCTTCCGGCTCAGAGATTACAGCATAGTTGC  550

seq1  ATTACTCTCTTTCAGCACTGTCGTGGCCAAGAACAACATGATACTCCGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTCTCTTTCAGCACTGTCGTGGCCAAGAACAACATGATACTCCGAG  600

seq1  GACAGCTCCACCCCCTGAGAGCTGACCTTTCAGACTCCCAAGCCTCCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTCCACCCCCTGAGAGCTGACCTTTCAGACTCCCAAGCCTCCCAA  650

seq1  ACTGGGAGGGAGGAGGTGTCAGCCTAGCTCTTTGTAGTCACACTTAGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAGGGAGGAGGTGTCAGCCTAGCTCTTTGTAGTCACACTTAGGGT  700

seq1  GGCCATGCTGCCCCACGGACTAGAATTTTAGTGATGTGACCGACAAGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATGCTGCCCCACGGACTAGAATTTTAGTGATGTGACCGACAAGCCC  750

seq1  TTTTTCTCACAACCTGAGGCTGAATATCCACACTGGGGATTATGCCTTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTCACAACCTGAGGCTGAATATCCACACTGGGGATTATGCCTTAG  800

seq1  AGCGGATGAAATAGCTCCAGCGGGCGAAGGATAAGAAAATGCTTCCAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGATGAAATAGCTCCAGCGGGCGAAGGATAAGAAAATGCTTCCAAGG  850

seq1  CCTTAGCCTCTTTAAAGCCAGAACGTCAGCTTTCTGCTTGTTTTCTTTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGCCTCTTTAAAGCCAGAACGTCAGCTTTCTGCTTGTTTTCTTTTC  900

seq1  CCTTAAAGTATTATCATCTTCCAGGACATTTCTTTTAAAAACCAGGATAG  950
      |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||
seq2  CCTT-AAGTATTATCATCTTCCA-GACATTTCTTT--AAAACCAGGATAG  946

seq1  TGCATCTGGCTTTTGACTGAGAGCGTTATTAGCTGCTTAAGTCACATGAA  1000
      |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  TGCATCTGGC-TTTGACTGAGAGCGTTA-TAGCTGCTT-AGTCACATGAA  993

seq1  TAACCCAGCGTTGGGAAGAGGGCCCAGTGGGTGAAGTGCTTCCTGAGCCA  1050
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TAACCCAGCG-TGGGAAGA-GGCCCAGTGGGTGAAGTGCTT-CTGAG-CA  1039

seq1  GAAGGAGGGTCTGAGTTATTCCCAGCAACCATGTATAAAAGTCAGGTGTG  1100
      | |||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||
seq2  G-AGGA-GGTCTGAG-TATTCCCAGCA--CATGTAT-AAAGTCAGGTGTG  1083

seq1  ATAAACATGTATAATCCTAACACGGGGGGTGGTGGAAACGGGAAT  1145
      ||||||||||||||||   ||||||||||||| |  |||||||||
seq2  ATAAACATGTATAATC--TACACGGGGGGTGG-GTGAACGGGAAT  1125

seq1: chr14_120867944_120869093
seq2: B6Ng01-119D04.g_67_1205 (reverse)

seq1  TAGGATTAGACAGAATTT-CCACAAAGTTCTGAAATGTTCCTACATATGC  49
      ||||| ||||| |||||| |||||||||||  |  | |||  ||||||||
seq2  TAGGAATAGACCGAATTTCCCACAAAGTTCGAAGGTCTTC--ACATATGC  48

seq1  TTTAACTATTTTGAACCACATATTGATTTGATGTTCTCAACAGTGACAGT  99
       |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||| 
seq2  -TTAACTATTTGGA--CACATATTGATTTGATG-TCTCACAGGTGACAG-  93

seq1  TAGAAAATCAAAATATCAGTAACTTTGAAAAGCATCAAAGATGGTCTGTG  149
      ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAATC-AAATATCAGT-ACCTTGAAAAGCATCAAAGATGGTCTGTG  141

seq1  TTCTGTAGCATCATTTCCCTGTAAAAATAAACAAGCAACCTATCTCATTA  199
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  -TCTGTAGCATCATTTCCCTGTAAAAATAAACAAGCAACCTATCTCAT--  188

seq1  TTACGTATGCGTACCCATCTTTGCTAAATGGTAAAAATATGTGTGTACCA  249
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGTATGCGTACCCATCTTTGCTAAATGGTAAAAATATGTGTGTACCA  238

seq1  AACAATATAATTTTAATATTTAATATAATTTAATATATAATTTGACATAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATATAATTTTAATATTTAATATAATTTAATATATAATTTGACATAT  288

seq1  TTAATTTAATTTAATTTAATATTTAATATAATTTATCAATAAATATCTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTAATTTAATTTAATATTTAATATAATTTATCAATAAATATCTGA  338

seq1  TTTAGAGACCCATGCTATATATCTATTCAAAACTCTGCCCCACAATCCAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAGACCCATGCTATATATCTATTCAAAACTCTGCCCCACAATCCAA  388

seq1  GGCCCTACATGGAGCTCAGTGTTCCAGGAAGTCAGCTACTCAGGAACTGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTACATGGAGCTCAGTGTTCCAGGAAGTCAGCTACTCAGGAACTGC  438

seq1  AGAAAACAAGTCGTTGACCTACACCCAGACAACAACAGATCCTGAATTTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACAAGTCGTTGACCTACACCCAGACAACAACAGATCCTGAATTTC  488

seq1  ATGAACAACTGTCTAAGGGAAACAGCCAGCTCGCCTAGTCAGCTCTAACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACAACTGTCTAAGGGAAACAGCCAGCTCGCCTAGTCAGCTCTAACT  538

seq1  TGCCCAGTCGGCTCTAGTGGGACCCTTCCCTAGCCTTAGCTACAGAACCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGTCGGCTCTAGTGGGACCCTTCCCTAGCCTTAGCTACAGAACCC  588

seq1  CCACCAAGAAGCATGCGACCCGTGTTCCCTCACACTCTGGTCACTGTGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAAGAAGCATGCGACCCGTGTTCCCTCACACTCTGGTCACTGTGTT  638

seq1  TCTGGGTCCTGTGCCCTCATCACGGTGTGGCCAGAACTTGACACATCACC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGTCCTGTGCCCTCATCACGGTGTGGCCAGAACTTGACACATCACC  688

seq1  TCTTTGGCATTAAGCCAAACTGCGGTAGCCGCTGAGGTCGTGTAAAGTCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGCATTAAGCCAAACTGCGGTAGCCGCTGAGGTCGTGTAAAGTCC  738

seq1  CATCTTTTATATCTTCCCACAGACTTTCTTCTCACATATTCTTATACCTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTTATATCTTCCCACAGACTTTCTTCTCACATATTCTTATACCTA  788

seq1  TACACTCAGATTTGTTTCTAAGGGGCTTGCGAGCTTAAGAAGAAGTGCTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTCAGATTTGTTTCTAAGGGGCTTGCGAGCTTAAGAAGAAGTGCTA  838

seq1  CCAGGCAGCTGTCTGGCTGTGTCGCATCCTGAGTCACCGCATCCTGTCCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAGCTGTCTGGCTGTGTCGCATCCTGAGTCACCGCATCCTGTCCA  888

seq1  GGATTCTTCTGCGAGTCTGGCAGCTTCTGCGGCTACTCCCTAGAAGGGGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCTTCTGCGAGTCTGGCAGCTTCTGCGGCTACTCCCTAGAAGGGGG  938

seq1  CAAATGTCAAGGTGGGGTGACTCAACACACAGCAGTTAAAAGCTACCACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTCAAGGTGGGGTGACTCAACACACAGCAGTTAAAAGCTACCACC  988

seq1  AGGTTTTTAAATTTTAATATACACTACTTTTTAAAATTTGTTCATTTTTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTTTAAATTTTAATATACACTACTTTTTAAAATTTGTTCATTTTTA  1038

seq1  TTTGTCCATGGTATGGAATACCATGAAGCTTGTGTGAGAGTCAAAGGACA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCCATGGTATGGAATACCATGAAGCTTGTGTGAGAGTCAAAGGACA  1088

seq1  GCCTGTGGGAATCCTTTCTATTCTGCCCTTCAGGTCCTGGGAACTGAATT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGGGAATCCTTTCTATTCTGCCCTTCAGGTCCTGGGAACTGAATT  1138

seq1  C  1150
      |
seq2  C  1139