BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121A24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 99,766,329 - 99,891,356
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043789, LOC668671
Upstream geneLOC635593, LOC619716, LOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400
Downstream geneLOC668672, EG546623, Klf12, LOC100043413
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121A24.bB6Ng01-121A24.g
ACCDH924843DH924844
length1,116788
definitionDH924843|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121A24, 5' end.DH924844|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121A24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,766,329 - 99,767,457)(99,890,719 - 99,891,356)
sequence
gaattcattccctttagcagggagctgagggctggagaccgtttatctgt
ccactcctgtgttgtagccctgtgtgtggctttatgcttggctaagtgcc
tgtcatgtgtgttggttgccggtacaacagcttggctcatttagtaaagt
aaggagcccggtttttctttgagatagcagccggtaatattccactggag
cccgcagagctgcggaccttcagatgtgctctgtccagggtcccctgcac
tggttttccagcttggggtcatgacttgtcccttgctttggttcctttgt
catttgcttggggttccactgtgtagctgaggtgggcttcaaacttgcca
tcttccagcctctgtctcctcggtgttgtggttacaagtcccctgtcgtg
tttggtgacccagttcagaaaacggttacttctttctccatccttctccg
cacatccgattcttcctcttacctctgtcacaacacatgcagtcaccaag
aactatgactttctcttttctgaggttttttttttttcttcccagccttg
attttcctcaagtttgaattcctgttcccgtatccctgacaataaccccc
ctgcttttctcagtcctgctcctctctaatccatcttaagtaaacgccag
agcaggcttccctgacgctttgcctaattgaattgtatttccttgcacaa
acatctccaataactccccgtggcctgaaagatctcactcaaattccaca
ggctggcatttgaaagcttttgtcaatttggttctggtgacttcctggcc
ttgagtgagcttttagatctgtcaaccccgcaggaaagactctttctcct
ctcgctctgcgccgcgcatcccaggtgccttctagtgctccggtggacaa
gcactttctcccacgacacgtaaaactcattttcgacaaagagtgactgt
ctttaaatggataaaagatcacggagtgaaaatgcatggggttggagaga
caagtcagtgttaggagcccacgctgctctggcagagagctgtgctggat
cctgaccgcccgtgtggccctcacaactgtctgtacttcaggcgtggatt
caagggcagctgccct
gaattcccagccaatgaaagaacctgcatccaaaacaaaacaaaacaaaa
aacaaataagccaaaaaccaatgtgactggactagagagatggctcagct
taagagcacaggctgctcttccagaggaccaggctcaattcccagcatcc
tcataaaagctcacaatcatctgtaactccagtcctggaagatgcaaaac
cctctcctggcatccacgggcaccaggcatgcccatgatgaacatatgca
tacacgcagacaagaacatccgcgcataaaacaaataaacaaaaaagtta
atcaccaaacaaccagccatcagtgtgtggagctagaaagatggctctgt
cagaaaagtgccagtcctggaaagcccaaggacgttccatcccctctcta
catttcctttaaacagaagccaggtgcagatacagatgcctgcagtgcca
gctctgaggtggcagaggcagaaacattcttgggtttgccagatcctcaa
gttccagttttactgaacaccagtatcttaaaaaagaaaagaaaaattga
agaaggttggagagcaattgagttaaacacccagtgttgatttctggctg
ttacacatgtacacacatgtgtacctgcacactcactcatgcatacacac
atacatacacaaagtcaaggtgaatggtgtttgaatagtcacagttaaag
ttgccttctgacctttatacaaagcacatacatttgcctgcgtacaacag
cacatacatacatcctcatacacacgggggtggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_99766329_99767457
seq2: B6Ng01-121A24.b_48_1163

seq1  GAATTCATTCCCTTTAGCAGGGAGCTGAGGGCTGGAGACCGTTTATCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCCCTTTAGCAGGGAGCTGAGGGCTGGAGACCGTTTATCTGT  50

seq1  CCACTCCTGTGTTGTAGCCCTGTGTGTGGCTTTATGCTTGGCTAAGTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCTGTGTTGTAGCCCTGTGTGTGGCTTTATGCTTGGCTAAGTGCC  100

seq1  TGTCATGTGTGTTGGTTGCCGGTACAACAGCTTGGCTCATTTAGTAAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATGTGTGTTGGTTGCCGGTACAACAGCTTGGCTCATTTAGTAAAGT  150

seq1  AAGGAGCCCGGTTTTTCTTTGAGATAGCAGCCGGTAATATTCCACTGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGCCCGGTTTTTCTTTGAGATAGCAGCCGGTAATATTCCACTGGAG  200

seq1  CCCGCAGAGCTGCGGACCTTCAGATGTGCTCTGTCCAGGGTCCCCTGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCAGAGCTGCGGACCTTCAGATGTGCTCTGTCCAGGGTCCCCTGCAC  250

seq1  TGGTTTTCCAGCTTGGGGTCATGACTTGTCCCTTGCTTTGGTTCCTTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTCCAGCTTGGGGTCATGACTTGTCCCTTGCTTTGGTTCCTTTGT  300

seq1  CATTTGCTTGGGGTTCCACTGTGTAGCTGAGGTGGGCTTCAAACTTGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCTTGGGGTTCCACTGTGTAGCTGAGGTGGGCTTCAAACTTGCCA  350

seq1  TCTTCCAGCCTCTGTCTCCTCGGTGTTGTGGTTACAAGTCCCCTGTCGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAGCCTCTGTCTCCTCGGTGTTGTGGTTACAAGTCCCCTGTCGTG  400

seq1  TTTGGTGACCCAGTTCAGAAAACGGTTACTTCTTTCTCCATCCTTCTCCG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTGACCCAGTTCAGAAAACGGTTACTTCTTTCTCCATCCTTCTCCG  450

seq1  CACATCCGATTCTTCCTCTTACCTCTGTCACAACACATGCAGTCACCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCCGATTCTTCCTCTTACCTCTGTCACAACACATGCAGTCACCAAG  500

seq1  AACTATGACTTTCTCTTTTCTGAGGTTTTTTTTTTTTCTTCCCAGCCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATGACTTTCTCTTTTCTGAGGTTTTTTTTTTTTCTTCCCAGCCTTG  550

seq1  ATTTTCCTCAAGTTTGAATTCCTGTTCCCGTATCCCTGACAATAACCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTCAAGTTTGAATTCCTGTTCCCGTATCCCTGACAATAACCCCC  600

seq1  CTGCTTTTCTCAGTCCTGCTCCTCTCTAATCCATCTTAAGTAAACGCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTTCTCAGTCCTGCTCCTCTCTAATCCATCTTAAGTAAACGCCAG  650

seq1  AGCAGGCTTCCCTGACGCTTTGCCTAATTGAATTGTATTTCCTTGCACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCTTCCCTGACGCTTTGCCTAATTGAATTGTATTTCCTTGCACAA  700

seq1  ACATCTCCAATAACTCCCCGTGGCCTGAAAGATCTCACTCAAATTCCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTCCAATAACTCCCCGTGGCCTGAAAGATCTCACTCAAATTCCACA  750

seq1  GGCTGGCATTTGAAAGCTTTTGTCAATTTGGTTCTGGTGACTTCCTGGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGCATTTGAAAGCTTTTGTCAATTTGGTTCTGGTGACTTCCTGGCC  800

seq1  TTGAGTGAGCTTTTAGATCTGTCAACCCCGCAGGAAAGACTCTTTCTCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTGAGCTTTTAGATCTGTCAACCCCGCAGGAAAGACTCTTTCTCCT  850

seq1  CTCGCTCTGCGCCGCGCATCCCAGGTGCCTTCTAGTGCTCCGGTGGACAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCTCTGCGCCGCGCATCCCAGGTGCCTTCTAGTGCTCCGGTGGACAA  900

seq1  GCACTTTCTCCCACGAACACGTAAAAACTCATTTTCGACAAAGAGTGACT  950
      ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTTCTCCCACG-ACACGT-AAAACTCATTTTCGACAAAGAGTGACT  948

seq1  GTCTTTAAAATGGAATAAAAGAATCACGGAGTGAAAAATGCCATGGGGTT  1000
      |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  GTCTTT-AAATGG-ATAAAAG-ATCACGGAGTG-AAAATG-CATGGGGTT  993

seq1  GGAGAGACAAGTCAGTGGTTAGGAGCACACGCTGCTCTGGCAGAGAGCTG  1050
      |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGACAAGTCAGT-GTTAGGAGCCCACGCTGCTCTGGCAGAGAGCTG  1042

seq1  TGCTGGATTCCTGA-CGCCCGTGTTGGGCCCCTCACAACTGTCTGTAACT  1099
      ||||||| |||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |||
seq2  TGCTGGA-TCCTGACCGCCCGTGT---GGCCCTCACAACTGTCTGT-ACT  1087

seq1  CCAGCTGTGGAATCCAAGGGCAGCTGCCCT  1129
       |||  |||| || ||||||||||||||||
seq2  TCAGGCGTGG-ATTCAAGGGCAGCTGCCCT  1116

seq1: chr14_99890719_99891356
seq2: B6Ng01-121A24.g_214_852 (reverse)

seq1  CCCCCCCACCCCCGTGTGTATGAGGATGTATGTATGTGCTGTTGTACGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCACCCCCGTGTGTATGAGGATGTATGTATGTGCTGTTGTACGCA  50

seq1  GGCAAATGTATGTGC-TTGTATAAAGGTCAGAAGGCAACCTTAACTGTGA  99
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGCAAATGTATGTGCTTTGTATAAAGGTCAGAAGGCAACTTTAACTGTGA  100

seq1  CTATTCAAACACCATTCACCTTGACTTTGTGTATGTATGTGTGTATGCAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCAAACACCATTCACCTTGACTTTGTGTATGTATGTGTGTATGCAT  150

seq1  GAGTGAGTGTGCAGGTACACATGTGTGTACATGTGTAACAGCCAGAAATC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAGTGTGCAGGTACACATGTGTGTACATGTGTAACAGCCAGAAATC  200

seq1  AACACTGGGTGTTTAACTCAATTGCTCTCCAACCTTCTTCAATTTTTCTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGGGTGTTTAACTCAATTGCTCTCCAACCTTCTTCAATTTTTCTT  250

seq1  TTCTTTTTTAAGATACTGGTGTTCAGTAAAACTGGAACTTGAGGATCTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTTTAAGATACTGGTGTTCAGTAAAACTGGAACTTGAGGATCTGG  300

seq1  CAAACCCAAGAATGTTTCTGCCTCTGCCACCTCAGAGCTGGCACTGCAGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCAAGAATGTTTCTGCCTCTGCCACCTCAGAGCTGGCACTGCAGG  350

seq1  CATCTGTATCTGCACCTGGCTTCTGTTTAAAGGAAATGTAGAGAGGGGAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTATCTGCACCTGGCTTCTGTTTAAAGGAAATGTAGAGAGGGGAT  400

seq1  GGAACGTCCTTGGGCTTTCCAGGACTGGCACTTTTCTGACAGAGCCATCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACGTCCTTGGGCTTTCCAGGACTGGCACTTTTCTGACAGAGCCATCT  450

seq1  TTCTAGCTCCACACACTGATGGCTGGTTGTTTGGTGATTAACTTTTTTGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCTCCACACACTGATGGCTGGTTGTTTGGTGATTAACTTTTTTGT  500

seq1  TTATTTGTTTTATGCGCGGATGTTCTTGTCTGCGTGTATGCATATGTTCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGTTTTATGCGCGGATGTTCTTGTCTGCGTGTATGCATATGTTCA  550

seq1  TCATGGGCATGCCTGGTGCCCGTGGATGCCAGGAGAGGGTTTTGCATCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGGCATGCCTGGTGCCCGTGGATGCCAGGAGAGGGTTTTGCATCTT  600

seq1  CCAGGACTGGAGTTACAGATGATTGTGAGCTTTTATGAG  638
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACTGGAGTTACAGATGATTGTGAGCTTTTATGAG  639