BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129D20
Chromosome14 (Build37)
Map Location 81,784,697 - 81,836,183
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC672828, LOC639207
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129D20.bB6Ng01-129D20.g
ACCDH930878DH930879
length1,149490
definitionDH930878|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129D20, 5' end.DH930879|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129D20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,835,020 - 81,836,183)(81,784,697 - 81,785,192)
sequence
gaattctcaaatgaatgaggcacttctgaaagaagttacattttatgtga
ccagttatctttcctggcagtgtattactgtgtatttccctgatcaatcc
ttaatctggaaatacttttacatatcatttactctgatgtcgtctattta
cgacatctcattctatctttacttcattcccttgagcgagatacactgta
cattcctgtaacagttgaaaccacgtttgtcaaaatctttctgatcaatc
acactcatgctggttgcattgtggtacaagtacaacagagtgccggctgg
tttggctgaaaatctatggatctgaaagtccagaaagcctctcaaacaac
gataacatttgcactaggattagcaaccacagattcagctggtgagagac
tgtaccacttcccccagaacctgcaagcagtttgcttccccctatttgtc
ctgtacttagacttgacctaagtcatcaaatcaactcttctaatatcatt
tatcatgctctgttgtcagcctgcttgtcttttgctactactactgtgca
ccaggcttagttgtttgagtactacttcattacccactgactccagaatt
ctaggaactaacaactgcacagttgatgttttttctcctgcctgtatagt
tcatcctcattttattatcatatgatgaaaactaaattgaaaattggtca
agacatttgaatgacatacctgagactaacatgtttaaatagtgtacctg
agtctaagcatgtgccatgttttaccttatattaacaatgttaaaaacac
tatgtctgccatcataggcaaagcacagcaagcggcaattttgacatagt
tttgattacacttcagctctaagaaatcttgttacttgtattaattttct
cccttagccttttaaagcatattttgaactcttgacagtacttttgtaat
gtatttccatgactatgtttgataagtcatgtttgataaattgctcatat
cattttaacaaaaaccacagaatttacctgaaaatatgtcaagaggtgtg
tctaagttttgtttgaagaaataaagacctagaaaaagttggacatttac
gctgatggctcgtagcataatctggctgtaatcgtacatttagcattta
aggttttaaagaaaacccagtcaggaaatagcctctgcaaaactcaacct
gagttttatcttctggaactatgacatgtcttacaataaatatttgagaa
atatcctctacttatctggatgaggatagagtcatgaaatgactccatgg
agtctaaaatagacatcaaaactttactcttttttctattgagaattcta
tcatgtatataacgtgttcgatgaaatccatccttcattgattcctctct
caattgctcttatatttatcctactaaaattttacctcatatcttaatgt
ttgttctatatgtctctgtctctctgtgagtatatctgtgtgtgtgtgtg
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagctag
aaggaggatgaatggagaaccatatatctcctggagtatgggaaacactt
caagggttgcatttcggaacaaaacttactctacgtcccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_81835020_81836183
seq2: B6Ng01-129D20.b_48_1196 (reverse)

seq1  TAAATGCTAAATGTACGATTTTACAGCAGAATAATGCTACGAAGCCCATC  50
      ||||||||||||||||||  |||||||   || |||||||||   |||||
seq2  TAAATGCTAAATGTACGA--TTACAGCCAGATTATGCTACGA--GCCATC  46

seq1  AGCGTTAAATGTTCCAACTTTTTCTAGGTCTTTATTTCTTCAAAAACAAA  100
      |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||
seq2  AGCG-TAAATG-TCCAACTTTTTCTAGGTCTTTATTTCTTCAAA---CAA  91

seq1  AACTTAGAACAACACCTCTTGACATAATTTTCAGGTAAAATCTGTGGTTT  150
      ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
seq2  AACTTAGA--CACACCTCTTGACAT-ATTTTCAGGTAAATTCTGTGGTTT  138

seq1  TTGTTAAAATGATTATGAGCAATTTATCAAACAATGACTTATTCAAACAT  200
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
seq2  TTGTTAAAATGA-TATGAGCAATTTATCAAAC-ATGACTTA-TCAAACAT  185

seq1  AGTCATGGAAATACATTACAAAAGTACTGTCAAGAGTTCAAAATATGCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATGGAAATACATTACAAAAGTACTGTCAAGAGTTCAAAATATGCTT  235

seq1  TAAAAGGCTAAGGGAGAAAATTAATACAAGTAACAAGATTTCTTAGAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGCTAAGGGAGAAAATTAATACAAGTAACAAGATTTCTTAGAGCT  285

seq1  GAAGTGTAATCAAAACTATGTCAAAATTGCCGCTTGCTGTGCTTTGCCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTAATCAAAACTATGTCAAAATTGCCGCTTGCTGTGCTTTGCCTA  335

seq1  TGATGGCAGACATAGTGTTTTTAACATTGTTAATATAAGGTAAAACATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGCAGACATAGTGTTTTTAACATTGTTAATATAAGGTAAAACATGG  385

seq1  CACATGCTTAGACTCAGGTACACTATTTAAACATGTTAGTCTCAGGTATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCTTAGACTCAGGTACACTATTTAAACATGTTAGTCTCAGGTATG  435

seq1  TCATTCAAATGTCTTGACCAATTTTCAATTTAGTTTTCATCATATGATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCAAATGTCTTGACCAATTTTCAATTTAGTTTTCATCATATGATAA  485

seq1  TAAAATGAGGATGAACTATACAGGCAGGAGAAAAAACATCAACTGTGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGAGGATGAACTATACAGGCAGGAGAAAAAACATCAACTGTGCAG  535

seq1  TTGTTAGTTCCTAGAATTCTGGAGTCAGTGGGTAATGAAGTAGTACTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAGTTCCTAGAATTCTGGAGTCAGTGGGTAATGAAGTAGTACTCAA  585

seq1  ACAACTAAGCCTGGTGCACAGTAGTAGTAGCAAAAGACAAGCAGGCTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTAAGCCTGGTGCACAGTAGTAGTAGCAAAAGACAAGCAGGCTGAC  635

seq1  AACAGAGCATGATAAATGATATTAGAAGAGTTGATTTGATGACTTAGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGCATGATAAATGATATTAGAAGAGTTGATTTGATGACTTAGGTC  685

seq1  AAGTCTAAGTACAGGACAAATAGGGGGAAGCAAACTGCTTGCAGGTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTAAGTACAGGACAAATAGGGGGAAGCAAACTGCTTGCAGGTTCTG  735

seq1  GGGGAAGTGGTACAGTCTCTCACCAGCTGAATCTGTGGTTGCTAATCCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGTGGTACAGTCTCTCACCAGCTGAATCTGTGGTTGCTAATCCTA  785

seq1  GTGCAAATGTTATCGTTGTTTGAGAGGCTTTCTGGACTTTCAGATCCATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAAATGTTATCGTTGTTTGAGAGGCTTTCTGGACTTTCAGATCCATA  835

seq1  GATTTTCAGCCAAACCAGCCGGCACTCTGTTGTACTTGTACCACAATGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCAGCCAAACCAGCCGGCACTCTGTTGTACTTGTACCACAATGCA  885

seq1  ACCAGCATGAGTGTGATTGATCAGAAAGATTTTGACAAACGTGGTTTCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCATGAGTGTGATTGATCAGAAAGATTTTGACAAACGTGGTTTCAA  935

seq1  CTGTTACAGGAATGTACAGTGTATCTCGCTCAAGGGAATGAAGTAAAGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTACAGGAATGTACAGTGTATCTCGCTCAAGGGAATGAAGTAAAGAT  985

seq1  AGAATGAGATGTCGTAAATAGACGACATCAGAGTAAATGATATGTAAAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGAGATGTCGTAAATAGACGACATCAGAGTAAATGATATGTAAAAG  1035

seq1  TATTTCCAGATTAAGGATTGATCAGGGAAATACACAGTAATACACTGCCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCAGATTAAGGATTGATCAGGGAAATACACAGTAATACACTGCCA  1085

seq1  GGAAAGATAACTGGTCACATAAAATGTAACTTCTTTCAGAAGTGCCTCAT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGATAACTGGTCACATAAAATGTAACTTCTTTCAGAAGTGCCTCAT  1135

seq1  TCATTTGAGAATTC  1164
      ||||||||||||||
seq2  TCATTTGAGAATTC  1149

seq1: chr14_81784697_81785192
seq2: B6Ng01-129D20.g_66_561

seq1  GAATTCAGGTTTTAAAGAAAACCCAGTCAGGAAATAGCCTCTGCAAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGTTTTAAAGAAAACCCAGTCAGGAAATAGCCTCTGCAAAACT  50

seq1  CAACCTGAGTTTTATCTTCTGGAACTATGACATGTCTTACAATAAATATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTGAGTTTTATCTTCTGGAACTATGACATGTCTTACAATAAATATT  100

seq1  TGAGAAATATCCTCTACTTATCTGGATGAGGATAGAGTCATGAAATGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATATCCTCTACTTATCTGGATGAGGATAGAGTCATGAAATGACT  150

seq1  CCATGGAGTCTAAAATAGACATCAAAACTTTACTCTTTTTTCTATTGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGAGTCTAAAATAGACATCAAAACTTTACTCTTTTTTCTATTGAGA  200

seq1  ATTCTATCATGTATATAACGTGTTCGATGAAATCCATCCTTCATTGATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATCATGTATATAACGTGTTCGATGAAATCCATCCTTCATTGATTC  250

seq1  CTCTCTCAATTGCTCTTATATTTATCCTACTAAAATTTTACCTCATATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCAATTGCTCTTATATTTATCCTACTAAAATTTTACCTCATATCT  300

seq1  TAATGTTTGTTCTATATGTCTCTGTCTCTCTGTGAGTATATCTGTGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTTTGTTCTATATGTCTCTGTCTCTCTGTGAGTATATCTGTGTGTG  350

seq1  TGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  400

seq1  AGCTAGAAGGAGGATGAATGGAGAACCATATATCTCCTGGAGTATGGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAAGGAGGATGAATGGAGAACCATATATCTCCTGGAGTATGGGAA  450

seq1  ACACTTCAAGGGTTGCATTTCGGAACAAAACTTACTCTACGTCCCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTCAAGGGTTGCATTTCGGAACAAAACTTACTCTACGTCCCC  496