BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130K19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 81,664,993 - 81,775,580
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC639207
Upstream geneLOC672828
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130K19.bB6Ng01-130K19.g
ACCDH931930DH931931
length1,1601,141
definitionDH931930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130K19, 5' end.DH931931|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130K19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,664,993 - 81,666,171)(81,774,442 - 81,775,580)
sequence
gaattcatggtcaagtttagctacttaagaaactggaggatagttcatac
cttcatgacattgcttattaaatttagagacaaatatacacaatgatgct
aaaactctgaaacaaattatcaaaacactctttaaaataaactatcgatg
cacaaatacaaactcatatatatgaattccttttacattcatttattttt
tctctgtttttcaattttttattagatattttcttcatttacatttcaaa
tgctataccgaaagtcctctataccctcgcccctgacctgttcccctacc
caaccactcccacttcttggccctggcgttctcctgtactggggcatcca
cttctgtatataagtatatatgtcttttgaaatttaaaatttaaaattaa
tctacagtcatctattggatggaacacagggcctctaatggaggagctag
agaaagtatccaaggagctgaaggggtctgcaaccctatgggtagaacaa
ccatatgaactatccagtaccaccagagctcgtgtctctagctgcatatg
tagcagaagatggcctagtcagctatcactgggaaaagaggccccttggt
cttgcaagcttcatataccccagtacaggggaatgccagggcccagaagt
ggccctcaatctcacagtgatggtaaaatttctgtatacttgtatacatg
tttaattatgggcatgtttgaagagtgggcacagcaagtgtgtgagagct
tacagatgatgaagatgttcaatctcctgcatctggatgtacaataggtt
gtgaacctactaataacagaactcgggttctcttccaaaacaatatattc
tcttaaccaccagccaactctccctttatgattttcttctcatccattta
actagtcagttttaagccatgcaaaactttagtgcccaaacctatccttc
actggcaatctcataatttattgtattctagcttttttcttttcatttac
aagtggatatttcatgacttatgtcattgcatctgccaaagacagaaatc
agccttcctgatgttcctgcccacagtacactgatggacatattctcttt
ctgctaagggaattcctctattaagcttgatggtctgccattgtcaccag
cttgatgtgg
gaattcctgacctctggtttatacttttataagagccagaaggaggttat
tttcaagtaccttctgttttaggccctgaaaggcccctgaggcacaaaaa
cacaaaaggcttcttagaacagaaggaaaaaacgcagagcacaaaacaca
ttgaactctcattctttctgatcgctcctcagtggagtaaagaaaacaca
aatgaattttccaataaatgatcctgccacacagtgtttgtgaagttcca
tgctttcggctcttctttgccatgcatgtgactgcttgttaataattcac
caggagagagactcactacccacttctcttctgttttgtactttttaaca
aagttaggacactatgctctttatttcaagttgtgagatttcagttataa
aaaggacactttatcccatgaaagtcaatgtgaaatgtgtttaaatgtcc
tcaaatcctccagtgaaattagcgagataaataacaatgctcttcaagaa
cagttgacacttgagcttgtgggattcttaaaatgtctcttaccttgttt
aatctaactggaattcctcatactcttttccactaatatgctctgtagta
tcattacaatgtacactagctaaagagaaaggtaccttgtgggaagaagt
gagagaagttccctaatttatcttccccattacttaatctaatgtcactt
aatgtttctaagattgacaactcttactaccacttccaattcaaaattgt
tcaattattctctatgatataatatcataatttctataaaaatgattgta
tcactatatgtatttaccttatgtttgtttgcctaagccaaaattccttt
actgcatgtgtcattgatatttacagaagaatgcttaaaaggttcagaca
ggaaggaaatggagttcttttatctaagctgcccattcataagctgataa
gtctcacaattcagattcataacaacataacagatcctgaactagaggat
tgaaacttatccattgtcctctattaaaaatcaatccttaaattattaat
catgcctttaatactggccactcactcattacatacgtattcaaataaac
agcaaatggtatatatatgaaaggggccctacctgagattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_81664993_81666171
seq2: B6Ng01-130K19.b_48_1207

seq1  GAATTCATGGTCAAGTTTAGCTACTTAAGAAACTGGAGGATAGTTCATAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGTCAAGTTTAGCTACTTAAGAAACTGGAGGATAGTTCATAC  50

seq1  CTTCATGACATTGCTTATTAAATTTAGAGACAAATATACACAATGATGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGACATTGCTTATTAAATTTAGAGACAAATATACACAATGATGCT  100

seq1  AAAACTCTGAAACAAATTATCAAAACACTCTTTAAAATAAACTATCGATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCTGAAACAAATTATCAAAACACTCTTTAAAATAAACTATCGATG  150

seq1  CACAAATACAAACTCATATATATGAATTCCTTTTACATTCATTTATTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATACAAACTCATATATATGAATTCCTTTTACATTCATTTATTTTT  200

seq1  TCTCTGTTTTTCAATTTTTTATTAGATATTTTCTTCATTTACATTTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTTTTTCAATTTTTTATTAGATATTTTCTTCATTTACATTTCAAA  250

seq1  TGCTATACCGAAAGTCCTCTATACCCTCGCCCCTGACCTGTTCCCCTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATACCGAAAGTCCTCTATACCCTCGCCCCTGACCTGTTCCCCTACC  300

seq1  CAACCACTCCCACTTCTTGGCCCTGGCGTTCTCCTGTACTGGGGCATCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCACTCCCACTTCTTGGCCCTGGCGTTCTCCTGTACTGGGGCATCCA  350

seq1  CTTCTGTATATAAGTATATATGTCTTTTGAAATTTAAAATTTAAAATTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGTATATAAGTATATATGTCTTTTGAAATTTAAAATTTAAAATTAA  400

seq1  TCTACAGTCATCTATTGGATGGAACACAGGGCCTCTAATGGAGGAGCTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACAGTCATCTATTGGATGGAACACAGGGCCTCTAATGGAGGAGCTAG  450

seq1  AGAAAGTATCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATGGGTAGAACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTATCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATGGGTAGAACAA  500

seq1  CCATATGAACTATCCAGTACCACCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATGAACTATCCAGTACCACCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATG  550

seq1  TAGCAGAAGATGGCCTAGTCAGCTATCACTGGGAAAAGAGGCCCCTTGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGAAGATGGCCTAGTCAGCTATCACTGGGAAAAGAGGCCCCTTGGT  600

seq1  CTTGCAAGCTTCATATACCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCCAGAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAAGCTTCATATACCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCCAGAAGT  650

seq1  GGCCCTCAATCTCACAGTGATGGTAAAATTTCTGTATACTTGTATACATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTCAATCTCACAGTGATGGTAAAATTTCTGTATACTTGTATACATG  700

seq1  TTTAATTATGGGCATGTTTGAAGAGTGGGCACAGCAAGTGTGTGAGAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTATGGGCATGTTTGAAGAGTGGGCACAGCAAGTGTGTGAGAGCT  750

seq1  TACAGATGATGAAGATGTTCAATCTCCTGCATCTGGATGTACAATAGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATGATGAAGATGTTCAATCTCCTGCATCTGGATGTACAATAGGTT  800

seq1  GTGAACCTACTAATAACAGAACTCGGGTTCTCTTCCAAAACAATATATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACCTACTAATAACAGAACTCGGGTTCTCTTCCAAAACAATATATTC  850

seq1  TCTTAACCACCAGCCAACTCTCCCTTTATGATTTTCTTCTCATCCATTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAACCACCAGCCAACTCTCCCTTTATGATTTTCTTCTCATCCATTTA  900

seq1  ACTAGTCAGTTTTTAAGCCATGCAAAACTTTAGTGCCCAAACCTATCCTT  950
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTCAG-TTTTAAGCCATGCAAAACTTTAGTGCCCAAACCTATCCTT  949

seq1  CACTGGCAATCTCATAATTTAATTGGTATTCTAGCTCTTCTCTTTTCATT  1000
      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |
seq2  CACTGGCAATCTCATAATTTA--TTGTATTCTAGCTTTTTTCTTTTCA-T  996

seq1  TTACAAGTGATAATTTCATGACTTTATGTCATTGCATCTGCCAAAGACAG  1050
      |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGTGGATATTTCATGAC-TTATGTCATTGCATCTGCCAAAGACAG  1045

seq1  ATATCAAGCCCTCCTGAGTGTTTCTGCCCCACCAGTACCACTGAATGGAC  1100
      | ||| |||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||||| ||||||
seq2  AAATC-AGCCTTCCTGA-TGTTCCTGCCC--ACAGTA-CACTG-ATGGAC  1089

seq1  ATATTCTCTTTCTGCTAAAGGGGAAATTTCCCTCTATTAGCTTTGATGTG  1150
      ||||||||||||||||||  |||||   | |||||||||   ||||  ||
seq2  ATATTCTCTTTCTGCTAA--GGGAA---TTCCTCTATTAAGCTTGA--TG  1132

seq1  TTCTGCCATGTGCACACAGCTTGATGTGG  1179
       ||||||||   ||| |||||||||||||
seq2  GTCTGCCATTGTCAC-CAGCTTGATGTGG  1160

seq1: chr14_81774442_81775580
seq2: B6Ng01-130K19.g_68_1208 (reverse)

seq1  CAATCTCAGTGTAGTGCCCCTTT-TCATATATACCATTTGCTGTTTATTT  49
      ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTCAG-GTAGGGCCCCTTTCATATATATACCATTTGCTGTTTATTT  49

seq1  GAATACGTATGTAATGAGTGAGTGG-CAGTATTAAA-GCATGATTAATAA  97
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  GAATACGTATGTAATGAGTGAGTGGCCAGTATTAAAGGCATGATTAATAA  99

seq1  TTTAA-GAATGATTTTAAATAAGAGACAATGGAT-AGTTTCAATCCTCTA  145
      ||||| || ||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTTAAGGATTGATTTTTAATAGAGGACAATGGATAAGTTTCAATCCTCTA  149

seq1  GTTCAGGATCTGTTATGTTGTTATGAATCTGAATTGTGAAGACTTATCAG  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTTCAGGATCTGTTATGTTGTTATGAATCTGAATTGTG-AGACTTATCAG  198

seq1  C-TATGAATGGGCAGCTTAGATAAAAGAAACTCCATTTCCTTCCTGTCTG  244
      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGAATGGGCAGCTTAGATAAAAG-AACTCCATTTCCTTCCTGTCTG  247

seq1  AACCTTTTAAGCATTCTTCTGTAAATATCAATGACACATGCAGTAAAGGA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTTAAGCATTCTTCTGTAAATATCAATGACACATGCAGTAAAGGA  297

seq1  ATTTTGGCTTTAGGCAAACAAACATAAGGTAAATACATATAGTGATACAA  344
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGC-TTAGGCAAACAAACATAAGGTAAATACATATAGTGATACAA  346

seq1  TCATTTTTATAGAAATTATGATATTATATCATAGAGAATAATTGAACAAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTTATAGAAATTATGATATTATATCATAGAGAATAATTGAACAAT  396

seq1  TTTGAATTGGAAGTGGTAGTAAGAGTTGTCAATCTTAGAAACATTAAGTG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTGGAAGTGGTAGTAAGAGTTGTCAATCTTAGAAACATTAAGTG  446

seq1  ACATTAGATTAAGTAATGGGGAAGATAAATTAGGGAACTTCTCTCACTTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAGATTAAGTAATGGGGAAGATAAATTAGGGAACTTCTCTCACTTC  496

seq1  TTCCCACAAGGTACCTTTCTCTTTAGCTAGTGTACATTGTAATGATACTA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACAAGGTACCTTTCTCTTTAGCTAGTGTACATTGTAATGATACTA  546

seq1  CAGAGCATATTAGTGGAAAAGAGTATGAGGAATTCCAGTTAGATTAAACA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCATATTAGTGGAAAAGAGTATGAGGAATTCCAGTTAGATTAAACA  596

seq1  AGGTAAGAGACATTTTAAGAATCCCACAAGCTCAAGTGTCAACTGTTCTT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGAGACATTTTAAGAATCCCACAAGCTCAAGTGTCAACTGTTCTT  646

seq1  GAAGAGCATTGTTATTTATCTCGCTAATTTCACTGGAGGATTTGAGGACA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCATTGTTATTTATCTCGCTAATTTCACTGGAGGATTTGAGGACA  696

seq1  TTTAAACACATTTCACATTGACTTTCATGGGATAAAGTGTCCTTTTTATA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACACATTTCACATTGACTTTCATGGGATAAAGTGTCCTTTTTATA  746

seq1  ACTGAAATCTCACAACTTGAAATAAAGAGCATAGTGTCCTAACTTTGTTA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAATCTCACAACTTGAAATAAAGAGCATAGTGTCCTAACTTTGTTA  796

seq1  AAAAGTACAAAACAGAAGAGAAGTGGGTAGTGAGTCTCTCTCCTGGTGAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTACAAAACAGAAGAGAAGTGGGTAGTGAGTCTCTCTCCTGGTGAA  846

seq1  TTATTAACAAGCAGTCACATGCATGGCAAAGAAGAGCCGAAAGCATGGAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAACAAGCAGTCACATGCATGGCAAAGAAGAGCCGAAAGCATGGAA  896

seq1  CTTCACAAACACTGTGTGGCAGGATCATTTATTGGAAAATTCATTTGTGT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACAAACACTGTGTGGCAGGATCATTTATTGGAAAATTCATTTGTGT  946

seq1  TTTCTTTACTCCACTGAGGAGCGATCAGAAAGAATGAGAGTTCAATGTGT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTACTCCACTGAGGAGCGATCAGAAAGAATGAGAGTTCAATGTGT  996

seq1  TTTGTGCTCTGCGTTTTTTCCTTCTGTTCTAAGAAGCCTTTTGTGTTTTT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCTCTGCGTTTTTTCCTTCTGTTCTAAGAAGCCTTTTGTGTTTTT  1046

seq1  GTGCCTCAGGGGCCTTTCAGGGCCTAAAACAGAAGGTACTTGAAAATAAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTCAGGGGCCTTTCAGGGCCTAAAACAGAAGGTACTTGAAAATAAC  1096

seq1  CTCCTTCTGGCTCTTATAAAAGTATAAACCAGAGGTCAGGAATTC  1139
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCTGGCTCTTATAAAAGTATAAACCAGAGGTCAGGAATTC  1141