BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-132H01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 97,190,856 - 97,265,509
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4921530L21Rik, Klhl1, LOC100043366
Downstream geneLOC668654, EG668659, Dach1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132H01.bB6Ng01-132H01.g
ACCDH933242DH933243
length1,1551,081
definitionDH933242|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132H01, 5' end.DH933243|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132H01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,264,348 - 97,265,509)(97,190,856 - 97,191,737)
sequence
gaattctggaatcccttgtatacttgcaagacaaagactctctgatagaa
atgtatttgaaaatcatgacactttattttctgtgaaaaagaatacaagt
gtgtgcttttgatcttagttactcaggaagctaatgtacccgatagcaaa
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cataatgtcaattgtaagagaccagagtaaccctgaatttctttatatgc
aaaggtttacaattacaactgatacaacataactgaaactactcaacccc
atagttttagtacaggtttacacctctctacaggaatatagtgaccgata
gagattaaattatctaacagaaacgagtcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_97264348_97265509
seq2: B6Ng01-132H01.b_43_1197 (reverse)

seq1  GACATGTAAGAACCCAATTATAAACTAGATATA-TTTTAGAAATAGAAAT  49
      |||| |||||||||    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  GACA-GTAAGAACC---ATATAACCTAGA-ATATTTTTAGAAATAGAAAT  45

seq1  AATAAATACATATGAG-ACAAACTGTTGCTATTACAAGGCCACCCAATAA  98
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AATAAATACATATGAGAACAAACTGTTGCTATTACAA-GCCACCCAATAA  94

seq1  AAAAATCAGTTTACATCTGTGAGTTGTTGATGTGAGTTAAAATGTTTCCT  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  AAAAATCAGTTTACATCTGTGAGTTGTTGATGTGAG-TAAAATGTTTCC-  142

seq1  TGGAGCTTGTAGTTATAGCCCACAGAATATTAGAGTCATTTATAGCCAAG  198
      | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGCTTGTAG-TATAGCCCACAGAATATTAGAGTCATTTATAGCCAAG  191

seq1  AGAGTACACTGATGTGGGACACAGATTAATATAAAATTACTAAGATATTA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTACACTGATGTGGGACACAGATTAATATAAAATTACTAAGATATTA  241

seq1  TACATGTAAAATGTATATATGCTAAGAAAGAATATAATTATTCTTTTGAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTAAAATGTATATATGCTAAGAAAGAATATAATTATTCTTTTGAC  291

seq1  TATTGACTATTGATTGATTGTAATCTAGATTGGTAGATAATAGAAAATAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGACTATTGATTGATTGTAATCTAGATTGGTAGATAATAGAAAATAA  341

seq1  ATGGAATATATTTATAATGCTTATGATTATATATAATAGATGATAGAAAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAATATATTTATAATGCTTATGATTATATATAATAGATGATAGAAAT  391

seq1  ATATGTATATATCAATACATAGATAAATATATTGATTATACATAGACAGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATATATCAATACATAGATAAATATATTGATTATACATAGACAGA  441

seq1  TATATTGATTATACATAGCTAATATAAAGAAGATAGATAAAAGATGATTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTGATTATACATAGCTAATATAAAGAAGATAGATAAAAGATGATTG  491

seq1  ATGCATGATAGATTGGTAGAAAGATGATAAATTGGTAGAAATTTATTTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGATAGATTGGTAGAAAGATGATAAATTGGTAGAAATTTATTTTT  541

seq1  TAAGACAGGTTCTCACATAGCCCAGACTATTTTATAACTCTCTATACAAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACAGGTTCTCACATAGCCCAGACTATTTTATAACTCTCTATACAAC  591

seq1  AGAAGATGACCATGAACTTCTGATCTGGAGACCTTTCATTGCAAATTTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGATGACCATGAACTTCTGATCTGGAGACCTTTCATTGCAAATTTGG  641

seq1  TGATATTAAAAACAAGAACCATTATGACCAGTTTATAGAGTCACAGGCTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATTAAAAACAAGAACCATTATGACCAGTTTATAGAGTCACAGGCTG  691

seq1  AACTAGGGGCATACAGCATAAGTACTTTATTACTTCCCAGTCTCTAGATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGGGGCATACAGCATAAGTACTTTATTACTTCCCAGTCTCTAGATA  741

seq1  CATAAATAAAGGAATCTTTACATACATATGAGTGTATATACATTGACATA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATAAAGGAATCTTTACATACATATGAGTGTATATACATTGACATA  791

seq1  CAAATGCATGCACACACAAGCAGACATATTGTGTTGCACTGAGACTAGAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGCATGCACACACAAGCAGACATATTGTGTTGCACTGAGACTAGAA  841

seq1  TCTAGAATAATGGATGCTAGTCAAGCACCCTAACGTTGAGGCATACAAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAATAATGGATGCTAGTCAAGCACCCTAACGTTGAGGCATACAAGG  891

seq1  AGTCATCATTTTACTATCATATATTTTACTAATATATATATCTTTTCATA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATCATTTTACTATCATATATTTTACTAATATATATATCTTTTCATA  941

seq1  AAAGGGCTTGTTAATTTCTTCAGACTGATATTGATCAACCAATGCAATGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGCTTGTTAATTTCTTCAGACTGATATTGATCAACCAATGCAATGC  991

seq1  ATATAGAACTTGAGTTTGCTATCGGGTACATTAGCTTCCTGAGTAACTAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGAACTTGAGTTTGCTATCGGGTACATTAGCTTCCTGAGTAACTAA  1041

seq1  GATCAAAAGCACACACTTGTATTCTTTTTCACAGAAAATAAAGTGTCATG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAAAGCACACACTTGTATTCTTTTTCACAGAAAATAAAGTGTCATG  1091

seq1  ATTTTCAAATACATTTCTATCAGAGAGTCTTTGTCTTGCAAGTATACAAG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCAAATACATTTCTATCAGAGAGTCTTTGTCTTGCAAGTATACAAG  1141

seq1  GGATTCCAGAATTC  1162
      ||||||||||||||
seq2  GGATTCCAGAATTC  1155

seq1: chr14_97190856_97191737
seq2: B6Ng01-132H01.g_279_1147

seq1  AAGACAATAAACTAGAATTTCAAGCATTTTAAAACATGCTAGATGGAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAATAAACTAGAATTTCAAGCATTTTAAAACATGCTAGATGGAAAC  50

seq1  ATAACAATCAGAATGGTAGATAACATTTTATCACAAATTAGTTACATGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAATCAGAATGGTAGATAACATTTTATCACAAATTAGTTACATGAG  100

seq1  GAAATAATATTTGTATTTTTTGACAACAAAACAAAATCAAACCTGTTAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAATATTTGTATTTTTTGACAACAAAACAAAATCAAACCTGTTAAC  150

seq1  CTGGTAGTCCCATACCTCACACAAATGTCTTTTATAAATAACAGAGATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAGTCCCATACCTCACACAAATGTCTTTTATAAATAACAGAGATAA  200

seq1  AAACCTTTACATTAAGCAATGAGGAGGCAGAGAACTTATCACTATGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTTACATTAAGCAATGAGGAGGCAGAGAACTTATCACTATGGCAC  250

seq1  ATTCAATTCCTCAAAATTTGTCAAGAAAATTTCACCAATAAGAAAACGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATTCCTCAAAATTTGTCAAGAAAATTTCACCAATAAGAAAACGAA  300

seq1  AAAATAAGCTGAACTTAACATTATAAAGAGTAAAGATCATAGTATGGGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAGCTGAACTTAACATTATAAAGAGTAAAGATCATAGTATGGGTA  350

seq1  TGGGTAAATACAATTGGATTTTGTTTTCCTTTTGATTTTTCTAAAGATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAAATACAATTGGATTTTGTTTTCCTTTTGATTTTTCTAAAGATGC  400

seq1  TAAAGACAATTCTAATATCGCAATACAGCTGTTCATGTCATGATATGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACAATTCTAATATCGCAATACAGCTGTTCATGTCATGATATGAGC  450

seq1  TCTACACATGCTCATATAGGAAATATTTTAACCACTTATATAACAAAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACACATGCTCATATAGGAAATATTTTAACCACTTATATAACAAAGCA  500

seq1  TGGCATTAAAAAAATAACTGTTGTACAAAGTTCCATGCATAGATCACAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATTAAAAAAATAACTGTTGTACAAAGTTCCATGCATAGATCACAGT  550

seq1  CAGTTATAAATATCTTGATTACAGAATAGATAAGAATAATAAAAAGAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTATAAATATCTTGATTACAGAATAGATAAGAATAATAAAAAGAAAA  600

seq1  TTAAAAGCAAATATGAACCTAGAGTGCATCTATTAATATCCAATTGTAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGCAAATATGAACCTAGAGTGCATCTATTAATATCCAATTGTAAT  650

seq1  TTAAGAGCAAAGTATATGACTATAGTTAAGGAAAGGCAACATAATGTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGCAAAGTATATGACTATAGTTAAGG-AAGGCAACATAATGTCAA  699

seq1  TTGTAAGAGACCAGAGTAACCCTGAATTTCTTTATATGCAAAGGTTTACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGAGACCAGAGTAACCCTGAATTTCTTTATATGCAAAGGTTTACA  749

seq1  ATTACAACTGATACAACATAACTGAAAACTACTCAACCCCATAGTTTTAG  800
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAACTGATACAACATAACTG-AAACTACTCAACCCCATAGTTTTAG  798

seq1  TTACAAGTTTTAACACTCTTCCTTACAGGAATAATAGGTGAACGATTAGA  850
       |||| ||||    || | ||  ||||||||| ||| |||| ||||    
seq2  -TACAGGTTT----ACACCTCTCTACAGGAAT-ATA-GTGACCGAT----  837

seq1  AGAATTAAAATTATCTAACAGAACAGAGTCAT  882
      |||  | ||||||||||||||||  |||||||
seq2  AGAGATTAAATTATCTAACAGAAACGAGTCAT  869