BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136J10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 60,967,156 - 61,130,755
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2600011E07Rik, Ppia-ps14_696.1
Upstream geneD14Ertd668e, EG628705, Setdb2, Cab39l, Cdadc1, Tmem46, Atp8a2, LOC668162, LOC628768, Nupl1, Mtmr6
Downstream geneEG628836, Spata13, C1qtnf9, Mipep, LOC100043586, Tnfrsf19, Sacs, Sgcg, Arl11, EG432864, Ebpl, Kpna3, LOC100042933, EG432865
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136J10.bB6Ng01-136J10.g
ACCDH936324DH936325
length1,075751
definitionDH936324|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J10, 5' end.DH936325|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,129,667 - 61,130,755)(60,967,156 - 60,967,906)
sequence
gaattctgaggactcttcagagggtgcatcaatgctaggaggcagagagg
gggtgggctgttggttggttgtggtttgttaagtagtctttgttaagtac
aaagaagaaacaacaagaaaaaaaaaaggagataacctgaaagatcaaac
ttgctcctaggaactccatgcccctaaccagcaggaagtagtctaagggt
aacattgcccccttccccctctcttttgttctcctatgtagtgttagggg
gtttaaagggcagacatggggtggcaaagggtggaagaaaaaagaatcca
caaagtaaataaagcccagctacaatggatgttagaaatgctagtctgtc
tgtcaccccacctgtgtgtgtgtttctcagtctgtgtctctgtccgtctg
tctgtctctctgattgtctctgtttctgtccctgccccctcccccccccc
accatgtatgtctcctctctttctcacatacacccctcacctttctggct
tcgattaacgcaaaaggtcttgctgtaccatctgctcacaccacgatgtc
tgctttaaccacaggcccaaagcaacagaaccgagtgtacagggatcaag
actgacacaccccagagagctctcccctccttccaacccactgatgattc
cccactgcaatagaagggtagtagacaactttggctgctaaagcaaagat
tcctgcttcttctctagggcagagagccttccaggggaagtctgtgaggc
ctgcttaggtgctgagggctgagctgtgttatctgctacacaacacatgt
tgaagccctaagccccggtaacttaagggctgtcttcatttggaaacagg
gatgctgcagaggtaattaagatttggttaggagacatctaaaaggtcta
gaagaaaaggagcaattcacccagaggagttgaaggcaggaaatatcaac
tcagggtgaaatcaaccaagtggaacagaagactattcaaagattaccaa
cgaggagtggttctttgagaaaatcacaagatagataaacctttagctag
actcacttgagggcacctggacaaa
gaattccaggacagccagagccatatagcaatatatatcttggaaaaaaa
ataaacacagagaaagagagagaagagaggagacagagagggggtggggg
gagactgggcatgtgattgtgggagcctgcaagctcagaatgagtagggc
aaacaggctgtaaatcctggccagggtagaggccaagctgaaggttgaag
gccaactgtggtgaaagaatccttccattgggctattgtgcttcctgaag
gcctgtctcatcatcatgaggtttcagatgttggtttcactcacatcctg
gcagtgatgtgtatatccatgtgtgcaggtgtgttgagcaaactcaggtg
tcatatgtcagaagcaacccagcttgatttatgaggcaggatctttgatg
taatgcctttaagccacagcggactttagatagtaaaaagcacagaaggc
aaggcatagaaggggcattcaggacatggtgaagaaagatggcttctccc
atgattcataccttctgagaaggcaacttagaggtgtagagatgtagaag
caaagttttaaggccagacttagagcatccttgctgagaaataagcttat
ttgatgtaggatcacataccactaatggcacagctagccctgtgggtttg
ttgaaatctaagaccccgagggaccatatgattcatgggaaggatatgag
ggcttgattctgccaatcacattagggggactgtgatctgggggtggggg
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_61129667_61130755
seq2: B6Ng01-136J10.b_47_1121 (reverse)

seq1  TTTGTCCCTGTGCCCTCTAGTGAGTCTAGCTAAGGGTTTATCTATCTTGT  50
      |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  TTTGTCCAGGTGCCCTCAAGTGAGTCTAGCTAAAGGTTTATCTATCTTG-  49

seq1  TGATTTTCTCAAAGAACCAACTCCTCGTTTGGTTAATTCTTTGAATAGTT  100
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| |
seq2  TGATTTTCTCAAAGAACC-ACTCCTCG-TTGGT--AATCTTTGAATAG-T  94

seq1  CTTCTTGTTTCCACTTGGTTGATTTCACCCCTGAGTTTGATTATTTCCTG  150
      |||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||
seq2  CTTCT--GTTCCACTTGGTTGATTTCA-CCCTGAG-TTGA-TATTTCCTG  139

seq1  CCTTCTACTCCTCTTGGGTGAATTTGCTTCCTTTTCTTCTAGACCTTTTA  200
      ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAACTCCTC-TGGGTGAA-TTGC-TCCTTTTCTTCTAGACCTTTTA  186

seq1  GGTGTCTCCTAACCAAATCTTAATTACCTCTGCAGCATCCCTGTTTCCAA  250
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTCCTAACCAAATCTTAATTACCTCTGCAGCATCCCTGTTTCCAA  236

seq1  ATGAAGACAGCCCTTAAGTTACCGGGGCTTAGGGCTTCAACATGTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGACAGCCCTTAAGTTACCGGGGCTTAGGGCTTCAACATGTGTTGT  286

seq1  GTAGCAGATAACACAGCTCAGCCCTCAGCACCTAAGCAGGCCTCACAGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGATAACACAGCTCAGCCCTCAGCACCTAAGCAGGCCTCACAGAC  336

seq1  TTCCCCTGGAAGGCTCTCTGCCCTAGAGAAGAAGCAGGAATCTTTGCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTGGAAGGCTCTCTGCCCTAGAGAAGAAGCAGGAATCTTTGCTTT  386

seq1  AGCAGCCAAAGTTGTCTACTACCCTTCTATTGCAGTGGGGAATCATCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCAAAGTTGTCTACTACCCTTCTATTGCAGTGGGGAATCATCAGT  436

seq1  GGGTTGGAAGGAGGGGAGAGCTCTCTGGGGTGTGTCAGTCTTGATCCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGAAGGAGGGGAGAGCTCTCTGGGGTGTGTCAGTCTTGATCCCTG  486

seq1  TACACTCGGTTCTGTTGCTTTGGGCCTGTGGTTAAAGCAGACATCGTGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTCGGTTCTGTTGCTTTGGGCCTGTGGTTAAAGCAGACATCGTGGT  536

seq1  GTGAGCAGATGGTACAGCAAGACCTTTTGCGTTAATCGAAGCCAGAAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCAGATGGTACAGCAAGACCTTTTGCGTTAATCGAAGCCAGAAAGG  586

seq1  TGAGGGGTGTATGTGAGAAAGAGAGGAGACATACATGGTGGGGGGGGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGGTGTATGTGAGAAAGAGAGGAGACATACATGGTGGGGGGGGGGA  636

seq1  GGGGGCAGGGACAGAAACAGAGACAATCAGAGAGACAGACAGACGGACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGCAGGGACAGAAACAGAGACAATCAGAGAGACAGACAGACGGACAG  686

seq1  AGACACAGACTGAGAAACACACACACAGGTGGGGTGACAGACAGACTAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGACTGAGAAACACACACACAGGTGGGGTGACAGACAGACTAGC  736

seq1  ATTTCTAACATCCATTGTAGCTGGGCTTTATTTACTTTGTGGATTCTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTAACATCCATTGTAGCTGGGCTTTATTTACTTTGTGGATTCTTTT  786

seq1  TTCTTCCACCCTTTGCCACCCCATGTCTGCCCTTTAAACCCCCTAACACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCACCCTTTGCCACCCCATGTCTGCCCTTTAAACCCCCTAACACT  836

seq1  ACATAGGAGAACAAAAGAGAGGGGGAAGGGGGCAATGTTACCCTTAGACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGAGAACAAAAGAGAGGGGGAAGGGGGCAATGTTACCCTTAGACT  886

seq1  ACTTCCTGCTGGTTAGGGGCATGGAGTTCCTAGGAGCAAGTTTGATCTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCTGCTGGTTAGGGGCATGGAGTTCCTAGGAGCAAGTTTGATCTTT  936

seq1  CAGGTTATCTCCTTTTTTTTTTCTTGTTGTTTCTTCTTTGTACTTAACAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTATCTCCTTTTTTTTTTCTTGTTGTTTCTTCTTTGTACTTAACAA  986

seq1  AGACTACTTAACAAACCACAACCAACCAACAGCCCACCCCCTCTCTGCCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTACTTAACAAACCACAACCAACCAACAGCCCACCCCCTCTCTGCCT  1036

seq1  CCTAGCATTGATGCACCCTCTGAAGAGTCCTCAGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCATTGATGCACCCTCTGAAGAGTCCTCAGAATTC  1075

seq1: chr14_60967156_60967906
seq2: B6Ng01-136J10.g_66_816

seq1  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCCATATAGCAATATATATCTTGGAAAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCCATATAGCAATATATATCTTGGAAAAAAA  50

seq1  ATAAACACAGAGAAAGAGAGAGAAGAGAGGAGACAGAGAGGGGGTGGGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACACAGAGAAAGAGAGAGAAGAGAGGAGACAGAGAGGGGGTGGGGG  100

seq1  GAGACTGGGCATGTGATTGTGGGAGCCTGCAAGCTCAGAATGAGTAGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGGGCATGTGATTGTGGGAGCCTGCAAGCTCAGAATGAGTAGGGC  150

seq1  AAACAGGCTGTAAATCCTGGCCAGGGTAGAGGCCAAGCTGAAGGTTGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGCTGTAAATCCTGGCCAGGGTAGAGGCCAAGCTGAAGGTTGAAG  200

seq1  GCCAACTGTGGTGAAAGAATCCTTCCATTGGGCTATTGTGCTTCCTGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACTGTGGTGAAAGAATCCTTCCATTGGGCTATTGTGCTTCCTGAAG  250

seq1  GCCTGTCTCATCATCATGAGGTTTCAGATGTTGGTTTCACTCACATCCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTCTCATCATCATGAGGTTTCAGATGTTGGTTTCACTCACATCCTG  300

seq1  GCAGTGATGTGTATATCCATGTGTGCAGGTGTGTTGAGCAAACTCAGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGATGTGTATATCCATGTGTGCAGGTGTGTTGAGCAAACTCAGGTG  350

seq1  TCATATGTCAGAAGCAACCCAGCTTGATTTATGAGGCAGGATCTTTGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATGTCAGAAGCAACCCAGCTTGATTTATGAGGCAGGATCTTTGATG  400

seq1  TAATGCCTTTAAGCCACAGCGGACTTTAGATAGTAAAAAGCACAGAAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCCTTTAAGCCACAGCGGACTTTAGATAGTAAAAAGCACAGAAGGC  450

seq1  AAGGCATAGAAGGGGCATTCAGGACATGGTGAAGAAAGATGGCTTCTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATAGAAGGGGCATTCAGGACATGGTGAAGAAAGATGGCTTCTCCC  500

seq1  ATGATTCATACCTTCTGAGAAGGCAACTTAGAGGTGTAGAGATGTAGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTCATACCTTCTGAGAAGGCAACTTAGAGGTGTAGAGATGTAGAAG  550

seq1  CAAAGTTTTAAGGCCAGACTTAGAGCATCCTTGCTGAGAAATAAGCTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTTTTAAGGCCAGACTTAGAGCATCCTTGCTGAGAAATAAGCTTAT  600

seq1  TTGATGTAGGATCACATACCACTAATGGCACAGCTAGCCCTGTGGGTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTAGGATCACATACCACTAATGGCACAGCTAGCCCTGTGGGTTTG  650

seq1  TTGAAATCTAAGACCCCGAGGGACCATATGATTCATGGGAAGGATATGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATCTAAGACCCCGAGGGACCATATGATTCATGGGAAGGATATGAG  700

seq1  GGCTTGATTCTGCCAATCACATTAGGGGGACTGTGATCTGGGGGTGGGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGATTCTGCCAATCACATTAGGGGGACTGTGATCTGGGGGTGGGGG  750

seq1  T  751
      |
seq2  T  751