BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-142H19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,251,886 - 100,319,421
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf12
Upstream geneLOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623
Downstream geneLOC100043413, EG668683, EG668684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-142H19.bB6Ng01-142H19.g
ACCDH940674DH940675
length1,1701,041
definitionDH940674|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142H19, 5' end.DH940675|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142H19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,318,245 - 100,319,421)(100,251,886 - 100,252,973)
sequence
gaattcaaatttaaaacaaatttttaaaattttgtgtagaacctggactt
cctcagagggcttgtataatagaaattagtataaattgaacacgagagta
tgttcgggcgtccttgatacttagagctgatgcccatcctgtctcatgcc
ttataatgtgtacttatgtctaggctcttacgtcctgttttcctgctttc
atcactgggtaggacttgtatgcatgtgtgttccattctgcaactcgggc
tgtgctgttgtctgtcatgagagtcctctgtgtgtaggagtctccaacac
gcaggtgcatttggtagctcatgggtgccttcccaatgattttcagacag
tgtttctacaatgctttccccattcctgaatctcaacatgaaggaacatt
tggcagaggatgttcaaatagtggctttgaaaacccaaatcaaactctga
actcatttactaaagggaaagtatatgtggtttggctagccctaaatcac
cctctatgacaatgtttaagcagtgacttggtctgtccaagctgctgtaa
gtataatagatctgtggcttataaagcatggtcatttgtctcttcgtttt
ggggatgggaagtccaatatcaaagtgcatgaaggttcagtgatggggaa
ggttggctgggggattccggacctgccctctgggtggtgtcttcacacag
taaacggacaaagaagctctttggagacttggtacacaggtccaggtgtc
actcacatggttgggtgacttaatcacctgcaaatatcatacctccaacg
aagtcttttaccttgagcactgggaggcctacatatgaatttggagtgca
cagacatcaacccacggaaaccctgcaattctcacggcaatttagtaact
gaaagattttgttgccatttaaaccataagactaagttgcatattctggg
cagagtccaccaaactgagttctgtacagttgctgccttgatggatctac
caggtcagtgccagagggacagttgactgttccttgtcacatctgcagtt
ttaaatgatatgcctagaagcatagcatgtatccactaaatataacttaa
gagtgggaaacaaggacatttggtaggaaaaaaataatccaagagtggct
tacgggtgataaatatataa
gaattccatgacctctgacaaatgttaaacttgtgggcatcagcttccac
acatatggagttacatgctagtcataggatttctatgattaagactttat
ttcattctaattatgtacatatgtgtgtgtgggtatatgcaggtaagttt
agttattcgagagggctagaagagtgtttgttcctctggggctggacttc
ccgttggttgtgaaccactggatgaaggttggctgagagctgagctcagc
tcctctgccagatcaatctgagctcttagctgcagcatcatctttccagc
cccagtagcacgaagttgaagcagataaacccaacagcagtgtgaaacag
aactgctgttctgagtagatcatgggtggtacccgaatgtggtctcctgc
tattgagagcagctgcggctccagacttttagtaaggttcttctaaaaga
cgaaaatggcacttgtaggtcgctttgaggccaaggctagaggaaattcc
ctttagctaagtggtttctttcaatacagggaagagacactggcagcact
ggatttcggatgccaaggaaatctatgttttgtgtacctgaaacaaaaat
cattattgttcatggactttccccaccatcttcatctgcccgagctgaaa
taaactggtattacagctaacagatcaggaagaaaaatgtgcttcctcaa
aggacagtgtttcaaaaagccacaaaagataccaggtggcttattcagct
ctaagagcccacgttgtcacacagatagcctggcaaggtaatgtcgatgt
tttgaaagggttttgtttgtgtatcagtcagcttcattggtttctcacca
atatcccaggaacaggtcatattcttctagagcgaaggacagaatttcat
gaaaatatgcaaatacatgtactcctgctgtcatcatctttctatttttt
atactgagcattgtagctagaacgactgagggtcaacaataaacttaact
caaatttccactagagtgttacgttacactggccttgttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100318245_100319421
seq2: B6Ng01-142H19.b_48_1217 (reverse)

seq1  TTATATATTTATCTACCGTTAGCACACTCTTGGATAATTTTTTTTCCTAC  50
      |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||
seq2  TTATATATTTATCACCCGTAAGC-CACTCTTGGATTA-TTTTTTTCCTAC  48

seq1  AAATTGT-CTTGTTTCCAACTC-TAAGTTATAATTTTAGTGGATACATGC  98
       || ||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||
seq2  CAAATGTCCTTGTTTCCCACTCTTAAGTTATA--TTTAGTGGATACATGC  96

seq1  TATGCTCTAAGGCATATCATTTAAAAACTGCAGATGTGTACAAGG-ACAG  147
      ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  TATGCTTCTAGGCATATCATTT-AAAACTGCAGATGTG-ACAAGGAACAG  144

seq1  TCAACTGTCCCTCTGGCACTGACCTGGTAGGATCCATCAAGGCAGCAACT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTGTCCCTCTGGCACTGACCTGGTA-GATCCATCAAGGCAGCAACT  193

seq1  GGTACAGAACTCAGTTTGGTGGACTCTGCCCAAGAATATGCAACTTAGTC  247
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  -GTACAGAACTCAGTTTGGTGGACTCTGCCC-AGAATATGCAACTTAGTC  241

seq1  TTATGGTTTTAAATGGCAACAAAAATCTTTTCAGTTACTAAATTGCCGTG  297
      |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGG-TTTAAATGGCAAC-AAAATC-TTTCAGTTACTAAATTGCCGTG  288

seq1  AGAATTGCAGGG-TTCCGTGGGTTGATGTCTGTGCACTCCAAATTCATAT  346
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGCAGGGTTTCCGTGGGTTGATGTCTGTGCACTCCAAATTCATAT  338

seq1  GTAGGCCTCCCAGTGCTCAAGGTAAAAGACTTCGTTGGAGGTATGATATT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCCTCCCAGTGCTCAAGGTAAAAGACTTCGTTGGAGGTATGATATT  388

seq1  TGCAGGTGATTAAGTCACCCAACCATGTGAGTGACACCTGGACCTGTGTA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGTGATTAAGTCACCCAACCATGTGAGTGACACCTGGACCTGTGTA  438

seq1  CCAAGTCTCCAAAGAGCTTCTTTGTCCGTTTACTGTGTGAAGACACCA-C  495
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCAAGTCTCCAAAGAGCTTCTTTGTCCGTTTACTGTGTGAAGACACCACC  488

seq1  CAGAGGGCAGGTCCGGAATCCCCCAGCCAACCTTCCCCATCACTGAACCT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGCAGGTCCGGAATCCCCCAGCCAACCTTCCCCATCACTGAACCT  538

seq1  TCATGCACTTTGATATTGGACTTCCCATCCCCAAAACGAAGAGACAAATG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCACTTTGATATTGGACTTCCCATCCCCAAAACGAAGAGACAAATG  588

seq1  ACCATGCTTTATAAGCCACAGATCTATTATACTTACAGCAGCTTGGACAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCTTTATAAGCCACAGATCTATTATACTTACAGCAGCTTGGACAG  638

seq1  ACCAAGTCACTGCTTAAACATTGTCATAGAGGGTGATTTAGGGCTAGCCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGTCACTGCTTAAACATTGTCATAGAGGGTGATTTAGGGCTAGCCA  688

seq1  AACCACATATACTTTCCCTTTAGTAAATGAGTTCAGAGTTTGATTTGGGT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACATATACTTTCCCTTTAGTAAATGAGTTCAGAGTTTGATTTGGGT  738

seq1  TTTCAAAGCCACTATTTGAACATCCTCTGCCAAATGTTCCTTCATGTTGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAGCCACTATTTGAACATCCTCTGCCAAATGTTCCTTCATGTTGA  788

seq1  GATTCAGGAATGGGGAAAGCATTGTAGAAACACTGTCTGAAAATCATTGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGGAATGGGGAAAGCATTGTAGAAACACTGTCTGAAAATCATTGG  838

seq1  GAAGGCACCCATGAGCTACCAAATGCACCTGCGTGTTGGAGACTCCTACA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCACCCATGAGCTACCAAATGCACCTGCGTGTTGGAGACTCCTACA  888

seq1  CACAGAGGACTCTCATGACAGACAACAGCACAGCCCGAGTTGCAGAATGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGACTCTCATGACAGACAACAGCACAGCCCGAGTTGCAGAATGG  938

seq1  AACACACATGCATACAAGTCCTACCCAGTGATGAAAGCAGGAAAACAGGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACATGCATACAAGTCCTACCCAGTGATGAAAGCAGGAAAACAGGA  988

seq1  CGTAAGAGCCTAGACATAAGTACACATTATAAGGCATGAGACAGGATGGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAAGAGCCTAGACATAAGTACACATTATAAGGCATGAGACAGGATGGG  1038

seq1  CATCAGCTCTAAGTATCAAGGACGCCCGAACATACTCTCGTGTTCAATTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCTCTAAGTATCAAGGACGCCCGAACATACTCTCGTGTTCAATTT  1088

seq1  ATACTAATTTCTATTATACAAGCCCTCTGAGGAAGTCCAGGTTCTACACA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAATTTCTATTATACAAGCCCTCTGAGGAAGTCCAGGTTCTACACA  1138

seq1  AAATTTTAAAAATTTGTTTTAAATTTGAATTC  1177
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTAAAAATTTGTTTTAAATTTGAATTC  1170

seq1: chr14_100251886_100252973
seq2: B6Ng01-142H19.g_67_1107

seq1  GAATTCCATGACCTCTGACAAATGTTAAACTTGTGGGCATCAGCTTCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGACCTCTGACAAATGTTAAACTTGTGGGCATCAGCTTCCAC  50

seq1  ACATATGGAGTTACATGCTAGTCATAGGATTTCTATGATTAAGACTTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGGAGTTACATGCTAGTCATAGGATTTCTATGATTAAGACTTTAT  100

seq1  TTCATTCTAATTATGTACATATGTGTGTGTGGGTATATGCAGGTAAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCTAATTATGTACATATGTGTGTGTGGGTATATGCAGGTAAGTTT  150

seq1  AGTTATTCGAGAGGGCTAGAAGAGTGTTTGTTCCTCTGGGGCTGGACTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTCGAGAGGGCTAGAAGAGTGTTTGTTCCTCTGGGGCTGGACTTC  200

seq1  CCGTTGGTTGTGAACCACTGGATGAAGGTTGGCTGAGAGCTGAGCTCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTGGTTGTGAACCACTGGATGAAGGTTGGCTGAGAGCTGAGCTCAGC  250

seq1  TCCTCTGCCAGATCAATCTGAGCTCTTAGCTGCAGCATCATCTTTCCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGCCAGATCAATCTGAGCTCTTAGCTGCAGCATCATCTTTCCAGC  300

seq1  CCCAGTAGCACGAAGTTGAAGCAGATAAACCCAACAGCAGTGTGAAACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTAGCACGAAGTTGAAGCAGATAAACCCAACAGCAGTGTGAAACAG  350

seq1  AACTGCTGTTCTGAGTAGATCATGGGTGGTACCCGAATGTGGTCTCCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCTGTTCTGAGTAGATCATGGGTGGTACCCGAATGTGGTCTCCTGC  400

seq1  TATTGAGAGCAGCTGCGGCTCCAGACTTTTAGTAAGGTTCTTCTAAAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGAGCAGCTGCGGCTCCAGACTTTTAGTAAGGTTCTTCTAAAAGA  450

seq1  CGAAAATGGCACTTGTAGGTCGCTTTGAGGCCAAGGCTAGAGGAAATTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAATGGCACTTGTAGGTCGCTTTGAGGCCAAGGCTAGAGGAAATTCC  500

seq1  CTTTAGCTAAGTGGTTTCTTTCAATACAGGGAAGAGACACTGGCAGCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGCTAAGTGGTTTCTTTCAATACAGGGAAGAGACACTGGCAGCACT  550

seq1  GGATTTCGGATGCCAAGGAAATCTATGTTTTGTGTACCTGAAACAAAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCGGATGCCAAGGAAATCTATGTTTTGTGTACCTGAAACAAAAAT  600

seq1  CATTATTGTTCATGGACTTTCCCCACCATCTTCATCTGCCCGAGCTGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTGTTCATGGACTTTCCCCACCATCTTCATCTGCCCGAGCTGAAA  650

seq1  TAAACTGGTATTACAGCTAACAGATCAGGAAGAAAAATGTGCTTCCTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGGTATTACAGCTAACAGATCAGGAAGAAAAATGTGCTTCCTCAA  700

seq1  AGGACAGGTGTTTCAAAAAGCCACAAAAGATACCAGGTGGCTTATTCAGC  750
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACA-GTGTTTCAAAAAGCCACAAAAGATACCAGGTGGCTTATTCAGC  749

seq1  TCTAAGAAGCCCACGTTGTCACACAGATAGCCTGGCAAGGTAATGTCGAT  800
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAG-AGCCCACGTTGTCACACAGATAGCCTGGCAAGGTAATGTCGAT  798

seq1  GTTTTTGAAAGGTTTTGTTTGTGTATCAGTCAGCTCCATTGGTTTCTCAC  850
      |||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTTTTGAAAGGGTTTTGTTTGTGTATCAGTCAGCTTCATTGGTTTCTCAC  848

seq1  CAATATCCCAGGAACAGTTCATATTCTCCTAGAGCGAAGGACAGAATTTC  900
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATCCCAGGAACAGGTCATATTCTTCTAGAGCGAAGGACAGAATTTC  898

seq1  ATGGAAAAATAATGCACATTACATTGTTTAACTCCTGCCTGTACATTTCC  950
      |||  ||||| ||||| | |||| |||   ||||||| |||| |||   |
seq2  ATG--AAAAT-ATGCA-AATACA-TGT---ACTCCTG-CTGT-CAT---C  935

seq1  ATTCTTTTCTATTTTTTTTAATTAACTTTGGTAGCATTTTGTAGCCTAAG  1000
      ||   |||||||||||| || |          ||||  |||||||   ||
seq2  AT--CTTTCTATTTTTTATACT---------GAGCA--TTGTAGC--TAG  970

seq1  AACAGACTTGAGGAGTCAAAACAAAATAAGACCTACAAACTCCAAAATCT  1050
      ||| ||| ||||| ||||    | ||||| || |   |||||  |||| |
seq2  AAC-GAC-TGAGG-GTCA----ACAATAA-ACTT---AACTC--AAATTT  1007

seq1  CCACTAAGATGTGTTACGTTAACAACTGGCCTTGTTGA  1088
      ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||
seq2  CCACT-AGA-GTGTTACGTTA--CACTGGCCTTGTTGA  1041