BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157K04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 65,116,797 - 65,270,332
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTdh, Mtmr9, Xkr6, LOC668306, 2610028A01Rik, Sox7, 4930578I06Rik, Rp1l1, 4933401F05Rik, 1700007N14Rik, 1700049K14Rik, Msra
Downstream geneKif13b, Hmbox1, LOC100043657, D14Ertd231e, Extl3, Fzd3, LOC668286, Fbxo16, Zfp395, Pnoc, Elp3, Gm600
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157K04.bB6Ng01-157K04.g
ACCDH951814DH951815
length9501,103
definitionDH951814|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157K04, 5' end.DH951815|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157K04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,116,797 - 65,117,749)(65,269,223 - 65,270,332)
sequence
gaattccacccacatggccttttgttctactcatgccttccacagaaagg
gagatcacttatacaggagaaagcagtctgctttactcgggccaccaacc
ccagttacgacagttcctggaaacattttacagacacagaaataatagcc
agagactggccatctcatagcctagcatgttgacagagaaaataaaaaca
ttaccaggtagattggagaggactagagggccagacagatgtgtttctaa
tcattgttgtgaacaggacgaagccatcagaatgtctaagtgaggagtag
ttggttactctgacatcctttatattgagttctaaatgcatggctagcca
tgtaaaagggcatcatttatcaatgattttaaatgacaataaagtacaat
ttctgataatacaaaccaaagggatgtgtcaaccagatgtaacatccaac
cttacactgggtcctgttcatgcaaaaaaaagagagaaatgtttaatgaa
ggacattatgctttgattgataaagttgaggaaacaatgctaggactgta
ggttagctaaaaaaaaatattctgtgtgaaaatagctaaatgtgataagt
atactgtgctaaaggaaaagaataatccttactcctaggaaatacaaact
ggaatgtgaaaggataaagaatgagcagtctgtcatcataaacagacaga
cagacagatagaaatatatatacatatataaaaggtagagagatgataag
taagtataaacatatagagataagtctatgctataatacttatagaaaca
tatagacggtaagtaagtagaaaacatagagttaaccgatgcatagataa
tatgggacggataagttggagggacggatgattacatatgatgagatgaa
gacggacccgactactgtattacgataaagtagatcctgtacgcatatgt

gaattcagaagagggcatccgatcccctggacctagaattacagagagtt
gcgagccaccacataggggcagagaatagagcccagtgagccagctctcc
agcccctgtgctttgggttttgatagaggtccacatgagttgctcaaatt
agctttttacttgcaatcttcctgtctcaccctctcaagtagctggaata
acagacctgaggcctctctcgcctgcctctgtatctagccctagctggtc
tgtaaactcactcagtagacagactggtctccacttcagagatccatctg
cttctgccttctaagtgctggagctaaaggtttgcacctcgcctcacctc
gattctgcaggactcttaaactctagcaatctgtattgagactacggtgt
ccaagaactgacccttcatctgaaaacctcttcctctcctttttaagacc
tctgggtttgatccttgattttgatgattttctctgactgccttgtcccc
ctcttgtttctttactgacttatccttcaggataaatggatgcattcaac
cttgaccacagcctctgcatcctctgagtcataaccttgggttatggaaa
caaacttaactcaaatcccactcatttgccaacctgtggtcacggtcaac
ttatttggccactcaaatttcatcttttttaatgtgtaaagtggagaccc
tgtgtcacccaacctgcagtgacatttatcgtgtgagtcaatgaaaccaa
agtgtaaatactgtttatcagcctcacagagactgctggttggtggtttg
tgcaccaagtctatcctacaaacatgttctgtttagccaacacaaaagtc
agatttggggtgcattaatgacccttactatatgttagtaacactaaatc
aacaggaatagcactggacatactataatcccagcactcagcaaaccgaa
gcagagattgcataaattgagacgagtctaggctccaagctctacctcag
cctcctactactggggactacagaatgtgagcttcaatgcccagcccact
ctagcttttttaactggggcagtggatagaaaaaagaaggttaagaagtt
tca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_65116797_65117749
seq2: B6Ng01-157K04.b_49_998

seq1  GAATTCCACCCACATGGCCTTTTGTTCTACTCATGCCTTCCACAGAAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCCACATGGCCTTTTGTTCTACTCATGCCTTCCACAGAAAGG  50

seq1  GAGATCACTTATACAGGAGAAAGCAGTCTGCTTTACTCGGGCCACCAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCACTTATACAGGAGAAAGCAGTCTGCTTTACTCGGGCCACCAACC  100

seq1  CCAGTTACGACAGTTCCTGGAAACATTTTACAGACACAGAAATAATAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTACGACAGTTCCTGGAAACATTTTACAGACACAGAAATAATAGCC  150

seq1  AGAGACTGGCCATCTCATAGCCTAGCATGTTGACAGAGAAAATAAAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTGGCCATCTCATAGCCTAGCATGTTGACAGAGAAAATAAAAACA  200

seq1  TTACCAGGTAGATTGGAGAGGACTAGAGGGCCAGACAGATGTGTTTCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAGGTAGATTGGAGAGGACTAGAGGGCCAGACAGATGTGTTTCTAA  250

seq1  TCATTGTTGTGAACAGGACGAAGCCATCAGAATGTCTAAGTGAGGAGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGTTGTGAACAGGACGAAGCCATCAGAATGTCTAAGTGAGGAGTAG  300

seq1  TTGGTTACTCTGACATCCTTTATATTGAGTTCTAAATGCATGGCTAGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTACTCTGACATCCTTTATATTGAGTTCTAAATGCATGGCTAGCCA  350

seq1  TGTAAAAGGGCATCATTTATCAATGATTTTAAATGACAATAAAGTACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAGGGCATCATTTATCAATGATTTTAAATGACAATAAAGTACAAT  400

seq1  TTCTGATAATACAAACCAAAGGGATGTGTCAACCAGATGTAACATCCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATAATACAAACCAAAGGGATGTGTCAACCAGATGTAACATCCAAC  450

seq1  CTTACACTGGGTCCTGTTCATGCAAAAAAAAGAGAGAAATGTTTAATGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACACTGGGTCCTGTTCATGCAAAAAAAAGAGAGAAATGTTTAATGAA  500

seq1  GGACATTATGCTTTGATTGATAAAGTTGAGGAAACAATGCTAGGACTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATTATGCTTTGATTGATAAAGTTGAGGAAACAATGCTAGGACTGTA  550

seq1  GGTTAGCTAAAAAAAAATATTCTGTGTGAAAATAGCTAAATGTGATAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGCTAAAAAAAAATATTCTGTGTGAAAATAGCTAAATGTGATAAGT  600

seq1  ATACTGTGCTAAAGGAAAAGAATAATCCTTACTCCTAGGAAATACAAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGTGCTAAAGGAAAAGAATAATCCTTACTCCTAGGAAATACAAACT  650

seq1  GGAATGTGAAAGGATAAAGAATGAGCAGTCTGTCATCATAAACAGACAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGTGAAAGGATAAAGAATGAGCAGTCTGTCATCATAAACAGACAGA  700

seq1  CAGACAGATAGAAATATATATACATATATAAAAGGTAGAGAGATGATAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAGATAGAAATATATATACATATATAAAAGGTAGAGAGATGATAAG  750

seq1  TAAGTATAAACATATAGAGATAAGTCTATGCTAT-ATACTTATAAGATAC  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
seq2  TAAGTATAAACATATAGAGATAAGTCTATGCTATAATACTTAT-AGAAAC  799

seq1  ATATAGACGGTAAGTAAGTAG-ATACATAGAGTTAACCGATGCATAGATA  848
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGACGGTAAGTAAGTAGAAAACATAGAGTTAACCGATGCATAGATA  849

seq1  ATAT-GGACAGATAAG-TAGAGAGACAGATAGATAACATATAGATGAGAT  896
      |||| |||| |||||| | ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||
seq2  ATATGGGACGGATAAGTTGGAGGGACGGAT-GATTACATAT-GATGAGAT  897

seq1  AGAAAGACAGACACAGACTACATGTATTACAGAT-AAGTAGATACTGTAC  945
         ||||| ||| | |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||
seq2  --GAAGACGGAC-CCGACTAC-TGTATTAC-GATAAAGTAGATCCTGTAC  942

seq1  GCATATGT  953
      ||||||||
seq2  GCATATGT  950

seq1: chr14_65269223_65270332
seq2: B6Ng01-157K04.g_69_1171 (reverse)

seq1  TGAAACTTCTTAACCTTCTTTTTTCTTATCTCACTGCCCCAGTTTAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||
seq2  TGAAACTTCTTAACCTTCTTTTTTC-TATC-CACTGCCCCAGTTAAAAAA  48

seq1  GCTAGAGTGGGGCTGGGCATTGAAGCTCACA-TCTGTAGT-CCCAGTAGT  98
      |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| 
seq2  GCTAGAGT-GGGCTGGGCATTGAAGCTCACATTCTGTAGTCCCCAGTAG-  96

seq1  TGGGAGGCTGAGGTAGGAGCTTGGAGCCTAGACTCGTCTCAATTTATGGC  148
      | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TAGGAGGCTGAGGTA-GAGCTTGGAGCCTAGACTCGTCTCAATTTAT-GC  144

seq1  AATCTTCCTGCTTCGGTTTGCTGAGTGCTGGGATTATAGTATGTCCAGTG  198
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCT--CTGCTTCGGTTTGCTGAGTGCTGGGATTATAGTATGTCCAGTG  192

seq1  CTATTCCTGTTTGATTTAGTGTTACTAACATATAGTAAGGGTCATTAATG  248
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCTG-TTGATTTAGTGTTACTAACATATAGTAAGGGTCATTAATG  241

seq1  CACCCCAAATCTGACTTTTGTGTTGGCTAAACAGAACATGTTTGTAGGAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCAAATCTGACTTTTGTGTTGGCTAAACAGAACATGTTTGTAGGAT  291

seq1  AGACTTGGTGCACAAACCACCAACCAGCAGTCTCTGTGAGGCTGATAAAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTGGTGCACAAACCACCAACCAGCAGTCTCTGTGAGGCTGATAAAC  341

seq1  AGTATTTACACTTTGGTTTCATTGACTCACACGATAAATGTCACTGCAGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTACACTTTGGTTTCATTGACTCACACGATAAATGTCACTGCAGG  391

seq1  TTGGGTGACACAGGGTCTCCACTTTACACATTAAAAAAGATGAAATTTGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTGACACAGGGTCTCCACTTTACACATTAAAAAAGATGAAATTTGA  441

seq1  GTGGCCAAATAAGTTGACCGTGACCACAGGTTGGCAAATGAGTGGGATTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCAAATAAGTTGACCGTGACCACAGGTTGGCAAATGAGTGGGATTT  491

seq1  GAGTTAAGTTTGTTTCCATAACCCAAGGTTATGACTCAGAGGATGCAGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAAGTTTGTTTCCATAACCCAAGGTTATGACTCAGAGGATGCAGAG  541

seq1  GCTGTGGTCAAGGTTGAATGCATCCATTTATCCTGAAGGATAAGTCAGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGTCAAGGTTGAATGCATCCATTTATCCTGAAGGATAAGTCAGTA  591

seq1  AAGAAACAAGAGGGGGACAAGGCAGTCAGAGAAAATCATCAAAATCAAGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACAAGAGGGGGACAAGGCAGTCAGAGAAAATCATCAAAATCAAGG  641

seq1  ATCAAACCCAGAGGTCTTAAAAAGGAGAGGAAGAGGTTTTCAGATGAAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACCCAGAGGTCTTAAAAAGGAGAGGAAGAGGTTTTCAGATGAAGG  691

seq1  GTCAGTTCTTGGACACCGTAGTCTCAATACAGATTGCTAGAGTTTAAGAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTCTTGGACACCGTAGTCTCAATACAGATTGCTAGAGTTTAAGAG  741

seq1  TCCTGCAGAATCGAGGTGAGGCGAGGTGCAAACCTTTAGCTCCAGCACTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCAGAATCGAGGTGAGGCGAGGTGCAAACCTTTAGCTCCAGCACTT  791

seq1  AGAAGGCAGAAGCAGATGGATCTCTGAAGTGGAGACCAGTCTGTCTACTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGCAGAAGCAGATGGATCTCTGAAGTGGAGACCAGTCTGTCTACTG  841

seq1  AGTGAGTTTACAGACCAGCTAGGGCTAGATACAGAGGCAGGCGAGAGAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTTTACAGACCAGCTAGGGCTAGATACAGAGGCAGGCGAGAGAGG  891

seq1  CCTCAGGTCTGTTATTCCAGCTACTTGAGAGGGTGAGACAGGAAGATTGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGGTCTGTTATTCCAGCTACTTGAGAGGGTGAGACAGGAAGATTGC  941

seq1  AAGTAAAAAGCTAATTTGAGCAACTCATGTGGACCTCTATCAAAACCCAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAAAAGCTAATTTGAGCAACTCATGTGGACCTCTATCAAAACCCAA  991

seq1  AGCACAGGGGCTGGAGAGCTGGCTCACTGGGCTCTATTCTCTGCCCCTAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGGGCTGGAGAGCTGGCTCACTGGGCTCTATTCTCTGCCCCTAT  1041

seq1  GTGGTGGCTCGCAACTCTCTGTAATTCTAGGTCCAGGGGATCGGATGCCC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGCTCGCAACTCTCTGTAATTCTAGGTCCAGGGGATCGGATGCCC  1091

seq1  TCTTCTGAATTC  1110
      ||||||||||||
seq2  TCTTCTGAATTC  1103