BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-161A19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 102,163,198 - 102,307,546
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLmo7, LOC100043795
Upstream gene1700110M21Rik, LOC100043421, LOC382936, Tbc1d4, Commd6, Uchl3
Downstream geneLOC545567, LOC669278
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-161A19.bB6Ng01-161A19.g
ACCDH954268DH954269
length1,1051,131
definitionDH954268|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-161A19, 5' end.DH954269|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-161A19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,306,438 - 102,307,546)(102,163,198 - 102,164,339)
sequence
gaattctctccacaaggctgttttgaacttgaaaataaagaaatctctga
acatgttaaataaaagaacagatacccacctctatgaacctaacagagag
gatggttttgcgatggctacaagcggccagactgccatgtccataactca
ggacaaaacacaaagacagaacaaggtagggacaattactgggaaatctg
ttaatatccaagttaccccatgtatgacattgaatgtaatgtcagagcct
gctcgaactgacaatggtttttcatggttgaagctctcctttcaaatgac
aatcttatgtgcacagcatccttcacaaacacatacatatgtatgtgtgt
acacacacagatacacacacacacacacacacacacacacacacatacac
gctcaaacacaatatgtaagtaggtgagagctatttgaggattagggttg
taggtcacaggctcccagttgtatcatttcttcattatagaattctttag
gacattcctgtgaagtgctgggttcctatactactagattatgcctaaga
ctttttatatgtaaacatagctacaatttggtcatgcttcaactagtaac
aatgacttcaggcaggacctctaacttcttaactttctctacaaaaattt
aagccatgtgcacgtaggacaaaggctctgaactacagaagacaatcgag
gagttacctctttgcactagatgggacaaacgtacaaattgtcaagggaa
acctacattattttgatgactaagaaatgaatttcccaaggagtttcagt
tgtccatgccagaaaagagaaagtcatagctatccatcaatggctcagcg
tttacgctgaaagcagtctccctcggatcggctacaatttgaacagaaat
ctccactaaaagtgagattgcaccacttaccgtcagctgatgagccagga
gagacttttaattgtctaagatagacctgatgtcaccagagtatgaatta
tttcttctggagttgatgaattataatttccatggcactaccactgggag
tgagaaacagagtcttatcttattgcacaggaaactatttcttttcatgt
ttcta
gaattctgtgaatgtctctctctttgtatcagtccacacctgaagattag
ggttgctcagctttggataaaacattccttatttaatgcattccacagca
gctaccagagaatgtgagtgtgaaatccaaacctcctttcaggagctaac
aaagatgagaatgcgttgcattattaaaagagcttttagccacggagagg
ggtgctaggtaaataagttgagaatagcctcccacattccttttcaaacc
ccccttcccccttctaaaaaacaggagcaaagaaaaccttttgtaataag
atggtgattctttgatggctgtaagctttcttatggggcttttaaccgat
caaatgctgggactgtagctcaggattacagttttaggtctgtaacggaa
gacgctctttctgtgagaggcatgaagcgctcctttgggatcagatactg
atggtgcaatgtctgtgcctgagataagaacagcttacctttctcctttt
aggaaaggcttttggaaacattacatatggtatggcacgagcccatcatt
cattccttacaactttgcttaatttagaagggacagagatcactgggctg
acatgaagcactaataaagaccagaagatctggagccatgacttagttgt
tggctggagacatggaccgtggaaagtcttctgtgaaaatctaacacttt
ttggttaattattctcatctatttaatggtcttttaaggttgtaggtatt
ttctggtaaaatgtggccattgccattcaatttggaccagtatttgtaat
cacaatttaataaatgatcataggctattgggatcattatattgagaatt
attatattgagaatattcactcattcattcaacaaatacttgagtatata
ttatgtcctagtgatctgtgtacgtgggtatatgagtgaaaaaaatatca
gacacatgcagaataattagtgagtgttaggatcattttggagtgataag
agaactggggtgtctttgaagaatgtctgagcatttcttgaagatgttag
tctagaaaacttgaatgccaccaaaccactgaaatcatggcttggggtta
acactccctcctccaacaatttgtttactta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_102306438_102307546
seq2: B6Ng01-161A19.b_42_1146 (reverse)

seq1  TAGAAACACTGGAAAGGAATAGTTTTCTTGGTGC-ATAAGAT-AGACTCT  48
      |||||||| || |||| |||||||| ||  |||| ||||||| |||||||
seq2  TAGAAACA-TGAAAAGAAATAGTTTCCT--GTGCAATAAGATAAGACTCT  47

seq1  GTTTCTCACTCCCAGTGGTAGTGCCATGGAAATTATAATTCATCAACTCC  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCACTCCCAGTGGTAGTGCCATGGAAATTATAATTCATCAACTCC  97

seq1  AGGAGAAATAATTCATACTCTGGTGACATCAGGTCTATCCTTAGACAATT  148
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGAAGAAATAATTCATACTCTGGTGACATCAGGTCTAT-CTTAGACAATT  146

seq1  AAAAGTCTCCTCCTGGCTCATCAGCCTGACGGTAAGTGGTGCAATCTCAC  198
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTCT-CTCCTGGCTCATCAG-CTGACGGTAAGTGGTGCAATCTCAC  194

seq1  TTTTAGTGGAGATTTCTGTTCAAATTGTAGCCGATCCGAGGGAGACTGCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGTGGAGATTTCTGTTCAAATTGTAGCCGATCCGAGGGAGACTGCT  244

seq1  TTCAGCGTAAACGCTGAGCCATTGATGGATAGCTATGACTTTCTCTTTTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCGTAAACGCTGAGCCATTGATGGATAGCTATGACTTTCTCTTTTC  294

seq1  TGGCATGGACAACTGAAACTCCTTGGGAAATTCATTTCTTAGTCATCAAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGGACAACTGAAACTCCTTGGGAAATTCATTTCTTAGTCATCAAA  344

seq1  ATAATGTAGGTTTCCCTTGACAATTTGTACGTTTGTCCCATCTAGTGCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTAGGTTTCCCTTGACAATTTGTACGTTTGTCCCATCTAGTGCAA  394

seq1  AGAGGTAACTCCTCGATTGTCTTCTGTAGTTCAGAGCCTTTGTCCTACGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTAACTCCTCGATTGTCTTCTGTAGTTCAGAGCCTTTGTCCTACGT  444

seq1  GCACATGGCTTAAATTTTTGTAGAGAAAGTTAAGAAGTTAGAGGTCCTGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGGCTTAAATTTTTGTAGAGAAAGTTAAGAAGTTAGAGGTCCTGC  494

seq1  CTGAAGTCATTGTTACTAGTTGAAGCATGACCAAATTGTAGCTATGTTTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTCATTGTTACTAGTTGAAGCATGACCAAATTGTAGCTATGTTTA  544

seq1  CATATAAAAAGTCTTAGGCATAATCTAGTAGTATAGGAACCCAGCACTTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAAAAAGTCTTAGGCATAATCTAGTAGTATAGGAACCCAGCACTTC  594

seq1  ACAGGAATGTCCTAAAGAATTCTATAATGAAGAAATGATACAACTGGGAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAATGTCCTAAAGAATTCTATAATGAAGAAATGATACAACTGGGAG  644

seq1  CCTGTGACCTACAACCCTAATCCTCAAATAGCTCTCACCTACTTACATAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGACCTACAACCCTAATCCTCAAATAGCTCTCACCTACTTACATAT  694

seq1  TGTGTTTGAGCGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTGAGCGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA  744

seq1  TCTGTGTGTGTACACACATACATATGTATGTGTTTGTGAAGGATGCTGTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTGTGTACACACATACATATGTATGTGTTTGTGAAGGATGCTGTG  794

seq1  CACATAAGATTGTCATTTGAAAGGAGAGCTTCAACCATGAAAAACCATTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAAGATTGTCATTTGAAAGGAGAGCTTCAACCATGAAAAACCATTG  844

seq1  TCAGTTCGAGCAGGCTCTGACATTACATTCAATGTCATACATGGGGTAAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCGAGCAGGCTCTGACATTACATTCAATGTCATACATGGGGTAAC  894

seq1  TTGGATATTAACAGATTTCCCAGTAATTGTCCCTACCTTGTTCTGTCTTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATATTAACAGATTTCCCAGTAATTGTCCCTACCTTGTTCTGTCTTT  944

seq1  GTGTTTTGTCCTGAGTTATGGACATGGCAGTCTGGCCGCTTGTAGCCATC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTGTCCTGAGTTATGGACATGGCAGTCTGGCCGCTTGTAGCCATC  994

seq1  GCAAAACCATCCTCTCTGTTAGGTTCATAGAGGTGGGTATCTGTTCTTTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAACCATCCTCTCTGTTAGGTTCATAGAGGTGGGTATCTGTTCTTTT  1044

seq1  ATTTAACATGTTCAGAGATTTCTTTATTTTCAAGTTCAAAACAGCCTTGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACATGTTCAGAGATTTCTTTATTTTCAAGTTCAAAACAGCCTTGT  1094

seq1  GGAGAGAATTC  1109
      |||||||||||
seq2  GGAGAGAATTC  1105

seq1: chr14_102163198_102164339
seq2: B6Ng01-161A19.g_67_1197

seq1  GAATTCTGTGAATGTCTCTCTCTTTGTATCAGTCCACACCTGAAGATTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGAATGTCTCTCTCTTTGTATCAGTCCACACCTGAAGATTAG  50

seq1  GGTTGCTCAGCTTTGGATAAAACATTCCTTATTTAATGCATTCCACAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCTCAGCTTTGGATAAAACATTCCTTATTTAATGCATTCCACAGCA  100

seq1  GCTACCAGAGAATGTGAGTGTGAAATCCAAACCTCCTTTCAGGAGCTAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCAGAGAATGTGAGTGTGAAATCCAAACCTCCTTTCAGGAGCTAAC  150

seq1  AAAGATGAGAATGCGTTGCATTATTAAAAGAGCTTTTAGCCACGGAGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGAGAATGCGTTGCATTATTAAAAGAGCTTTTAGCCACGGAGAGG  200

seq1  GGTGCTAGGTAAATAAGTTGAGAATAGCCTCCCACATTCCTTTTCAAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTAGGTAAATAAGTTGAGAATAGCCTCCCACATTCCTTTTCAAACC  250

seq1  CCCCTTCCCCCTTCTAAAAAACAGGAGCAAAGAAAACCTTTTGTAATAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTCCCCCTTCTAAAAAACAGGAGCAAAGAAAACCTTTTGTAATAAG  300

seq1  ATGGTGATTCTTTGATGGCTGTAAGCTTTCTTATGGGGCTTTTAACCGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGATTCTTTGATGGCTGTAAGCTTTCTTATGGGGCTTTTAACCGAT  350

seq1  CAAATGCTGGGACTGTAGCTCAGGATTACAGTTTTAGGTCTGTAACGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGCTGGGACTGTAGCTCAGGATTACAGTTTTAGGTCTGTAACGGAA  400

seq1  GACGCTCTTTCTGTGAGAGGCATGAAGCGCTCCTTTGGGATCAGATACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGCTCTTTCTGTGAGAGGCATGAAGCGCTCCTTTGGGATCAGATACTG  450

seq1  ATGGTGCAATGTCTGTGCCTGAGATAAGAACAGCTTACCTTTCTCCTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGCAATGTCTGTGCCTGAGATAAGAACAGCTTACCTTTCTCCTTTT  500

seq1  AGGAAAGGCTTTTGGAAACATTACATATGGTATGGCACGAGCCCATCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGCTTTTGGAAACATTACATATGGTATGGCACGAGCCCATCATT  550

seq1  CATTCCTTACAACTTTGCTTAATTTAGAAGGGACAGAGATCACTGGGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTTACAACTTTGCTTAATTTAGAAGGGACAGAGATCACTGGGCTG  600

seq1  ACATGAAGCACTAATAAAGACCAGAAGATCTGGAGCCATGACTTAGTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAGCACTAATAAAGACCAGAAGATCTGGAGCCATGACTTAGTTGT  650

seq1  TGGCTGGAGACATGGACCGTGGAAAGTCTTCTGTGAAAATCTAACACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGAGACATGGACCGTGGAAAGTCTTCTGTGAAAATCTAACACTTT  700

seq1  TTGGTTAATTATTCTCATCTATTTAATGGTCTTTTAAGGTTGTAGGTATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTAATTATTCTCATCTATTTAATGGTCTTTTAAGGTTGTAGGTATT  750

seq1  TTCTGGTAAAATGTGGCCATTGCCATTCAATTTGGACCAGTATTTGTAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTAAAATGTGGCCATTGCCATTCAATTTGGACCAGTATTTGTAAT  800

seq1  CACAATTTAATAAATGATCATAGGCTATTGGGATCATTATATTGAGAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATTTAATAAATGATCATAGGCTATTGGGATCATTATATTGAGAATT  850

seq1  ATTATATTGAGAATATTCACTCATTCATTCAACAAATACTTGAGTATATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTGAGAATATTCACTCATTCATTCAACAAATACTTGAGTATATA  900

seq1  TTATGTCCTAGTGATCTGTGTACGTGGGTATATGAGTGAAAAAAAATATC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTATGTCCTAGTGATCTGTGTACGTGGGTATATGAGTG-AAAAAAATATC  949

seq1  AGACACATGCAGAATAATTAGTGAGTGTTAAGATCATTTTGAAGTGATAA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  AGACACATGCAGAATAATTAGTGAGTGTTAGGATCATTTTGGAGTGATAA  999

seq1  GAGAACCTTGGGGTGTCTTTG-AGAATGTCTGAGCATTTCTTGAAGA-GT  1048
      ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAGAAC--TGGGGTGTCTTTGAAGAATGTCTGAGCATTTCTTGAAGATGT  1047

seq1  TAAGGTCTTAGAAACTTGATGGCCACCAAAGCCACCTGAAATCAATGGCT  1098
      ||  ||||   ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||| 
seq2  TA--GTCTAGAAAACTTGAATGCCACCAAA-CCA-CTGAAATC-ATGGC-  1091

seq1  TTTGGGTTTACTACTCCTCCTCCTCAACTAATTTGTTTATCTTA  1142
       ||||| |||  ||||  ||||||| |  |||||||||| ||||
seq2  -TTGGGGTTAACACTC--CCTCCTCCAACAATTTGTTTA-CTTA  1131