BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167M07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 80,675,462 - 80,773,516
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC672828
Upstream gene1190002H23Rik, Narg1l, Mtrf1, Kbtbd7, EG432879, Wbp4, Elf1, LOC668560, Sugt1, Lect1, Pcdh8, EG629734, Olfm4
Downstream geneLOC639207
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167M07.bB6Ng01-167M07.g
ACCDH959177DH959178
length1,2171,021
definitionDH959177|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167M07, 5' end.DH959178|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167M07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,675,462 - 80,676,700)(80,772,492 - 80,773,516)
sequence
gaattcctttgtgaatgtgttacctcactcaggatgatgccctccaggtc
catccatttggctaggaatttcataaattcattctttttaatagctgagt
agtactccattgtgtagatgtaccacattttctgtatccattcctctgtt
gaggggcatctgggttctttccagcttctggctattataaataaggctgc
tatgaacatagtggagcatgtgtccttcttaccagttggggcatcttctg
gatatatgcccaggagaggtattgctggatcctccggtagtactatgtcc
aattttctgaggaaccgccagacggatttccagagtggttgtacaagcct
acaatcccaccaacaatggaggagtgttcctctttctccacatcctcgcc
agcatctgctgtcacctgaatttttgatcttagccattctgactgtctta
cccatttactaaagacaatcctttcatatcttacaaggcatatacctttc
aatgaccagagccttcacatccactgacatatccaaaaaatagctgtcaa
atggagatgctgaaagcaacatctttcatcattacctctttgatgtctgc
agataatgtaacatggcctaagcttctagattttaaacacaaatggtaaa
tataatgattactgaatacatgtctcaattataggtccaaactctgtaat
gctggatgtatcacattttcagttctcttttatagtatagtttatagttt
cataacactggtttgagcgtgagctttgacacttacttgctactgagagt
agacatggaatttctttcaatgtcacatttcttggcaataaaattggtat
agtaagagagtctttgttgggacgattgattattatgtatgtaaaatgcc
tgacacagaatgactgtttataaatggaaatggcatagtatgtatatctc
tacagtcctagcacagggtagtgattgagtaatcaatgattaagtatttt
attcattttggattttggtattgatcaagaacacatagacatcttgtagt
ttggcatatattcttgaatgtattattacgcatgcattatggatccctga
ccattcactacaccttcagtgggaacacagatgtgttattcttagagcca
ggaggttctatgcttatggtaagttatgaatgagatggtaatccgtgagt
gttttatacgctgtctg
gaattccaagctgtggatccactgagtgcctaacaaaatgaaatgctaac
atcattctttatgtagagaagaccaaatgagacacaagtgagtcaaaaga
gtggtgatcataaggcgattactatatctacggtgactgtgatggctatt
tgcagttgtcaactcaagtacatctggaactaaaacctaattgaatgggt
acacctgtgaagaatttggaacacccacttagaatccagatatttagaga
tgagaagacctactttaaatcaagatcttttgaggaaggaagatccacct
ttaacctgggggcacacctgatatcagcctatatatgaagaacttggagg
gactcccccttccctccccttcctttctacttacccccacccccacttgt
ttgcttgttcttgctcttatactagcaagtccattcctttactgacatta
gaacctacttctgtaccctgacatatactaaagaccaactaagatccagc
ctcatggattaaacaactactgaactctgttcttctgtacatagacattg
ttagacaacaacattcctataagccattctaatcaatcccagataggtag
gtaggtaggtagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat
agatacaaagacagaccatgaatagatttggttggttgattgattgataa
tagatgatactcatttctacccttcctttcctctagattatccctgaata
atatggtgactgagaaatttcctcctgaacaaatgacatatttttactta
tttgaaagattattttaattttattatgcataggtcttttttttagtttc
ttaggatcccatttttttattttgtaataagataaaacaaattaattatg
tgtaagtctagggcatacctgagtgtgggacccttggaggtcagaagttc
atgtttccttggacttcgctccagtagttggaaccaagttgttaagacca
aacttgtgtgatctgaaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_80675462_80676700
seq2: B6Ng01-167M07.b_49_1265

seq1  GAATTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTC  50

seq1  CATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGT  100

seq1  AGTACTCCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTT  150

seq1  GAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGC  200

seq1  TATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATCTTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATCTTCTG  250

seq1  GATATATGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATATGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCC  300

seq1  AATTTTCTGAGGAACCGCCAGACGGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCTGAGGAACCGCCAGACGGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCT  350

seq1  ACAATCCCACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCCCACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCC  400

seq1  AGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGTCTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGTCTTA  450

seq1  CCCATTTACTAAAGACAATCCTTTCATATCTTACAAGGCATATACCTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTACTAAAGACAATCCTTTCATATCTTACAAGGCATATACCTTTC  500

seq1  AATGACCAGAGCCTTCACATCCACTGACATATCCAAAAAATAGCTGTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACCAGAGCCTTCACATCCACTGACATATCCAAAAAATAGCTGTCAA  550

seq1  ATGGAGATGCTGAAAGCAACATCTTTCATCATTACCTCTTTGATGTCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGATGCTGAAAGCAACATCTTTCATCATTACCTCTTTGATGTCTGC  600

seq1  AGATAATGTAACATGGCCTAAGCTTCTAGATTTTAAACACAAATGGTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAATGTAACATGGCCTAAGCTTCTAGATTTTAAACACAAATGGTAAA  650

seq1  TATAATGATTACTGAATACATGTCTCAATTATAGGTCCAAACTCTGTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGATTACTGAATACATGTCTCAATTATAGGTCCAAACTCTGTAAT  700

seq1  GCTGGATGTATCACATTTTCAGTTCTCTTTTATAGTATAGTTTATAGTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGATGTATCACATTTTCAGTTCTCTTTTATAGTATAGTTTATAGTTT  750

seq1  CATAACACTGGTTTGAGCGTGAGCTTTGACACTTACTTGCTACTGAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACACTGGTTTGAGCGTGAGCTTTGACACTTACTTGCTACTGAGAGT  800

seq1  AGACATGGAATTTCTTTCAATGTCACATTTCTTGGCAATAAAATTGGTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGGAATTTCTTTCAATGTCACATTTCTTGGCAATAAAATTGGTAT  850

seq1  AGTAAGAGAGTCTTTGTTGGGACGATTGATTATTATGTATGTAAAATGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAGAGTCTTTGTTGGGACGATTGATTATTATGTATGTAAAATGCC  900

seq1  TGACACAGAATGACTGTTTAATAAATGGAAATGGCATAGGTATGTATATC  950
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGACACAGAATGACTGTTT-ATAAATGGAAATGGCATA-GTATGTATATC  948

seq1  TCTACAGTCCTAGCACAGGGTAGTGAATTGAGTTAATCAATGATTAAGTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
seq2  TCTACAGTCCTAGCACAGGGTAGTG-ATTGAG-TAATCAATGATTAAG-T  995

seq1  ATTTTATTCATTTTGGATTTTTGGTATTGATCAAAGACACATAGGAACCA  1050
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    ||
seq2  ATTTTATTCATTTTGGA-TTTTGGTATTGATCAAGAACACATAG---ACA  1041

seq1  TC-TGTAAGGTTTGGCATATATTCTTGAATGTATTATATACCGCATGCAT  1099
      || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
seq2  TCTTGTA--GTTTGGCATATATTCTTGAATGTATTAT-TA-CGCATGCAT  1087

seq1  TAGTGATCCCTGACCATCACCCTACACCTTCCCAGTGGGGACCACAGATG  1149
      ||  |||||||||||||  | |||||||||  |||| |||| ||||||||
seq2  TATGGATCCCTGACCAT-TCACTACACCTT--CAGT-GGGAACACAGATG  1133

seq1  TGTGATTTCTAAGAGGCAGAGGAGTACTCATGGCTGAATGGTACAGTGAT  1199
      ||| | |||| |||| ||| |  || || |||  |  |||||| ||| ||
seq2  TGTTA-TTCTTAGAGCCAG-GAGGTTCT-ATGCTT--ATGGTA-AGTTAT  1177

seq1  GGAATGAGAATTGTGAATCAGTGA-TGTTT--TACGCTGTCTG  1239
       ||||||||  ||  |||| |||| |||||  |||||||||||
seq2  -GAATGAGA--TGGTAATCCGTGAGTGTTTTATACGCTGTCTG  1217

seq1: chr14_80772492_80773516
seq2: B6Ng01-167M07.g_67_1087 (reverse)

seq1  TTCTTTCAGATCACCCAAGTTTGGTTCTCAGCAAACTTGGCTCACAACTG  50
      |||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||| || ||||| 
seq2  TTCTTTCAGATCACACAAGTTTGG-TCTTAAC-AACTTGGTTC-CAACT-  46

seq1  CCTGGAAGCGAAGCTCCAAGGAAACCTGACACTTCTGACCTCCAAGGGTA  100
       |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| 
seq2  ACTGG-AGCGAAG-TCCAAGGAAACATGA-ACTTCTGACCTCCAAGGGT-  92

seq1  CCTACACTCAGGTATTCCCATAGACTTACACATAATTAATTTGTTTTATC  150
      || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACTCAGGTATGCCC-TAGACTTACACATAATTAATTTGTTTTATC  141

seq1  TTATTACAAAAT-AATAAATGGGATCCTATGAAACT-AAAAAAAGACATA  198
      |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||
seq2  TTATTACAAAATAAAAAAATGGGATCCTAAGAAACTAAAAAAAAGACCTA  191

seq1  TGCATAATTAAAATTAAAATAAATCTTTCAAATAAGT-AAAATATGTCAT  247
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TGCATAA-TAAAATTAAAAT-AATCTTTCAAATAAGTAAAAATATGTCAT  239

seq1  TTGTTCAGGAGGAAATTTCTCAGTCACCATATTATTCA-GGATAATCTAG  296
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTGTTCAGGAGGAAATTTCTCAGTCACCATATTATTCAGGGATAATCTAG  289

seq1  AGGAAAGGAA-GGTAG-AATGAGTATCATCTATTATCAATCAATCAACCA  344
      |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGAAGGGTAGAAATGAGTATCATCTATTATCAATCAATCAACCA  339

seq1  ACC-AATCTATTCATGGTCTGTCTTTGTATCTATCTATCTATCTATCTAT  393
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAATCTATTCATGGTCTGTCTTTGTATCTATCTATCTATCTATCTAT  389

seq1  CTATCTATCTATCTATCTATCTACCTACCTACCTACCTATCTGGGATTGA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTATCTATCTATCTATCTACCTACCTACCTACCTATCTGGGATTGA  439

seq1  TTAGAATGGCTTATAGGAATGTTGTTGTCTAACAATGTCTATGTACAGAA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATGGCTTATAGGAATGTTGTTGTCTAACAATGTCTATGTACAGAA  489

seq1  GAACAGAGTTCAGTAGTTGTTTAATCCATGAGGCTGGATCTTAGTTGGTC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAGTTCAGTAGTTGTTTAATCCATGAGGCTGGATCTTAGTTGGTC  539

seq1  TTTAGTATATGTCAGGGTACAGAAGTAGGTTCTAATGTCAGTAAAGGAAT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTATATGTCAGGGTACAGAAGTAGGTTCTAATGTCAGTAAAGGAAT  589

seq1  GGACTTGCTAGTATAAGAGCAAGAACAAGCAAACAAGTGGGGGTGGGGGT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGCTAGTATAAGAGCAAGAACAAGCAAACAAGTGGGGGTGGGGGT  639

seq1  AAGTAGAAAGGAAGGGGAGGGAAGGGGGAGTCCCTCCAAGTTCTTCATAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGAAAGGAAGGGGAGGGAAGGGGGAGTCCCTCCAAGTTCTTCATAT  689

seq1  ATAGGCTGATATCAGGTGTGCCCCCAGGTTAAAGGTGGATCTTCCTTCCT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCTGATATCAGGTGTGCCCCCAGGTTAAAGGTGGATCTTCCTTCCT  739

seq1  CAAAAGATCTTGATTTAAAGTAGGTCTTCTCATCTCTAAATATCTGGATT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGATCTTGATTTAAAGTAGGTCTTCTCATCTCTAAATATCTGGATT  789

seq1  CTAAGTGGGTGTTCCAAATTCTTCACAGGTGTACCCATTCAATTAGGTTT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTGGGTGTTCCAAATTCTTCACAGGTGTACCCATTCAATTAGGTTT  839

seq1  TAGTTCCAGATGTACTTGAGTTGACAACTGCAAATAGCCATCACAGTCAC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCCAGATGTACTTGAGTTGACAACTGCAAATAGCCATCACAGTCAC  889

seq1  CGTAGATATAGTAATCGCCTTATGATCACCACTCTTTTGACTCACTTGTG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGATATAGTAATCGCCTTATGATCACCACTCTTTTGACTCACTTGTG  939

seq1  TCTCATTTGGTCTTCTCTACATAAAGAATGATGTTAGCATTTCATTTTGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTTGGTCTTCTCTACATAAAGAATGATGTTAGCATTTCATTTTGT  989

seq1  TAGGCACTCAGTGGATCCACAGCTTGGAATTC  1025
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCACTCAGTGGATCCACAGCTTGGAATTC  1021