BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169H09
Chromosome14 (Build37)
Map Location 59,092,967 - 59,276,857
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneIft88, Il17d, N6amt2, Xpo4, Lats2, Sap18, F630043A04Rik, Mrp63, Zdhhc20, Efha1, LOC668160, Fgf9, LOC100043554
Downstream geneEG668177, EG668182, 1700129C05Rik, EG380907, Rcbtb1, EG628693, Phf11, EG236451, D14Ertd668e, EG628705, Setdb2, Cab39l, Cdadc1, Tmem46, Atp8a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169H09.bB6Ng01-169H09.g
ACCDH960435DH960436
length832885
definitionDH960435|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169H09, 5' end.DH960436|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169H09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,092,967 - 59,093,801)(59,275,973 - 59,276,857)
sequence
gaattcaaaaagagagctggctactgagaaggacatcacagtggctatca
gctgtgtcactcaaggacctggaactccgaacaaccaccagaaatgtgac
ttggtaactatgcacagtgaactttccaaacggctctatgcattaaacta
ttcatgctgatatttttatgctttgttggaaattagaaagcaatgaaata
gtagagaaattatgagtctaagagatatcatgacatgtccattaaatggt
tctcaccaacactggtaacaataaagaaaaatgccaggctaattgaacaa
caaccaaaaaaaaaaactaatatggctccttatgcaacaaattatgaggg
tttatttctgggttttattctttatgtttcttggttttgcacttgtaaat
tacgtaaagtactatttcaacttgttgctagagtctccaagctactagca
cacatcggtacaaacctcacacatctcagttgtcctgttctctccatgga
aattattgatatgtgtgtacatataaaagtttagtggtataggttatggt
tatatgtagctcaaatgttatgcacatacactctctaagcatgaaggttt
tgttagtatatagcagttgtttagatagtgagtttcacctgggtattctt
ggacacacctatagcatagcttggctactttgcctctcctcccttatcca
cacttattcccccccccccaaaccccgtcacagcgtctccggatgacagg
ctcttttgttacctttgagaaaaagcattttctaatcttgtttattacag
ttgcctaggagagctaaagtcccttccattct
gaattccttggctccactctcaacccatttactacagcttttagctctag
ttagcaacagagagagccctgagcccttgtctggtgcttgtgcacctacc
ccactgttcatgttgtgctttccccagttagctaacagtggacacttgat
gctgggaagtttccattaagataattgattctaagacaccatcccccaat
agctaattaagaggagagctgaccttttaagagagtcctcccgtttgtaa
aattaaatcaatcatggtgatagaaattcttcaggacaaagtgaaactaa
gaattttggaccatctggaaggattggttgtcttggggtctcttaaagta
cctcacatagtagaccacttgctcctgggctctacacaattctatattgt
aggctccttcttggatctcaattctgtcttctcctttgtgcattcagaaa
cacatatgcacaggcacacatacacacacaggcactatacatacttacac
atacacacacatgtacacacatacacatgcacatacatacacatgtacac
acatacacaggcacacacatacactcacacgtacacttgtgggcttccag
acacacctagtcaggctctgtgctgtgaaaggttagcagtttccacccat
gacagttatcaccttttaaatgcactgtggtgtgtgtggcaatatatact
gtcatttttctcgggattttatttactgctgaagaatttcatctctttat
cctacctgacctgcaaagaaacccttagtaccccctcctgaatcaatgta
aacaaaggcttgctccatagagcagtgagcagccacacagtgtctttatg
ccttctagtccccaaatggggtggggtgggtgtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_59092967_59093801
seq2: B6Ng01-169H09.b_49_880

seq1  GAATTCAAAAAGAGAGCTGGCTACTGAGAAGGACATCACAGTGGCTATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAAGAGAGCTGGCTACTGAGAAGGACATCACAGTGGCTATCA  50

seq1  GCTGTGTCACTCAAGGACCTGGAACTCCGAACAACCACCAGAAATGTGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGTCACTCAAGGACCTGGAACTCCGAACAACCACCAGAAATGTGAC  100

seq1  TTGGTAACTATGCACAGTGAACTTTCCAAACGGCTCTATGCATTAAACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAACTATGCACAGTGAACTTTCCAAACGGCTCTATGCATTAAACTA  150

seq1  TTCATGCTGATATTTTTATGCTTTGTTGGAAATTAGAAAGCAATGAAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGCTGATATTTTTATGCTTTGTTGGAAATTAGAAAGCAATGAAATA  200

seq1  GTAGAGAAATTATGAGTCTAAGAGATATCATGACATGTCCATTAAATGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGAAATTATGAGTCTAAGAGATATCATGACATGTCCATTAAATGGT  250

seq1  TCTCACCAACACTGGTAACAATAAAGAAAAATGCCAGGCTAATTGAACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCAACACTGGTAACAATAAAGAAAAATGCCAGGCTAATTGAACAA  300

seq1  CAACCAAAAAAAAAAACTAATATGGCTCCTTATGCAACAAATTATGAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAAAAAAAAAAACTAATATGGCTCCTTATGCAACAAATTATGAGGG  350

seq1  TTTATTTCTGGGTTTTATTCTTTATGTTTCTTGGTTTTGCACTTGTAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTCTGGGTTTTATTCTTTATGTTTCTTGGTTTTGCACTTGTAAAT  400

seq1  TACGTAAAGTACTATTTCAACTTGTTGCTAGAGTCTCCAAGCTACTAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTAAAGTACTATTTCAACTTGTTGCTAGAGTCTCCAAGCTACTAGCA  450

seq1  CACATCGGTACAAACCTCACACATCTCAGTTGTCCTGTTCTCTCCATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCGGTACAAACCTCACACATCTCAGTTGTCCTGTTCTCTCCATGGA  500

seq1  AATTATTGATATGTGTGTACATATAAAAGTTTAGTGGTATAGGTTATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTGATATGTGTGTACATATAAAAGTTTAGTGGTATAGGTTATGGT  550

seq1  TATATGTAGCTCAAATGTTATGCACATACACTCTCTAAGCATGAAGGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTAGCTCAAATGTTATGCACATACACTCTCTAAGCATGAAGGTTT  600

seq1  TGTTAGTATATAGCAGTTGTTTAGATAGTGAGTTTCACCTGGGTATTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGTATATAGCAGTTGTTTAGATAGTGAGTTTCACCTGGGTATTCTT  650

seq1  GGACACACCTATAGCATAGCTTGGCTACTTTGCCTCTCCTCCCTTATCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACACCTATAGCATAGCTTGGCTACTTTGCCTCTCCTCCCTTATCCA  700

seq1  CACTTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTCACAGCGTCTCCGGATGAC  750
      ||||||||   |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATT---CCCCCCCCCCCAAACCCCGTCACAGCGTCTCCGGATGAC  747

seq1  AGGCTCTTTTGTTACCTTTGAGAAAAAGCATTTTCTAATCTTGTTTATTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCTTTTGTTACCTTTGAGAAAAAGCATTTTCTAATCTTGTTTATTA  797

seq1  CAGTTGCCATGGTGAGCTAAAGTTCCATCCATTCT  835
      ||||||||  || |||||||||| || ||||||||
seq2  CAGTTGCCTAGGAGAGCTAAAGTCCCTTCCATTCT  832

seq1: chr14_59275973_59276857
seq2: B6Ng01-169H09.g_68_952 (reverse)

seq1  CCACACCCACCCCACCCCATTTGGGGACTAGAAGGCATAAAGACACTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCCACCCCACCCCATTTGGGGACTAGAAGGCATAAAGACACTGTG  50

seq1  TGGCTGCTCACTGCTCTATGGAGCAAGCCTTTGTTTACATTGATTCAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGCTCACTGCTCTATGGAGCAAGCCTTTGTTTACATTGATTCAGGA  100

seq1  GGGGGTACTAAGGGTTTCTTTGCAGGTCAGGTAGGATAAAGAGATGAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTACTAAGGGTTTCTTTGCAGGTCAGGTAGGATAAAGAGATGAAAT  150

seq1  TCTTCAGCAGTAAATAAAATCCCGAGAAAAATGACAGTATATATTGCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGCAGTAAATAAAATCCCGAGAAAAATGACAGTATATATTGCCAC  200

seq1  ACACACCACAGTGCATTTAAAAGGTGATAACTGTCATGGGTGGAAACTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCACAGTGCATTTAAAAGGTGATAACTGTCATGGGTGGAAACTGC  250

seq1  TAACCTTTCACAGCACAGAGCCTGACTAGGTGTGTCTGGAAGCCCACAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTTTCACAGCACAGAGCCTGACTAGGTGTGTCTGGAAGCCCACAAG  300

seq1  TGTACGTGTGAGTGTATGTGTGTGCCTGTGTATGTGTGTACATGTGTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACGTGTGAGTGTATGTGTGTGCCTGTGTATGTGTGTACATGTGTATG  350

seq1  TATGTGCATGTGTATGTGTGTACATGTGTGTGTATGTGTAAGTATGTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCATGTGTATGTGTGTACATGTGTGTGTATGTGTAAGTATGTATA  400

seq1  GTGCCTGTGTGTGTATGTGTGCCTGTGCATATGTGTTTCTGAATGCACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGTGTGTGTATGTGTGCCTGTGCATATGTGTTTCTGAATGCACAA  450

seq1  AGGAGAAGACAGAATTGAGATCCAAGAAGGAGCCTACAATATAGAATTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAGACAGAATTGAGATCCAAGAAGGAGCCTACAATATAGAATTGT  500

seq1  GTAGAGCCCAGGAGCAAGTGGTCTACTATGTGAGGTACTTTAAGAGACCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCCCAGGAGCAAGTGGTCTACTATGTGAGGTACTTTAAGAGACCC  550

seq1  CAAGACAACCAATCCTTCCAGATGGTCCAAAATTCTTAGTTTCACTTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACAACCAATCCTTCCAGATGGTCCAAAATTCTTAGTTTCACTTTGT  600

seq1  CCTGAAGAATTTCTATCACCATGATTGATTTAATTTTACAAACGGGAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAGAATTTCTATCACCATGATTGATTTAATTTTACAAACGGGAGGA  650

seq1  CTCTCTTAAAAGGTCAGCTCTCCTCTTAATTAGCTATTGGGGGATGGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTAAAAGGTCAGCTCTCCTCTTAATTAGCTATTGGGGGATGGTGT  700

seq1  CTTAGAATCAATTATCTTAATGGAAACTTCCCAGCATCAAGTGTCCACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAATCAATTATCTTAATGGAAACTTCCCAGCATCAAGTGTCCACTG  750

seq1  TTAGCTAACTGGGGAAAGCACAACATGAACAGTGGGGTAGGTGCACAAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTAACTGGGGAAAGCACAACATGAACAGTGGGGTAGGTGCACAAGC  800

seq1  ACCAGACAAGGGCTCAGGGCTCTCTCTGTTGCTAACTAGAGCTAAAAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACAAGGGCTCAGGGCTCTCTCTGTTGCTAACTAGAGCTAAAAGCT  850

seq1  GTAGTAAATGGGTTGAGAGTGGAGCCAAGGAATTC  885
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTAAATGGGTTGAGAGTGGAGCCAAGGAATTC  885