BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-190M14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 25,688,306 - 25,787,733
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKcnma1, LOC620499, Dlg5, LOC100039335, E330034G19Rik, LOC669325, Polr3a, Rps24, LOC669315
Downstream geneLOC100039411, Zmiz1, I920194n01, LOC100039007, 4931406H21Rik, Ppif, 2310047A01Rik, Anxa11, Plac9, D14Ertd449e, Cphx
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-190M14.bB6Ng01-190M14.g
ACCGA014456GA014457
length1,154897
definitionB6Ng01-190M14.b B6Ng01-190M14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,688,306 - 25,689,462)(25,786,840 - 25,787,733)
sequence
gaattctgctgcttgatgccaacatagcaaagtgtcaggaaagagccctg
gaaagggcagctcaagggagaccggagggatgggaaggtaggaacgagac
tgtaagaacttcctaaaggaaagtgcagcccagagccctatccagagctt
gtgtgcttgcatgcatgctcccagatacgtatgactggtggggcatgagg
ggaggccgagggtggcaatgagagttgggagtggagcagagggaaggaga
gaaagacacagatggaaaacctcccacgaaagccaaatcctcaagtcaga
cgactgttttcatctcatgttgataatagggacaaatgctgatggaaacc
cacaaatagtacctgccagtaccagttctttagcccctagtaggcagact
ctgatttgcctggcaggtcccagcagggtgagatatctgccaaaagcctg
cttaaggagcctgcttccacagaagaagtgttggaactgtaacctggggc
taatggcagaggtggacagtccaccgcttaaggggtctgcagctctaggc
ctcaggtttccagtctgtggaatggacacagctattccctgtctgcccag
ttatgggaatgggggtggagctcactttgtagcagaaaggattatcaggt
actgtatctactctcctgccccaagcaaccacagtcttagcttcggccac
agcatcagataaagaaaatccagggaaaccccagaattgaagacaggctg
agagagaagaagcaagcagagtgggtgccacactgcccactcaccttcct
agaaaggcatttccaagatttccagaggacactgccaatgtgtctttgct
tttattccttcccaagctatccagggagtcaccttcccaaaagaaccagg
ccatcctgactggtcactcacctgactggtcacagcccctggctgtgttt
cccaggccttgatccttcagcctgtggacctagccagattccctccatgc
ctgtctttgtcttctgtctgagagcagtctactaaagcctttctgtgccc
actttggtgttttatgatcttctttctagactgaccttcagcaaatgtct
cctccccttcattatccctccttatgcctctctatatatcacttcaagtc
tagc
gaattctgtgcaatggacaaggacatctaggacatgcactaaagtctgtg
ggactaggagactgcttgggttctttgaaatcatggatgctttgtgttct
attgtcctcactgtgcacagacagaacactaagccactcactcaaactgc
aaatgcgaggaccagaatgaatgtttgatttggttgtttgtgtacctggg
tacggagttgtgaattttgttgggaaggacacaggaagaatagtcatgtg
tctcggttctctatgaaacccgacctccttgtcatgtcctccacctcctc
cttcccagcacgcacctcacctgtccatcagccgaacttgtcacttaaat
gtctggagcatgctccacacctgcccatcttcctcatctccctgtcacag
agtcaccagcttcctccctggaggatgctgacagcagcctcttcgctggc
cgttaggcaccttctcttgcgcctccttggttctctttatcctcttaaag
agttctcgtgagtgcccgatgaaagccatccctggtagaagcaggtacgt
ggctcaagctccagtgagctcacactaatctgcacacaggcagcacaaac
tggattccaggttcttcaaaacaaaaataaaaagagggggtgaagtttag
aggaaagtgaggtaggggcacaggggaactggggagagatggtgaggagg
gataggataaatatacattgtataaatgtatgacaatttcaaaagtataa
aaatgttattctgttagaagccaccctctctcccccactctcccattgcc
ctgttttatactctttgcctgcatgtacaatgttttgagaaggaaccttc
agactctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_25688306_25689462
seq2: B6Ng01-190M14.b_48_1201

seq1  GAATTCTGCTGCTTGATGCCAACATAGCAAAGTGTCAGGAAAGAGCCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTGCTTGATGCCAACATAGCAAAGTGTCAGGAAAGAGCCCTG  50

seq1  GAAAGGGCAGCTCAAGGGAGACCGGAGGGATGGGAAGGTAGGAACGAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCAGCTCAAGGGAGACCGGAGGGATGGGAAGGTAGGAACGAGAC  100

seq1  TGTAAGAACTTCCTAAAGGAAAGTGCAGCCCAGAGCCCTATCCAGAGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGAACTTCCTAAAGGAAAGTGCAGCCCAGAGCCCTATCCAGAGCTT  150

seq1  GTGTGCTTGCATGCATGCTCCCAGATACGTATGACTGGTGGGGCATGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCTTGCATGCATGCTCCCAGATACGTATGACTGGTGGGGCATGAGG  200

seq1  GGAGGCCGAGGGTGGCAATGAGAGTTGGGAGTGGAGCAGAGGGAAGGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCCGAGGGTGGCAATGAGAGTTGGGAGTGGAGCAGAGGGAAGGAGA  250

seq1  GAAAGACACAGATGGAAAACCTCCCACGAAAGCCAAATCCTCAAGTCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGACACAGATGGAAAACCTCCCACGAAAGCCAAATCCTCAAGTCAGA  300

seq1  CGACTGTTTTCATCTCATGTTGATAATAGGGACAAATGCTGATGGAAACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACTGTTTTCATCTCATGTTGATAATAGGGACAAATGCTGATGGAAACC  350

seq1  CACAAATAGTACCTGCCAGTACCAGTTCTTTAGCCCCTAGTAGGCAGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATAGTACCTGCCAGTACCAGTTCTTTAGCCCCTAGTAGGCAGACT  400

seq1  CTGATTTGCCTGGCAGGTCCCAGCAGGGTGAGATATCTGCCAAAAGCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTGCCTGGCAGGTCCCAGCAGGGTGAGATATCTGCCAAAAGCCTG  450

seq1  CTTAAGGAGCCTGCTTCCACAGAAGAAGTGTTGGAACTGTAACCTGGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGGAGCCTGCTTCCACAGAAGAAGTGTTGGAACTGTAACCTGGGGC  500

seq1  TAATGGCAGAGGTGGACAGTCCACCGCTTAAGGGGTCTGCAGCTCTAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGCAGAGGTGGACAGTCCACCGCTTAAGGGGTCTGCAGCTCTAGGC  550

seq1  CTCAGGTTTCCAGTCTGTGGAATGGACACAGCTATTCCCTGTCTGCCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGTTTCCAGTCTGTGGAATGGACACAGCTATTCCCTGTCTGCCCAG  600

seq1  TTATGGGAATGGGGGTGGAGCTCACTTTGTAGCAGAAAGGATTATCAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGAATGGGGGTGGAGCTCACTTTGTAGCAGAAAGGATTATCAGGT  650

seq1  ACTGTATCTACTCTCCTGCCCCAAGCAACCACAGTCTTAGCTTCGGCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTATCTACTCTCCTGCCCCAAGCAACCACAGTCTTAGCTTCGGCCAC  700

seq1  AGCATCAGATAAAGAAAATCCAGGGAAACCCCAGAATTGAAGACAGGCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCAGATAAAGAAAATCCAGGGAAACCCCAGAATTGAAGACAGGCTG  750

seq1  AGAGAGAAGAAGCAAGCAGAGTGGGTGCCACACTGCCCACTCACCTTCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAGAAGCAAGCAGAGTGGGTGCCACACTGCCCACTCACCTTCCT  800

seq1  AG-AAGGCATTTCCAAGATTTCCAGAGGACACTGCCAATGTGTCTTTGCT  849
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGCATTTCCAAGATTTCCAGAGGACACTGCCAATGTGTCTTTGCT  850

seq1  TTTATTCCTTCCCAAGCTATCCAGGGAGTCACCTTCCCAAAAGAACCAGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCCTTCCCAAGCTATCCAGGGAGTCACCTTCCCAAAAGAACCAGG  900

seq1  CCATCCTGACTGGTCACTCACCTGACTGGTCACAGCCCCTGGCTGTGTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTGACTGGTCACTCACCTGACTGGTCACAGCCCCTGGCTGTGTTT  950

seq1  CCCAGGCCTTGATCCTCCAGCCTGTGGACCTAGCCAGATTCCCTCCATGC  999
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCCTTGATCCTTCAGCCTGTGGACCTAGCCAGATTCCCTCCATGC  1000

seq1  CTGTCTTTGTCTTCTGTCTGAGAGCAGTCTACTAAAGCCTTTCTGTGCCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTTGTCTTCTGTCTGAGAGCAGTCTACTAAAGCCTTTCTGTGCCC  1050

seq1  ACTTTGGTGTTTTATGATC-TCTTTCTAGACTGACCTTCAGCAAATGTCT  1098
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGTGTTTTATGATCTTCTTTCTAGACTGACCTTCAGCAAATGTCT  1100

seq1  TCCCTCCCCTCCTTTAT-CCTCCTTAATGGCCTCTCCTATATATCACCTT  1147
        |||||||| | |||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||
seq2  --CCTCCCCTTCATTATCCCTCCTTA--TGCCTCT-CTATATATCA-CTT  1144

seq1  CCAGTCTAGC  1157
      | ||||||||
seq2  CAAGTCTAGC  1154

seq1: chr14_25786840_25787733
seq2: B6Ng01-190M14.g_70_966 (reverse)

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCTGAA  50

seq1  GGTT-CTTCTC-AAACATTGTACATGCA-GCAAAGAGTATAAAACAGGGC  97
      |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCTTCTCAAAACATTGTACATGCAGGCAAAGAGTATAAAACAGGGC  100

seq1  AATGGGAGAGTGGGGGAGAGAGGGTGGCTTCTAACAGAATAACATTTTTA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGAGAGTGGGGGAGAGAGGGTGGCTTCTAACAGAATAACATTTTTA  150

seq1  TACTTTTGAAATTGTCATACATTTATACAATGTATATTTATCCTATCCCT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTGAAATTGTCATACATTTATACAATGTATATTTATCCTATCCCT  200

seq1  CCTCACCATCTCTCCCCAGTTCCCCTGTGCCCCTACCTCACTTTCCTCTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACCATCTCTCCCCAGTTCCCCTGTGCCCCTACCTCACTTTCCTCTA  250

seq1  AACTTCACCCCCTCTTTTTATTTTTGTTTTGAAGAACCTGGAATCCAGTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCACCCCCTCTTTTTATTTTTGTTTTGAAGAACCTGGAATCCAGTT  300

seq1  TGTGCTGCCTGTGTGCAGATTAGTGTGAGCTCACTGGAGCTTGAGCCACG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTGCCTGTGTGCAGATTAGTGTGAGCTCACTGGAGCTTGAGCCACG  350

seq1  TACCTGCTTCTACCAGGGATGGCTTTCATCGGGCACTCACGAGAACTCTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGCTTCTACCAGGGATGGCTTTCATCGGGCACTCACGAGAACTCTT  400

seq1  TAAGAGGATAAAGAGAACCAAGGAGGCGCAAGAGAAGGTGCCTAACGGCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGGATAAAGAGAACCAAGGAGGCGCAAGAGAAGGTGCCTAACGGCC  450

seq1  AGCGAAGAGGCTGCTGTCAGCATCCTCCAGGGAGGAAGCTGGTGACTCTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAAGAGGCTGCTGTCAGCATCCTCCAGGGAGGAAGCTGGTGACTCTG  500

seq1  TGACAGGGAGATGAGGAAGATGGGCAGGTGTGGAGCATGCTCCAGACATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGGAGATGAGGAAGATGGGCAGGTGTGGAGCATGCTCCAGACATT  550

seq1  TAAGTGACAAGTTCGGCTGATGGACAGGTGAGGTGCGTGCTGGGAAGGAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGACAAGTTCGGCTGATGGACAGGTGAGGTGCGTGCTGGGAAGGAG  600

seq1  GAGGTGGAGGACATGACAAGGAGGTCGGGTTTCATAGAGAACCGAGACAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGGAGGACATGACAAGGAGGTCGGGTTTCATAGAGAACCGAGACAC  650

seq1  ATGACTATTCTTCCTGTGTCCTTCCCAACAAAATTCACAACTCCGTACCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTATTCTTCCTGTGTCCTTCCCAACAAAATTCACAACTCCGTACCC  700

seq1  AGGTACACAAACAACCAAATCAAACATTCATTCTGGTCCTCGCATTTGCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTACACAAACAACCAAATCAAACATTCATTCTGGTCCTCGCATTTGCA  750

seq1  GTTTGAGTGAGTGGCTTAGTGTTCTGTCTGTGCACAGTGAGGACAATAGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAGTGAGTGGCTTAGTGTTCTGTCTGTGCACAGTGAGGACAATAGA  800

seq1  ACACAAAGCATCCATGATTTCAAAGAACCCAAGCAGTCTCCTAGTCCCAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAGCATCCATGATTTCAAAGAACCCAAGCAGTCTCCTAGTCCCAC  850

seq1  AGACTTTAGTGCATGTCCTAGATGTCCTTGTCCATTGCACAGAATTC  894
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTAGTGCATGTCCTAGATGTCCTTGTCCATTGCACAGAATTC  897