BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205A10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 102,449,188 - 102,614,865
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700110M21Rik, LOC100043421, LOC382936, Tbc1d4, Commd6, Uchl3, Lmo7, LOC100043795, LOC545567
Downstream geneLOC669278, Kctd12, LOC668699, Irg1, Cln5, Fbxl3, LOC100043441, Phr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205A10.bB6Ng01-205A10.g
ACCGA024815GA024816
length874939
definitionB6Ng01-205A10.b B6Ng01-205A10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,449,188 - 102,450,060)(102,613,936 - 102,614,865)
sequence
ggaattcagtatcaaaactcctcttgtcagtcacttcaggttgatgaaga
ctacacttgtctttcatttggccaccattgtatgctttgggtttagaaca
tagtccatttagtacttatgaaatggaatggtctttcaacaatggaaaat
gttgatgtcattcatgtgtttaacttttagctatttctgattaagtattg
gaatggtttccagttgaatgagactttctgtgacctgaccctgtattcct
cttctcgagactcctgttcctcacctggatgcactttagctgtacttctt
gtctctagttcccgaatatgaactcacaagagtgcaagttcactgccaag
ctgcaaatatgacctcacctgttaatcaacgtcagtatgaaaccatcctc
atgtgggccataaactcagtgacaaccatctttaagaagagtgtagagaa
gccacggaaagggaggcttgctgtgaagatgtagggaaactagattgaat
ggaagcatttacaatagaaggaggtccaggattactggtacccacagtga
gcttgggcagaggtatgaaggaggttcctcagcatctctagagaagcctc
ctatactgacaactcgatttaacagttctcacacgcagagccatgctgcg
ctgtgtgacttctaaatcagaaagtctgggggcatttgttactacagaga
aatgaccggaagtcatctctgcactgttgcattgctttgccttagggaga
gaagtctatgagaccctgcttattatcctctgcccagttaaatctgctct
tctttactgtgttgctaccttttggaagtcaacctaccccctgaggcttg
tcagctctttctctctcatgtttt
gaattcaggaaaggaagcaatagcatgtgggcatgtggggtgaggactta
ttagggatggttcaaagagaatatgagagagcaagaagcagaaggaaaat
aataaggttcccctgtctgcctgttgtagctgatgatgtagtgatggcat
acagctgaaccgagtcacagccctgctgtgtctttcatgttccctcattc
agaagtacacagaactaaagtggaagtggaaggtcagcccggtggttcaa
ccccttgaagcattgagaagttagctgtgttccatcacatgaatagtcca
caaaataatcacatgtttgtttcttaagataagcagcagagttttaggaa
aaatttcccttttagagtattggttcccaggtgttgaactgatttctggt
ttccagttggggaaatgaccacttgggaattccacttttggaaatgtctt
agcatgggatttggtctatcatgcttgatattatttcttcagttgttggg
acaatacagataatttttattaaattattaaaattcatccaaatcaatta
tttattatatcagttactataatattttgtgagaaattaaatgtttttac
tcatgaaatgtgcttttctcttatgtttctattttttatcatttttatca
caagccaagtcattcaagccaagtcattatagccatatatttctgtgcat
gcttgtacacactaatgaatgcacattttattatttattttaccagtctc
cttttgttgttttgtttttgtgtttttttcatctgcctatcatgaacaaa
tgcacaaatttgcctaattatactacttaggattttgtcaggattccatg
actttgtgatgaagacaaaagatcgcctattgtttgctgagagaccagaa
actccatctagtgtccatgttttttcagcccatcttatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_102449188_102450060
seq2: B6Ng01-205A10.b_50_921

seq1  GAATTCAGTATCAAAACTCCTCTTGTCAGTCACTTCAGGTTGATGAAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTATCAAAACTCCTCTTGTCAGTCACTTCAGGTTGATGAAGAC  50

seq1  TACACTTGTCTTTCATTTGGCCACCATTGTATGCTTTGGGTTTAGAACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTGTCTTTCATTTGGCCACCATTGTATGCTTTGGGTTTAGAACAT  100

seq1  AGTCCATTTAGTACTTATGAAATGGAATGGTCTTTCAACAATGGAAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATTTAGTACTTATGAAATGGAATGGTCTTTCAACAATGGAAAATG  150

seq1  TTGATGTCATTCATGTGTTTAACTTTTAGCTATTTCTGATTAAGTATTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTCATTCATGTGTTTAACTTTTAGCTATTTCTGATTAAGTATTGG  200

seq1  AATGGTTTCCAGTTGAATGAGACTTTCTGTGACCTGACCCTGTATTCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTTCCAGTTGAATGAGACTTTCTGTGACCTGACCCTGTATTCCTC  250

seq1  TTCTCGAGACTCCTGTTCCTCACCTGGATGCACTTTAGCTGTACTTCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCGAGACTCCTGTTCCTCACCTGGATGCACTTTAGCTGTACTTCTTG  300

seq1  TCTCTAGTTCCCGAATATGAACTCACAAGAGTGCAAGTTCACTGCCAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGTTCCCGAATATGAACTCACAAGAGTGCAAGTTCACTGCCAAGC  350

seq1  TGCAAATATGACCTCACCTGTTAATCAACGTCAGTATGAAACCATCCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATATGACCTCACCTGTTAATCAACGTCAGTATGAAACCATCCTCA  400

seq1  TGTGGGCCATAAACTCAGTGACAACCATCTTTAAGAAGAGTGTAGAGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGCCATAAACTCAGTGACAACCATCTTTAAGAAGAGTGTAGAGAAG  450

seq1  CCACGGAAAGGGAGGCTTGCTGTGAAGATGTAGGGAAACTAGATTGAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGGAAAGGGAGGCTTGCTGTGAAGATGTAGGGAAACTAGATTGAATG  500

seq1  GAAGCATTTACAATAGAAGGAGGTCCAGGATTACTGGTACCCACAGTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCATTTACAATAGAAGGAGGTCCAGGATTACTGGTACCCACAGTGAG  550

seq1  CTTGGGCAGAGGTATGAAGGAGGTTCCTCAGCATCTCTAGAGAAGCCTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGCAGAGGTATGAAGGAGGTTCCTCAGCATCTCTAGAGAAGCCTCC  600

seq1  TATACTGACAACTCGATTTAACAGTTCTCACACGCAGAGCCATGCTGCGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGACAACTCGATTTAACAGTTCTCACACGCAGAGCCATGCTGCGC  650

seq1  TGTGTGACTTCTAAATCAGAAAGTCTGGGGGCATTTGTTACTACAGAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGACTTCTAAATCAGAAAGTCTGGGGGCATTTGTTACTACAGAGAA  700

seq1  ATGACCGGAAGTCATCTCTGCACTGTTGCATTGCTTTGCCTTAGGGAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCGGAAGTCATCTCTGCACTGTTGCATTGCTTTGCCTTAGGGAGAG  750

seq1  AAGTCTATGAGACCCTGCTTATTATCCTCTGCCCAGTTAAATCTGCTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTATGAGACCCTGCTTATTATCCTCTGCCCAGTTAAATCTGCTCTT  800

seq1  CTTTTACTGTGTTGCTACCTTTTGGAAGTCAACCTACCCCCTGAGGCTTG  850
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TTTACTGTGTTGCTACCTTTTGGAAGTCAACCTACCCCCTGAGGCTTG  849

seq1  TCAGCTCTTTCTCTCTCATGTTT  873
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTCTTTCTCTCTCATGTTT  872

seq1: chr14_102613936_102614865
seq2: B6Ng01-205A10.g_71_1009 (reverse)

seq1  CAAAAGAT-GGCTGAAAAAACATGGACACTAGATGGAGTTTCTGGTCTCT  49
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGATGGGCTGAAAAAACATGGACACTAGATGGAGTTTCTGGTCTCT  50

seq1  CAGCAAACAATGGGCGATCTTTTGTCTTCATCACAAAGTCATGG-ATCCT  98
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAGCAAACAATAGGCGATCTTTTGTCTTCATCACAAAGTCATGGAATCCT  100

seq1  GACATAATCCTAAGTAGTATAATTAGGCAAA-TTGTGCATTTGTTCATGA  147
      |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GACAAAATCCTAAGTAGTATAATTAGGCAAATTTGTGCATTTGTTCATGA  150

seq1  TAGGCAGATG-AAAAAACACAAAAACAAAACAACAAAAGGAGACTGGTAA  196
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCAGATGAAAAAAACACAAAAACAAAACAACAAAAGGAGACTGGTAA  200

seq1  A--TAATAAT-AAATGTGCATTCATTAGTGTGTACAAGCATGCACAG-AA  242
      |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AATAAATAATAAAATGTGCATTCATTAGTGTGTACAAGCATGCACAGAAA  250

seq1  TATATGGCTATAATGACTTGGCTTGAATGACTTGGCTTGTGATAAAAATG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGGCTATAATGACTTGGCTTGAATGACTTGGCTTGTGATAAAAATG  300

seq1  ATAAAAAATAGAAACATAAGAGAAAAGCACATTTCATGAGT-AAAACATT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATAAAAAATAGAAACATAAGAGAAAAGCACATTTCATGAGTAAAAACATT  350

seq1  TAATTTCTCACAAAATATTATAGTAACTGATATAATAAATAATTGATTTG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCTCACAAAATATTATAGTAACTGATATAATAAATAATTGATTTG  400

seq1  GATGAATTTTAATAATTTAATAAAAATTATCTGTATTGTCCCAACAACTG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAATTTTAATAATTTAATAAAAATTATCTGTATTGTCCCAACAACTG  450

seq1  AAGAAATAATATCAAGCATGATAGACCAAATCCCATGCTAAGACATTTCC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATAATATCAAGCATGATAGACCAAATCCCATGCTAAGACATTTCC  500

seq1  AAAAGTGGAATTCCCAAGTGGTCATTTCCCCAACTGGAAACCAGAAATCA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGGAATTCCCAAGTGGTCATTTCCCCAACTGGAAACCAGAAATCA  550

seq1  GTTCAACACCTGGGAACCAATACTCTAAAAGGGAAATTTTTCCTAAAACT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAACACCTGGGAACCAATACTCTAAAAGGGAAATTTTTCCTAAAACT  600

seq1  CTGCTGCTTATCTTAAGAAACAAACATGTGATTATTTTGTGGACTATTCA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCTTATCTTAAGAAACAAACATGTGATTATTTTGTGGACTATTCA  650

seq1  TGTGATGGAACACAGCTAACTTCTCAATGCTTCAAGGGGTTGAACCACCG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGGAACACAGCTAACTTCTCAATGCTTCAAGGGGTTGAACCACCG  700

seq1  GGCTGACCTTCCACTTCCACTTTAGTTCTGTGTACTTCTGAATGAGGGAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGACCTTCCACTTCCACTTTAGTTCTGTGTACTTCTGAATGAGGGAA  750

seq1  CATGAAAGACACAGCAGGGCTGTGACTCGGTTCAGCTGTATGCCATCACT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAAGACACAGCAGGGCTGTGACTCGGTTCAGCTGTATGCCATCACT  800

seq1  ACATCATCAGCTACAACAGGCAGACAGGGGAACCTTATTATTTTCCTTCT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATCAGCTACAACAGGCAGACAGGGGAACCTTATTATTTTCCTTCT  850

seq1  GCTTCTTGCTCTCTCATATTCTCTTTGAACCATCCCTAATAAGTCCTCAC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTGCTCTCTCATATTCTCTTTGAACCATCCCTAATAAGTCCTCAC  900

seq1  CCCACATGCCCACATGCTATTGCTTCCTTTCCTGAATTC  930
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATGCCCACATGCTATTGCTTCCTTTCCTGAATTC  939