BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206J22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 80,600,436 - 80,740,976
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1300010F03Rik, AU017455, 1190002H23Rik, Narg1l, Mtrf1, Kbtbd7, EG432879, Wbp4, Elf1, LOC668560, Sugt1, Lect1, Pcdh8, EG629734, Olfm4
Downstream geneLOC672828
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206J22.bB6Ng01-206J22.g
ACCGA025989GA025990
length1,1281,169
definitionB6Ng01-206J22.b B6Ng01-206J22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,739,838 - 80,740,976)(80,600,436 - 80,601,630)
sequence
gaattctactgtaactctccaaaagctactactccctgggcaacaacttc
tccttaactggaaatcttagcatcctgagtccagtctcactaccttttct
actctttcaagggtccattatttttgcctcaggatctgcccaactgctcc
ttttcaatcagaggcagccacccagacctcagcttctcactctttggtcc
atgctataaatctttaacttccctgtttcgtttaaagtctctgcagcctt
tcttcctctgagatgaaattagcactagtacatctagccggcctcaagca
tcactagatgtttaatctggaaagggaagccacttaacctctctgagtct
ctgtcctggctaataagatgaacttggggatctgatgcagcattccccat
gcaggtgtgttcaactgttcacagccaagctaaactgtaatctcagagcc
ctcccaaccatgcccatcagagcttttatactggcttagagaaagatgct
gccagactgtggaagataaataattgtaaccctccaactgccatttgtta
ttatccccaccatgataaacatcttctacaaagtttaaagactttcttta
ttcagcacccaaggtcttcaagcctggctagcctgtctgcctctcccact
caactcaatgcatcccttcaacaaaccctccttccgtgcatattcctgaa
aatattaaataaccatgtttttatccacgtccagaccttgatataacttt
tctccttctaaagcactttttcccattttcacctcctatttattgctttg
aatttttaatcatcttccaaatatcaattttagattctacctatgaagaa
gccccccctctaacaccttccagcccctggcacactgtgactctcatatg
ccaacctatactaagcactcacggagttatcattggtgagtgtttgcttg
cataaatttaaattttaaattaaattttaaacaccttaaatgactatgtt
ctgatcctgtctctaagatgtgctcaggcgggttacagaatagccctgtg
agtattataacatcgaatgaatgttactacctcttctttacaaacttctc
agaaactcaaaaaaaaaaagcacttttt
gaattctttcttgaggagagataaagaagtgcctatttgacaacgataga
gaggacagaggccacagagatgggttctatcaagctcagtgtgttgcacc
agtgagcttcttggggtcagtcacccaagtatgagtgattcttgggcagc
tgcacaaccaggaaatctcaacccagcctgagtgattcataaaccaccaa
tgaggaatttccatctcagtcagtcatgcatttccttgatattctagcaa
gtcaagaccagttgagacaggagggaatggtgactagaatttcaagtgaa
ggtctttgaacttccccattctttccgtgggaaaatgtcaatggttctat
tatagctacttttgtcttagctttcagatacattgttctgtttatttcat
tgtcaaagctttatgtctatcaccactgctctatgttggtgattgtcaaa
tcaccagattttctctctggagaaaaagtaccacaacaaatataaatggc
acagcattatgggaagtattttaacagttgcaaaagtaagcatgtgattg
ctatttatgctatcatttgcacttgtggctatttatcccccatcttttta
agacaaaatgtatgtgaagtgtgtatactaatatccatacttagtctgtt
cataagaccccaaaattgtaaacaactcaaaggttcacacaactattcaa
agatcatcacattcacacagaaaattattgctcaacaatacgcaaacaac
aaacaaagtaagacacatggaaatatctaaaatattatacagcataaaag
ggagaaaggaagggttcattctacggtttcttttaagtgaaatttgaaag
caggcaaaaactaatgagtagctacagaattcagagcatgggttttctag
aactgggtttgatcaaagtggcacaagggaacttgcgagacatggaatta
ctctgcatcttgattgagatggcaatttcatgggcatatgcattttcaaa
gtgaactgtaagttaaaagtgtgtgtgtgtgtttatatgtataaaggtga
ttaagaaactaatatccttataattaagaattacaacaacagcgacaagc
tgagctctgagaatgctgacacaatgttctttattggagaaaggcttatg
ctcatctccggcagttatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_80739838_80740976
seq2: B6Ng01-206J22.b_46_1173 (reverse)

seq1  AAAAAGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTTCTGGAGAGGTTTTGTAAA  50
      |||||| ||||||||||||||      ||||||| |||| | ||||||||
seq2  AAAAAG-TGCTTTTTTTTTTT-----GAGTTTCT-GAGAAG-TTTGTAAA  42

seq1  AGAGA-GTAGTAACATCCA-TCGATTGTTATAATACTCACA-GGCTATTC  97
        ||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAGAGGTAGTAACATTCATTCGA-TGTTATAATACTCACAGGGCTATTC  91

seq1  TGTACCCGGCCCTGAGCACATCTTAGAGACAGGATCAAGAACATAGTCAT  147
      |||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  TGTAACCCG-CCTGAGCACATCTTAGAGACAGGATC-AGAACATAGTCA-  138

seq1  TTTAAGGTGTTTAAAATTTAATTTAAAATTTAAAATTTATGCAAGCAAAC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGTGTTTAAAATTTAATTTAAAATTT-AAATTTATGCAAGCAAAC  187

seq1  ACTCACCAATGATAACTCCGTGAGTGCTTTAGTATAGGTTGGCATATGAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACCAATGATAACTCCGTGAGTGC-TTAGTATAGGTTGGCATATGAG  236

seq1  AGTCACAGTGTGCCAGGGGCTGGAAGGTGTTAGAGGGGGGGCTTCTTCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACAGTGTGCCAGGGGCTGGAAGGTGTTAGAGGGGGGGCTTCTTCAT  286

seq1  AGGTAGAATCTAAAATTGATATTTGGAAGATGATTAAAAATTCAAAGCAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAATCTAAAATTGATATTTGGAAGATGATTAAAAATTCAAAGCAA  336

seq1  TAAATAGGAGGTGAAAATGGGAAAAAGTGCTTTAGAAGGAGAAAAGTTAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGGAGGTGAAAATGGGAAAAAGTGCTTTAGAAGGAGAAAAGTTAT  386

seq1  ATCAAGGTCTGGACGTGGATAAAAACATGGTTATTTAATATTTTCAGGAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGTCTGGACGTGGATAAAAACATGGTTATTTAATATTTTCAGGAA  436

seq1  TATGCACGGAAGGAGGGTTTGTTGAAGGGATGCATTGAGTTGAGTGGGAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCACGGAAGGAGGGTTTGTTGAAGGGATGCATTGAGTTGAGTGGGAG  486

seq1  AGGCAGACAGGCTAGCCAGGCTTGAAGACCTTGGGTGCTGAATAAAGAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGACAGGCTAGCCAGGCTTGAAGACCTTGGGTGCTGAATAAAGAAA  536

seq1  GTCTTTAAACTTTGTAGAAGATGTTTATCATGGTGGGGATAATAACAAAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAAACTTTGTAGAAGATGTTTATCATGGTGGGGATAATAACAAAT  586

seq1  GGCAGTTGGAGGGTTACAATTATTTATCTTCCACAGTCTGGCAGCATCTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTTGGAGGGTTACAATTATTTATCTTCCACAGTCTGGCAGCATCTT  636

seq1  TCTCTAAGCCAGTATAAAAGCTCTGATGGGCATGGTTGGGAGGGCTCTGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAAGCCAGTATAAAAGCTCTGATGGGCATGGTTGGGAGGGCTCTGA  686

seq1  GATTACAGTTTAGCTTGGCTGTGAACAGTTGAACACACCTGCATGGGGAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTACAGTTTAGCTTGGCTGTGAACAGTTGAACACACCTGCATGGGGAA  736

seq1  TGCTGCATCAGATCCCCAAGTTCATCTTATTAGCCAGGACAGAGACTCAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCATCAGATCCCCAAGTTCATCTTATTAGCCAGGACAGAGACTCAG  786

seq1  AGAGGTTAAGTGGCTTCCCTTTCCAGATTAAACATCTAGTGATGCTTGAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTAAGTGGCTTCCCTTTCCAGATTAAACATCTAGTGATGCTTGAG  836

seq1  GCCGGCTAGATGTACTAGTGCTAATTTCATCTCAGAGGAAGAAAGGCTGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGCTAGATGTACTAGTGCTAATTTCATCTCAGAGGAAGAAAGGCTGC  886

seq1  AGAGACTTTAAACGAAACAGGGAAGTTAAAGATTTATAGCATGGACCAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTTTAAACGAAACAGGGAAGTTAAAGATTTATAGCATGGACCAAA  936

seq1  GAGTGAGAAGCTGAGGTCTGGGTGGCTGCCTCTGATTGAAAAGGAGCAGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAGAAGCTGAGGTCTGGGTGGCTGCCTCTGATTGAAAAGGAGCAGT  986

seq1  TGGGCAGATCCTGAGGCAAAAATAATGGACCCTTGAAAGAGTAGAAAAGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGATCCTGAGGCAAAAATAATGGACCCTTGAAAGAGTAGAAAAGG  1036

seq1  TAGTGAGACTGGACTCAGGATGCTAAGATTTCCAGTTAAGGAGAAGTTGT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAGACTGGACTCAGGATGCTAAGATTTCCAGTTAAGGAGAAGTTGT  1086

seq1  TGCCCAGGGAGTAGTAGCTTTTGGAGAGTTACAGTAGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGGAGTAGTAGCTTTTGGAGAGTTACAGTAGAATTC  1128

seq1: chr14_80600436_80601630
seq2: B6Ng01-206J22.g_67_1235

seq1  GAATTCTTTCTTGAGGAGAGATAAAGAAGTGCCTATTTGACAACGATAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTTGAGGAGAGATAAAGAAGTGCCTATTTGACAACGATAGA  50

seq1  GAGGACAGAGGCCACAGAGATGGGTTCTATCAAGCTCAGTGTGTTGCACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAGAGGCCACAGAGATGGGTTCTATCAAGCTCAGTGTGTTGCACC  100

seq1  AGTGAGCTTCTTGGGGTCAGTCACCCAAGTATGAGTGATTCTTGGGCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCTTCTTGGGGTCAGTCACCCAAGTATGAGTGATTCTTGGGCAGC  150

seq1  TGCACAACCAGGAAATCTCAACCCAGCCTGAGTGATTCATAAACCACCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAACCAGGAAATCTCAACCCAGCCTGAGTGATTCATAAACCACCAA  200

seq1  TGAGGAATTTCCATCTCAGTCAGTCATGCATTTCCTTGATATTCTAGCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAATTTCCATCTCAGTCAGTCATGCATTTCCTTGATATTCTAGCAA  250

seq1  GTCAAGACCAGTTGAGACAGGAGGGAATGGTGACTAGAATTTCAAGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGACCAGTTGAGACAGGAGGGAATGGTGACTAGAATTTCAAGTGAA  300

seq1  GGTCTTTGAACTTCCCCATTCTTTCCGTGGGAAAATGTCAATGGTTCTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTTGAACTTCCCCATTCTTTCCGTGGGAAAATGTCAATGGTTCTAT  350

seq1  TATAGCTACTTTTGTCTTAGCTTTCAGATACATTGTTCTGTTTATTTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCTACTTTTGTCTTAGCTTTCAGATACATTGTTCTGTTTATTTCAT  400

seq1  TGTCAAAGCTTTATGTCTATCACCACTGCTCTATGTTGGTGATTGTCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAAGCTTTATGTCTATCACCACTGCTCTATGTTGGTGATTGTCAAA  450

seq1  TCACCAGATTTTCTCTCTGGAGAAAAAGTACCACAACAAATATAAATGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGATTTTCTCTCTGGAGAAAAAGTACCACAACAAATATAAATGGC  500

seq1  ACAGCATTATGGGAAGTATTTTAACAGTTGCAAAAGTAAGCATGTGATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCATTATGGGAAGTATTTTAACAGTTGCAAAAGTAAGCATGTGATTG  550

seq1  CTATTTATGCTATCATTTGCACTTGTGGCTATTTATCCCCCATCTTTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTATGCTATCATTTGCACTTGTGGCTATTTATCCCCCATCTTTTTA  600

seq1  AGACAAAATGTATGTGAAGTGTGTATACTAATATCCATACTTAGTCTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAATGTATGTGAAGTGTGTATACTAATATCCATACTTAGTCTGTT  650

seq1  CATAAGACCCCAAAATTGTAAACAACTCAAAGGTTCACACAACTATTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGACCCCAAAATTGTAAACAACTCAAAGGTTCACACAACTATTCAA  700

seq1  AGATCATCACATTCACACAGAAAATTATTGCTCAACAATACGCAAACAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCATCACATTCACACAGAAAATTATTGCTCAACAATACGCAAACAAC  750

seq1  AAACAAAGTAAGACACATGGAAATATCTAAAATATTATACAGCATAAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAGTAAGACACATGGAAATATCTAAAATATTATACAGCATAAAAG  800

seq1  GGAGAAAGGAAGGGTTCATTCTACGGTTTCTTTTAAGTGAAATTTGAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAGGAAGGGTTCATTCTACGGTTTCTTTTAAGTGAAATTTGAAAG  850

seq1  CAGGCAAAAACTAATGAGTAGCTACAGAATTCAGAGCATGGGTTTTCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAAAAACTAATGAGTAGCTACAGAATTCAGAGCATGGGTTTTCTAG  900

seq1  AACTGGGTTTGAATCAAAGTGGCACAAGGGAACTTTGCGAGACAATGGAA  950
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  AACTGGGTTTG-ATCAAAGTGGCACAAGGGAAC-TTGCGAGAC-ATGGAA  947

seq1  TTACTCTGCATCTTGATTGAGATGGCAATTTCATGGGCATATGCATTTTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCTGCATCTTGATTGAGATGGCAATTTCATGGGCATATGCATTTTC  997

seq1  CAAAAGTGAACTGTAAAGTTAAAAAGTGTGTGTGTGTGTTTTATTATGTA  1050
        |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||
seq2  --AAAGTGAACTGT-AAGTT-AAAAGTGTGTGTGTGTGTTT--ATATGTA  1041

seq1  TTAAAGTTGATTAAGAAACTAATATCCTTTATTAATAAAGATTACAAAAC  1100
       ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||  |||
seq2  -TAAAGGTGATTAAGAAACTAATATCC-TTATAATTAAGAATTAC--AAC  1087

seq1  AACAGCGACAAAGCTGAAGCTCTGAGGAATGCTGCACCAAATGGTTCTTT  1150
      ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||| ||||  |
seq2  AACAGCGAC-AAGCTG-AGCTCTGA-GAATGCTG-ACACAAT-GTTC--T  1130

seq1  TTATTGGAGAAAAAAGGGCTTAGTGCTCATCTCCAGGCAGTTATG  1195
      ||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  TTATTGGAGAAA----GGCTTA-TGCTCATCTCC-GGCAGTTATG  1169