BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-207H12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 14,371,238 - 14,425,190
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSynpr
Upstream geneCadps, EG432822, LOC100042022, LOC100042026, EG328354
Downstream geneA430083B19Rik, EG382844, LOC100042045, Gm281, Thoc7, Atxn7, Psmd6, Olfr720, LOC667125, LOC100042543, Olfr31, Il3ra, LOC627139, Olfr721-ps1, LOC667152
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-207H12.bB6Ng01-207H12.g
ACCGA026610GA026611
length1,1581,040
definitionB6Ng01-207H12.b B6Ng01-207H12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,424,036 - 14,425,190)(14,371,238 - 14,372,288)
sequence
gaattcactgtgtagtagaggatgaccttgaatagctgatcctcctgcct
ccacctcctgagtgctgggattaaaggcttcaccctttctatccagtaaa
ccagggtttccttcctgctaggcaagcactgtaccaatggagctcattca
ttgtgatcatgatgctttttgtaagcttgaagcagtgatgtcagctccaa
acttcccagagaaagtgatcatatgcttccttgggttgttatttcaatct
tgtgaagtaaatattttggagtatcccctgtctagacataaatattaatt
gaatcataacttatgtctcatgctttatttagctgtttgtaccgtgcttt
gtcagttacatcatactttcgattcacattccagttttacatttctaggt
tttgggttttcttttacaattgcggtgagaatttttaaagatgtagacag
acttccatatctctagatttttttcctatgagtatcagaagatatgagta
gaaagttttcagaagcaaatgtatcctaggatgtctgcaaaaaacggctc
agccagcatgatgcttgctgttcaagcaggaggttctgagtttggatggc
catcacccatatacaaagctggcagtggtggcttgcagctgtaacctcag
ccaggaggatccagagatgggaggatccctgctgctcactggctgctgag
ctcacaagtggatgcgctggaggttcagtaaggaccttgtattaaagata
gagtgtgagaaggacaaccaacattgacctccagcttccatgcttacaca
cagcacacacacacacacacacaccctagtgaaaatcttctggacttcat
gtaccataatgctaacagacatctcactgtaaagcagattctgatttgga
aaggaacagaacagagtctgagagccagaatttctaacgtgcttccaagc
tctgtatgtgctgctgcgcacatatgaactctgagaagcatgtctagccc
tatgagagacttcctccatgccaacttttccaggctacattattgctagg
atccaccccactatgaaagaacataccacactattttattactttttctg
ctcacttcagaatatgtttgtttcattggcaggttcagtttaagaatagc
tgcacttc
gaattcattgtcacctcagtacacaatattttgtaattggaaatagcaca
tcttcccaatgtatttaagcttgccagtatagaaggggcctttcacacaa
agccactgtgagtataactatgagcagtaatatgcttcccaaacgctgtc
tgtcagaccaattgtccaccccagattaattcagagccttttctctgcaa
aactgaagaagaaagtccgtttcatgtgtgcataaaagaggcgccagtgt
agaaaacaaaccagtgcccattttcaaggcagttgcaaacaagtctgtgg
ctgctgtaattcctctcccgttctggagatgaagcccaaggagatagctg
gagttggaagtttcatgattcagagaatgcttcattagtttctgcaacca
cagtcatatagttaagattctgcatatttacttaaatgtgatatgtctgt
acaagtgggaaagggtaactttaccacccacatgactattaaattctgta
taatgtcaactaaacacagtgtaccaacatactttttccaaagttgataa
caaagctacagtttctgagggtacaaattatatatgtggctataaatatg
tgtatttatctaagaagattaataaacagaagcatggtgtatattggtag
tagtacatttgagccaaataaaagcatccaatatatgtcactaaagaaaa
aaaaagagccaaaagcaaaccctcaggaacagagcagctctgtcgctggg
tggcacctggaactgtttatgtcactagggctgtaccaggaacaattttt
aaaattagcttctaaaccatcatctaaaaagaacaaaaacaaacaaaaaa
cccaaccaaccaaccaaacaaacaacaaaaagcccagcattctagagtac
tgtccttgcaagtatctctaatgaaacacagttataagcaacacagatag
tttaaacccttattacagctgccaaggatggattggccacatcaagccat
ggtcagttcttactagttcatttgcacccccattcaaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_14424036_14425190
seq2: B6Ng01-207H12.b_31_1188 (reverse)

seq1  GAAGTGGCAGCTATCTTAAAACTGAACTGGCAAAATGAACAAACATA-TC  49
      ||||| ||||||||  | |||||||||  || ||   |||||||||| ||
seq2  GAAGT-GCAGCTATTCTTAAACTGAACCTGCCAATGAAACAAACATATTC  49

seq1  TGAAAGTGAGGCAG-AAAAGTATAAAAATAGTGTGGTATGTTCTTTCATA  98
      || |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TG-AAGTGA-GCAGAAAAAGTAATAAAATAGTGTGGTATGTTCTTTCATA  97

seq1  GTGGG--TGATCCTAGCCATAATGTAGGCTGG-AAAGTTGGCATGGAGGA  145
      |||||   ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  GTGGGGTGGATCCTAGCAATAATGTAGCCTGGAAAAGTTGGCATGGAGGA  147

seq1  AGTCTCCTCATA-GGCTAGACATGCTTCTCAGAGTTCATATGTGCGCAGC  194
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCT-CTCATAGGGCTAGACATGCTTCTCAGAGTTCATATGTGCGCAGC  196

seq1  AGCACATACAGAGCTTGGAAGCACGTTAGAAATTCTGGCTCTCAGACTCT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACATACAGAGCTTGGAAGCACGTTAGAAATTCTGGCTCTCAGACTCT  246

seq1  GTTCTGTTCC-TTCCAAATCAGAATCTGCTTTACAGTGAGATGTCTGTTA  293
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGTTCCTTTCCAAATCAGAATCTGCTTTACAGTGAGATGTCTGTTA  296

seq1  GCATTATGGTACATGAAGTCCAGAAGATTTTCACTAGGGTGTGTGTGTGT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATGGTACATGAAGTCCAGAAGATTTTCACTAGGGTGTGTGTGTGT  346

seq1  GTGTGTGTGCTGTGTGTAAGCATGGAAGCTGGAGGTCAATGTTGGTTGTC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGCTGTGTGTAAGCATGGAAGCTGGAGGTCAATGTTGGTTGTC  396

seq1  CTTCTCACACTCTATCTTTAATACAAGGTCCTTACTGAACCTCCAGCGCA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCACACTCTATCTTTAATACAAGGTCCTTACTGAACCTCCAGCGCA  446

seq1  TCCACTTGTGAGCTCAGCAGCCAGTGAGCAGCAGGGATCCTCCCATCTCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTTGTGAGCTCAGCAGCCAGTGAGCAGCAGGGATCCTCCCATCTCT  496

seq1  GGATCCTCCTGGCTGAGGTTACAGCTGCAAGCCACCACTGCCAGCTTTGT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCTCCTGGCTGAGGTTACAGCTGCAAGCCACCACTGCCAGCTTTGT  546

seq1  ATATGGGTGATGGCCATCCAAACTCAGAACCTCCTGCTTGAACAGCAAGC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGGTGATGGCCATCCAAACTCAGAACCTCCTGCTTGAACAGCAAGC  596

seq1  ATCATGCTGGCTGAGCCGTTTTTTGCAGACATCCTAGGATACATTTGCTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGCTGGCTGAGCCGTTTTTTGCAGACATCCTAGGATACATTTGCTT  646

seq1  CTGAAAACTTTCTACTCATATCTTCTGATACTCATAGGAAAAAAATCTAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAACTTTCTACTCATATCTTCTGATACTCATAGGAAAAAAATCTAG  696

seq1  AGATATGGAAGTCTGTCTACATCTTTAAAAATTCTCACCGCAATTGTAAA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGGAAGTCTGTCTACATCTTTAAAAATTCTCACCGCAATTGTAAA  746

seq1  AGAAAACCCAAAACCTAGAAATGTAAAACTGGAATGTGAATCGAAAGTAT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACCCAAAACCTAGAAATGTAAAACTGGAATGTGAATCGAAAGTAT  796

seq1  GATGTAACTGACAAAGCACGGTACAAACAGCTAAATAAAGCATGAGACAT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAACTGACAAAGCACGGTACAAACAGCTAAATAAAGCATGAGACAT  846

seq1  AAGTTATGATTCAATTAATATTTATGTCTAGACAGGGGATACTCCAAAAT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATGATTCAATTAATATTTATGTCTAGACAGGGGATACTCCAAAAT  896

seq1  ATTTACTTCACAAGATTGAAATAACAACCCAAGGAAGCATATGATCACTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACTTCACAAGATTGAAATAACAACCCAAGGAAGCATATGATCACTT  946

seq1  TCTCTGGGAAGTTTGGAGCTGACATCACTGCTTCAAGCTTACAAAAAGCA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGGAAGTTTGGAGCTGACATCACTGCTTCAAGCTTACAAAAAGCA  996

seq1  TCATGATCACAATGAATGAGCTCCATTGGTACAGTGCTTGCCTAGCAGGA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGATCACAATGAATGAGCTCCATTGGTACAGTGCTTGCCTAGCAGGA  1046

seq1  AGGAAACCCTGGTTTACTGGATAGAAAGGGTGAAGCCTTTAATCCCAGCA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACCCTGGTTTACTGGATAGAAAGGGTGAAGCCTTTAATCCCAGCA  1096

seq1  CTCAGGAGGTGGAGGCAGGAGGATCAGCTATTCAAGGTCATCCTCTACTA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGAGGTGGAGGCAGGAGGATCAGCTATTCAAGGTCATCCTCTACTA  1146

seq1  CACAGTGAATTC  1155
      ||||||||||||
seq2  CACAGTGAATTC  1158

seq1: chr14_14371238_14372288
seq2: B6Ng01-207H12.g_65_1104

seq1  GAATTCATTGTCACCTCAGTACACAATATTTTGTAATTGGAAATAGCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGTCACCTCAGTACACAATATTTTGTAATTGGAAATAGCACA  50

seq1  TCTTCCCAATGTATTTAAGCTTGCCAGTATAGAAGGGGCCTTTCACACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCCAATGTATTTAAGCTTGCCAGTATAGAAGGGGCCTTTCACACAA  100

seq1  AGCCACTGTGAGTATAACTATGAGCAGTAATATGCTTCCCAAACGCTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTGTGAGTATAACTATGAGCAGTAATATGCTTCCCAAACGCTGTC  150

seq1  TGTCAGACCAATTGTCCACCCCAGATTAATTCAGAGCCTTTTCTCTGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGACCAATTGTCCACCCCAGATTAATTCAGAGCCTTTTCTCTGCAA  200

seq1  AACTGAAGAAGAAAGTCCGTTTCATGTGTGCATAAAAGAGGCGCCAGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAGAAGAAAGTCCGTTTCATGTGTGCATAAAAGAGGCGCCAGTGT  250

seq1  AGAAAACAAACCAGTGCCCATTTTCAAGGCAGTTGCAAACAAGTCTGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACAAACCAGTGCCCATTTTCAAGGCAGTTGCAAACAAGTCTGTGG  300

seq1  CTGCTGTAATTCCTCTCCCGTTCTGGAGATGAAGCCCAAGGAGATAGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTAATTCCTCTCCCGTTCTGGAGATGAAGCCCAAGGAGATAGCTG  350

seq1  GAGTTGGAAGTTTCATGATTCAGAGAATGCTTCATTAGTTTCTGCAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGGAAGTTTCATGATTCAGAGAATGCTTCATTAGTTTCTGCAACCA  400

seq1  CAGTCATATAGTTAAGATTCTGCATATTTACTTAAATGTGATATGTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATATAGTTAAGATTCTGCATATTTACTTAAATGTGATATGTCTGT  450

seq1  ACAAGTGGGAAAGGGTAACTTTACCACCCACATGACTATTAAATTCTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGGGAAAGGGTAACTTTACCACCCACATGACTATTAAATTCTGTA  500

seq1  TAATGTCAACTAAACACAGTGTACCAACATACTTTTTCCAAAGTTGATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCAACTAAACACAGTGTACCAACATACTTTTTCCAAAGTTGATAA  550

seq1  CAAAGCTACAGTTTCTGAGGGTACAAATTATATATGTGGCTATAAATATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTACAGTTTCTGAGGGTACAAATTATATATGTGGCTATAAATATG  600

seq1  TGTATTTATCTAAGAAGATTAATAAACAGAAGCATGGTGTATATTGGTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTATCTAAGAAGATTAATAAACAGAAGCATGGTGTATATTGGTAG  650

seq1  TAGTACATTTGAGCCAAATAAAAGCATCCAATATATGTCACTAAAGAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACATTTGAGCCAAATAAAAGCATCCAATATATGTCACTAAAGAAAA  700

seq1  AAAAAGAGCCAAAAGCAAACCCTCAGGAACAGAGCAGCTCTGTCGCTGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGAGCCAAAAGCAAACCCTCAGGAACAGAGCAGCTCTGTCGCTGGG  750

seq1  TGGCACCTGGAACTGTTTATGTCACTAGGGCTGTACCAGGAACAATTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCTGGAACTGTTTATGTCACTAGGGCTGTACCAGGAACAATTTTT  800

seq1  AAAATTAGCTTCTAAACCATCATCTAAAAAAGAAACAAAAAACAAACAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||
seq2  AAAATTAGCTTCTAAACCATCATCT-AAAAAGAA--CAAAAACAAACAAA  847

seq1  AAACCCAACCAACCAACCAAACAAACAAACAAAAAGCCCCAGCATTCTAG  900
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2  AAACCCAACCAACCAACCAAACAAAC-AACAAAAAG-CCCAGCATTCTAG  895

seq1  AGTACTGTCCTTGCAAGTATCTCTAATGAAACACAGTTATAAAGCAACAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGTACTGTCCTTGCAAGTATCTCTAATGAAACACAGTTAT-AAGCAACAC  944

seq1  AGATAGTTTAAACCCTATTAACAGCTGCCAAGGAATGGATTGGCCACAAT  1000
      ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  AGATAGTTTAAACCCTTATTACAGCTGCCAAGG-ATGGATTGGCCAC-AT  992

seq1  CAAAGCCATGGTCAGTTCTTACTAAGTTCCATTGGCACCCCCATCCAAAA  1050
      | ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||
seq2  C-AAGCCATGGTCAGTTCTTACT-AGTT-CATTTGCACCCCCATTCAAAA  1039

seq1  A  1051
      |
seq2  A  1040